MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCIT chromosome

Total Repeats: 2756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015736	GCA	2	6	97504	97509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478206
2002	NC_015736	CCTGG	2	10	97588	97597	0 %	20 %	40 %	40 %	339478207
2003	NC_015736	GC	3	6	97615	97620	0 %	0 %	50 %	50 %	339478207
2004	NC_015736	CCG	2	6	97704	97709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478207
2005	NC_015736	AGC	2	6	97715	97720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478207
2006	NC_015736	AAT	2	6	97835	97840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339478207
2007	NC_015736	AC	3	6	97905	97910	50 %	0 %	0 %	50 %	339478207
2008	NC_015736	CAA	2	6	97941	97946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339478207
2009	NC_015736	TCA	2	6	97968	97973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478207
2010	NC_015736	GCA	2	6	97998	98003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478207
2011	NC_015736	CTC	2	6	98048	98053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478207
2012	NC_015736	TAGG	2	8	98133	98140	25 %	25 %	50 %	0 %	339478208
2013	NC_015736	CGCAA	2	10	98195	98204	40 %	0 %	20 %	40 %	339478208
2014	NC_015736	AGC	2	6	98220	98225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478208
2015	NC_015736	TTC	2	6	98250	98255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339478208
2016	NC_015736	CCG	2	6	98260	98265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478208
2017	NC_015736	GCGAG	2	10	98326	98335	20 %	0 %	60 %	20 %	339478208
2018	NC_015736	GCA	2	6	98368	98373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478208
2019	NC_015736	TG	3	6	98383	98388	0 %	50 %	50 %	0 %	339478208
2020	NC_015736	GCCT	2	8	98510	98517	0 %	25 %	25 %	50 %	339478208
2021	NC_015736	CAG	2	6	98581	98586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478208
2022	NC_015736	GCT	2	6	98589	98594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478208
2023	NC_015736	CGT	2	6	98605	98610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478208
2024	NC_015736	AGAAGT	2	12	98629	98640	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	339478208
2025	NC_015736	AGC	2	6	98666	98671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478208
2026	NC_015736	GCA	2	6	98709	98714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478208
2027	NC_015736	GTG	2	6	98743	98748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478208
2028	NC_015736	GCC	2	6	98801	98806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478208
2029	NC_015736	TGA	2	6	98810	98815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478208
2030	NC_015736	CAG	2	6	98828	98833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478208
2031	NC_015736	GTG	2	6	98835	98840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478208
2032	NC_015736	TGC	2	6	98844	98849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478208
2033	NC_015736	C	6	6	98860	98865	0 %	0 %	0 %	100 %	339478208
2034	NC_015736	CGC	3	9	98908	98916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478208
2035	NC_015736	GCA	2	6	98956	98961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478208
2036	NC_015736	GTA	2	6	98968	98973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478208
2037	NC_015736	CCTT	2	8	99039	99046	0 %	50 %	0 %	50 %	339478208
2038	NC_015736	CCAGC	2	10	99112	99121	20 %	0 %	20 %	60 %	339478208
2039	NC_015736	GCTG	2	8	99144	99151	0 %	25 %	50 %	25 %	339478208
2040	NC_015736	CGA	2	6	99152	99157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478208
2041	NC_015736	GTGCCA	2	12	99183	99194	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339478208
2042	NC_015736	CAT	2	6	99224	99229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478208
2043	NC_015736	ATG	2	6	99288	99293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478209
2044	NC_015736	ACC	2	6	99515	99520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478209
2045	NC_015736	GTCAGT	2	12	99607	99618	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339478209
2046	NC_015736	CG	3	6	99636	99641	0 %	0 %	50 %	50 %	339478209
2047	NC_015736	CCA	2	6	99684	99689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478209
2048	NC_015736	TGC	2	6	99752	99757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478210
2049	NC_015736	TCCT	2	8	99790	99797	0 %	50 %	0 %	50 %	339478210
2050	NC_015736	CCTA	2	8	99822	99829	25 %	25 %	0 %	50 %	339478210
2051	NC_015736	GCA	2	6	99865	99870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478210
2052	NC_015736	TGG	2	6	99914	99919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478210
2053	NC_015736	TGCGC	2	10	100025	100034	0 %	20 %	40 %	40 %	339478210
2054	NC_015736	CAG	2	6	100037	100042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478211
2055	NC_015736	ACC	2	6	100122	100127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478211
2056	NC_015736	TCG	2	6	100159	100164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478211
2057	NC_015736	GCCTG	2	10	100247	100256	0 %	20 %	40 %	40 %	339478211
2058	NC_015736	CGC	2	6	100300	100305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478211
2059	NC_015736	GTG	2	6	100351	100356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478211
