MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium variabile DSM 44702 chromosome

Total Repeats: 87449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015859	CGA	2	6	195629	195634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793123
5002	NC_015859	TCA	2	6	195652	195657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340793123
5003	NC_015859	GGCGCC	2	12	195675	195686	0 %	0 %	50 %	50 %	340793123
5004	NC_015859	TGC	2	6	195709	195714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793123
5005	NC_015859	TGC	2	6	195724	195729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793123
5006	NC_015859	TCG	2	6	195766	195771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793123
5007	NC_015859	GCGGT	2	10	195772	195781	0 %	20 %	60 %	20 %	340793123
5008	NC_015859	AC	3	6	195850	195855	50 %	0 %	0 %	50 %	340793123
5009	NC_015859	GTG	3	9	195870	195878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340793123
5010	NC_015859	CGC	2	6	195881	195886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340793123
5011	NC_015859	TCA	3	9	195898	195906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340793123
5012	NC_015859	CCT	2	6	195908	195913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340793123
5013	NC_015859	AGA	2	6	195973	195978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340793123
5014	NC_015859	GAA	2	6	195992	195997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340793123
5015	NC_015859	CAC	2	6	196126	196131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340793124
5016	NC_015859	GCT	2	6	196138	196143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793124
5017	NC_015859	CG	3	6	196200	196205	0 %	0 %	50 %	50 %	340793124
5018	NC_015859	TCG	2	6	196254	196259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793124
5019	NC_015859	GTC	2	6	196265	196270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793124
5020	NC_015859	GGA	2	6	196307	196312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340793124
5021	NC_015859	GGCT	2	8	196319	196326	0 %	25 %	50 %	25 %	340793124
5022	NC_015859	TCA	2	6	196335	196340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340793124
5023	NC_015859	TCG	2	6	196347	196352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793124
5024	NC_015859	CTG	3	9	196376	196384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793124
5025	NC_015859	ATC	2	6	196397	196402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340793124
5026	NC_015859	CTG	2	6	196403	196408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793124
5027	NC_015859	CGC	2	6	196426	196431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340793124
5028	NC_015859	GCC	3	9	196499	196507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340793124
5029	NC_015859	TCG	2	6	196512	196517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793124
5030	NC_015859	GCC	2	6	196520	196525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340793124
5031	NC_015859	CGG	2	6	196534	196539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793124
5032	NC_015859	CTGGCC	2	12	196595	196606	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340793124
5033	NC_015859	CGC	2	6	196671	196676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340793124
5034	NC_015859	ATC	2	6	196697	196702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340793124
5035	NC_015859	CCT	2	6	196728	196733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340793124
5036	NC_015859	GTCC	2	8	196741	196748	0 %	25 %	25 %	50 %	340793124
5037	NC_015859	TCG	2	6	196770	196775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793124
5038	NC_015859	CCA	2	6	196782	196787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340793124
5039	NC_015859	CGG	2	6	196816	196821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793124
5040	NC_015859	GAC	2	6	196861	196866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5041	NC_015859	CTG	2	6	196904	196909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5042	NC_015859	TGC	2	6	196929	196934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5043	NC_015859	GCT	2	6	196938	196943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5044	NC_015859	GTG	2	6	196982	196987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340793125
5045	NC_015859	GAA	2	6	197001	197006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340793125
5046	NC_015859	TCCGGC	2	12	197056	197067	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340793125
5047	NC_015859	CTG	2	6	197098	197103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5048	NC_015859	ACC	2	6	197152	197157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340793125
5049	NC_015859	GCA	2	6	197180	197185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5050	NC_015859	AAC	2	6	197224	197229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340793125
5051	NC_015859	GTCCGC	2	12	197304	197315	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340793125
5052	NC_015859	GC	3	6	197314	197319	0 %	0 %	50 %	50 %	340793125
5053	NC_015859	AAG	3	9	197320	197328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340793125
5054	NC_015859	AGC	2	6	197414	197419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5055	NC_015859	GC	3	6	197418	197423	0 %	0 %	50 %	50 %	340793125
5056	NC_015859	CGC	2	6	197430	197435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340793125
5057	NC_015859	TCA	2	6	197459	197464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340793125
5058	NC_015859	CGA	2	6	197477	197482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5059	NC_015859	CTG	2	6	197521	197526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5060	NC_015859	TCA	2	6	197564	197569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340793125
5061	NC_015859	TCGCCG	2	12	197579	197590	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340793125
5062	NC_015859	TCG	2	6	197609	197614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5063	NC_015859	GTG	2	6	197624	197629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340793125
5064	NC_015859	CGAC	2	8	197648	197655	25 %	0 %	25 %	50 %	340793125
