MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium sp. SY8519

Total Repeats: 7584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015737	CTTG	2	8	28	35	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015737	GTTC	2	8	535	542	0 %	50 %	25 %	25 %	339441065
3	NC_015737	GCCG	2	8	650	657	0 %	0 %	50 %	50 %	339441065
4	NC_015737	CAGG	2	8	737	744	25 %	0 %	50 %	25 %	339441065
5	NC_015737	CCGG	2	8	769	776	0 %	0 %	50 %	50 %	339441065
6	NC_015737	GGAT	2	8	794	801	25 %	25 %	50 %	0 %	339441065
7	NC_015737	GGCC	2	8	958	965	0 %	0 %	50 %	50 %	339441065
8	NC_015737	TGGA	2	8	1107	1114	25 %	25 %	50 %	0 %	339441065
9	NC_015737	CGTC	2	8	1278	1285	0 %	25 %	25 %	50 %	339441065
10	NC_015737	TTCC	2	8	1469	1476	0 %	50 %	0 %	50 %	339441065
11	NC_015737	CCTG	2	8	1493	1500	0 %	25 %	25 %	50 %	339441065
12	NC_015737	CCAT	2	8	1570	1577	25 %	25 %	0 %	50 %	339441065
13	NC_015737	AGGA	2	8	2496	2503	50 %	0 %	50 %	0 %	339441066
14	NC_015737	GCCG	2	8	2626	2633	0 %	0 %	50 %	50 %	339441066
15	NC_015737	TTCT	2	8	2765	2772	0 %	75 %	0 %	25 %	339441066
16	NC_015737	CATC	2	8	2932	2939	25 %	25 %	0 %	50 %	339441066
17	NC_015737	CAGG	2	8	3503	3510	25 %	0 %	50 %	25 %	339441066
18	NC_015737	CTGC	2	8	3754	3761	0 %	25 %	25 %	50 %	339441066
19	NC_015737	GAAG	2	8	4454	4461	50 %	0 %	50 %	0 %	339441067
20	NC_015737	ATCT	2	8	4549	4556	25 %	50 %	0 %	25 %	339441067
21	NC_015737	TCAG	2	8	4840	4847	25 %	25 %	25 %	25 %	339441068
22	NC_015737	TCAG	2	8	4858	4865	25 %	25 %	25 %	25 %	339441068
23	NC_015737	TCAG	2	8	4876	4883	25 %	25 %	25 %	25 %	339441068
24	NC_015737	CAGG	2	8	4931	4938	25 %	0 %	50 %	25 %	339441068
25	NC_015737	CAGC	2	8	4957	4964	25 %	0 %	25 %	50 %	339441068
26	NC_015737	AACG	2	8	4996	5003	50 %	0 %	25 %	25 %	339441068
27	NC_015737	ATCC	2	8	5309	5316	25 %	25 %	0 %	50 %	339441068
28	NC_015737	TGCC	2	8	6168	6175	0 %	25 %	25 %	50 %	339441069
29	NC_015737	CTGC	2	8	6257	6264	0 %	25 %	25 %	50 %	339441069
30	NC_015737	GCCT	2	8	7044	7051	0 %	25 %	25 %	50 %	339441070
31	NC_015737	CCCT	2	8	7200	7207	0 %	25 %	0 %	75 %	339441071
32	NC_015737	GCCG	2	8	7499	7506	0 %	0 %	50 %	50 %	339441071
33	NC_015737	AGAT	2	8	7787	7794	50 %	25 %	25 %	0 %	339441071
34	NC_015737	CCGT	2	8	8114	8121	0 %	25 %	25 %	50 %	339441071
35	NC_015737	GGTA	2	8	8217	8224	25 %	25 %	50 %	0 %	339441071
36	NC_015737	CCGC	2	8	8921	8928	0 %	0 %	25 %	75 %	339441072
37	NC_015737	AATA	2	8	10320	10327	75 %	25 %	0 %	0 %	339441074
38	NC_015737	CTTC	2	8	11201	11208	0 %	50 %	0 %	50 %	339441075
39	NC_015737	CGGC	2	8	11222	11229	0 %	0 %	50 %	50 %	339441075
40	NC_015737	CGGC	2	8	11803	11810	0 %	0 %	50 %	50 %	339441075
41	NC_015737	TGAT	2	8	12233	12240	25 %	50 %	25 %	0 %	339441076
42	NC_015737	GCGG	2	8	12382	12389	0 %	0 %	75 %	25 %	339441076
43	NC_015737	TACC	2	8	12429	12436	25 %	25 %	0 %	50 %	339441076
44	NC_015737	TCCT	2	8	12805	12812	0 %	50 %	0 %	50 %	339441076
45	NC_015737	GGAT	2	8	13377	13384	25 %	25 %	50 %	0 %	339441076
46	NC_015737	TTCC	2	8	13392	13399	0 %	50 %	0 %	50 %	339441076
47	NC_015737	ACAG	2	8	13646	13653	50 %	0 %	25 %	25 %	339441076
48	NC_015737	CATA	2	8	13788	13795	50 %	25 %	0 %	25 %	339441076
49	NC_015737	TTCC	2	8	13809	13816	0 %	50 %	0 %	50 %	339441076
