MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium sp. SY8519

Total Repeats: 59484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015737	A	6	6	143499	143504	100 %	0 %	0 %	0 %	339441209
3002	NC_015737	T	7	7	143506	143512	0 %	100 %	0 %	0 %	339441209
3003	NC_015737	AGAA	2	8	143518	143525	75 %	0 %	25 %	0 %	339441209
3004	NC_015737	CGT	2	6	143578	143583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441209
3005	NC_015737	CCCT	2	8	143585	143592	0 %	25 %	0 %	75 %	339441209
3006	NC_015737	AATCA	2	10	143605	143614	60 %	20 %	0 %	20 %	339441209
3007	NC_015737	GCT	2	6	143627	143632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441209
3008	NC_015737	CTG	2	6	143646	143651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441209
3009	NC_015737	TCA	2	6	143657	143662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441209
3010	NC_015737	ATC	2	6	143669	143674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441209
3011	NC_015737	GCG	2	6	143681	143686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441209
3012	NC_015737	GCT	3	9	143712	143720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441209
3013	NC_015737	CCT	2	6	143723	143728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441209
3014	NC_015737	GCC	2	6	143757	143762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441209
3015	NC_015737	TCT	2	6	143799	143804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441209
3016	NC_015737	A	7	7	143817	143823	100 %	0 %	0 %	0 %	339441209
3017	NC_015737	CTG	2	6	143902	143907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441209
3018	NC_015737	TCA	2	6	143994	143999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441209
3019	NC_015737	GAT	2	6	144028	144033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441209
3020	NC_015737	TTAAT	2	10	144143	144152	40 %	60 %	0 %	0 %	339441210
3021	NC_015737	T	6	6	144207	144212	0 %	100 %	0 %	0 %	339441210
3022	NC_015737	CAT	2	6	144214	144219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441210
3023	NC_015737	TTTTTC	2	12	144264	144275	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	339441210
3024	NC_015737	T	7	7	144355	144361	0 %	100 %	0 %	0 %	339441210
3025	NC_015737	AAGG	2	8	144365	144372	50 %	0 %	50 %	0 %	339441210
3026	NC_015737	CGA	2	6	144412	144417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441210
3027	NC_015737	GCA	2	6	144420	144425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441210
3028	NC_015737	CGGAA	2	10	144459	144468	40 %	0 %	40 %	20 %	339441210
3029	NC_015737	TCT	2	6	144514	144519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441210
3030	NC_015737	T	7	7	144580	144586	0 %	100 %	0 %	0 %	339441210
3031	NC_015737	TTC	2	6	144602	144607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441210
3032	NC_015737	CGC	2	6	144625	144630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441210
3033	NC_015737	TCA	2	6	144669	144674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441210
3034	NC_015737	CTT	3	9	144685	144693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441210
3035	NC_015737	GAC	2	6	144699	144704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441210
3036	NC_015737	TCT	2	6	144705	144710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441210
3037	NC_015737	CCT	2	6	144721	144726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441210
3038	NC_015737	CTT	2	6	144760	144765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441210
3039	NC_015737	TTCCTG	2	12	144804	144815	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	339441210
3040	NC_015737	CTTT	2	8	144823	144830	0 %	75 %	0 %	25 %	339441210
3041	NC_015737	ATAA	2	8	144869	144876	75 %	25 %	0 %	0 %	339441210
3042	NC_015737	CCG	2	6	144973	144978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441210
3043	NC_015737	TGC	2	6	144982	144987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441210
3044	NC_015737	CTG	3	9	145047	145055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441210
3045	NC_015737	GTT	2	6	145076	145081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339441210
3046	NC_015737	AAT	2	6	145124	145129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339441210
3047	NC_015737	T	6	6	145154	145159	0 %	100 %	0 %	0 %	339441210
3048	NC_015737	ATA	2	6	145161	145166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339441210
3049	NC_015737	CCT	2	6	145174	145179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_015737	CAG	2	6	145195	145200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_015737	CT	3	6	145222	145227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_015737	CGAAA	2	10	145310	145319	60 %	0 %	20 %	20 %	339441211
3053	NC_015737	CTG	2	6	145388	145393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441211
3054	NC_015737	CTG	2	6	145409	145414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441211
3055	NC_015737	A	6	6	145484	145489	100 %	0 %	0 %	0 %	339441211
3056	NC_015737	ATG	2	6	145518	145523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441211
3057	NC_015737	GCA	2	6	145527	145532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441211
3058	NC_015737	T	7	7	145537	145543	0 %	100 %	0 %	0 %	339441211
3059	NC_015737	TTTC	2	8	145547	145554	0 %	75 %	0 %	25 %	339441211
3060	NC_015737	A	6	6	145633	145638	100 %	0 %	0 %	0 %	339441212
3061	NC_015737	GCT	2	6	145781	145786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441212
3062	NC_015737	CT	3	6	145785	145790	0 %	50 %	0 %	50 %	339441212
3063	NC_015737	AAT	2	6	145823	145828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339441212
3064	NC_015737	TTA	2	6	145833	145838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339441212
3065	NC_015737	TGTC	2	8	145883	145890	0 %	50 %	25 %	25 %	339441212
3066	NC_015737	CCG	2	6	145933	145938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441212
3067	NC_015737	CAGG	2	8	145964	145971	25 %	0 %	50 %	25 %	339441212
3068	NC_015737	GCT	2	6	145987	145992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441212
