MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 2850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015744	TCTT	2	8	109	116	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015744	TTGT	2	8	304	311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015744	CATG	2	8	467	474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015744	AAAG	2	8	882	889	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015744	GCTA	2	8	974	981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015744	CATG	2	8	1293	1300	25 %	25 %	25 %	25 %	339625374
7	NC_015744	AGAT	2	8	1345	1352	50 %	25 %	25 %	0 %	339625374
8	NC_015744	AGGA	2	8	1423	1430	50 %	0 %	50 %	0 %	339625374
9	NC_015744	GTCT	2	8	1836	1843	0 %	50 %	25 %	25 %	339625374
10	NC_015744	TTTG	2	8	2043	2050	0 %	75 %	25 %	0 %	339625374
11	NC_015744	CCTT	2	8	2066	2073	0 %	50 %	0 %	50 %	339625374
12	NC_015744	AAGG	2	8	2313	2320	50 %	0 %	50 %	0 %	339625374
13	NC_015744	TTTG	2	8	4347	4354	0 %	75 %	25 %	0 %	339625376
14	NC_015744	TGCT	2	8	4429	4436	0 %	50 %	25 %	25 %	339625376
15	NC_015744	GTTT	2	8	4577	4584	0 %	75 %	25 %	0 %	339625376
16	NC_015744	CAGC	2	8	4656	4663	25 %	0 %	25 %	50 %	339625376
17	NC_015744	AAAC	2	8	4736	4743	75 %	0 %	0 %	25 %	339625376
18	NC_015744	AATC	2	8	4895	4902	50 %	25 %	0 %	25 %	339625376
19	NC_015744	CCTT	2	8	5365	5372	0 %	50 %	0 %	50 %	339625377
20	NC_015744	CTTT	2	8	5960	5967	0 %	75 %	0 %	25 %	339625377
21	NC_015744	CTTA	2	8	6239	6246	25 %	50 %	0 %	25 %	339625377
22	NC_015744	TTCG	2	8	6299	6306	0 %	50 %	25 %	25 %	339625377
23	NC_015744	TTCG	2	8	6641	6648	0 %	50 %	25 %	25 %	339625378
24	NC_015744	GAAA	2	8	6727	6734	75 %	0 %	25 %	0 %	339625378
25	NC_015744	TTCT	2	8	6759	6766	0 %	75 %	0 %	25 %	339625378
26	NC_015744	TTGT	2	8	7215	7222	0 %	75 %	25 %	0 %	339625378
27	NC_015744	TCTA	2	8	7682	7689	25 %	50 %	0 %	25 %	339625379
28	NC_015744	AAGA	2	8	7752	7759	75 %	0 %	25 %	0 %	339625379
29	NC_015744	TGTT	2	8	8210	8217	0 %	75 %	25 %	0 %	339625379
30	NC_015744	AATA	2	8	8411	8418	75 %	25 %	0 %	0 %	339625379
31	NC_015744	ACAT	2	8	8445	8452	50 %	25 %	0 %	25 %	339625379
32	NC_015744	GAAA	2	8	8588	8595	75 %	0 %	25 %	0 %	339625379
33	NC_015744	TTGC	2	8	9370	9377	0 %	50 %	25 %	25 %	339625379
34	NC_015744	GCTT	2	8	10418	10425	0 %	50 %	25 %	25 %	339625379
35	NC_015744	TCGA	2	8	10494	10501	25 %	25 %	25 %	25 %	339625379
36	NC_015744	GAAG	2	8	10834	10841	50 %	0 %	50 %	0 %	339625380
37	NC_015744	TAGG	2	8	11007	11014	25 %	25 %	50 %	0 %	339625380
38	NC_015744	TTAC	2	8	11293	11300	25 %	50 %	0 %	25 %	339625380
39	NC_015744	GAGT	2	8	11901	11908	25 %	25 %	50 %	0 %	339625380
40	NC_015744	GATG	2	8	12326	12333	25 %	25 %	50 %	0 %	339625380
41	NC_015744	AAAT	2	8	13206	13213	75 %	25 %	0 %	0 %	339625380
42	NC_015744	AGGG	2	8	13359	13366	25 %	0 %	75 %	0 %	339625380
43	NC_015744	TTCA	2	8	13641	13648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015744	TAGT	2	8	13810	13817	25 %	50 %	25 %	0 %	339625381
45	NC_015744	TTTA	2	8	14222	14229	25 %	75 %	0 %	0 %	339625381
46	NC_015744	GGAT	2	8	14505	14512	25 %	25 %	50 %	0 %	339625381
47	NC_015744	TGCT	2	8	14586	14593	0 %	50 %	25 %	25 %	339625381
48	NC_015744	GATC	2	8	15152	15159	25 %	25 %	25 %	25 %	339625381
