MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A chromosome

Total Repeats: 62091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015949	CAA	2	6	21009	21014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995345
502	NC_015949	AAG	2	6	21029	21034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995345
503	NC_015949	TA	3	6	21044	21049	50 %	50 %	0 %	0 %	344995345
504	NC_015949	GAT	2	6	21050	21055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995345
505	NC_015949	AGA	2	6	21090	21095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995345
506	NC_015949	TTAAGG	2	12	21150	21161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995345
507	NC_015949	AAGGT	2	10	21203	21212	40 %	20 %	40 %	0 %	344995345
508	NC_015949	GCA	2	6	21270	21275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995345
509	NC_015949	AGC	2	6	21280	21285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995345
510	NC_015949	AGT	2	6	21355	21360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995345
511	NC_015949	GCA	2	6	21372	21377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995345
512	NC_015949	CAA	2	6	21456	21461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995345
513	NC_015949	AAG	2	6	21476	21481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995345
514	NC_015949	TA	3	6	21491	21496	50 %	50 %	0 %	0 %	344995345
515	NC_015949	GAT	2	6	21497	21502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995345
516	NC_015949	GCA	2	6	21542	21547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995345
517	NC_015949	GTA	2	6	21549	21554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995345
518	NC_015949	CGA	2	6	21636	21641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995345
519	NC_015949	GCA	2	6	21642	21647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995345
520	NC_015949	GAC	2	6	21790	21795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995345
521	NC_015949	TATG	2	8	21815	21822	25 %	50 %	25 %	0 %	344995345
522	NC_015949	GGA	2	6	21929	21934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344995345
523	NC_015949	GAT	2	6	22069	22074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995345
524	NC_015949	AG	3	6	22170	22175	50 %	0 %	50 %	0 %	344995345
525	NC_015949	GGA	2	6	22180	22185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344995345
526	NC_015949	ACA	2	6	22272	22277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995345
527	NC_015949	CTGATG	2	12	22311	22322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344995345
528	NC_015949	AGC	2	6	22365	22370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995345
529	NC_015949	AGC	2	6	22391	22396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995345
530	NC_015949	ATT	2	6	22518	22523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995345
531	NC_015949	GGC	2	6	22621	22626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344995345
532	NC_015949	GAGC	2	8	22674	22681	25 %	0 %	50 %	25 %	344995345
533	NC_015949	GGT	2	6	22722	22727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344995345
534	NC_015949	GGAG	2	8	22738	22745	25 %	0 %	75 %	0 %	344995345
535	NC_015949	GAACC	2	10	22832	22841	40 %	0 %	20 %	40 %	344995345
536	NC_015949	TAC	2	6	22913	22918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344995345
537	NC_015949	TTG	2	6	23147	23152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995345
538	NC_015949	GAA	2	6	23170	23175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995345
539	NC_015949	GAA	2	6	23200	23205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995345
540	NC_015949	AGAGA	2	10	23272	23281	60 %	0 %	40 %	0 %	344995345
541	NC_015949	TA	4	8	23313	23320	50 %	50 %	0 %	0 %	344995345
542	NC_015949	TAA	2	6	23358	23363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995345
543	NC_015949	ACAG	2	8	23400	23407	50 %	0 %	25 %	25 %	344995345
544	NC_015949	GGC	2	6	23431	23436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344995345
545	NC_015949	CAAT	2	8	23533	23540	50 %	25 %	0 %	25 %	344995345
546	NC_015949	TGC	2	6	23593	23598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015949	A	6	6	23627	23632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015949	A	6	6	23639	23644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015949	AG	3	6	23646	23651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015949	A	6	6	23672	23677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015949	ATG	2	6	23694	23699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015949	GTT	2	6	23748	23753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995346
553	NC_015949	T	7	7	23752	23758	0 %	100 %	0 %	0 %	344995346
554	NC_015949	ATG	2	6	23821	23826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995346
555	NC_015949	AGT	2	6	23828	23833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995346
556	NC_015949	GATA	2	8	23837	23844	50 %	25 %	25 %	0 %	344995346
557	NC_015949	AAG	2	6	23996	24001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995346
558	NC_015949	TA	3	6	24006	24011	50 %	50 %	0 %	0 %	344995346
559	NC_015949	A	7	7	24080	24086	100 %	0 %	0 %	0 %	344995346
560	NC_015949	GCA	2	6	24148	24153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995346
561	NC_015949	TTTA	2	8	24238	24245	25 %	75 %	0 %	0 %	344995346
562	NC_015949	TTG	2	6	24292	24297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995346
563	NC_015949	TA	3	6	24315	24320	50 %	50 %	0 %	0 %	344995346