3069	NC_015737	TGT	2	6	145996	146001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339441212
3070	NC_015737	TC	4	8	146024	146031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_015737	TCC	2	6	146120	146125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_015737	A	7	7	146161	146167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_015737	TCA	2	6	146205	146210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_015737	T	6	6	146258	146263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_015737	GCCCA	2	10	146316	146325	20 %	0 %	20 %	60 %	339441213
3076	NC_015737	CA	3	6	146373	146378	50 %	0 %	0 %	50 %	339441213
3077	NC_015737	ATG	2	6	146505	146510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441213
3078	NC_015737	CCG	2	6	146543	146548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441213
3079	NC_015737	CAT	2	6	146562	146567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441213
3080	NC_015737	TCTG	2	8	146580	146587	0 %	50 %	25 %	25 %	339441213
3081	NC_015737	GCA	2	6	146602	146607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441213
3082	NC_015737	CCG	3	9	146645	146653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441213
3083	NC_015737	TAGA	2	8	146657	146664	50 %	25 %	25 %	0 %	339441213
3084	NC_015737	TTC	2	6	146720	146725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441213
3085	NC_015737	GTG	2	6	146764	146769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339441213
3086	NC_015737	T	6	6	146817	146822	0 %	100 %	0 %	0 %	339441213
3087	NC_015737	CTC	2	6	146829	146834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441213
3088	NC_015737	AAAT	2	8	146857	146864	75 %	25 %	0 %	0 %	339441213
3089	NC_015737	AGAA	2	8	146894	146901	75 %	0 %	25 %	0 %	339441213
3090	NC_015737	T	6	6	146939	146944	0 %	100 %	0 %	0 %	339441213
3091	NC_015737	CTTC	2	8	147029	147036	0 %	50 %	0 %	50 %	339441213
3092	NC_015737	TAT	2	6	147040	147045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_015737	TCC	2	6	147118	147123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441214
3094	NC_015737	AAT	2	6	147133	147138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339441214
3095	NC_015737	TGCCAC	2	12	147169	147180	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339441214
3096	NC_015737	GCC	2	6	147206	147211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441214
3097	NC_015737	GCAAAA	2	12	147218	147229	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	339441214
3098	NC_015737	CAG	2	6	147244	147249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441214
3099	NC_015737	GGT	2	6	147319	147324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339441214
3100	NC_015737	GTG	2	6	147356	147361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339441214
3101	NC_015737	A	6	6	147378	147383	100 %	0 %	0 %	0 %	339441214
3102	NC_015737	TAAA	2	8	147386	147393	75 %	25 %	0 %	0 %	339441214
3103	NC_015737	GCC	2	6	147398	147403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441214
3104	NC_015737	TTTC	2	8	147446	147453	0 %	75 %	0 %	25 %	339441214
3105	NC_015737	CTG	2	6	147504	147509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441215
3106	NC_015737	TAA	2	6	147560	147565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339441215
3107	NC_015737	TCA	2	6	147596	147601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441215
3108	NC_015737	CGC	2	6	147618	147623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441215
3109	NC_015737	CTTC	2	8	147800	147807	0 %	50 %	0 %	50 %	339441215
3110	NC_015737	ATC	2	6	147810	147815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441215
3111	NC_015737	TCT	2	6	147875	147880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441215
3112	NC_015737	GGCC	2	8	147911	147918	0 %	0 %	50 %	50 %	339441215
3113	NC_015737	CG	3	6	147922	147927	0 %	0 %	50 %	50 %	339441215
3114	NC_015737	CTC	2	6	147939	147944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441215
3115	NC_015737	TGATT	2	10	148004	148013	20 %	60 %	20 %	0 %	339441215
3116	NC_015737	TA	3	6	148068	148073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015737	ATA	3	9	148071	148079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_015737	T	6	6	148096	148101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_015737	GAAAAA	2	12	148220	148231	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015737	CGTG	2	8	148278	148285	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3121	NC_015737	T	7	7	148409	148415	0 %	100 %	0 %	0 %	339441216
3122	NC_015737	CTT	2	6	148488	148493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441216
3123	NC_015737	CTC	2	6	148498	148503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441216
3124	NC_015737	CTT	2	6	148513	148518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441216
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3249	NC_015737	CATC	2	8	154373	154380	25 %	25 %	0 %	50 %	339441228
3250	NC_015737	TCT	2	6	154389	154394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441228
3251	NC_015737	GCT	2	6	154439	154444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441229
3252	NC_015737	CAC	2	6	154445	154450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441229
3253	NC_015737	TCAT	2	8	154482	154489	25 %	50 %	0 %	25 %	339441229
3254	NC_015737	CGGAC	2	10	154582	154591	20 %	0 %	40 %	40 %	339441229
3255	NC_015737	CTG	2	6	154649	154654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441229
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3257	NC_015737	GCT	2	6	154704	154709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441229
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3259	NC_015737	GCA	2	6	154764	154769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441229
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3261	NC_015737	CAT	2	6	154945	154950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441229
3262	NC_015737	CA	3	6	154964	154969	50 %	0 %	0 %	50 %	339441229
3263	NC_015737	GCC	2	6	154970	154975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441229
