MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 22920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015744	GGT	2	6	21149	21154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625386
502	NC_015744	TTTC	2	8	21211	21218	0 %	75 %	0 %	25 %	339625386
503	NC_015744	CTT	2	6	21275	21280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625386
504	NC_015744	T	6	6	21297	21302	0 %	100 %	0 %	0 %	339625386
505	NC_015744	AAG	2	6	21323	21328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625386
506	NC_015744	GCA	2	6	21334	21339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625386
507	NC_015744	GTA	2	6	21403	21408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625386
508	NC_015744	CT	3	6	21452	21457	0 %	50 %	0 %	50 %	339625386
509	NC_015744	GGA	2	6	21459	21464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625386
510	NC_015744	G	6	6	21468	21473	0 %	0 %	100 %	0 %	339625386
511	NC_015744	TCT	2	6	21531	21536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625386
512	NC_015744	T	6	6	21555	21560	0 %	100 %	0 %	0 %	339625386
513	NC_015744	TGA	2	6	21576	21581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625386
514	NC_015744	AAG	2	6	21602	21607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625386
515	NC_015744	TTA	2	6	21652	21657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625386
516	NC_015744	CTT	2	6	21671	21676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625386
517	NC_015744	AAG	2	6	21689	21694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625386
518	NC_015744	TATC	2	8	21730	21737	25 %	50 %	0 %	25 %	339625386
519	NC_015744	ATC	2	6	21784	21789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625386
520	NC_015744	CT	3	6	21808	21813	0 %	50 %	0 %	50 %	339625386
521	NC_015744	AAG	2	6	21821	21826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625386
522	NC_015744	TC	3	6	21905	21910	0 %	50 %	0 %	50 %	339625386
523	NC_015744	A	7	7	21934	21940	100 %	0 %	0 %	0 %	339625386
524	NC_015744	GC	3	6	21974	21979	0 %	0 %	50 %	50 %	339625386
525	NC_015744	AG	3	6	22045	22050	50 %	0 %	50 %	0 %	339625386
526	NC_015744	TCGG	2	8	22083	22090	0 %	25 %	50 %	25 %	339625386
527	NC_015744	CAG	2	6	22093	22098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625386
528	NC_015744	AAG	2	6	22106	22111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625386
529	NC_015744	AAG	2	6	22169	22174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625386
530	NC_015744	ATT	2	6	22229	22234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625386
531	NC_015744	AGA	2	6	22245	22250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625386
532	NC_015744	TTCC	2	8	22253	22260	0 %	50 %	0 %	50 %	339625386
533	NC_015744	GAG	2	6	22261	22266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625386
534	NC_015744	ATG	2	6	22316	22321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625386
535	NC_015744	TTCT	2	8	22373	22380	0 %	75 %	0 %	25 %	339625386
536	NC_015744	AGGG	2	8	22425	22432	25 %	0 %	75 %	0 %	339625386
537	NC_015744	GCT	2	6	22482	22487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625387
538	NC_015744	CAG	2	6	22528	22533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625387
539	NC_015744	GA	3	6	22562	22567	50 %	0 %	50 %	0 %	339625387
540	NC_015744	TCT	2	6	22590	22595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625387
541	NC_015744	AGC	2	6	22625	22630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625387
542	NC_015744	GA	3	6	22669	22674	50 %	0 %	50 %	0 %	339625387
543	NC_015744	GTG	2	6	22734	22739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625387
544	NC_015744	AGA	2	6	22775	22780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625387
545	NC_015744	GA	3	6	22813	22818	50 %	0 %	50 %	0 %	339625387
546	NC_015744	GTT	2	6	22826	22831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625387
547	NC_015744	TAT	2	6	22876	22881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625387
548	NC_015744	TCTT	2	8	22925	22932	0 %	75 %	0 %	25 %	339625387
549	NC_015744	TCA	2	6	22956	22961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625387
550	NC_015744	TG	3	6	23007	23012	0 %	50 %	50 %	0 %	339625387
551	NC_015744	TC	4	8	23182	23189	0 %	50 %	0 %	50 %	339625388
552	NC_015744	TACA	2	8	23215	23222	50 %	25 %	0 %	25 %	339625388
553	NC_015744	GCA	2	6	23228	23233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625388
554	NC_015744	ACG	2	6	23255	23260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625388
555	NC_015744	AAT	2	6	23303	23308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625388
556	NC_015744	GTT	2	6	23416	23421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625388
557	NC_015744	AAC	2	6	23428	23433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625388
558	NC_015744	GGAA	2	8	23535	23542	50 %	0 %	50 %	0 %	339625388
559	NC_015744	GAA	2	6	23591	23596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625388
560	NC_015744	AAAC	2	8	23612	23619	75 %	0 %	0 %	25 %	339625388
561	NC_015744	TTG	2	6	23678	23683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625388
562	NC_015744	AGA	3	9	23686	23694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625388
563	NC_015744	GAA	2	6	23747	23752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625388
564	NC_015744	TGA	2	6	23863	23868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625388
565	NC_015744	GAA	2	6	23924	23929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625388
