MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 22920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_015744	GAA	2	6	44608	44613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625413
1003	NC_015744	TGT	2	6	44630	44635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625413
1004	NC_015744	GAGAAA	2	12	44654	44665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625413
1005	NC_015744	AGT	2	6	44755	44760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625413
1006	NC_015744	TAT	2	6	44872	44877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015744	TGT	2	6	44905	44910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625414
1008	NC_015744	GAGT	2	8	45033	45040	25 %	25 %	50 %	0 %	339625414
1009	NC_015744	CTT	2	6	45042	45047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625414
1010	NC_015744	GAA	2	6	45359	45364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625414
1011	NC_015744	ATT	2	6	45461	45466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625414
1012	NC_015744	GTC	2	6	45487	45492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625414
1013	NC_015744	TGC	2	6	45508	45513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625414
1014	NC_015744	TGA	2	6	45570	45575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625414
1015	NC_015744	CCT	2	6	45635	45640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625414
1016	NC_015744	GAT	2	6	45755	45760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625414
1017	NC_015744	TTCT	2	8	45813	45820	0 %	75 %	0 %	25 %	339625414
1018	NC_015744	AAC	2	6	45906	45911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625414
1019	NC_015744	ATT	2	6	45917	45922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625414
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1021	NC_015744	TCG	2	6	45988	45993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625414
1022	NC_015744	GGATC	2	10	45995	46004	20 %	20 %	40 %	20 %	339625414
1023	NC_015744	TAAAT	2	10	46036	46045	60 %	40 %	0 %	0 %	339625414
1024	NC_015744	A	6	6	46071	46076	100 %	0 %	0 %	0 %	339625414
1025	NC_015744	GCT	2	6	46091	46096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625414
1026	NC_015744	TAG	2	6	46134	46139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015744	TG	3	6	46143	46148	0 %	50 %	50 %	0 %	339625415
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1030	NC_015744	GTT	2	6	46212	46217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625415
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1032	NC_015744	GCGAT	2	10	46351	46360	20 %	20 %	40 %	20 %	339625415
1033	NC_015744	AGT	2	6	46385	46390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625415
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1039	NC_015744	A	6	6	46510	46515	100 %	0 %	0 %	0 %	339625415
1040	NC_015744	AGA	2	6	46529	46534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625415
1041	NC_015744	AAG	2	6	46543	46548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625415
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1053	NC_015744	TCT	2	6	46890	46895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625416
1054	NC_015744	AGA	4	12	46898	46909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625416
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1057	NC_015744	ATG	2	6	46998	47003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625416
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1065	NC_015744	A	6	6	47368	47373	100 %	0 %	0 %	0 %	339625416
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1100	NC_015744	TTGC	2	8	48685	48692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1107	NC_015744	GAGCA	2	10	49295	49304	40 %	0 %	40 %	20 %	339625418
1108	NC_015744	TTG	2	6	49349	49354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625418
1109	NC_015744	GCA	2	6	49460	49465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625418
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1113	NC_015744	ATA	2	6	49671	49676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625418
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1119	NC_015744	A	6	6	49948	49953	100 %	0 %	0 %	0 %	339625418
1120	NC_015744	G	7	7	49961	49967	0 %	0 %	100 %	0 %	339625418
1121	NC_015744	GGA	2	6	50002	50007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625418
1122	NC_015744	AC	3	6	50068	50073	50 %	0 %	0 %	50 %	339625418
1123	NC_015744	TATATT	2	12	50094	50105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625418
1124	NC_015744	CTT	2	6	50109	50114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625418
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