MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Collimonas fungivorans Ter331 chromosome

Total Repeats: 124237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015856	CG	4	8	210536	210543	0 %	0 %	50 %	50 %	340785371
5002	NC_015856	CGC	2	6	210578	210583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785371
5003	NC_015856	AAG	3	9	210720	210728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785371
5004	NC_015856	GAC	2	6	210735	210740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785371
5005	NC_015856	CGCGC	2	10	210741	210750	0 %	0 %	40 %	60 %	340785371
5006	NC_015856	GC	3	6	210762	210767	0 %	0 %	50 %	50 %	340785371
5007	NC_015856	GC	3	6	210834	210839	0 %	0 %	50 %	50 %	340785371
5008	NC_015856	GAC	2	6	210849	210854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785371
5009	NC_015856	CAT	2	6	210963	210968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785371
5010	NC_015856	CGCC	2	8	210974	210981	0 %	0 %	25 %	75 %	340785371
5011	NC_015856	CG	4	8	211040	211047	0 %	0 %	50 %	50 %	340785371
5012	NC_015856	GCG	2	6	211060	211065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785371
5013	NC_015856	ACG	2	6	211099	211104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785371
5014	NC_015856	GGT	2	6	211118	211123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785371
5015	NC_015856	CAA	4	12	211127	211138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785371
5016	NC_015856	CTG	2	6	211161	211166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785371
5017	NC_015856	CGA	2	6	211172	211177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785371
5018	NC_015856	TGC	2	6	211264	211269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785371
5019	NC_015856	GAA	2	6	211317	211322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785371
5020	NC_015856	GCG	2	6	211357	211362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785371
5021	NC_015856	GCC	2	6	211370	211375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785371
5022	NC_015856	CTG	2	6	211380	211385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785371
5023	NC_015856	GC	5	10	211397	211406	0 %	0 %	50 %	50 %	340785371
5024	NC_015856	CCA	2	6	211426	211431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785371
5025	NC_015856	CCGGC	2	10	211441	211450	0 %	0 %	40 %	60 %	340785371
5026	NC_015856	GCA	2	6	211486	211491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785371
5027	NC_015856	GCA	2	6	211517	211522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785371
5028	NC_015856	GCT	2	6	211529	211534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785371
5029	NC_015856	TTA	2	6	211616	211621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340785371
5030	NC_015856	GATGCC	2	12	211647	211658	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340785371
5031	NC_015856	CAA	2	6	211739	211744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785371
5032	NC_015856	TCG	2	6	211915	211920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_015856	GCG	2	6	211922	211927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_015856	ATTTT	2	10	211939	211948	20 %	80 %	0 %	0 %	340785372
5035	NC_015856	T	6	6	211945	211950	0 %	100 %	0 %	0 %	340785372
5036	NC_015856	GCC	2	6	212002	212007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785372
5037	NC_015856	ACGC	2	8	212035	212042	25 %	0 %	25 %	50 %	340785372
5038	NC_015856	CG	3	6	212187	212192	0 %	0 %	50 %	50 %	340785372
5039	NC_015856	GCC	3	9	212246	212254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785372
5040	NC_015856	TTG	2	6	212279	212284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340785372
5041	NC_015856	GCCG	2	8	212317	212324	0 %	0 %	50 %	50 %	340785372
5042	NC_015856	TCG	2	6	212348	212353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785372
5043	NC_015856	GCC	2	6	212356	212361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785372
5044	NC_015856	CGA	2	6	212406	212411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785372
5045	NC_015856	GCA	2	6	212415	212420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785372
5046	NC_015856	CAG	2	6	212434	212439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785372
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5048	NC_015856	CGT	2	6	212452	212457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785372
5049	NC_015856	CGC	2	6	212520	212525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785372
5050	NC_015856	GGC	2	6	212569	212574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785372
5051	NC_015856	GCT	2	6	212695	212700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785372
5052	NC_015856	GC	4	8	212727	212734	0 %	0 %	50 %	50 %	340785372
5053	NC_015856	ACC	2	6	212771	212776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785372
5054	NC_015856	CCAGG	2	10	212794	212803	20 %	0 %	40 %	40 %	340785372
5055	NC_015856	GGC	2	6	212839	212844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785372
5056	NC_015856	AGGA	2	8	212900	212907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_015856	GCC	2	6	212942	212947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_015856	AT	3	6	212951	212956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_015856	CGG	2	6	213059	213064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_015856	CGGG	2	8	213161	213168	0 %	0 %	75 %	25 %	340785373
