MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCIT chromosome

Total Repeats: 1827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015736	ACG	2	6	56	61	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478130
2	NC_015736	CCT	2	6	72	77	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478130
3	NC_015736	TCC	2	6	452	457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478130
4	NC_015736	AGA	2	6	476	481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339478130
5	NC_015736	TGC	2	6	529	534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478130
6	NC_015736	GGT	2	6	580	585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478130
7	NC_015736	GGA	2	6	610	615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339478130
8	NC_015736	ACC	2	6	752	757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478130
9	NC_015736	GGC	2	6	951	956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478130
10	NC_015736	GGC	2	6	1087	1092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478130
11	NC_015736	AGG	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339478130
12	NC_015736	TTG	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339478130
13	NC_015736	TGG	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478130
14	NC_015736	ATA	2	6	1475	1480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339478131
15	NC_015736	GGA	2	6	1542	1547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339478131
16	NC_015736	TGC	2	6	1596	1601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478131
17	NC_015736	CTG	2	6	1786	1791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478131
18	NC_015736	GTG	2	6	1835	1840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478131
19	NC_015736	GGC	2	6	1960	1965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478131
20	NC_015736	GCG	2	6	1991	1996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478131
21	NC_015736	CTT	2	6	2085	2090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339478132
22	NC_015736	CGG	2	6	2091	2096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478132
23	NC_015736	ATG	2	6	2141	2146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478132
24	NC_015736	CCT	2	6	2271	2276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478132
25	NC_015736	GCT	2	6	2297	2302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478132
26	NC_015736	GCC	2	6	2362	2367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478132
27	NC_015736	TAC	2	6	2410	2415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478132
28	NC_015736	TGT	2	6	2712	2717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339478132
29	NC_015736	CGC	2	6	2796	2801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478132
30	NC_015736	GCC	2	6	2887	2892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478132
31	NC_015736	TGC	2	6	2909	2914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478132
32	NC_015736	GGC	2	6	2943	2948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478132
33	NC_015736	AAT	2	6	2949	2954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339478132
34	NC_015736	TGC	2	6	2958	2963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478132
35	NC_015736	TGG	2	6	3352	3357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015736	GCA	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015736	GCA	2	6	3454	3459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015736	CCT	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015736	CAG	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015736	ATG	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015736	TGC	2	6	3842	3847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015736	TGC	2	6	3933	3938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015736	AAG	2	6	3949	3954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015736	GCC	2	6	3974	3979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015736	CCT	2	6	4024	4029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015736	GCA	2	6	4170	4175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015736	GCA	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015736	GTA	2	6	4560	4565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015736	TGC	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015736	GCC	2	6	4693	4698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478133
51	NC_015736	GCA	2	6	4716	4721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478133
52	NC_015736	AGC	2	6	4760	4765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478133
53	NC_015736	CTC	2	6	4794	4799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478133
54	NC_015736	ACT	2	6	4857	4862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478133
55	NC_015736	ACG	2	6	4898	4903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015736	GCT	2	6	4936	4941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015736	GCC	2	6	5075	5080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478134
58	NC_015736	AAC	2	6	5110	5115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339478134
59	NC_015736	GCA	2	6	5189	5194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478134
60	NC_015736	AGG	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339478134
61	NC_015736	GCT	2	6	5297	5302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478134
62	NC_015736	ACG	2	6	5321	5326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478134
63	NC_015736	GGC	2	6	5354	5359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478134
64	NC_015736	CGA	2	6	5383	5388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478134
65	NC_015736	GGC	2	6	5413	5418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478134
66	NC_015736	ATG	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478134
67	NC_015736	GTG	2	6	5546	5551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478135
68	NC_015736	GCG	2	6	5616	5621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478135
69	NC_015736	TGC	2	6	5655	5660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478135
70	NC_015736	TGC	2	6	5725	5730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478135
