MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyclobacterium marinum DSM 745 chromosome

Total Repeats: 5696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015914	TGTAT	2	10	686	695	20 %	60 %	20 %	0 %	343082722
2	NC_015914	ATACG	2	10	2927	2936	40 %	20 %	20 %	20 %	343082725
3	NC_015914	AACTT	2	10	5850	5859	40 %	40 %	0 %	20 %	343082729
4	NC_015914	CTTTT	2	10	7311	7320	0 %	80 %	0 %	20 %	343082731
5	NC_015914	ATATT	2	10	7462	7471	40 %	60 %	0 %	0 %	343082731
6	NC_015914	ACTCA	2	10	8192	8201	40 %	20 %	0 %	40 %	343082732
7	NC_015914	TAAAT	2	10	9466	9475	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015914	AAGCC	2	10	9871	9880	40 %	0 %	20 %	40 %	343082734
9	NC_015914	CACTC	2	10	11497	11506	20 %	20 %	0 %	60 %	343082735
10	NC_015914	TATGA	2	10	13122	13131	40 %	40 %	20 %	0 %	343082736
11	NC_015914	AAATA	2	10	14369	14378	80 %	20 %	0 %	0 %	343082736
12	NC_015914	AATTA	2	10	15004	15013	60 %	40 %	0 %	0 %	343082737
13	NC_015914	GTTTT	2	10	15034	15043	0 %	80 %	20 %	0 %	343082737
14	NC_015914	AAAAC	2	10	15250	15259	80 %	0 %	0 %	20 %	343082737
15	NC_015914	GTATG	2	10	19046	19055	20 %	40 %	40 %	0 %	343082739
16	NC_015914	AAAAT	2	10	19682	19691	80 %	20 %	0 %	0 %	343082739
17	NC_015914	TCTTA	2	10	19728	19737	20 %	60 %	0 %	20 %	343082739
18	NC_015914	TAACT	2	10	19970	19979	40 %	40 %	0 %	20 %	343082740
19	NC_015914	CTGAA	2	10	21892	21901	40 %	20 %	20 %	20 %	343082742
20	NC_015914	AAAAC	2	10	22354	22363	80 %	0 %	0 %	20 %	343082742
21	NC_015914	AAAAT	2	10	23417	23426	80 %	20 %	0 %	0 %	343082744
22	NC_015914	ACAAT	2	10	25146	25155	60 %	20 %	0 %	20 %	343082745
23	NC_015914	CAAGC	2	10	28492	28501	40 %	0 %	20 %	40 %	343082747
24	NC_015914	CTGAA	2	10	33439	33448	40 %	20 %	20 %	20 %	343082751
25	NC_015914	TAATT	2	10	34169	34178	40 %	60 %	0 %	0 %	343082751
26	NC_015914	TTTCC	2	10	35250	35259	0 %	60 %	0 %	40 %	343082753
27	NC_015914	TGATC	2	10	35863	35872	20 %	40 %	20 %	20 %	343082753
28	NC_015914	TTGAG	2	10	36522	36531	20 %	40 %	40 %	0 %	343082754
29	NC_015914	TTTCA	2	10	37168	37177	20 %	60 %	0 %	20 %	343082754
30	NC_015914	CATGA	2	10	41921	41930	40 %	20 %	20 %	20 %	343082760
31	NC_015914	TTTTA	2	10	42276	42285	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015914	CTTCC	2	10	42602	42611	0 %	40 %	0 %	60 %	343082761
33	NC_015914	TTCTT	2	10	43246	43255	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015914	CATCC	2	10	43300	43309	20 %	20 %	0 %	60 %	343082762
35	NC_015914	GTTTT	2	10	43870	43879	0 %	80 %	20 %	0 %	343082762
36	NC_015914	TGCCT	2	10	45945	45954	0 %	40 %	20 %	40 %	343082764
37	NC_015914	AGCTT	2	10	46841	46850	20 %	40 %	20 %	20 %	343082765
38	NC_015914	ATATT	2	10	48740	48749	40 %	60 %	0 %	0 %	343082765
39	NC_015914	AGTGC	2	10	48916	48925	20 %	20 %	40 %	20 %	343082765
40	NC_015914	TTCAT	2	10	49099	49108	20 %	60 %	0 %	20 %	343082765
41	NC_015914	GAATT	2	10	49272	49281	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015914	ATTTG	2	10	49620	49629	20 %	60 %	20 %	0 %	343082766
43	NC_015914	CAAAA	2	10	50486	50495	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015914	TCAAA	2	10	52149	52158	60 %	20 %	0 %	20 %	343082768
45	NC_015914	CTTCC	2	10	53781	53790	0 %	40 %	0 %	60 %	343082768
46	NC_015914	TTCCC	2	10	55292	55301	0 %	40 %	0 %	60 %	343082769
47	NC_015914	TACTT	2	10	56409	56418	20 %	60 %	0 %	20 %	343082770
48	NC_015914	AAAGA	2	10	57491	57500	80 %	0 %	20 %	0 %	343082771
49	NC_015914	AATAG	2	10	59371	59380	60 %	20 %	20 %	0 %	343082772
50	NC_015914	AATCA	2	10	60013	60022	60 %	20 %	0 %	20 %	343082772