5061	NC_015856	CATC	2	8	213276	213283	25 %	25 %	0 %	50 %	340785373
5062	NC_015856	GC	4	8	213385	213392	0 %	0 %	50 %	50 %	340785373
5063	NC_015856	GC	3	6	213464	213469	0 %	0 %	50 %	50 %	340785373
5064	NC_015856	CAG	2	6	213501	213506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785373
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5067	NC_015856	CG	5	10	213558	213567	0 %	0 %	50 %	50 %	340785373
5068	NC_015856	GCG	3	9	213565	213573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785373
5069	NC_015856	GC	3	6	213628	213633	0 %	0 %	50 %	50 %	340785373
5070	NC_015856	CAG	2	6	213667	213672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785373
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5072	NC_015856	CCG	2	6	213829	213834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785374
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5078	NC_015856	CCCG	2	8	214063	214070	0 %	0 %	25 %	75 %	340785375
5079	NC_015856	GGC	2	6	214093	214098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785375
5080	NC_015856	TCGG	2	8	214163	214170	0 %	25 %	50 %	25 %	340785375
5081	NC_015856	AAT	2	6	214242	214247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340785375
5082	NC_015856	CGT	2	6	214282	214287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785375
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5085	NC_015856	CGT	2	6	214497	214502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785375
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5089	NC_015856	GCTGCA	2	12	214713	214724	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340785375
5090	NC_015856	CTG	2	6	214782	214787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785376
5091	NC_015856	GGCGC	2	10	214817	214826	0 %	0 %	60 %	40 %	340785376
5092	NC_015856	GCA	2	6	214844	214849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785376
5093	NC_015856	CGA	2	6	214898	214903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785376
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5101	NC_015856	CGC	2	6	215246	215251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785376
5102	NC_015856	CCAG	2	8	215252	215259	25 %	0 %	25 %	50 %	340785376
5103	NC_015856	CCG	2	6	215260	215265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785376
5104	NC_015856	GCG	2	6	215300	215305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785376
5105	NC_015856	TCA	2	6	215330	215335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785376
5106	NC_015856	CAG	2	6	215382	215387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785376
5107	NC_015856	GGAT	2	8	215389	215396	25 %	25 %	50 %	0 %	340785376
5108	NC_015856	CAG	2	6	215423	215428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785376
5109	NC_015856	CGC	2	6	215467	215472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_015856	GGCCG	2	10	215477	215486	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5111	NC_015856	CGG	2	6	215506	215511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785378
5112	NC_015856	TACC	2	8	215526	215533	25 %	25 %	0 %	50 %	340785378
5113	NC_015856	ACA	2	6	215546	215551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785378
5114	NC_015856	GC	3	6	215592	215597	0 %	0 %	50 %	50 %	340785378
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5117	NC_015856	CGGC	2	8	215649	215656	0 %	0 %	50 %	50 %	340785378
5118	NC_015856	TTTTC	2	10	215664	215673	0 %	80 %	0 %	20 %	340785378
5119	NC_015856	CAC	3	9	215713	215721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785378
5120	NC_015856	TGC	2	6	215745	215750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785378
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5122	NC_015856	CCGG	2	8	215798	215805	0 %	0 %	50 %	50 %	340785378
5123	NC_015856	TCAGG	2	10	215922	215931	20 %	20 %	40 %	20 %	340785378
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5226	NC_015856	GCG	2	6	219445	219450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5227	NC_015856	CTGC	2	8	219490	219497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5230	NC_015856	GCG	2	6	219622	219627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785382
5231	NC_015856	CGG	2	6	219646	219651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785382
5232	NC_015856	CTT	2	6	219680	219685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785382
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5234	NC_015856	TTCT	2	8	219800	219807	0 %	75 %	0 %	25 %	340785382
5235	NC_015856	TGA	2	6	219808	219813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785382
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5237	NC_015856	CGT	2	6	219941	219946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785382
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5239	NC_015856	CTG	2	6	220007	220012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785382
5240	NC_015856	TGCC	2	8	220081	220088	0 %	25 %	25 %	50 %	340785382
5241	NC_015856	GCTGC	2	10	220096	220105	0 %	20 %	40 %	40 %	340785382
5242	NC_015856	TGC	2	6	220173	220178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785382