49	NC_015744	AGAA	2	8	15665	15672	75 %	0 %	25 %	0 %	339625382
50	NC_015744	AGAA	2	8	15840	15847	75 %	0 %	25 %	0 %	339625382
51	NC_015744	GCAG	2	8	16434	16441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015744	GAAA	2	8	16837	16844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015744	TTCA	2	8	17391	17398	25 %	50 %	0 %	25 %	339625384
54	NC_015744	CGTA	2	8	18030	18037	25 %	25 %	25 %	25 %	339625384
55	NC_015744	CTTT	2	8	20185	20192	0 %	75 %	0 %	25 %	339625385
56	NC_015744	TAAT	3	12	20971	20982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015744	TTTC	2	8	21211	21218	0 %	75 %	0 %	25 %	339625386
58	NC_015744	TATC	2	8	21730	21737	25 %	50 %	0 %	25 %	339625386
59	NC_015744	TCGG	2	8	22083	22090	0 %	25 %	50 %	25 %	339625386
60	NC_015744	TTCC	2	8	22253	22260	0 %	50 %	0 %	50 %	339625386
61	NC_015744	TTCT	2	8	22373	22380	0 %	75 %	0 %	25 %	339625386
62	NC_015744	AGGG	2	8	22425	22432	25 %	0 %	75 %	0 %	339625386
63	NC_015744	TCTT	2	8	22925	22932	0 %	75 %	0 %	25 %	339625387
64	NC_015744	TACA	2	8	23215	23222	50 %	25 %	0 %	25 %	339625388
65	NC_015744	GGAA	2	8	23535	23542	50 %	0 %	50 %	0 %	339625388
66	NC_015744	AAAC	2	8	23612	23619	75 %	0 %	0 %	25 %	339625388
67	NC_015744	AAAG	2	8	24238	24245	75 %	0 %	25 %	0 %	339625388
68	NC_015744	GGAT	2	8	24518	24525	25 %	25 %	50 %	0 %	339625389
69	NC_015744	CTCC	2	8	24843	24850	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_015744	CCGA	2	8	25089	25096	25 %	0 %	25 %	50 %	339625391
71	NC_015744	CGAG	2	8	26407	26414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015744	AAAG	2	8	26646	26653	75 %	0 %	25 %	0 %	339625394
73	NC_015744	GCCT	2	8	27779	27786	0 %	25 %	25 %	50 %	339625394
74	NC_015744	CTAG	2	8	27953	27960	25 %	25 %	25 %	25 %	339625394
75	NC_015744	TGGC	2	8	28046	28053	0 %	25 %	50 %	25 %	339625394
76	NC_015744	AGCG	2	8	29190	29197	25 %	0 %	50 %	25 %	339625395
77	NC_015744	ATGA	2	8	29770	29777	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015744	AGAA	2	8	29782	29789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015744	AGCT	2	8	29830	29837	25 %	25 %	25 %	25 %	339625396
80	NC_015744	GATA	2	8	30196	30203	50 %	25 %	25 %	0 %	339625397
81	NC_015744	GTTC	2	8	32704	32711	0 %	50 %	25 %	25 %	339625400
82	NC_015744	ACAA	2	8	32998	33005	75 %	0 %	0 %	25 %	339625401
83	NC_015744	TATT	2	8	33008	33015	25 %	75 %	0 %	0 %	339625401
84	NC_015744	GAAA	2	8	33899	33906	75 %	0 %	25 %	0 %	339625402
85	NC_015744	ACAA	2	8	34117	34124	75 %	0 %	0 %	25 %	339625402
86	NC_015744	GGTA	2	8	34830	34837	25 %	25 %	50 %	0 %	339625404
87	NC_015744	TTGC	2	8	35051	35058	0 %	50 %	25 %	25 %	339625404
88	NC_015744	TCTT	2	8	35141	35148	0 %	75 %	0 %	25 %	339625404
89	NC_015744	GAGG	2	8	35447	35454	25 %	0 %	75 %	0 %	339625404
90	NC_015744	CATC	2	8	35642	35649	25 %	25 %	0 %	50 %	339625404
91	NC_015744	CTTG	2	8	36976	36983	0 %	50 %	25 %	25 %	339625405
92	NC_015744	CAGC	2	8	37182	37189	25 %	0 %	25 %	50 %	339625405
93	NC_015744	GAAA	2	8	37538	37545	75 %	0 %	25 %	0 %	339625405
94	NC_015744	CAAT	2	8	37797	37804	50 %	25 %	0 %	25 %	339625405
95	NC_015744	ATTT	2	8	38746	38753	25 %	75 %	0 %	0 %	339625406
96	NC_015744	CTTT	2	8	38850	38857	0 %	75 %	0 %	25 %	339625406
