MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 58934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016024	CAG	2	6	23772	23777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753753
502	NC_016024	CGG	2	6	23784	23789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753753
503	NC_016024	TCG	2	6	23800	23805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753753
504	NC_016024	CAG	3	9	23814	23822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753753
505	NC_016024	ACTG	2	8	23963	23970	25 %	25 %	25 %	25 %	347753753
506	NC_016024	GGC	2	6	23987	23992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753753
507	NC_016024	GC	3	6	24020	24025	0 %	0 %	50 %	50 %	347753753
508	NC_016024	GTC	2	6	24090	24095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753753
509	NC_016024	TGC	2	6	24104	24109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753753
510	NC_016024	GCT	2	6	24141	24146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753753
511	NC_016024	GAA	2	6	24156	24161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753753
512	NC_016024	CG	3	6	24226	24231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
513	NC_016024	ACA	2	6	24368	24373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347753754
514	NC_016024	TGA	2	6	24396	24401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753754
515	NC_016024	CGG	2	6	24489	24494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753754
516	NC_016024	GCC	2	6	24601	24606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753754
517	NC_016024	TGCCC	2	10	24627	24636	0 %	20 %	20 %	60 %	347753754
518	NC_016024	CGG	2	6	24666	24671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753754
519	NC_016024	GACA	2	8	24687	24694	50 %	0 %	25 %	25 %	347753754
520	NC_016024	GAA	2	6	24709	24714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753754
521	NC_016024	CAT	2	6	24807	24812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753754
522	NC_016024	TGA	2	6	24885	24890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016024	AGCC	2	8	24910	24917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
524	NC_016024	GCT	2	6	24919	24924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_016024	AGCC	2	8	24937	24944	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
526	NC_016024	GAC	2	6	24957	24962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_016024	GCT	2	6	24970	24975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753755
528	NC_016024	ATC	2	6	25068	25073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753755
529	NC_016024	ACG	3	9	25075	25083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753755
530	NC_016024	TGC	2	6	25228	25233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753755
531	NC_016024	ACG	2	6	25368	25373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753755
532	NC_016024	CAT	2	6	25412	25417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753755
533	NC_016024	GGC	2	6	25433	25438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753755
534	NC_016024	GCA	2	6	25460	25465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753755
535	NC_016024	CAT	2	6	25469	25474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753755
536	NC_016024	GAC	2	6	25509	25514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753755
537	NC_016024	CAG	2	6	25554	25559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753755
538	NC_016024	GCT	2	6	25562	25567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753755
539	NC_016024	GCC	2	6	25598	25603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753755
540	NC_016024	ACC	2	6	25650	25655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753755
541	NC_016024	ATC	2	6	25701	25706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753755
542	NC_016024	GCG	2	6	25709	25714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753755
543	NC_016024	TCA	2	6	25810	25815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753755
544	NC_016024	GAA	2	6	25881	25886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753755
545	NC_016024	CAT	2	6	25922	25927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753755
546	NC_016024	CGA	2	6	25979	25984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753755
547	NC_016024	GAT	2	6	26045	26050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753755
548	NC_016024	GAA	2	6	26055	26060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753755
549	NC_016024	GA	3	6	26179	26184	50 %	0 %	50 %	0 %	347753755
550	NC_016024	CAG	2	6	26185	26190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_016024	CCT	2	6	26238	26243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_016024	CGC	2	6	26404	26409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753756
553	NC_016024	GCA	2	6	26443	26448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753756
554	NC_016024	CGACC	2	10	26449	26458	20 %	0 %	20 %	60 %	347753756
555	NC_016024	GAA	2	6	26462	26467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753756
556	NC_016024	CAC	2	6	26516	26521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753756
557	NC_016024	GCT	2	6	26604	26609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753756
558	NC_016024	CGC	2	6	26662	26667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753756
559	NC_016024	GCT	2	6	26824	26829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753756
560	NC_016024	CTG	2	6	26855	26860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753756
561	NC_016024	A	6	6	26973	26978	100 %	0 %	0 %	0 %	347753756
562	NC_016024	GAA	2	6	27029	27034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753756
563	NC_016024	CGG	2	6	27066	27071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753756
564	NC_016024	GCC	2	6	27102	27107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753756
565	NC_016024	TCA	2	6	27168	27173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753756
566	NC_016024	GAA	2	6	27197	27202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753756
567	NC_016024	GGC	2	6	27217	27222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753756
568	NC_016024	GCA	2	6	27223	27228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753756
569	NC_016024	A	6	6	27258	27263	100 %	0 %	0 %	0 %	347753756
570	NC_016024	CCG	2	6	27314	27319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753756
571	NC_016024	CCG	2	6	27344	27349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753756
