MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 22920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_015744	CTT	2	6	255344	255349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625585
5503	NC_015744	GAT	2	6	255469	255474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625585
5504	NC_015744	GCTAT	2	10	255508	255517	20 %	40 %	20 %	20 %	339625585
5505	NC_015744	AGG	2	6	255528	255533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625585
5506	NC_015744	TTAA	2	8	255574	255581	50 %	50 %	0 %	0 %	339625585
5507	NC_015744	GAA	2	6	255593	255598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625585
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5509	NC_015744	CAG	2	6	255638	255643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625585
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5511	NC_015744	ATG	2	6	255767	255772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625585
5512	NC_015744	AGCT	2	8	255780	255787	25 %	25 %	25 %	25 %	339625585
5513	NC_015744	TTC	2	6	255802	255807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625585
5514	NC_015744	GAT	2	6	255850	255855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625585
5515	NC_015744	GAA	2	6	255883	255888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625585
5516	NC_015744	GAA	2	6	255904	255909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625585
5517	NC_015744	GA	3	6	255932	255937	50 %	0 %	50 %	0 %	339625585
5518	NC_015744	AAG	2	6	255949	255954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625585
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5533	NC_015744	GAA	2	6	256773	256778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625585
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5555	NC_015744	GAAA	2	8	257671	257678	75 %	0 %	25 %	0 %	339625586
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5573	NC_015744	T	8	8	258418	258425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5592	NC_015744	T	6	6	259332	259337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_015744	ATG	2	6	259348	259353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625588
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5602	NC_015744	TAC	2	6	259695	259700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625588
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5610	NC_015744	T	6	6	259991	259996	0 %	100 %	0 %	0 %	339625589
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5617	NC_015744	T	8	8	260286	260293	0 %	100 %	0 %	0 %	339625589
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5999	NC_015744	GAG	2	6	278325	278330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625608
6000	NC_015744	TG	3	6	278337	278342	0 %	50 %	50 %	0 %	339625608

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