5065	NC_015859	CGC	2	6	197689	197694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340793125
5066	NC_015859	CCGGC	2	10	197745	197754	0 %	0 %	40 %	60 %	340793125
5067	NC_015859	GCT	2	6	197775	197780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5068	NC_015859	GAC	2	6	197818	197823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5069	NC_015859	TCG	2	6	197828	197833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5070	NC_015859	GAT	2	6	197839	197844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340793125
5071	NC_015859	CGC	2	6	197859	197864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340793125
5072	NC_015859	GAT	2	6	197922	197927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340793125
5073	NC_015859	CGA	2	6	197982	197987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5074	NC_015859	CGC	2	6	198013	198018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340793125
5075	NC_015859	GCG	2	6	198024	198029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793125
5076	NC_015859	GCG	2	6	198222	198227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793125
5077	NC_015859	GGT	2	6	198244	198249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340793125
5078	NC_015859	CAGCGC	2	12	198250	198261	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340793125
5079	NC_015859	GTG	2	6	198301	198306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340793125
5080	NC_015859	GGT	2	6	198423	198428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340793125
5081	NC_015859	TGA	2	6	198455	198460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340793125
5082	NC_015859	GGC	2	6	198467	198472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793125
5083	NC_015859	CTG	2	6	198535	198540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793125
5084	NC_015859	ACCGCT	2	12	198557	198568	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340793125
5085	NC_015859	TG	3	6	198622	198627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_015859	GACA	2	8	198689	198696	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5087	NC_015859	GTC	2	6	198792	198797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793126
5088	NC_015859	TCG	2	6	198820	198825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793126
5089	NC_015859	CGG	2	6	198887	198892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793126
5090	NC_015859	CTT	2	6	198936	198941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340793126
5091	NC_015859	CGAC	2	8	198966	198973	25 %	0 %	25 %	50 %	340793126
5092	NC_015859	CGT	2	6	198980	198985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793126
5093	NC_015859	CCA	2	6	199059	199064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340793126
5094	NC_015859	GTGC	2	8	199112	199119	0 %	25 %	50 %	25 %	340793126
5095	NC_015859	GCG	2	6	199142	199147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793126
5096	NC_015859	ATG	2	6	199148	199153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340793126
5097	NC_015859	GTG	2	6	199154	199159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340793126
5098	NC_015859	GGC	2	6	199210	199215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793126
5099	NC_015859	CGC	2	6	199232	199237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340793126
5100	NC_015859	GCA	2	6	199301	199306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793127
5101	NC_015859	GCA	2	6	199310	199315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793127
5102	NC_015859	GCA	2	6	199319	199324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793127
5103	NC_015859	TCGGCG	2	12	199325	199336	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340793127
5104	NC_015859	TCA	2	6	199431	199436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340793127
5105	NC_015859	TCG	2	6	199479	199484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793127
5106	NC_015859	TCG	2	6	199494	199499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793127
5107	NC_015859	CGG	3	9	199585	199593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793127
5108	NC_015859	GC	3	6	199626	199631	0 %	0 %	50 %	50 %	340793127
5109	NC_015859	GGCG	2	8	199645	199652	0 %	0 %	75 %	25 %	340793127
5110	NC_015859	GTG	2	6	199743	199748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340793127
5111	NC_015859	CTTCG	2	10	199778	199787	0 %	40 %	20 %	40 %	340793127
5112	NC_015859	CGG	2	6	199888	199893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793127
5113	NC_015859	CGG	2	6	199902	199907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793127
5114	NC_015859	CGG	2	6	199920	199925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793127
5115	NC_015859	CTC	2	6	199931	199936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340793127
5116	NC_015859	TG	3	6	199964	199969	0 %	50 %	50 %	0 %	340793127
5117	NC_015859	TCG	2	6	200001	200006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793127
5118	NC_015859	GCG	2	6	200010	200015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793127
5119	NC_015859	TGC	2	6	200038	200043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793127
5120	NC_015859	GTG	2	6	200053	200058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340793127
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5242	NC_015859	CTT	2	6	204561	204566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340793130
5243	NC_015859	TCC	2	6	204690	204695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340793130
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5247	NC_015859	CGG	2	6	204992	204997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5251	NC_015859	CGT	2	6	205105	205110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5253	NC_015859	CGCCAG	2	12	205221	205232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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5256	NC_015859	TCG	2	6	205355	205360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5258	NC_015859	CTG	2	6	205390	205395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5261	NC_015859	GCT	2	6	205503	205508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5277	NC_015859	GCCTG	2	10	205955	205964	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5371	NC_015859	CCGA	2	8	209594	209601	25 %	0 %	25 %	50 %	340793131