564	NC_015949	A	6	6	24347	24352	100 %	0 %	0 %	0 %	344995346
565	NC_015949	A	6	6	24356	24361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015949	TTC	2	6	24366	24371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_015949	A	6	6	24409	24414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015949	TAT	2	6	24415	24420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015949	GGA	2	6	24479	24484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015949	GAAAA	2	10	24497	24506	80 %	0 %	20 %	0 %	344995347
571	NC_015949	TTG	2	6	24521	24526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995347
572	NC_015949	TA	3	6	24553	24558	50 %	50 %	0 %	0 %	344995347
573	NC_015949	TAA	2	6	24585	24590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995347
574	NC_015949	TAA	2	6	24658	24663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995347
575	NC_015949	AT	3	6	24720	24725	50 %	50 %	0 %	0 %	344995347
576	NC_015949	A	6	6	24738	24743	100 %	0 %	0 %	0 %	344995347
577	NC_015949	AGG	2	6	24787	24792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344995347
578	NC_015949	CTT	2	6	24798	24803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344995347
579	NC_015949	TTA	2	6	24813	24818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995347
580	NC_015949	AG	3	6	24844	24849	50 %	0 %	50 %	0 %	344995347
581	NC_015949	GAA	2	6	24854	24859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995347
582	NC_015949	ACTA	2	8	24875	24882	50 %	25 %	0 %	25 %	344995347
583	NC_015949	AAATT	2	10	24888	24897	60 %	40 %	0 %	0 %	344995347
584	NC_015949	ACC	2	6	24904	24909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344995347
585	NC_015949	GCA	2	6	24926	24931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995347
586	NC_015949	AAT	2	6	24985	24990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995347
587	NC_015949	TGGA	2	8	25155	25162	25 %	25 %	50 %	0 %	344995347
588	NC_015949	CAG	2	6	25191	25196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995347
589	NC_015949	TA	3	6	25337	25342	50 %	50 %	0 %	0 %	344995347
590	NC_015949	TTG	2	6	25479	25484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995347
591	NC_015949	GA	3	6	25495	25500	50 %	0 %	50 %	0 %	344995347
592	NC_015949	ATG	2	6	25611	25616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995347
593	NC_015949	TA	3	6	25630	25635	50 %	50 %	0 %	0 %	344995347
594	NC_015949	GAC	2	6	25652	25657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995347
595	NC_015949	ATT	2	6	25718	25723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995347
596	NC_015949	GACC	2	8	25727	25734	25 %	0 %	25 %	50 %	344995347
597	NC_015949	GGA	2	6	25778	25783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344995347
598	NC_015949	TTG	2	6	25817	25822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995347
599	NC_015949	CTG	2	6	25860	25865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344995347
600	NC_015949	CAA	2	6	25875	25880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995347
601	NC_015949	A	6	6	25879	25884	100 %	0 %	0 %	0 %	344995347
602	NC_015949	GGC	2	6	25900	25905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344995347
603	NC_015949	TGG	2	6	25976	25981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344995347
604	NC_015949	TCT	2	6	25990	25995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344995347
605	NC_015949	ATT	2	6	26002	26007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995347
606	NC_015949	TA	3	6	26022	26027	50 %	50 %	0 %	0 %	344995347
607	NC_015949	TCA	2	6	26081	26086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344995347
608	NC_015949	AAT	2	6	26087	26092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995347
609	NC_015949	AT	3	6	26124	26129	50 %	50 %	0 %	0 %	344995347
610	NC_015949	CGA	2	6	26167	26172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995347
611	NC_015949	AT	4	8	26186	26193	50 %	50 %	0 %	0 %	344995347
612	NC_015949	TAC	2	6	26194	26199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344995347
613	NC_015949	CAT	2	6	26208	26213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344995347
614	NC_015949	TATT	2	8	26335	26342	25 %	75 %	0 %	0 %	344995347
615	NC_015949	T	6	6	26345	26350	0 %	100 %	0 %	0 %	344995347
616	NC_015949	CAA	2	6	26442	26447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995347
617	NC_015949	CCAACA	3	18	26459	26476	50 %	0 %	0 %	50 %	344995347
618	NC_015949	CCGACA	2	12	26477	26488	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344995347
619	NC_015949	GACGGT	2	12	26527	26538	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344995347
620	NC_015949	ACCGAC	2	12	26542	26553	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344995347
621	NC_015949	GTACA	2	10	26594	26603	40 %	20 %	20 %	20 %	344995347
622	NC_015949	TGGA	2	8	26718	26725	25 %	25 %	50 %	0 %	344995347
623	NC_015949	TAT	2	6	26825	26830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995347
624	NC_015949	TGGTCA	2	12	26945	26956	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344995347
625	NC_015949	ATA	2	6	26979	26984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995347
626	NC_015949	CAACAC	2	12	27078	27089	50 %	0 %	0 %	50 %	344995347
627	NC_015949	AAC	2	6	27103	27108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995347
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629	NC_015949	CTG	2	6	27180	27185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344995347
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