2060	NC_015736	GCA	2	6	100374	100379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478211
2061	NC_015736	GCA	2	6	100542	100547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478211
2062	NC_015736	CTCTA	2	10	100699	100708	20 %	40 %	0 %	40 %	339478212
2063	NC_015736	TGG	2	6	100744	100749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478212
2064	NC_015736	AC	3	6	100758	100763	50 %	0 %	0 %	50 %	339478212
2065	NC_015736	TGC	2	6	100811	100816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478212
2066	NC_015736	GC	3	6	100842	100847	0 %	0 %	50 %	50 %	339478212
2067	NC_015736	CTA	2	6	100857	100862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478212
2068	NC_015736	CCCG	2	8	100868	100875	0 %	0 %	25 %	75 %	339478212
2069	NC_015736	AGC	2	6	100945	100950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478212
2070	NC_015736	AGT	2	6	100957	100962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478212
2071	NC_015736	GAA	2	6	101013	101018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339478212
2072	NC_015736	GTA	2	6	101092	101097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478212
2073	NC_015736	GCT	2	6	101109	101114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478212
2074	NC_015736	TGCA	2	8	101126	101133	25 %	25 %	25 %	25 %	339478212
2075	NC_015736	AGA	2	6	101231	101236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339478212
2076	NC_015736	CCCT	2	8	101243	101250	0 %	25 %	0 %	75 %	339478212
2077	NC_015736	CCT	2	6	101297	101302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478213
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2079	NC_015736	TCC	2	6	101346	101351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478213
2080	NC_015736	CGC	2	6	101468	101473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478213
2081	NC_015736	CTGCG	2	10	101489	101498	0 %	20 %	40 %	40 %	339478213
2082	NC_015736	ACG	2	6	101500	101505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478213
2083	NC_015736	TTG	2	6	101595	101600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339478213
2084	NC_015736	GGT	2	6	101603	101608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478213
2085	NC_015736	GC	3	6	101632	101637	0 %	0 %	50 %	50 %	339478213
2086	NC_015736	TGCC	2	8	101771	101778	0 %	25 %	25 %	50 %	339478214
2087	NC_015736	CGC	2	6	101840	101845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478214
2088	NC_015736	CG	3	6	101957	101962	0 %	0 %	50 %	50 %	339478214
2089	NC_015736	GC	3	6	101969	101974	0 %	0 %	50 %	50 %	339478214
2090	NC_015736	CCT	2	6	102112	102117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478215
2091	NC_015736	GAG	2	6	102155	102160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339478215
2092	NC_015736	CCA	2	6	102225	102230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478216
2093	NC_015736	CAT	2	6	102375	102380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478216
2094	NC_015736	GCCCC	2	10	102389	102398	0 %	0 %	20 %	80 %	339478216
2095	NC_015736	CGA	2	6	102478	102483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478216
2096	NC_015736	TG	3	6	102498	102503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2097	NC_015736	GCT	2	6	102505	102510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478217
2098	NC_015736	CGAGC	2	10	102520	102529	20 %	0 %	40 %	40 %	339478217
2099	NC_015736	AGC	2	6	102591	102596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478217
2100	NC_015736	TGTGC	2	10	102634	102643	0 %	40 %	40 %	20 %	339478217
2101	NC_015736	CCCT	2	8	102737	102744	0 %	25 %	0 %	75 %	339478217
2102	NC_015736	CTAA	2	8	102902	102909	50 %	25 %	0 %	25 %	339478218
2103	NC_015736	GCG	2	6	102942	102947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478218
2104	NC_015736	GCGT	2	8	102957	102964	0 %	25 %	50 %	25 %	339478218
2105	NC_015736	CGA	2	6	103021	103026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478218
2106	NC_015736	CG	3	6	103077	103082	0 %	0 %	50 %	50 %	339478218
2107	NC_015736	ACCTC	2	10	103093	103102	20 %	20 %	0 %	60 %	339478219
2108	NC_015736	TGC	2	6	103108	103113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478219
2109	NC_015736	GCT	2	6	103198	103203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478219
2110	NC_015736	GCCCT	2	10	103244	103253	0 %	20 %	20 %	60 %	339478219
2111	NC_015736	GC	3	6	103326	103331	0 %	0 %	50 %	50 %	339478219
2112	NC_015736	CG	3	6	103348	103353	0 %	0 %	50 %	50 %	339478219
2113	NC_015736	CAGC	2	8	103357	103364	25 %	0 %	25 %	50 %	339478219
2114	NC_015736	CAT	2	6	103562	103567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478220
2115	NC_015736	CAGC	2	8	103588	103595	25 %	0 %	25 %	50 %	339478220
2116	NC_015736	CA	3	6	103638	103643	50 %	0 %	0 %	50 %	339478220
2117	NC_015736	GCA	2	6	103692	103697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478220
2118	NC_015736	GC	3	6	103698	103703	0 %	0 %	50 %	50 %	339478220
2119	NC_015736	GCT	2	6	103723	103728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478220
2120	NC_015736	TGC	2	6	103816	103821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478220
2121	NC_015736	AGC	2	6	103827	103832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478220
2122	NC_015736	CTGCT	2	10	103839	103848	0 %	40 %	20 %	40 %	339478220