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3275	NC_015737	TGA	2	6	155627	155632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441230
3276	NC_015737	GCT	2	6	155637	155642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441230
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3279	NC_015737	A	6	6	155789	155794	100 %	0 %	0 %	0 %	339441230
3280	NC_015737	CTT	2	6	155849	155854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441230
3281	NC_015737	CA	3	6	155861	155866	50 %	0 %	0 %	50 %	339441230
3282	NC_015737	TTC	3	9	155922	155930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441230
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3286	NC_015737	GCATCA	2	12	156027	156038	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339441231
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3288	NC_015737	GTC	2	6	156263	156268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441231
3289	NC_015737	CCT	2	6	156279	156284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441232
3290	NC_015737	TAC	2	6	156329	156334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441232
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3297	NC_015737	ATCA	2	8	156677	156684	50 %	25 %	0 %	25 %	339441232
3298	NC_015737	CAT	2	6	156739	156744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441232
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3302	NC_015737	CAG	2	6	157055	157060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441232
3303	NC_015737	TGG	2	6	157096	157101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339441232
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3313	NC_015737	GTCCCG	2	12	157572	157583	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339441232
3314	NC_015737	ATC	3	9	157629	157637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441232
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3319	NC_015737	CTTT	2	8	158223	158230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3320	NC_015737	ATTT	2	8	158264	158271	25 %	75 %	0 %	0 %	339441233
3321	NC_015737	T	6	6	158335	158340	0 %	100 %	0 %	0 %	339441233
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3326	NC_015737	TTC	2	6	158515	158520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441233
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3328	NC_015737	CTT	2	6	158565	158570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441233
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3336	NC_015737	TGC	2	6	159338	159343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441234
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3338	NC_015737	GC	3	6	159475	159480	0 %	0 %	50 %	50 %	339441234
3339	NC_015737	CTT	2	6	159521	159526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441234
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3342	NC_015737	CATCGA	2	12	159676	159687	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339441234
3343	NC_015737	A	6	6	159884	159889	100 %	0 %	0 %	0 %	339441234
3344	NC_015737	ATCC	2	8	159906	159913	25 %	25 %	0 %	50 %	339441234
3345	NC_015737	CGC	2	6	159992	159997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441234
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3347	NC_015737	GTT	2	6	160080	160085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339441234
3348	NC_015737	TGT	2	6	160171	160176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339441234
3349	NC_015737	GGT	2	6	160228	160233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339441234
3350	NC_015737	TCG	2	6	160276	160281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441234
3351	NC_015737	CAC	2	6	160310	160315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441234
3352	NC_015737	CG	3	6	160406	160411	0 %	0 %	50 %	50 %	339441234
3353	NC_015737	ATT	2	6	160424	160429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339441234
3354	NC_015737	GCC	2	6	160440	160445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441234
3355	NC_015737	GCG	2	6	160453	160458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441234
3356	NC_015737	CCA	2	6	160498	160503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441234
3357	NC_015737	GCC	2	6	160518	160523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441234
3358	NC_015737	CTG	2	6	160526	160531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441234
3359	NC_015737	TCT	2	6	160552	160557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441234
3360	NC_015737	CAT	2	6	160625	160630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441234
3361	NC_015737	TCAT	2	8	160692	160699	25 %	50 %	0 %	25 %	339441234
3362	NC_015737	AGGT	2	8	160737	160744	25 %	25 %	50 %	0 %	339441234
3363	NC_015737	GCT	2	6	160750	160755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441234
3364	NC_015737	CCG	2	6	160779	160784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441234
3365	NC_015737	CGC	2	6	160789	160794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441234
3366	NC_015737	CGCA	2	8	160859	160866	25 %	0 %	25 %	50 %	339441234
3367	NC_015737	CCT	2	6	160870	160875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441234
3368	NC_015737	CTG	3	9	160886	160894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441234
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3370	NC_015737	CTTT	2	8	160920	160927	0 %	75 %	0 %	25 %	339441234
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3493	NC_015737	CTC	2	6	167224	167229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441245
3494	NC_015737	GTT	2	6	167239	167244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339441245
3495	NC_015737	CTT	2	6	167245	167250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441245
3496	NC_015737	CTTC	2	8	167307	167314	0 %	50 %	0 %	50 %	339441245
3497	NC_015737	TCC	2	6	167342	167347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441245
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3500	NC_015737	AGT	2	6	167426	167431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441245

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