51	NC_015914	TTATT	2	10	60456	60465	20 %	80 %	0 %	0 %	343082772
52	NC_015914	AGATT	2	10	62208	62217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015914	ATTTT	2	10	62934	62943	20 %	80 %	0 %	0 %	343082775
54	NC_015914	ATCTA	2	10	65171	65180	40 %	40 %	0 %	20 %	343082776
55	NC_015914	TTTAG	2	10	65568	65577	20 %	60 %	20 %	0 %	343082776
56	NC_015914	CCATG	2	10	66929	66938	20 %	20 %	20 %	40 %	343082778
57	NC_015914	CTGCT	2	10	67986	67995	0 %	40 %	20 %	40 %	343082778
58	NC_015914	TCAAA	2	10	68222	68231	60 %	20 %	0 %	20 %	343082778
59	NC_015914	TTATA	2	10	68819	68828	40 %	60 %	0 %	0 %	343082778
60	NC_015914	CACCT	2	10	69772	69781	20 %	20 %	0 %	60 %	343082779
61	NC_015914	GGAAG	2	10	70073	70082	40 %	0 %	60 %	0 %	343082779
62	NC_015914	TGTAT	2	10	70368	70377	20 %	60 %	20 %	0 %	343082779
63	NC_015914	TCACC	2	10	72153	72162	20 %	20 %	0 %	60 %	343082780
64	NC_015914	CGAAC	2	10	74643	74652	40 %	0 %	20 %	40 %	343082780
65	NC_015914	ATGTA	2	10	75928	75937	40 %	40 %	20 %	0 %	343082780
66	NC_015914	TACCA	2	10	76740	76749	40 %	20 %	0 %	40 %	343082781
67	NC_015914	ATCAG	2	10	77611	77620	40 %	20 %	20 %	20 %	343082781
68	NC_015914	CAGCA	2	10	79753	79762	40 %	0 %	20 %	40 %	343082782
69	NC_015914	ATATC	2	10	79992	80001	40 %	40 %	0 %	20 %	343082782
70	NC_015914	CGTAG	2	10	83293	83302	20 %	20 %	40 %	20 %	343082788
71	NC_015914	CAGCT	2	10	83557	83566	20 %	20 %	20 %	40 %	343082789
72	NC_015914	GACCT	2	10	88019	88028	20 %	20 %	20 %	40 %	343082793
73	NC_015914	AATAC	2	10	88848	88857	60 %	20 %	0 %	20 %	343082793
74	NC_015914	GGGAA	2	10	90069	90078	40 %	0 %	60 %	0 %	343082794
75	NC_015914	AATGC	2	10	90453	90462	40 %	20 %	20 %	20 %	343082795
76	NC_015914	ATCCC	2	10	91704	91713	20 %	20 %	0 %	60 %	343082798
77	NC_015914	CAATA	2	10	98290	98299	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015914	AGTAC	2	10	98777	98786	40 %	20 %	20 %	20 %	343082812
79	NC_015914	CCATT	2	10	100247	100256	20 %	40 %	0 %	40 %	343082813
80	NC_015914	ACCCT	2	10	102090	102099	20 %	20 %	0 %	60 %	343082815
81	NC_015914	TAAAA	2	10	105181	105190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015914	AAAGA	2	10	107906	107915	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015914	AAGAA	2	10	110777	110786	80 %	0 %	20 %	0 %	343082821
84	NC_015914	AAAAG	2	10	115916	115925	80 %	0 %	20 %	0 %	343082827
85	NC_015914	TTTAG	2	10	116394	116403	20 %	60 %	20 %	0 %	343082827
86	NC_015914	TGACA	2	10	120231	120240	40 %	20 %	20 %	20 %	343082829
87	NC_015914	GGCCT	2	10	121586	121595	0 %	20 %	40 %	40 %	343082830
88	NC_015914	CGGAA	2	10	121978	121987	40 %	0 %	40 %	20 %	343082830
89	NC_015914	GTATT	2	10	122588	122597	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015914	AAATC	2	10	123454	123463	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015914	ACTCA	2	10	124192	124201	40 %	20 %	0 %	40 %	343082832
92	NC_015914	AAAGA	2	10	124626	124635	80 %	0 %	20 %	0 %	343082833
93	NC_015914	GGCTT	2	10	126815	126824	0 %	40 %	40 %	20 %	343082834
94	NC_015914	AAAAG	2	10	127443	127452	80 %	0 %	20 %	0 %	343082835
95	NC_015914	GATCT	2	10	127581	127590	20 %	40 %	20 %	20 %	343082835
96	NC_015914	GTTAA	2	10	129779	129788	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015914	TTTAC	2	10	130820	130829	20 %	60 %	0 %	20 %	343082840
98	NC_015914	TAAAA	2	10	130920	130929	80 %	20 %	0 %	0 %	343082840
99	NC_015914	GAAAA	2	10	133998	134007	80 %	0 %	20 %	0 %	343082842
100	NC_015914	CACTT	2	10	136117	136126	20 %	40 %	0 %	40 %	343082844
101	NC_015914	CAATT	2	10	136510	136519	40 %	40 %	0 %	20 %	343082844