71	NC_015736	TAG	2	6	5774	5779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478135
72	NC_015736	GCA	2	6	5839	5844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478135
73	NC_015736	TAC	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478135
74	NC_015736	GCG	2	6	5944	5949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478135
75	NC_015736	CGC	2	6	5954	5959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478135
76	NC_015736	GAG	2	6	5960	5965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339478135
77	NC_015736	GCA	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478135
78	NC_015736	GCT	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478135
79	NC_015736	ATA	2	6	6292	6297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339478135
80	NC_015736	CTA	2	6	6348	6353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478135
81	NC_015736	GCA	2	6	6451	6456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015736	GCT	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015736	AGT	2	6	6614	6619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478136
84	NC_015736	TGC	2	6	6630	6635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478136
85	NC_015736	TAG	2	6	6808	6813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478136
86	NC_015736	TGA	2	6	6921	6926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478136
87	NC_015736	CCG	2	6	7037	7042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478136
88	NC_015736	AAT	2	6	7049	7054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339478136
89	NC_015736	GGT	2	6	7060	7065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478136
90	NC_015736	CTG	2	6	7156	7161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478136
91	NC_015736	GTG	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478136
92	NC_015736	TGG	2	6	7469	7474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478136
93	NC_015736	CGG	2	6	7600	7605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478136
94	NC_015736	CAG	2	6	7620	7625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478136
95	NC_015736	TGC	2	6	7672	7677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478136
96	NC_015736	AGT	2	6	7823	7828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478137
97	NC_015736	GTG	2	6	7843	7848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478137
98	NC_015736	GCC	2	6	7959	7964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478137
99	NC_015736	CCT	2	6	8023	8028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478137
100	NC_015736	GCC	2	6	8041	8046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478137
101	NC_015736	GCA	2	6	8053	8058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478137
102	NC_015736	CCG	2	6	8123	8128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478137
103	NC_015736	TCG	2	6	8179	8184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478137
104	NC_015736	CAA	2	6	8207	8212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339478137
105	NC_015736	AGG	2	6	8269	8274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339478137
106	NC_015736	ATC	2	6	8350	8355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478137
107	NC_015736	GTA	2	6	8375	8380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478137
108	NC_015736	CTG	2	6	8511	8516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015736	GGA	2	6	8543	8548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015736	CGG	2	6	8656	8661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478138
111	NC_015736	GCG	2	6	8859	8864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478138
112	NC_015736	TAC	2	6	8891	8896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478138
113	NC_015736	CAT	2	6	8923	8928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478138
114	NC_015736	TCG	2	6	9084	9089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478138
115	NC_015736	TCG	2	6	9128	9133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478138
116	NC_015736	CCT	2	6	9187	9192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478138
117	NC_015736	GCT	2	6	9508	9513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478138
118	NC_015736	ACG	2	6	9525	9530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478138
119	NC_015736	CTA	2	6	9544	9549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478138
120	NC_015736	ATG	2	6	9614	9619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478138
121	NC_015736	CGG	2	6	9705	9710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478138
122	NC_015736	CCA	2	6	9750	9755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478138
123	NC_015736	CGC	2	6	9760	9765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478138
124	NC_015736	TGG	2	6	9924	9929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015736	CTG	2	6	10049	10054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015736	AGC	2	6	10114	10119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015736	TGC	2	6	10278	10283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015736	CGC	2	6	10360	10365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015736	CAG	2	6	10397	10402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015736	CGT	2	6	10461	10466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015736	TGG	2	6	10495	10500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015736	TGC	2	6	10548	10553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015736	GCA	2	6	10613	10618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015736	GTT	2	6	10662	10667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015736	CTT	2	6	10849	10854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015736	ATG	2	6	10899	10904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015736	GAT	2	6	10988	10993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015736	ACT	2	6	11029	11034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478139
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146	NC_015736	CGG	2	6	11746	11751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_015736	AGT	2	6	19787	19792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478145
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