50	NC_015737	AACC	2	8	13874	13881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015737	TACA	2	8	14231	14238	50 %	25 %	0 %	25 %	339441077
52	NC_015737	CTTC	2	8	15713	15720	0 %	50 %	0 %	50 %	339441079
53	NC_015737	GCAG	2	8	15860	15867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015737	CCTG	2	8	15868	15875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015737	AATA	2	8	16533	16540	75 %	25 %	0 %	0 %	339441081
56	NC_015737	AATA	2	8	16545	16552	75 %	25 %	0 %	0 %	339441081
57	NC_015737	CTTT	2	8	17453	17460	0 %	75 %	0 %	25 %	339441081
58	NC_015737	TTTC	2	8	18077	18084	0 %	75 %	0 %	25 %	339441081
59	NC_015737	GGCC	2	8	18131	18138	0 %	0 %	50 %	50 %	339441081
60	NC_015737	ATCA	2	8	18536	18543	50 %	25 %	0 %	25 %	339441082
61	NC_015737	CTTC	2	8	18691	18698	0 %	50 %	0 %	50 %	339441082
62	NC_015737	TGAT	2	8	19247	19254	25 %	50 %	25 %	0 %	339441083
63	NC_015737	CTTC	2	8	19280	19287	0 %	50 %	0 %	50 %	339441083
64	NC_015737	TCAA	2	8	19325	19332	50 %	25 %	0 %	25 %	339441083
65	NC_015737	CTTC	2	8	19729	19736	0 %	50 %	0 %	50 %	339441084
66	NC_015737	GAAA	2	8	20975	20982	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015737	GATG	2	8	21132	21139	25 %	25 %	50 %	0 %	339441085
68	NC_015737	TCTG	2	8	21441	21448	0 %	50 %	25 %	25 %	339441085
69	NC_015737	ACGC	2	8	21961	21968	25 %	0 %	25 %	50 %	339441085
70	NC_015737	GTAA	2	8	22207	22214	50 %	25 %	25 %	0 %	339441085
71	NC_015737	CCGG	2	8	22973	22980	0 %	0 %	50 %	50 %	339441086
72	NC_015737	AGAT	2	8	23645	23652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015737	GATG	2	8	24759	24766	25 %	25 %	50 %	0 %	339441088
74	NC_015737	CAGC	2	8	24775	24782	25 %	0 %	25 %	50 %	339441088
75	NC_015737	ATCA	2	8	24799	24806	50 %	25 %	0 %	25 %	339441088
76	NC_015737	TTCT	2	8	25043	25050	0 %	75 %	0 %	25 %	339441089
77	NC_015737	CGGA	2	8	25594	25601	25 %	0 %	50 %	25 %	339441090
78	NC_015737	GTTC	2	8	25614	25621	0 %	50 %	25 %	25 %	339441090
79	NC_015737	AGGA	2	8	26048	26055	50 %	0 %	50 %	0 %	339441090
80	NC_015737	TTCT	2	8	26515	26522	0 %	75 %	0 %	25 %	339441090
81	NC_015737	GTCT	2	8	26986	26993	0 %	50 %	25 %	25 %	339441090
82	NC_015737	AACA	2	8	28056	28063	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015737	GATT	2	8	28493	28500	25 %	50 %	25 %	0 %	339441092
84	NC_015737	ATCA	2	8	28512	28519	50 %	25 %	0 %	25 %	339441092
85	NC_015737	ATCA	2	8	29140	29147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015737	AATT	2	8	29276	29283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015737	GAAT	2	8	29388	29395	50 %	25 %	25 %	0 %	339441094
88	NC_015737	TCAC	2	8	29456	29463	25 %	25 %	0 %	50 %	339441094
89	NC_015737	CAAA	2	8	29900	29907	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015737	TCTT	2	8	30267	30274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015737	CTGT	2	8	30655	30662	0 %	50 %	25 %	25 %	339441095
92	NC_015737	TCCG	2	8	31024	31031	0 %	25 %	25 %	50 %	339441095
93	NC_015737	TTCG	2	8	31226	31233	0 %	50 %	25 %	25 %	339441095
94	NC_015737	AACG	2	8	31412	31419	50 %	0 %	25 %	25 %	339441095
95	NC_015737	TTTC	2	8	31785	31792	0 %	75 %	0 %	25 %	339441095
96	NC_015737	ATGG	2	8	31908	31915	25 %	25 %	50 %	0 %	339441095