97	NC_015744	AAGG	2	8	38889	38896	50 %	0 %	50 %	0 %	339625406
98	NC_015744	TTAT	2	8	39003	39010	25 %	75 %	0 %	0 %	339625406
99	NC_015744	ATTT	2	8	39629	39636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015744	ATAC	2	8	39802	39809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015744	TCGT	2	8	39947	39954	0 %	50 %	25 %	25 %	339625407
102	NC_015744	AGGG	2	8	40112	40119	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015744	TTTG	2	8	40385	40392	0 %	75 %	25 %	0 %	339625408
104	NC_015744	CAGA	2	8	40902	40909	50 %	0 %	25 %	25 %	339625409
105	NC_015744	CTTC	2	8	40995	41002	0 %	50 %	0 %	50 %	339625409
106	NC_015744	AAAC	2	8	41211	41218	75 %	0 %	0 %	25 %	339625409
107	NC_015744	AACC	2	8	41239	41246	50 %	0 %	0 %	50 %	339625409
108	NC_015744	TTGA	2	8	41889	41896	25 %	50 %	25 %	0 %	339625409
109	NC_015744	GAAG	2	8	42233	42240	50 %	0 %	50 %	0 %	339625409
110	NC_015744	AATA	2	8	43053	43060	75 %	25 %	0 %	0 %	339625409
111	NC_015744	TTTA	2	8	43073	43080	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015744	AAGC	2	8	43732	43739	50 %	0 %	25 %	25 %	339625412
113	NC_015744	TCAC	2	8	43908	43915	25 %	25 %	0 %	50 %	339625412
114	NC_015744	GATC	2	8	44331	44338	25 %	25 %	25 %	25 %	339625413
115	NC_015744	GAGT	2	8	45033	45040	25 %	25 %	50 %	0 %	339625414
116	NC_015744	TTCT	2	8	45813	45820	0 %	75 %	0 %	25 %	339625414
117	NC_015744	AGAA	2	8	46432	46439	75 %	0 %	25 %	0 %	339625415
118	NC_015744	TAAA	2	8	46663	46670	75 %	25 %	0 %	0 %	339625416
119	NC_015744	GAAG	2	8	46770	46777	50 %	0 %	50 %	0 %	339625416
120	NC_015744	GTTG	2	8	47327	47334	0 %	50 %	50 %	0 %	339625416
121	NC_015744	GAAG	2	8	47591	47598	50 %	0 %	50 %	0 %	339625417
122	NC_015744	TCTG	2	8	47702	47709	0 %	50 %	25 %	25 %	339625417
123	NC_015744	GGAG	2	8	48002	48009	25 %	0 %	75 %	0 %	339625417
124	NC_015744	TTGC	2	8	48685	48692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015744	AAGA	2	8	49541	49548	75 %	0 %	25 %	0 %	339625418
126	NC_015744	GCAG	2	8	50697	50704	25 %	0 %	50 %	25 %	339625419
127	NC_015744	AAAC	2	8	50991	50998	75 %	0 %	0 %	25 %	339625419
128	NC_015744	CCTC	2	8	52014	52021	0 %	25 %	0 %	75 %	339625419
129	NC_015744	AATC	2	8	52177	52184	50 %	25 %	0 %	25 %	339625419
130	NC_015744	GGAT	2	8	52668	52675	25 %	25 %	50 %	0 %	339625419
131	NC_015744	AGGA	2	8	52847	52854	50 %	0 %	50 %	0 %	339625419
132	NC_015744	TTTC	2	8	53623	53630	0 %	75 %	0 %	25 %	339625420
133	NC_015744	TGCC	2	8	54067	54074	0 %	25 %	25 %	50 %	339625420
134	NC_015744	GTTT	2	8	54247	54254	0 %	75 %	25 %	0 %	339625420
135	NC_015744	TACA	2	8	54794	54801	50 %	25 %	0 %	25 %	339625421
136	NC_015744	AGGA	2	8	54958	54965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015744	AGAA	2	8	54998	55005	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015744	ATTT	2	8	55233	55240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015744	GATC	2	8	55943	55950	25 %	25 %	25 %	25 %	339625423
140	NC_015744	CAAT	2	8	56438	56445	50 %	25 %	0 %	25 %	339625423
141	NC_015744	TCTT	2	8	56454	56461	0 %	75 %	0 %	25 %	339625423
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143	NC_015744	CTTT	2	8	56809	56816	0 %	75 %	0 %	25 %	339625424
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