2123	NC_015736	CCT	2	6	103876	103881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478221
2124	NC_015736	CCT	2	6	103954	103959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478221
2125	NC_015736	GCC	2	6	103967	103972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478221
2126	NC_015736	GCT	2	6	103986	103991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478221
2127	NC_015736	TGGG	2	8	104068	104075	0 %	25 %	75 %	0 %	339478221
2128	NC_015736	GAT	2	6	104140	104145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478221
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2131	NC_015736	TGG	2	6	104199	104204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478221
2132	NC_015736	CCCTTG	2	12	104217	104228	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	339478221
2133	NC_015736	CACC	2	8	104258	104265	25 %	0 %	0 %	75 %	339478221
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2141	NC_015736	GCGA	2	8	104718	104725	25 %	0 %	50 %	25 %	339478222
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2145	NC_015736	CCTCTC	2	12	105101	105112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478223
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2148	NC_015736	ACGC	2	8	105274	105281	25 %	0 %	25 %	50 %	339478224
2149	NC_015736	TGC	2	6	105291	105296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478224
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2153	NC_015736	GCCA	2	8	105688	105695	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2154	NC_015736	ACT	2	6	105727	105732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478225
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2157	NC_015736	TAC	2	6	105882	105887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478225
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2167	NC_015736	CG	3	6	106371	106376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2170	NC_015736	GC	3	6	106565	106570	0 %	0 %	50 %	50 %	339478227
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2197	NC_015736	TACTG	2	10	107894	107903	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2200	NC_015736	CGT	2	6	108216	108221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478230
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2231	NC_015736	ATG	2	6	110354	110359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478233
2232	NC_015736	CCGG	2	8	110402	110409	0 %	0 %	50 %	50 %	339478234
2233	NC_015736	CTG	2	6	110433	110438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478234
2234	NC_015736	AGG	2	6	110531	110536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339478234
2235	NC_015736	GCG	2	6	110545	110550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478234
2236	NC_015736	GCT	3	9	110591	110599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478234
2237	NC_015736	GC	3	6	110605	110610	0 %	0 %	50 %	50 %	339478234
2238	NC_015736	GCT	2	6	110618	110623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478234
2239	NC_015736	TCCT	2	8	110748	110755	0 %	50 %	0 %	50 %	339478235
2240	NC_015736	TGC	2	6	110840	110845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478235
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2242	NC_015736	GT	3	6	110900	110905	0 %	50 %	50 %	0 %	339478235
2243	NC_015736	GCC	2	6	110910	110915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478235
2244	NC_015736	GCG	2	6	110944	110949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478235
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2246	NC_015736	ACC	2	6	111127	111132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478235
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2483	NC_015736	AAG	2	6	124165	124170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2485	NC_015736	TGT	2	6	124237	124242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2486	NC_015736	ATC	2	6	124331	124336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2487	NC_015736	CG	3	6	124340	124345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2488	NC_015736	CAT	2	6	124388	124393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2489	NC_015736	AC	3	6	124475	124480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2490	NC_015736	TCTTG	2	10	124496	124505	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2491	NC_015736	TTA	2	6	124514	124519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2492	NC_015736	CAG	2	6	124565	124570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2493	NC_015736	GAC	2	6	124610	124615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2494	NC_015736	AGC	2	6	124662	124667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2495	NC_015736	ACG	2	6	124716	124721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2496	NC_015736	CTG	2	6	124777	124782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2497	NC_015736	GATGA	2	10	124792	124801	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2498	NC_015736	ACC	2	6	124911	124916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2499	NC_015736	CTC	2	6	125030	125035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2500	NC_015736	GAG	2	6	125049	125054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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