97	NC_015737	GAAA	2	8	32180	32187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015737	ATTT	2	8	32228	32235	25 %	75 %	0 %	0 %	339441096
99	NC_015737	AACG	2	8	33328	33335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015737	CCGT	2	8	33609	33616	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015737	ATCC	2	8	33867	33874	25 %	25 %	0 %	50 %	339441097
102	NC_015737	CAGC	2	8	33922	33929	25 %	0 %	25 %	50 %	339441097
103	NC_015737	GGTC	2	8	34346	34353	0 %	25 %	50 %	25 %	339441097
104	NC_015737	TTCC	2	8	35802	35809	0 %	50 %	0 %	50 %	339441099
105	NC_015737	GTCT	2	8	35854	35861	0 %	50 %	25 %	25 %	339441099
106	NC_015737	GCCT	2	8	36049	36056	0 %	25 %	25 %	50 %	339441099
107	NC_015737	CCGG	2	8	36214	36221	0 %	0 %	50 %	50 %	339441099
108	NC_015737	TGTT	2	8	36227	36234	0 %	75 %	25 %	0 %	339441099
109	NC_015737	GGCC	2	8	36651	36658	0 %	0 %	50 %	50 %	339441100
110	NC_015737	CTTC	2	8	36959	36966	0 %	50 %	0 %	50 %	339441100
111	NC_015737	GAAG	2	8	37203	37210	50 %	0 %	50 %	0 %	339441100
112	NC_015737	TCTG	2	8	37583	37590	0 %	50 %	25 %	25 %	339441100
113	NC_015737	ATGG	2	8	37635	37642	25 %	25 %	50 %	0 %	339441100
114	NC_015737	ATCC	2	8	37652	37659	25 %	25 %	0 %	50 %	339441100
115	NC_015737	ATTC	2	8	38362	38369	25 %	50 %	0 %	25 %	339441101
116	NC_015737	ATAC	2	8	38481	38488	50 %	25 %	0 %	25 %	339441101
117	NC_015737	TCCT	2	8	38902	38909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015737	TTCC	2	8	39161	39168	0 %	50 %	0 %	50 %	339441102
119	NC_015737	CTTT	2	8	39880	39887	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015737	GTCG	2	8	40046	40053	0 %	25 %	50 %	25 %	339441104
121	NC_015737	CGGG	2	8	40728	40735	0 %	0 %	75 %	25 %	339441104
122	NC_015737	TCTT	2	8	40906	40913	0 %	75 %	0 %	25 %	339441104
123	NC_015737	TCTG	2	8	41511	41518	0 %	50 %	25 %	25 %	339441105
124	NC_015737	CTGC	2	8	42013	42020	0 %	25 %	25 %	50 %	339441105
125	NC_015737	CTGA	2	8	42197	42204	25 %	25 %	25 %	25 %	339441105
126	NC_015737	CAAC	2	8	42259	42266	50 %	0 %	0 %	50 %	339441105
127	NC_015737	CATA	2	8	42533	42540	50 %	25 %	0 %	25 %	339441106
128	NC_015737	GCCG	2	8	42767	42774	0 %	0 %	50 %	50 %	339441106
129	NC_015737	AATA	2	8	43128	43135	75 %	25 %	0 %	0 %	339441106
130	NC_015737	TGCA	2	8	43702	43709	25 %	25 %	25 %	25 %	339441106
131	NC_015737	CCGC	2	8	43924	43931	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_015737	CCTG	2	8	44758	44765	0 %	25 %	25 %	50 %	339441107
133	NC_015737	TCTG	2	8	46730	46737	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015737	GCAC	2	8	46906	46913	25 %	0 %	25 %	50 %	339441108
135	NC_015737	CTGG	2	8	47133	47140	0 %	25 %	50 %	25 %	339441108
136	NC_015737	TGTC	2	8	47552	47559	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015737	CATT	2	8	47666	47673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015737	TGGT	2	8	48201	48208	0 %	50 %	50 %	0 %	339441109
139	NC_015737	CCGG	2	8	48522	48529	0 %	0 %	50 %	50 %	339441109
140	NC_015737	GATT	2	8	48629	48636	25 %	50 %	25 %	0 %	339441109
141	NC_015737	TTTC	2	8	49427	49434	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015737	GCCG	2	8	49918	49925	0 %	0 %	50 %	50 %	339441111
143	NC_015737	CATA	2	8	50330	50337	50 %	25 %	0 %	25 %	339441112
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