MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium sp. SY8519

Total Repeats: 39823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015737	TCC	2	6	8	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015737	ACC	2	6	160	165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015737	GCA	2	6	240	245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015737	GGT	2	6	321	326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339441065
5	NC_015737	GCA	2	6	358	363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441065
6	NC_015737	GCC	2	6	551	556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441065
7	NC_015737	CAG	2	6	623	628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441065
8	NC_015737	CAG	2	6	710	715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441065
9	NC_015737	TGG	2	6	853	858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339441065
10	NC_015737	CTT	2	6	973	978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441065
11	NC_015737	CAC	2	6	992	997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441065
12	NC_015737	TTC	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441065
13	NC_015737	TTC	2	6	1088	1093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441065
14	NC_015737	TGC	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441065
15	NC_015737	TCC	2	6	1164	1169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441065
16	NC_015737	CAG	4	12	1184	1195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441065
17	NC_015737	CTG	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441065
18	NC_015737	TTC	2	6	1250	1255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441065
19	NC_015737	GCA	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441065
20	NC_015737	TCC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441065
21	NC_015737	GCC	3	9	1376	1384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441065
22	NC_015737	CTT	2	6	1525	1530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441065
23	NC_015737	TTC	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441066
24	NC_015737	CTT	2	6	1684	1689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441066
25	NC_015737	TCC	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441066
26	NC_015737	GCG	2	6	1814	1819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441066
27	NC_015737	CGG	2	6	1912	1917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441066
28	NC_015737	TCA	2	6	1939	1944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441066
29	NC_015737	TCT	2	6	1954	1959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441066
30	NC_015737	CTT	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441066
31	NC_015737	ATG	2	6	2160	2165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441066
32	NC_015737	GCA	2	6	2227	2232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441066
33	NC_015737	TCA	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441066
34	NC_015737	CGG	2	6	2348	2353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441066
35	NC_015737	ATC	2	6	2361	2366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441066
36	NC_015737	TCC	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441066
37	NC_015737	GCA	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441066
38	NC_015737	GCT	2	6	2608	2613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441066
39	NC_015737	TCC	2	6	2787	2792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441066
40	NC_015737	CCT	2	6	2806	2811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441066
41	NC_015737	AGT	2	6	2818	2823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441066
42	NC_015737	CCT	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441066
43	NC_015737	GGC	2	6	2924	2929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441066
44	NC_015737	CTG	2	6	3051	3056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441066
45	NC_015737	GCG	2	6	3135	3140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441066
46	NC_015737	ATC	2	6	3186	3191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441066
47	NC_015737	ATC	2	6	3267	3272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441066
48	NC_015737	ACC	2	6	3402	3407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441066
49	NC_015737	GTT	2	6	3512	3517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339441066
50	NC_015737	TCT	2	6	3591	3596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441066
51	NC_015737	TTC	2	6	3686	3691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441066
52	NC_015737	TCA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441066
53	NC_015737	AGC	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441066
54	NC_015737	AGA	2	6	3977	3982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339441066
55	NC_015737	TGC	2	6	4023	4028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441066
56	NC_015737	GAC	2	6	4053	4058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441066
57	NC_015737	TAA	2	6	4202	4207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339441067
58	NC_015737	GGC	2	6	4312	4317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441067
59	NC_015737	CAT	2	6	4564	4569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441067
60	NC_015737	ATT	2	6	4641	4646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015737	ATT	2	6	4664	4669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015737	TTA	2	6	4737	4742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339441068
63	NC_015737	GAA	2	6	4744	4749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339441068
64	NC_015737	GCA	2	6	4772	4777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441068
65	NC_015737	GCT	2	6	4795	4800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441068
66	NC_015737	TTC	2	6	4816	4821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441068
67	NC_015737	CTT	2	6	4830	4835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441068
68	NC_015737	GCC	2	6	4895	4900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441068
69	NC_015737	AGA	2	6	4906	4911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339441068
70	NC_015737	CTT	2	6	4923	4928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441068
71	NC_015737	CAG	2	6	4942	4947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441068
72	NC_015737	CGG	2	6	4951	4956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441068
73	NC_015737	GCA	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441068
74	NC_015737	GCC	3	9	5051	5059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441068
75	NC_015737	GCG	2	6	5139	5144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441068
76	NC_015737	AGC	2	6	5250	5255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441068
77	NC_015737	CTC	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441068
78	NC_015737	ATC	2	6	5394	5399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441068
79	NC_015737	AAG	2	6	5423	5428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339441068