102	NC_015914	ATCTC	2	10	139556	139565	20 %	40 %	0 %	40 %	343082847
103	NC_015914	TTAAT	2	10	139621	139630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015914	CTTTC	2	10	140250	140259	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_015914	AACTA	2	10	141339	141348	60 %	20 %	0 %	20 %	343082849
106	NC_015914	AGAAC	2	10	141349	141358	60 %	0 %	20 %	20 %	343082849
107	NC_015914	ACCAA	2	10	142666	142675	60 %	0 %	0 %	40 %	343082850
108	NC_015914	GAATG	2	10	142969	142978	40 %	20 %	40 %	0 %	343082851
109	NC_015914	CCAAC	2	10	145523	145532	40 %	0 %	0 %	60 %	343082853
110	NC_015914	AAATG	2	10	146710	146719	60 %	20 %	20 %	0 %	343082854
111	NC_015914	TGCTG	2	10	149430	149439	0 %	40 %	40 %	20 %	343082856
112	NC_015914	TTTGG	2	10	151124	151133	0 %	60 %	40 %	0 %	343082857
113	NC_015914	TTATT	2	10	156040	156049	20 %	80 %	0 %	0 %	343082860
114	NC_015914	CATCA	2	10	156467	156476	40 %	20 %	0 %	40 %	343082860
115	NC_015914	ATTGG	2	10	156794	156803	20 %	40 %	40 %	0 %	343082860
116	NC_015914	CCGGA	2	10	157786	157795	20 %	0 %	40 %	40 %	343082861
117	NC_015914	ACCTC	2	10	158836	158845	20 %	20 %	0 %	60 %	343082861
118	NC_015914	CCAAA	2	10	159904	159913	60 %	0 %	0 %	40 %	343082861
119	NC_015914	AGGTA	2	10	162108	162117	40 %	20 %	40 %	0 %	343082862
120	NC_015914	CATTC	2	10	162281	162290	20 %	40 %	0 %	40 %	343082863
121	NC_015914	ATTCC	2	10	163010	163019	20 %	40 %	0 %	40 %	343082863
122	NC_015914	TCCCT	2	10	163603	163612	0 %	40 %	0 %	60 %	343082863
123	NC_015914	AAAAG	2	10	165653	165662	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015914	CTGTA	2	10	170009	170018	20 %	40 %	20 %	20 %	343082867
125	NC_015914	TCAAA	2	10	170180	170189	60 %	20 %	0 %	20 %	343082868
126	NC_015914	AAAGA	2	10	171406	171415	80 %	0 %	20 %	0 %	343082868
127	NC_015914	TTTTC	2	10	175668	175677	0 %	80 %	0 %	20 %	343082873
128	NC_015914	TGATC	2	10	176342	176351	20 %	40 %	20 %	20 %	343082873
129	NC_015914	AGGGA	2	10	179587	179596	40 %	0 %	60 %	0 %	343082875
130	NC_015914	GTTAC	2	10	181619	181628	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015914	AAGTT	2	10	183182	183191	40 %	40 %	20 %	0 %	343082877
132	NC_015914	TCAAT	2	10	183239	183248	40 %	40 %	0 %	20 %	343082878
133	NC_015914	ACCAA	2	10	183382	183391	60 %	0 %	0 %	40 %	343082878
134	NC_015914	AATAT	2	10	184603	184612	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015914	AAACA	2	10	184639	184648	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015914	GAAAA	2	10	184786	184795	80 %	0 %	20 %	0 %	343082879
137	NC_015914	ACTTT	2	10	186396	186405	20 %	60 %	0 %	20 %	343082879
138	NC_015914	GATTT	2	10	186444	186453	20 %	60 %	20 %	0 %	343082879
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261	NC_015914	TAAAA	2	10	310784	310793	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_015914	TAGTT	2	10	311240	311249	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_015914	AAAGG	2	10	312163	312172	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_015914	ATTTT	2	10	313292	313301	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_015914	TGACT	2	10	315903	315912	20 %	40 %	20 %	20 %	343083006
266	NC_015914	GAAAA	2	10	316112	316121	80 %	0 %	20 %	0 %	343083006
267	NC_015914	TAAAT	2	10	316217	316226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_015914	GTTTT	2	10	317894	317903	0 %	80 %	20 %	0 %	343083009
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270	NC_015914	ACGAA	2	10	320640	320649	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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