5243	NC_015856	GAA	2	6	220202	220207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785382
5244	NC_015856	TTC	2	6	220316	220321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785382
5245	NC_015856	CTG	2	6	220329	220334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785382
5246	NC_015856	GTC	2	6	220373	220378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785382
5247	NC_015856	CGG	2	6	220420	220425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785382
5248	NC_015856	CGG	2	6	220438	220443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785382
5249	NC_015856	CCGG	2	8	220452	220459	0 %	0 %	50 %	50 %	340785382
5250	NC_015856	GAT	2	6	220472	220477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785382
5251	NC_015856	ATG	2	6	220557	220562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785382
5252	NC_015856	GCT	2	6	220619	220624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785382
5253	NC_015856	GC	3	6	220634	220639	0 %	0 %	50 %	50 %	340785382
5254	NC_015856	CAG	2	6	220640	220645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785382
5255	NC_015856	GCT	2	6	220654	220659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785382
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5257	NC_015856	CAG	2	6	220724	220729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785382
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5259	NC_015856	CCA	2	6	220762	220767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785382
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5262	NC_015856	GCG	2	6	220787	220792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785382
5263	NC_015856	GCA	2	6	220798	220803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785382
5264	NC_015856	TCT	2	6	220812	220817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785382
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5266	NC_015856	T	7	7	220882	220888	0 %	100 %	0 %	0 %	340785382
5267	NC_015856	AGC	2	6	220901	220906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785382
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5270	NC_015856	CCG	2	6	221031	221036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785382
5271	NC_015856	GTC	2	6	221060	221065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785382
5272	NC_015856	GCT	2	6	221082	221087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785382
5273	NC_015856	AAG	2	6	221100	221105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785382
5274	NC_015856	GCCGG	2	10	221158	221167	0 %	0 %	60 %	40 %	340785383
5275	NC_015856	GCG	2	6	221178	221183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785383
5276	NC_015856	GAC	2	6	221198	221203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785383
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5278	NC_015856	GCCGG	2	10	221231	221240	0 %	0 %	60 %	40 %	340785383
5279	NC_015856	CTG	2	6	221261	221266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785383
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5281	NC_015856	GCG	3	9	221328	221336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785383
5282	NC_015856	GGC	2	6	221402	221407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785383
5283	NC_015856	GGC	2	6	221461	221466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785383
5284	NC_015856	GTG	2	6	221474	221479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785383
5285	NC_015856	TGC	2	6	221499	221504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785383
5286	NC_015856	GCGT	2	8	221526	221533	0 %	25 %	50 %	25 %	340785383
5287	NC_015856	ACC	2	6	221591	221596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785383
5288	NC_015856	TGC	2	6	221622	221627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785383
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5290	NC_015856	GCC	2	6	221642	221647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785383
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5292	NC_015856	TGG	2	6	221682	221687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785383
5293	NC_015856	CG	3	6	221781	221786	0 %	0 %	50 %	50 %	340785383
5294	NC_015856	GT	3	6	221829	221834	0 %	50 %	50 %	0 %	340785383
5295	NC_015856	CGG	2	6	221845	221850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785383
5296	NC_015856	GCA	2	6	221902	221907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785383
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5300	NC_015856	ATTT	2	8	222035	222042	25 %	75 %	0 %	0 %	340785383
5301	NC_015856	CGC	2	6	222064	222069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785383
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5303	NC_015856	GC	3	6	222094	222099	0 %	0 %	50 %	50 %	340785383
5304	NC_015856	GCC	2	6	222117	222122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785383
5305	NC_015856	TGC	2	6	222123	222128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785383
5306	NC_015856	TGC	2	6	222138	222143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785383
5307	NC_015856	GC	3	6	222151	222156	0 %	0 %	50 %	50 %	340785383
5308	NC_015856	CGC	3	9	222154	222162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785383
