MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Collimonas fungivorans Ter331 chromosome

Total Repeats: 124237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015856	CAT	2	6	22372	22377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785210
502	NC_015856	TGC	2	6	22435	22440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785210
503	NC_015856	GTC	2	6	22462	22467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785210
504	NC_015856	TGG	2	6	22470	22475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785210
505	NC_015856	GC	3	6	22501	22506	0 %	0 %	50 %	50 %	340785210
506	NC_015856	AAGG	2	8	22511	22518	50 %	0 %	50 %	0 %	340785210
507	NC_015856	CGT	2	6	22620	22625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785210
508	NC_015856	CAG	2	6	22647	22652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785210
509	NC_015856	TAA	2	6	22667	22672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340785210
510	NC_015856	CTA	2	6	22830	22835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785210
511	NC_015856	CTC	2	6	22879	22884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340785210
512	NC_015856	TCG	2	6	22985	22990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785210
513	NC_015856	GTC	2	6	23005	23010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785210
514	NC_015856	CAG	2	6	23014	23019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785210
515	NC_015856	GT	3	6	23024	23029	0 %	50 %	50 %	0 %	340785210
516	NC_015856	GATG	2	8	23037	23044	25 %	25 %	50 %	0 %	340785210
517	NC_015856	A	6	6	23065	23070	100 %	0 %	0 %	0 %	340785210
518	NC_015856	GGC	2	6	23074	23079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785210
519	NC_015856	CTT	2	6	23146	23151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785210
520	NC_015856	TGC	2	6	23216	23221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785210
521	NC_015856	TTGT	2	8	23231	23238	0 %	75 %	25 %	0 %	340785210
522	NC_015856	GCA	2	6	23271	23276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785210
523	NC_015856	TCAT	2	8	23354	23361	25 %	50 %	0 %	25 %	340785210
524	NC_015856	TGA	2	6	23393	23398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785210
525	NC_015856	TGT	2	6	23403	23408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340785210
526	NC_015856	TA	3	6	23458	23463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015856	GAT	2	6	23495	23500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015856	TTTG	2	8	23594	23601	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015856	CAT	2	6	23657	23662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015856	AGA	2	6	23743	23748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015856	CAT	2	6	23926	23931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_015856	GCT	2	6	23995	24000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785211
533	NC_015856	CGC	3	9	24096	24104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785211
534	NC_015856	GCC	2	6	24118	24123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785211
535	NC_015856	CG	3	6	24158	24163	0 %	0 %	50 %	50 %	340785211
536	NC_015856	CAT	2	6	24234	24239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785211
537	NC_015856	CCA	2	6	24326	24331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785211
538	NC_015856	CGCC	2	8	24338	24345	0 %	0 %	25 %	75 %	340785211
539	NC_015856	GC	3	6	24356	24361	0 %	0 %	50 %	50 %	340785211
540	NC_015856	ATCC	2	8	24366	24373	25 %	25 %	0 %	50 %	340785211
541	NC_015856	GCA	2	6	24391	24396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785211
542	NC_015856	CCA	2	6	24398	24403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785211
543	NC_015856	GCG	2	6	24415	24420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785211
544	NC_015856	GGC	3	9	24486	24494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785211
545	NC_015856	GCCA	2	8	24550	24557	25 %	0 %	25 %	50 %	340785211
546	NC_015856	ATG	2	6	24574	24579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785211
547	NC_015856	GC	3	6	24607	24612	0 %	0 %	50 %	50 %	340785212
548	NC_015856	GCC	2	6	24627	24632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785212
549	NC_015856	CGC	2	6	24694	24699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785212
550	NC_015856	CAT	2	6	24719	24724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785212
551	NC_015856	CAT	2	6	24737	24742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785212
552	NC_015856	CGC	2	6	24751	24756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785212
553	NC_015856	CGT	2	6	24793	24798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785212
554	NC_015856	GCG	2	6	24994	24999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785212
555	NC_015856	CG	3	6	24998	25003	0 %	0 %	50 %	50 %	340785212
556	NC_015856	AGC	2	6	25078	25083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785212
557	NC_015856	TCC	2	6	25095	25100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340785212
558	NC_015856	TGC	2	6	25122	25127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785212
559	NC_015856	CAG	2	6	25130	25135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785212
560	NC_015856	GGC	3	9	25138	25146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785212
561	NC_015856	CGG	2	6	25180	25185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785212
562	NC_015856	GC	4	8	25225	25232	0 %	0 %	50 %	50 %	340785212
563	NC_015856	CG	3	6	25276	25281	0 %	0 %	50 %	50 %	340785212
564	NC_015856	CAG	2	6	25283	25288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785212
565	NC_015856	GCTC	2	8	25297	25304	0 %	25 %	25 %	50 %	340785212
566	NC_015856	GAT	2	6	25330	25335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785212
567	NC_015856	ATG	2	6	25391	25396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015856	TCCA	2	8	25407	25414	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_015856	GGAT	2	8	25470	25477	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015856	GCC	2	6	25536	25541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785213
571	NC_015856	CAC	2	6	25655	25660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785213
572	NC_015856	CAG	2	6	25697	25702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785213
573	NC_015856	GC	3	6	25770	25775	0 %	0 %	50 %	50 %	340785213
574	NC_015856	GC	3	6	25865	25870	0 %	0 %	50 %	50 %	340785213
575	NC_015856	TGC	2	6	25873	25878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785213
576	NC_015856	GGCG	2	8	25883	25890	0 %	0 %	75 %	25 %	340785213