5372	NC_015859	CGA	3	9	209628	209636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793131
5373	NC_015859	CG	3	6	209837	209842	0 %	0 %	50 %	50 %	340793131
5374	NC_015859	GGT	2	6	209947	209952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340793131
5375	NC_015859	GCA	2	6	209980	209985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793131
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5378	NC_015859	GCC	2	6	210070	210075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340793131
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5382	NC_015859	GGA	2	6	210229	210234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340793131
5383	NC_015859	CGC	2	6	210288	210293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340793131
5384	NC_015859	TCG	2	6	210297	210302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793131
5385	NC_015859	GACGGC	2	12	210308	210319	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340793131
5386	NC_015859	ACG	2	6	210321	210326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793131
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5389	NC_015859	TACGGC	2	12	210386	210397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340793131
5390	NC_015859	GTT	2	6	210418	210423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5391	NC_015859	CGG	2	6	210473	210478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5392	NC_015859	CCG	2	6	210493	210498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5393	NC_015859	GCT	2	6	210555	210560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793132
5394	NC_015859	GAG	2	6	210572	210577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340793132
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5396	NC_015859	CGA	2	6	210639	210644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793132
5397	NC_015859	CGA	2	6	210678	210683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793132
5398	NC_015859	CAG	2	6	210691	210696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793132
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5400	NC_015859	AC	3	6	210774	210779	50 %	0 %	0 %	50 %	340793132
5401	NC_015859	GGC	2	6	210781	210786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793132
5402	NC_015859	GGC	2	6	210790	210795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793132
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5405	NC_015859	CGG	3	9	210888	210896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793132
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5422	NC_015859	TCGCC	2	10	211582	211591	0 %	20 %	20 %	60 %	340793133
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5424	NC_015859	CGG	2	6	211645	211650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793133
5425	NC_015859	GTA	2	6	211676	211681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340793133
5426	NC_015859	GCT	2	6	211694	211699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793133
5427	NC_015859	GGTCG	2	10	211700	211709	0 %	20 %	60 %	20 %	340793133
5428	NC_015859	GCT	2	6	211736	211741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5429	NC_015859	TCAT	2	8	211773	211780	25 %	50 %	0 %	25 %	340793134
5430	NC_015859	CGA	2	6	211805	211810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793134
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5432	NC_015859	CGA	3	9	211946	211954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793134
5433	NC_015859	TCC	2	6	211959	211964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340793134
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5436	NC_015859	GA	3	6	212089	212094	50 %	0 %	50 %	0 %	340793134
5437	NC_015859	CGA	2	6	212141	212146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793134
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5441	NC_015859	CG	3	6	212482	212487	0 %	0 %	50 %	50 %	340793135
5442	NC_015859	CCG	2	6	212495	212500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340793135
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5444	NC_015859	CAG	2	6	212544	212549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340793135
5445	NC_015859	GTC	2	6	212550	212555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793135
5446	NC_015859	GAACTC	2	12	212586	212597	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340793135
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5449	NC_015859	CGAACC	2	12	212693	212704	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	340793135
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5487	NC_015859	CCG	3	9	214206	214214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5488	NC_015859	GGA	2	6	214289	214294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340793136
5489	NC_015859	C	6	6	214315	214320	0 %	0 %	0 %	100 %	340793136
5490	NC_015859	CCG	2	6	214366	214371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340793136
5491	NC_015859	CGGT	2	8	214408	214415	0 %	25 %	50 %	25 %	340793136
5492	NC_015859	TCG	2	6	214450	214455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793136
5493	NC_015859	CG	3	6	214501	214506	0 %	0 %	50 %	50 %	340793136
5494	NC_015859	TCC	2	6	214512	214517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340793136
5495	NC_015859	CTG	2	6	214524	214529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793136
5496	NC_015859	GGC	2	6	214544	214549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793136
5497	NC_015859	GTG	2	6	214647	214652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340793136
5498	NC_015859	CGG	3	9	214658	214666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793136
5499	NC_015859	GTC	2	6	214674	214679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340793136
5500	NC_015859	CGG	2	6	214706	214711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340793136

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