5309	NC_015856	ATGG	2	8	222163	222170	25 %	25 %	50 %	0 %	340785383
5310	NC_015856	CAG	2	6	222224	222229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785383
5311	NC_015856	ATCA	2	8	222230	222237	50 %	25 %	0 %	25 %	340785383
5312	NC_015856	CTG	2	6	222284	222289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785383
5313	NC_015856	GCTG	2	8	222312	222319	0 %	25 %	50 %	25 %	340785383
5314	NC_015856	CGAT	2	8	222386	222393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5315	NC_015856	CAGG	2	8	222441	222448	25 %	0 %	50 %	25 %	340785384
5316	NC_015856	AGC	2	6	222491	222496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785384
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5320	NC_015856	TGG	2	6	222588	222593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785384
5321	NC_015856	GCG	2	6	222617	222622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785384
5322	NC_015856	GGT	2	6	222661	222666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785384
5323	NC_015856	CGG	2	6	222676	222681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785384
5324	NC_015856	TGG	2	6	222729	222734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785384
5325	NC_015856	GGC	2	6	222814	222819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785384
5326	NC_015856	AGT	2	6	222844	222849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785384
5327	NC_015856	GC	3	6	222891	222896	0 %	0 %	50 %	50 %	340785384
5328	NC_015856	CAG	2	6	222922	222927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785384
5329	NC_015856	GCGAT	2	10	222942	222951	20 %	20 %	40 %	20 %	340785384
5330	NC_015856	ATG	2	6	222971	222976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785384
5331	NC_015856	TAG	2	6	222991	222996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5332	NC_015856	GCG	2	6	223014	223019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5333	NC_015856	GCT	2	6	223034	223039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5334	NC_015856	TAG	2	6	223107	223112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5335	NC_015856	AGC	2	6	223116	223121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5336	NC_015856	AAC	2	6	223129	223134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5337	NC_015856	ATG	2	6	223194	223199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785385
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5340	NC_015856	GCA	2	6	223291	223296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785385
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5342	NC_015856	CGG	2	6	223343	223348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785385
5343	NC_015856	CAG	2	6	223392	223397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785385
5344	NC_015856	GAC	2	6	223403	223408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785385
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5346	NC_015856	TGA	2	6	223507	223512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785385
5347	NC_015856	AAG	2	6	223530	223535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785385
5348	NC_015856	CGAG	2	8	223546	223553	25 %	0 %	50 %	25 %	340785385
5349	NC_015856	CGC	2	6	223565	223570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785385
5350	NC_015856	GGC	2	6	223575	223580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785385
5351	NC_015856	GCG	2	6	223594	223599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785385
5352	NC_015856	GGC	2	6	223616	223621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785385
5353	NC_015856	AGG	2	6	223652	223657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340785385
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5356	NC_015856	CGG	2	6	223740	223745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785386
5357	NC_015856	T	6	6	223765	223770	0 %	100 %	0 %	0 %	340785386
5358	NC_015856	ACA	2	6	223856	223861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785386
5359	NC_015856	GTG	3	9	223864	223872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785386
5360	NC_015856	TGC	2	6	223922	223927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785386
5361	NC_015856	CGG	2	6	224025	224030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785386
5362	NC_015856	CCA	2	6	224033	224038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785386
5363	NC_015856	GC	3	6	224083	224088	0 %	0 %	50 %	50 %	340785386
5364	NC_015856	TGG	2	6	224096	224101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785386
5365	NC_015856	GCC	3	9	224104	224112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785386
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5373	NC_015856	CAG	2	6	224320	224325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785386
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5384	NC_015856	GC	3	6	224971	224976	0 %	0 %	50 %	50 %	340785386
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5401	NC_015856	TGT	2	6	225879	225884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5402	NC_015856	ATA	2	6	225947	225952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5487	NC_015856	GCA	2	6	229094	229099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785389
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