577	NC_015856	TCG	2	6	26013	26018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785213
578	NC_015856	GCG	2	6	26095	26100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785213
579	NC_015856	TTGA	2	8	26149	26156	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015856	GTG	2	6	26219	26224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015856	GCT	2	6	26262	26267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785214
582	NC_015856	CGC	2	6	26274	26279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785214
583	NC_015856	GC	3	6	26283	26288	0 %	0 %	50 %	50 %	340785214
584	NC_015856	TGCCGC	2	12	26293	26304	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340785214
585	NC_015856	CGC	4	12	26302	26313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785214
586	NC_015856	GGC	2	6	26364	26369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785214
587	NC_015856	GCG	2	6	26411	26416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785214
588	NC_015856	TCG	2	6	26427	26432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785214
589	NC_015856	GGA	2	6	26509	26514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340785214
590	NC_015856	GATC	2	8	26530	26537	25 %	25 %	25 %	25 %	340785214
591	NC_015856	TGG	2	6	26538	26543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785214
592	NC_015856	CCCA	2	8	26565	26572	25 %	0 %	0 %	75 %	340785214
593	NC_015856	GATC	2	8	26656	26663	25 %	25 %	25 %	25 %	340785214
594	NC_015856	GCT	2	6	26674	26679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785214
595	NC_015856	GGTG	2	8	26695	26702	0 %	25 %	75 %	0 %	340785214
596	NC_015856	CG	3	6	26743	26748	0 %	0 %	50 %	50 %	340785214
597	NC_015856	CGC	2	6	26755	26760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785214
598	NC_015856	GGC	2	6	26795	26800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785214
599	NC_015856	CGT	2	6	26815	26820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785214
600	NC_015856	GC	3	6	26885	26890	0 %	0 %	50 %	50 %	340785214
601	NC_015856	GC	3	6	26965	26970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_015856	GCG	2	6	26977	26982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_015856	GCG	2	6	27012	27017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785215
604	NC_015856	GCG	3	9	27049	27057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785215
605	NC_015856	CAGC	2	8	27059	27066	25 %	0 %	25 %	50 %	340785215
606	NC_015856	CGCC	2	8	27077	27084	0 %	0 %	25 %	75 %	340785215
607	NC_015856	GC	4	8	27124	27131	0 %	0 %	50 %	50 %	340785215
608	NC_015856	GCTG	2	8	27142	27149	0 %	25 %	50 %	25 %	340785215
609	NC_015856	AGC	2	6	27201	27206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785215
610	NC_015856	GCC	2	6	27207	27212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785215
611	NC_015856	GCG	2	6	27238	27243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785215
612	NC_015856	CAG	2	6	27245	27250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785215
613	NC_015856	GC	3	6	27258	27263	0 %	0 %	50 %	50 %	340785215
614	NC_015856	CG	4	8	27289	27296	0 %	0 %	50 %	50 %	340785215
615	NC_015856	GC	3	6	27359	27364	0 %	0 %	50 %	50 %	340785215
616	NC_015856	GT	3	6	27368	27373	0 %	50 %	50 %	0 %	340785215
617	NC_015856	TCG	2	6	27375	27380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785215
618	NC_015856	TCAA	2	8	27405	27412	50 %	25 %	0 %	25 %	340785215
619	NC_015856	GC	4	8	27451	27458	0 %	0 %	50 %	50 %	340785215
620	NC_015856	GGCA	2	8	27526	27533	25 %	0 %	50 %	25 %	340785215
621	NC_015856	TCA	2	6	27573	27578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785215
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624	NC_015856	CAG	2	6	27662	27667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785215
625	NC_015856	GCC	2	6	27714	27719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785215
626	NC_015856	CAGC	2	8	27763	27770	25 %	0 %	25 %	50 %	340785215
627	NC_015856	CCG	2	6	27778	27783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785215
628	NC_015856	CGG	2	6	27791	27796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785215
629	NC_015856	TCG	2	6	27837	27842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785215
630	NC_015856	AGC	2	6	27852	27857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785215
631	NC_015856	GC	3	6	27866	27871	0 %	0 %	50 %	50 %	340785215
632	NC_015856	GC	3	6	27945	27950	0 %	0 %	50 %	50 %	340785215
633	NC_015856	CCTCGG	2	12	27985	27996	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340785215
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645	NC_015856	CGG	2	6	28248	28253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_015856	TGA	2	6	28256	28261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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661	NC_015856	AAT	2	6	29072	29077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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663	NC_015856	ATGC	2	8	29145	29152	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
664	NC_015856	GCT	2	6	29160	29165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
665	NC_015856	GGCG	2	8	29214	29221	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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746	NC_015856	TCG	2	6	32356	32361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
747	NC_015856	T	7	7	32362	32368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
748	NC_015856	CTG	2	6	32382	32387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
749	NC_015856	TTG	2	6	32409	32414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
750	NC_015856	GGA	2	6	32430	32435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
751	NC_015856	GGC	2	6	32442	32447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
752	NC_015856	GC	3	6	32446	32451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
753	NC_015856	ATG	2	6	32459	32464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
754	NC_015856	AGGC	2	8	32478	32485	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
755	NC_015856	ATTG	2	8	32534	32541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
756	NC_015856	GCG	2	6	32552	32557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
757	NC_015856	CGG	2	6	32679	32684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
758	NC_015856	CAAAA	2	10	32709	32718	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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760	NC_015856	TGC	2	6	32820	32825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785218
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