572	NC_016024	GCG	2	6	27423	27428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753756
573	NC_016024	ATC	2	6	27491	27496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753756
574	NC_016024	GAT	2	6	27499	27504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753756
575	NC_016024	TGC	2	6	27534	27539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753756
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577	NC_016024	CGG	3	9	27585	27593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753756
578	NC_016024	ATC	2	6	27740	27745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753756
579	NC_016024	CGG	2	6	27788	27793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753756
580	NC_016024	AGC	2	6	27807	27812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753756
581	NC_016024	ATC	2	6	27872	27877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753756
582	NC_016024	CCA	2	6	27927	27932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753756
583	NC_016024	CTG	2	6	27959	27964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753756
584	NC_016024	CCA	2	6	27996	28001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753756
585	NC_016024	GGC	2	6	28006	28011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753756
586	NC_016024	GCCC	2	8	28048	28055	0 %	0 %	25 %	75 %	347753756
587	NC_016024	CGG	2	6	28111	28116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753756
588	NC_016024	ACC	2	6	28136	28141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753756
589	NC_016024	CTG	2	6	28142	28147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753756
590	NC_016024	GCGG	2	8	28207	28214	0 %	0 %	75 %	25 %	347753756
591	NC_016024	ACGT	2	8	28220	28227	25 %	25 %	25 %	25 %	347753756
592	NC_016024	GCGGGC	2	12	28228	28239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753756
593	NC_016024	CCG	2	6	28270	28275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753756
594	NC_016024	CGGC	2	8	28329	28336	0 %	0 %	50 %	50 %	347753756
595	NC_016024	GCT	2	6	28459	28464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753756
596	NC_016024	TGG	2	6	28629	28634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753756
597	NC_016024	ACC	2	6	28704	28709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753756
598	NC_016024	GCG	2	6	28741	28746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753757
599	NC_016024	CGG	4	12	28766	28777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753757
600	NC_016024	TCA	2	6	28844	28849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753757
601	NC_016024	GCT	2	6	28854	28859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753757
602	NC_016024	CCAG	2	8	28883	28890	25 %	0 %	25 %	50 %	347753757
603	NC_016024	CCGG	2	8	28895	28902	0 %	0 %	50 %	50 %	347753757
604	NC_016024	TCA	2	6	28910	28915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753757
605	NC_016024	T	6	6	28918	28923	0 %	100 %	0 %	0 %	347753757
606	NC_016024	CCG	2	6	29031	29036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753757
607	NC_016024	GCCTTG	2	12	29041	29052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753757
608	NC_016024	TGGC	2	8	29113	29120	0 %	25 %	50 %	25 %	347753757
609	NC_016024	CGT	2	6	29131	29136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753757
610	NC_016024	CCA	2	6	29150	29155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753757
611	NC_016024	GC	3	6	29205	29210	0 %	0 %	50 %	50 %	347753757
612	NC_016024	CGC	2	6	29286	29291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753757
613	NC_016024	CGC	2	6	29295	29300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753757
614	NC_016024	CGC	2	6	29311	29316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753757
615	NC_016024	CTGAAA	2	12	29330	29341	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347753757
616	NC_016024	ATCC	2	8	29422	29429	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_016024	CAT	2	6	29434	29439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_016024	GAA	2	6	29453	29458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753758
619	NC_016024	C	7	7	29502	29508	0 %	0 %	0 %	100 %	347753758
620	NC_016024	TGCC	2	8	29693	29700	0 %	25 %	25 %	50 %	347753758
621	NC_016024	GC	3	6	29719	29724	0 %	0 %	50 %	50 %	347753758
622	NC_016024	GCCCG	2	10	29743	29752	0 %	0 %	40 %	60 %	347753758
623	NC_016024	GAC	2	6	29753	29758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753758
624	NC_016024	GCC	2	6	29830	29835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753758
625	NC_016024	AAGG	2	8	29837	29844	50 %	0 %	50 %	0 %	347753758
626	NC_016024	TCA	2	6	29862	29867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753758
627	NC_016024	GCC	2	6	29890	29895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753758
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752	NC_016024	CAA	2	6	35072	35077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347753762
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755	NC_016024	ACC	2	6	35173	35178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753762
756	NC_016024	GCC	2	6	35233	35238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753762
757	NC_016024	AGTT	2	8	35295	35302	25 %	50 %	25 %	0 %	347753762
758	NC_016024	GTTGG	2	10	35325	35334	0 %	40 %	60 %	0 %	347753763
759	NC_016024	TGG	2	6	35354	35359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753763
760	NC_016024	CGG	2	6	35366	35371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753763
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762	NC_016024	CCG	2	6	35448	35453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753763
763	NC_016024	GTT	2	6	35513	35518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753763
764	NC_016024	ATGCCG	2	12	35568	35579	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347753763
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807	NC_016024	GC	3	6	37375	37380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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817	NC_016024	TGA	2	6	37747	37752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
818	NC_016024	ACG	2	6	37754	37759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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845	NC_016024	G	6	6	39067	39072	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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880	NC_016024	T	6	6	41111	41116	0 %	100 %	0 %	0 %	347753766
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