MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium variabile DSM 44702 chromosome

Total Repeats: 87449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015859	AGGGG	2	10	41285	41294	20 %	0 %	80 %	0 %	340792988
1002	NC_015859	CCA	2	6	41322	41327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792988
1003	NC_015859	CCG	2	6	41343	41348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792988
1004	NC_015859	TCC	2	6	41376	41381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792988
1005	NC_015859	GGCGG	2	10	41462	41471	0 %	0 %	80 %	20 %	340792988
1006	NC_015859	CGA	2	6	41502	41507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792988
1007	NC_015859	CTCGAT	2	12	41567	41578	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340792988
1008	NC_015859	AGGC	2	8	41604	41611	25 %	0 %	50 %	25 %	340792988
1009	NC_015859	CAG	2	6	41615	41620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792988
1010	NC_015859	ACGAC	2	10	41706	41715	40 %	0 %	20 %	40 %	340792988
1011	NC_015859	CAC	2	6	41716	41721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792988
1012	NC_015859	CCG	2	6	41745	41750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792988
1013	NC_015859	TGC	2	6	41778	41783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792988
1014	NC_015859	CATGA	2	10	41813	41822	40 %	20 %	20 %	20 %	340792988
1015	NC_015859	TGCCT	2	10	41922	41931	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1016	NC_015859	GAG	2	6	41972	41977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015859	CTGAC	2	10	41989	41998	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1018	NC_015859	GCC	2	6	42004	42009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_015859	GCTCAC	2	12	42053	42064	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_015859	TCG	2	6	42072	42077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_015859	GAC	3	9	42081	42089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792989
1022	NC_015859	TCG	2	6	42102	42107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792989
1023	NC_015859	AGA	2	6	42110	42115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792989
1024	NC_015859	GGA	2	6	42190	42195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792989
1025	NC_015859	CAT	2	6	42237	42242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792989
1026	NC_015859	AGG	2	6	42293	42298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792989
1027	NC_015859	CCTCCG	2	12	42341	42352	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	340792989
1028	NC_015859	CGC	2	6	42384	42389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792989
1029	NC_015859	GCCA	2	8	42412	42419	25 %	0 %	25 %	50 %	340792989
1030	NC_015859	ACG	2	6	42440	42445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792989
1031	NC_015859	ACT	2	6	42548	42553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792989
1032	NC_015859	TGC	2	6	42597	42602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792989
1033	NC_015859	CGA	2	6	42660	42665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792989
1034	NC_015859	CCG	2	6	42671	42676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792989
1035	NC_015859	CGA	2	6	42684	42689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792989
1036	NC_015859	CCG	3	9	42692	42700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792989
1037	NC_015859	TCA	2	6	42710	42715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792989
1038	NC_015859	CGA	2	6	42738	42743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792989
1039	NC_015859	AGG	2	6	42785	42790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792989
1040	NC_015859	TCC	2	6	42803	42808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792989
1041	NC_015859	ACA	2	6	42809	42814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340792989
1042	NC_015859	GAG	2	6	42862	42867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792989
1043	NC_015859	CTG	2	6	42946	42951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792989
1044	NC_015859	CGG	2	6	42963	42968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792989
1045	NC_015859	CGA	2	6	42969	42974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792989
1046	NC_015859	TCT	2	6	43053	43058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_015859	CTG	2	6	43083	43088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015859	TAA	2	6	43120	43125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340792990
1049	NC_015859	CGG	2	6	43141	43146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792990
1050	NC_015859	TGC	2	6	43147	43152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792990
1051	NC_015859	CGA	2	6	43219	43224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792990
1052	NC_015859	CGC	2	6	43243	43248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792990
1053	NC_015859	CAT	2	6	43261	43266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792990
1054	NC_015859	GAG	2	6	43304	43309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792990
1055	NC_015859	ACA	2	6	43359	43364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340792990
1056	NC_015859	CAT	2	6	43372	43377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792990
1057	NC_015859	AGC	2	6	43398	43403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792990
1058	NC_015859	CGGC	2	8	43404	43411	0 %	0 %	50 %	50 %	340792990
1059	NC_015859	CCA	2	6	43488	43493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792990
1060	NC_015859	GAC	2	6	43622	43627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792990
1061	NC_015859	CGT	2	6	43633	43638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792990
1062	NC_015859	CAT	2	6	43642	43647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792990
1063	NC_015859	CCA	2	6	43692	43697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792990
1064	NC_015859	GAA	2	6	43762	43767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792990
1065	NC_015859	AGCGTC	2	12	43776	43787	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340792990
1066	NC_015859	ACT	2	6	43791	43796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792990
1067	NC_015859	CCGC	2	8	43830	43837	0 %	0 %	25 %	75 %	340792990
1068	NC_015859	GCTCCG	2	12	43841	43852	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340792990
1069	NC_015859	GTC	2	6	43853	43858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792990
1070	NC_015859	CAA	2	6	43867	43872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340792990
1071	NC_015859	ATC	2	6	43874	43879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792990
1072	NC_015859	AC	3	6	43937	43942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_015859	CGC	2	6	43950	43955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_015859	CTA	2	6	44001	44006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792991
1075	NC_015859	CTG	2	6	44057	44062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792991
1076	NC_015859	CCT	3	9	44120	44128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792991
1077	NC_015859	GCT	2	6	44132	44137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792991