566	NC_015744	TTA	2	6	23966	23971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625388
567	NC_015744	TCT	2	6	24130	24135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625388
568	NC_015744	AGG	2	6	24226	24231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625388
569	NC_015744	AAAG	2	8	24238	24245	75 %	0 %	25 %	0 %	339625388
570	NC_015744	GTT	2	6	24308	24313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625389
571	NC_015744	CGA	2	6	24316	24321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625389
572	NC_015744	AGC	2	6	24341	24346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625389
573	NC_015744	AGC	2	6	24369	24374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625389
574	NC_015744	CTC	2	6	24496	24501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625389
575	NC_015744	GGAT	2	8	24518	24525	25 %	25 %	50 %	0 %	339625389
576	NC_015744	AG	3	6	24558	24563	50 %	0 %	50 %	0 %	339625389
577	NC_015744	CTA	2	6	24690	24695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625389
578	NC_015744	T	6	6	24702	24707	0 %	100 %	0 %	0 %	339625389
579	NC_015744	AGC	2	6	24752	24757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625389
580	NC_015744	ATG	2	6	24785	24790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625389
581	NC_015744	CTCC	2	8	24843	24850	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
582	NC_015744	TCTGCA	2	12	24856	24867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_015744	T	8	8	24871	24878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015744	A	6	6	24880	24885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015744	AG	3	6	24912	24917	50 %	0 %	50 %	0 %	339625390
586	NC_015744	A	7	7	24935	24941	100 %	0 %	0 %	0 %	339625390
587	NC_015744	T	7	7	24950	24956	0 %	100 %	0 %	0 %	339625390
588	NC_015744	TGT	2	6	24975	24980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625390
589	NC_015744	TCT	2	6	25049	25054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625390
590	NC_015744	CAA	2	6	25063	25068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625390
591	NC_015744	CCGA	2	8	25089	25096	25 %	0 %	25 %	50 %	339625391
592	NC_015744	TTC	2	6	25174	25179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625391
593	NC_015744	GAA	2	6	25257	25262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625391
594	NC_015744	AAC	2	6	25297	25302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625391
595	NC_015744	GGC	2	6	25348	25353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339625391
596	NC_015744	TGC	2	6	25390	25395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625391
597	NC_015744	TGTGAT	2	12	25498	25509	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	339625391
598	NC_015744	AGC	2	6	25519	25524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625391
599	NC_015744	ATG	2	6	25589	25594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625391
600	NC_015744	GGA	2	6	25712	25717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625391
601	NC_015744	TTC	2	6	25735	25740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625391
602	NC_015744	TCG	2	6	25756	25761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625391
603	NC_015744	GAG	2	6	25779	25784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625391
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605	NC_015744	CTC	2	6	25839	25844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625391
606	NC_015744	TTC	2	6	25888	25893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625391
607	NC_015744	A	7	7	25923	25929	100 %	0 %	0 %	0 %	339625391
608	NC_015744	TAT	2	6	25930	25935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625391
609	NC_015744	GTT	2	6	26026	26031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625391
610	NC_015744	AAG	2	6	26171	26176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625392
611	NC_015744	TCT	2	6	26181	26186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625392
612	NC_015744	TTTCT	2	10	26199	26208	0 %	80 %	0 %	20 %	339625392
613	NC_015744	TGT	2	6	26219	26224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625392
614	NC_015744	T	6	6	26299	26304	0 %	100 %	0 %	0 %	339625393
615	NC_015744	CTT	2	6	26336	26341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625393
616	NC_015744	CGAG	2	8	26407	26414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
617	NC_015744	T	7	7	26492	26498	0 %	100 %	0 %	0 %	339625394
618	NC_015744	GA	3	6	26503	26508	50 %	0 %	50 %	0 %	339625394
619	NC_015744	AG	3	6	26558	26563	50 %	0 %	50 %	0 %	339625394
620	NC_015744	TGT	2	6	26618	26623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625394
621	NC_015744	AAAG	2	8	26646	26653	75 %	0 %	25 %	0 %	339625394
622	NC_015744	T	6	6	26673	26678	0 %	100 %	0 %	0 %	339625394
623	NC_015744	TTTTG	2	10	26710	26719	0 %	80 %	20 %	0 %	339625394
624	NC_015744	GTT	2	6	26728	26733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625394
625	NC_015744	T	6	6	26758	26763	0 %	100 %	0 %	0 %	339625394
626	NC_015744	T	6	6	26837	26842	0 %	100 %	0 %	0 %	339625394
627	NC_015744	GGT	2	6	26901	26906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625394
628	NC_015744	AGA	2	6	26980	26985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625394
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630	NC_015744	TTA	2	6	27039	27044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625394
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