80	NC_015737	GCC	2	6	5456	5461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015737	CAT	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441069
82	NC_015737	CAT	2	6	5575	5580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441069
83	NC_015737	CGT	2	6	5613	5618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441069
84	NC_015737	CCA	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441069
85	NC_015737	GGA	2	6	5720	5725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339441069
86	NC_015737	GCG	2	6	5748	5753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441069
87	NC_015737	CCG	2	6	5909	5914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441069
88	NC_015737	CCT	2	6	5969	5974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441069
89	NC_015737	TTC	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441069
90	NC_015737	GAT	2	6	6072	6077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441069
91	NC_015737	CTG	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441069
92	NC_015737	CCG	3	9	6182	6190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441069
93	NC_015737	CAG	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441069
94	NC_015737	TTC	2	6	6428	6433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441069
95	NC_015737	TCT	2	6	6470	6475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015737	CAG	2	6	6478	6483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015737	GCC	2	6	6544	6549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441070
98	NC_015737	CGC	2	6	6594	6599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441070
99	NC_015737	CAG	2	6	6802	6807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441070
100	NC_015737	CAG	2	6	6838	6843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441070
101	NC_015737	GCC	2	6	6925	6930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441070
102	NC_015737	CCA	2	6	6943	6948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441070
103	NC_015737	TCA	2	6	6972	6977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441070
104	NC_015737	CAA	2	6	6996	7001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339441070
105	NC_015737	TCC	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441070
106	NC_015737	CAG	2	6	7156	7161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441070
107	NC_015737	CAG	2	6	7234	7239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441071
108	NC_015737	CTC	2	6	7276	7281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441071
109	NC_015737	TAT	2	6	7479	7484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339441071
110	NC_015737	CAG	2	6	7534	7539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441071
111	NC_015737	TTC	2	6	7573	7578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441071
112	NC_015737	CAT	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441071
113	NC_015737	ATT	2	6	7693	7698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339441071
114	NC_015737	GTT	2	6	7700	7705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339441071
115	NC_015737	CAA	2	6	7812	7817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339441071
116	NC_015737	GCC	2	6	7850	7855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441071
117	NC_015737	GGA	2	6	7887	7892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339441071
118	NC_015737	CCG	2	6	7905	7910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441071
119	NC_015737	TCT	2	6	7968	7973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441071
120	NC_015737	TCC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441071
121	NC_015737	CAG	2	6	8080	8085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441071
122	NC_015737	TCC	2	6	8148	8153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441071
123	NC_015737	CGG	2	6	8231	8236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441071
124	NC_015737	GCG	2	6	8241	8246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441071
125	NC_015737	ATA	2	6	8269	8274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339441071
126	NC_015737	GAA	2	6	8322	8327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339441071
127	NC_015737	CCT	2	6	8340	8345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441071
128	NC_015737	TAA	2	6	8418	8423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339441071
129	NC_015737	TCC	2	6	8504	8509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441071
130	NC_015737	CTG	2	6	8641	8646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441071
131	NC_015737	TCT	2	6	8684	8689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015737	GGC	2	6	8894	8899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441072
133	NC_015737	CCA	2	6	8909	8914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441072
134	NC_015737	GCA	2	6	8957	8962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441072
135	NC_015737	TGC	2	6	8967	8972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441072
136	NC_015737	TTC	2	6	8973	8978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441072
137	NC_015737	CTC	2	6	9060	9065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441072
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140	NC_015737	GCC	2	6	9288	9293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441072
141	NC_015737	TTC	2	6	9351	9356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441072
142	NC_015737	CCT	2	6	9467	9472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_015737	CAT	2	6	9641	9646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441073
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146	NC_015737	CAG	2	6	9749	9754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441073
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150	NC_015737	TAC	2	6	9872	9877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015737	CTT	3	9	10011	10019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441074
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161	NC_015737	CTG	3	9	10688	10696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_015737	GCA	2	6	10788	10793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441075
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172	NC_015737	CCG	2	6	11942	11947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441075
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259	NC_015737	TAT	2	6	17645	17650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339441081
260	NC_015737	TCT	2	6	17653	17658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441081
261	NC_015737	TCT	2	6	17801	17806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441081
262	NC_015737	CAG	2	6	17814	17819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441081
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280	NC_015737	CCA	2	6	19194	19199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441083
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