1078	NC_015859	CCT	2	6	44144	44149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792991
1079	NC_015859	GC	3	6	44213	44218	0 %	0 %	50 %	50 %	340792991
1080	NC_015859	CAG	2	6	44231	44236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792991
1081	NC_015859	GTC	2	6	44262	44267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792991
1082	NC_015859	TCG	2	6	44275	44280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792991
1083	NC_015859	CCG	2	6	44306	44311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792991
1084	NC_015859	CCA	2	6	44361	44366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792991
1085	NC_015859	CAT	2	6	44373	44378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792991
1086	NC_015859	GAT	3	9	44382	44390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340792991
1087	NC_015859	GAACG	2	10	44397	44406	40 %	0 %	40 %	20 %	340792991
1088	NC_015859	CCG	2	6	44452	44457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792991
1089	NC_015859	AGC	2	6	44461	44466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792991
1090	NC_015859	GAT	2	6	44502	44507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340792991
1091	NC_015859	CG	3	6	44529	44534	0 %	0 %	50 %	50 %	340792991
1092	NC_015859	CAC	2	6	44559	44564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792991
1093	NC_015859	GAA	2	6	44589	44594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792991
1094	NC_015859	CAC	2	6	44598	44603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792991
1095	NC_015859	CAC	2	6	44613	44618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792991
1096	NC_015859	TC	3	6	44672	44677	0 %	50 %	0 %	50 %	340792991
1097	NC_015859	CCA	2	6	44862	44867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792991
1098	NC_015859	CAG	2	6	44874	44879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792991
1099	NC_015859	GGT	2	6	44880	44885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340792991
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1101	NC_015859	CTCG	2	8	44919	44926	0 %	25 %	25 %	50 %	340792991
1102	NC_015859	ATGTTG	2	12	45052	45063	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	340792991
1103	NC_015859	CAG	2	6	45066	45071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792991
1104	NC_015859	GAT	2	6	45105	45110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340792991
1105	NC_015859	GAC	2	6	45114	45119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792991
1106	NC_015859	CCA	2	6	45137	45142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792991
1107	NC_015859	CGA	2	6	45143	45148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792991
1108	NC_015859	GCG	2	6	45256	45261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792991
1109	NC_015859	GAT	2	6	45267	45272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340792991
1110	NC_015859	GGT	2	6	45354	45359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340792991
1111	NC_015859	GCC	2	6	45459	45464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792991
1112	NC_015859	CGTC	2	8	45470	45477	0 %	25 %	25 %	50 %	340792991
1113	NC_015859	CGG	3	9	45480	45488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792991
1114	NC_015859	TGC	2	6	45499	45504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792991
1115	NC_015859	AGA	2	6	45524	45529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792991
1116	NC_015859	CGG	2	6	45548	45553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792991
1117	NC_015859	ACC	2	6	45706	45711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792991
1118	NC_015859	TGG	2	6	45722	45727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340792991
1119	NC_015859	TTCGTG	2	12	45829	45840	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1120	NC_015859	TGGA	2	8	45874	45881	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015859	GGC	2	6	45894	45899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_015859	CTT	2	6	45900	45905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_015859	TTCTC	2	10	45959	45968	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1124	NC_015859	CTC	2	6	45993	45998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_015859	GT	3	6	46005	46010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1249	NC_015859	GACCG	2	10	50360	50369	20 %	0 %	40 %	40 %	340792996
1250	NC_015859	GCA	2	6	50437	50442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792996
1251	NC_015859	CAG	2	6	50468	50473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792996
1252	NC_015859	GACG	2	8	50477	50484	25 %	0 %	50 %	25 %	340792996
1253	NC_015859	GCG	2	6	50501	50506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792996
1254	NC_015859	ACC	2	6	50547	50552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792996
1255	NC_015859	TGA	2	6	50554	50559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340792996
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1257	NC_015859	TG	3	6	50605	50610	0 %	50 %	50 %	0 %	340792996
1258	NC_015859	AGGT	2	8	50625	50632	25 %	25 %	50 %	0 %	340792996
1259	NC_015859	ACG	2	6	50641	50646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792996
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1281	NC_015859	CGG	2	6	51319	51324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792996
1282	NC_015859	CAT	2	6	51371	51376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792996
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1292	NC_015859	GTC	3	9	51568	51576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1293	NC_015859	CGT	2	6	51618	51623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1294	NC_015859	CGT	2	6	51652	51657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1356	NC_015859	CCG	2	6	54060	54065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792998
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1361	NC_015859	GCT	2	6	54239	54244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792998
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1364	NC_015859	GTG	2	6	54351	54356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1365	NC_015859	GTGGGG	2	12	54362	54373	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
1366	NC_015859	A	6	6	54374	54379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1367	NC_015859	GAT	2	6	54511	54516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340792999
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1370	NC_015859	GCA	2	6	54618	54623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792999
1371	NC_015859	CACGGT	2	12	54634	54645	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340792999
1372	NC_015859	CGA	2	6	54681	54686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792999
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1374	NC_015859	TGCG	2	8	54843	54850	0 %	25 %	50 %	25 %	340792999
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1499	NC_015859	GCT	2	6	60496	60501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1500	NC_015859	CGG	2	6	60505	60510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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