MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 22920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015744	GA	3	6	68130	68135	50 %	0 %	50 %	0 %	339625432
1502	NC_015744	GAGG	2	8	68189	68196	25 %	0 %	75 %	0 %	339625432
1503	NC_015744	TTA	2	6	68255	68260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625432
1504	NC_015744	TGA	2	6	68308	68313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625432
1505	NC_015744	A	6	6	68499	68504	100 %	0 %	0 %	0 %	339625433
1506	NC_015744	GT	3	6	68579	68584	0 %	50 %	50 %	0 %	339625433
1507	NC_015744	A	7	7	68888	68894	100 %	0 %	0 %	0 %	339625433
1508	NC_015744	GAT	2	6	68904	68909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625433
1509	NC_015744	TTC	2	6	69004	69009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625433
1510	NC_015744	A	6	6	69180	69185	100 %	0 %	0 %	0 %	339625433
1511	NC_015744	TCC	2	6	69203	69208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625433
1512	NC_015744	AGG	3	9	69215	69223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625433
1513	NC_015744	ATTAGG	2	12	69314	69325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625433
1514	NC_015744	GCG	2	6	69327	69332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339625433
1515	NC_015744	ATT	2	6	69337	69342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625433
1516	NC_015744	AGC	2	6	69403	69408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625433
1517	NC_015744	GTA	2	6	69472	69477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625433
1518	NC_015744	T	6	6	69512	69517	0 %	100 %	0 %	0 %	339625433
1519	NC_015744	CAGC	2	8	69564	69571	25 %	0 %	25 %	50 %	339625433
1520	NC_015744	CTT	2	6	69607	69612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625433
1521	NC_015744	AGC	2	6	69628	69633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625433
1522	NC_015744	TTC	2	6	69640	69645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625433
1523	NC_015744	TCGT	2	8	69683	69690	0 %	50 %	25 %	25 %	339625433
1524	NC_015744	TGT	2	6	69701	69706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015744	AG	3	6	69709	69714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_015744	TTCT	2	8	69940	69947	0 %	75 %	0 %	25 %	339625434
1527	NC_015744	TCC	2	6	69971	69976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625434
1528	NC_015744	TAT	2	6	70014	70019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625434
1529	NC_015744	CGT	2	6	70038	70043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625434
1530	NC_015744	GC	3	6	70046	70051	0 %	0 %	50 %	50 %	339625434
1531	NC_015744	TGT	2	6	70082	70087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625434
1532	NC_015744	TGA	2	6	70106	70111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625434
1533	NC_015744	GCA	2	6	70116	70121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625434
1534	NC_015744	TTG	2	6	70198	70203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625434
1535	NC_015744	A	6	6	70233	70238	100 %	0 %	0 %	0 %	339625434
1536	NC_015744	GAA	2	6	70244	70249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625434
1537	NC_015744	TC	3	6	70282	70287	0 %	50 %	0 %	50 %	339625434
1538	NC_015744	A	6	6	70306	70311	100 %	0 %	0 %	0 %	339625434
1539	NC_015744	GA	3	6	70321	70326	50 %	0 %	50 %	0 %	339625434
1540	NC_015744	CTT	2	6	70468	70473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625434
1541	NC_015744	AGA	2	6	70478	70483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625434
1542	NC_015744	TTC	2	6	70487	70492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625434
1543	NC_015744	CTT	2	6	70498	70503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625434
1544	NC_015744	CAA	2	6	70534	70539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625434
1545	NC_015744	T	6	6	70593	70598	0 %	100 %	0 %	0 %	339625434
1546	NC_015744	AAC	2	6	70640	70645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625434
1547	NC_015744	TCT	3	9	70647	70655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625434
1548	NC_015744	CTTAA	2	10	70664	70673	40 %	40 %	0 %	20 %	339625434
1549	NC_015744	CGG	2	6	70690	70695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339625435
1550	NC_015744	AGC	2	6	70726	70731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625435
1551	NC_015744	GT	3	6	70736	70741	0 %	50 %	50 %	0 %	339625435
1552	NC_015744	TGC	2	6	70747	70752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625435
1553	NC_015744	TCT	2	6	70768	70773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625435
1554	NC_015744	GAC	2	6	70836	70841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625435
1555	NC_015744	AAAT	2	8	70856	70863	75 %	25 %	0 %	0 %	339625435
1556	NC_015744	TTG	2	6	70881	70886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625435
1557	NC_015744	ATAG	2	8	70924	70931	50 %	25 %	25 %	0 %	339625435
1558	NC_015744	TCA	2	6	70951	70956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625435
1559	NC_015744	AG	3	6	71058	71063	50 %	0 %	50 %	0 %	339625435
1560	NC_015744	CCA	2	6	71066	71071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339625435
1561	NC_015744	TTC	2	6	71103	71108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625435
1562	NC_015744	GAT	2	6	71123	71128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625435
1563	NC_015744	CCTT	2	8	71229	71236	0 %	50 %	0 %	50 %	339625435
1564	NC_015744	T	6	6	71235	71240	0 %	100 %	0 %	0 %	339625435
1565	NC_015744	AGT	2	6	71322	71327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625435
