MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 22920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015744	TCC	2	6	210824	210829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625548
4502	NC_015744	GTT	2	6	210860	210865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625548
4503	NC_015744	CTT	2	6	210931	210936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625548
4504	NC_015744	AGT	2	6	210991	210996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625548
4505	NC_015744	A	8	8	211012	211019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_015744	CTTT	2	8	211046	211053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4507	NC_015744	GAA	2	6	211061	211066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_015744	GCT	2	6	211118	211123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625549
4509	NC_015744	CAG	2	6	211126	211131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625549
4510	NC_015744	TCA	2	6	211157	211162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625549
4511	NC_015744	AGT	2	6	211230	211235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625549
4512	NC_015744	AGT	2	6	211258	211263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625549
4513	NC_015744	TGT	2	6	211377	211382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625549
4514	NC_015744	GCA	2	6	211388	211393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625549
4515	NC_015744	TTC	2	6	211415	211420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625549
4516	NC_015744	CAAA	2	8	211547	211554	75 %	0 %	0 %	25 %	339625549
4517	NC_015744	CTT	2	6	211575	211580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625549
4518	NC_015744	AAAT	2	8	211636	211643	75 %	25 %	0 %	0 %	339625549
4519	NC_015744	GTG	2	6	211667	211672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625549
4520	NC_015744	AGA	2	6	211676	211681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625549
4521	NC_015744	CGT	2	6	211703	211708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625549
4522	NC_015744	GAG	2	6	211727	211732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625549
4523	NC_015744	AG	3	6	211759	211764	50 %	0 %	50 %	0 %	339625549
4524	NC_015744	TCTAT	2	10	211772	211781	20 %	60 %	0 %	20 %	339625549
4525	NC_015744	TAA	2	6	211792	211797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625549
4526	NC_015744	GCT	2	6	211865	211870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625549
4527	NC_015744	GTAA	2	8	211890	211897	50 %	25 %	25 %	0 %	339625549
4528	NC_015744	GAG	2	6	212008	212013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625549
4529	NC_015744	CTGT	2	8	212204	212211	0 %	50 %	25 %	25 %	339625549
4530	NC_015744	CA	3	6	212223	212228	50 %	0 %	0 %	50 %	339625549
4531	NC_015744	TAG	2	6	212308	212313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625549
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4534	NC_015744	ACAT	2	8	212516	212523	50 %	25 %	0 %	25 %	339625549
4535	NC_015744	AAG	2	6	212574	212579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625549
4536	NC_015744	TGA	2	6	212587	212592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625549
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4538	NC_015744	CCA	2	6	212672	212677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339625549
4539	NC_015744	T	6	6	212691	212696	0 %	100 %	0 %	0 %	339625549
4540	NC_015744	GGAT	2	8	212706	212713	25 %	25 %	50 %	0 %	339625549
4541	NC_015744	TTC	2	6	212764	212769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625549
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4543	NC_015744	GA	3	6	212853	212858	50 %	0 %	50 %	0 %	339625549
4544	NC_015744	GAA	2	6	212878	212883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625549
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4547	NC_015744	G	6	6	212936	212941	0 %	0 %	100 %	0 %	339625549
4548	NC_015744	T	6	6	212944	212949	0 %	100 %	0 %	0 %	339625549
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4551	NC_015744	GTT	2	6	213084	213089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625549
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4554	NC_015744	TTG	2	6	213165	213170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625549
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4559	NC_015744	TCA	2	6	213431	213436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625549
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4561	NC_015744	TAAG	2	8	213521	213528	50 %	25 %	25 %	0 %	339625549
4562	NC_015744	CACAT	2	10	213539	213548	40 %	20 %	0 %	40 %	339625549
4563	NC_015744	CGC	2	6	213609	213614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339625549
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4567	NC_015744	GAAA	2	8	213806	213813	75 %	0 %	25 %	0 %	339625549
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4573	NC_015744	AG	3	6	214279	214284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_015744	T	6	6	214298	214303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_015744	TATT	2	8	214322	214329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_015744	GA	3	6	214380	214385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_015744	AG	3	6	214431	214436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_015744	GAG	3	9	214434	214442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4603	NC_015744	T	6	6	215737	215742	0 %	100 %	0 %	0 %	339625551
4604	NC_015744	A	8	8	215761	215768	100 %	0 %	0 %	0 %	339625551
4605	NC_015744	TGTCG	2	10	215839	215848	0 %	40 %	40 %	20 %	339625551
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4608	NC_015744	AC	3	6	215997	216002	50 %	0 %	0 %	50 %	339625551
4609	NC_015744	ATTC	2	8	216045	216052	25 %	50 %	0 %	25 %	339625551
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4614	NC_015744	AGG	2	6	216225	216230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625551
4615	NC_015744	GCA	3	9	216233	216241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625551
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4619	NC_015744	A	7	7	216388	216394	100 %	0 %	0 %	0 %	339625551
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4622	NC_015744	TG	3	6	216565	216570	0 %	50 %	50 %	0 %	339625551
4623	NC_015744	AAT	2	6	216571	216576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625551
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4870	NC_015744	GCGA	2	8	225990	225997	25 %	0 %	50 %	25 %	339625562
4871	NC_015744	T	7	7	225999	226005	0 %	100 %	0 %	0 %	339625562
4872	NC_015744	AGGG	2	8	226011	226018	25 %	0 %	75 %	0 %	339625562
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5000	NC_015744	TAA	2	6	232154	232159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625567

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