1566	NC_015744	GTA	2	6	71404	71409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625435
1567	NC_015744	T	6	6	71415	71420	0 %	100 %	0 %	0 %	339625435
1568	NC_015744	TAA	2	6	71446	71451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625435
1569	NC_015744	GCTT	2	8	71466	71473	0 %	50 %	25 %	25 %	339625435
1570	NC_015744	GGA	2	6	71474	71479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625435
1571	NC_015744	ATT	2	6	71487	71492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625435
1572	NC_015744	GAT	3	9	71514	71522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625436
1573	NC_015744	GAG	2	6	71583	71588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625436
1574	NC_015744	GAG	2	6	71622	71627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625436
1575	NC_015744	CTG	2	6	71653	71658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625436
1576	NC_015744	TCT	2	6	71690	71695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625436
1577	NC_015744	AGA	2	6	71734	71739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625436
1578	NC_015744	ACAAA	2	10	71763	71772	80 %	0 %	0 %	20 %	339625436
1579	NC_015744	T	9	9	71838	71846	0 %	100 %	0 %	0 %	339625436
1580	NC_015744	TAA	2	6	71920	71925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625436
1581	NC_015744	TCC	2	6	71974	71979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625436
1582	NC_015744	GT	3	6	72088	72093	0 %	50 %	50 %	0 %	339625436
1583	NC_015744	TTG	2	6	72112	72117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625436
1584	NC_015744	GAG	2	6	72217	72222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625436
1585	NC_015744	TTA	2	6	72230	72235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625436
1586	NC_015744	CT	3	6	72263	72268	0 %	50 %	0 %	50 %	339625436
1587	NC_015744	CCCTGA	2	12	72310	72321	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339625436
1588	NC_015744	AAT	2	6	72328	72333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625436
1589	NC_015744	CA	3	6	72447	72452	50 %	0 %	0 %	50 %	339625436
1590	NC_015744	CTA	2	6	72467	72472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_015744	A	7	7	72506	72512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_015744	A	6	6	72514	72519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_015744	AT	5	10	72550	72559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_015744	AGG	2	6	72562	72567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015744	A	6	6	72601	72606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_015744	TTC	2	6	72682	72687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625437
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1598	NC_015744	TTC	2	6	72769	72774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625437
1599	NC_015744	AAG	2	6	72811	72816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625437
1600	NC_015744	TTC	2	6	72837	72842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625437
1601	NC_015744	CG	3	6	72849	72854	0 %	0 %	50 %	50 %	339625437
1602	NC_015744	TTG	2	6	72920	72925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625437
1603	NC_015744	GAG	2	6	72959	72964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625437
1604	NC_015744	TTC	2	6	72968	72973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625437
1605	NC_015744	GA	3	6	73026	73031	50 %	0 %	50 %	0 %	339625437
1606	NC_015744	TCT	2	6	73049	73054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625437
1607	NC_015744	AGTG	2	8	73090	73097	25 %	25 %	50 %	0 %	339625437
1608	NC_015744	TTC	2	6	73154	73159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625437
1609	NC_015744	ATT	2	6	73208	73213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625437
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1611	NC_015744	GAGT	2	8	73260	73267	25 %	25 %	50 %	0 %	339625437
1612	NC_015744	AGA	2	6	73276	73281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625437
1613	NC_015744	TGC	2	6	73298	73303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625438
1614	NC_015744	ATG	2	6	73355	73360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625438
1615	NC_015744	AAGC	2	8	73408	73415	50 %	0 %	25 %	25 %	339625438
1616	NC_015744	TGT	2	6	73517	73522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625438
1617	NC_015744	GCG	2	6	73552	73557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339625438
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1619	NC_015744	CTT	2	6	73589	73594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625438
1620	NC_015744	ATC	2	6	73654	73659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625438
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1622	NC_015744	GGA	2	6	73735	73740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625438
1623	NC_015744	TCT	2	6	73757	73762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625438
1624	NC_015744	TA	3	6	73784	73789	50 %	50 %	0 %	0 %	339625438
1625	NC_015744	ATT	2	6	73843	73848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625438
1626	NC_015744	GTG	2	6	73877	73882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625438
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1628	NC_015744	CTT	2	6	73974	73979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625438
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1751	NC_015744	AAGA	2	8	79670	79677	75 %	0 %	25 %	0 %	339625443
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1753	NC_015744	TGT	2	6	79698	79703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625443
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