MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCIT chromosome

Total Repeats: 2756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015736	GCC	2	6	73920	73925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478186
1502	NC_015736	CAC	2	6	74016	74021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478186
1503	NC_015736	AGC	2	6	74055	74060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478186
1504	NC_015736	ATGCC	2	10	74203	74212	20 %	20 %	20 %	40 %	339478186
1505	NC_015736	TGCA	2	8	74246	74253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_015736	GCAC	2	8	74298	74305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_015736	CG	3	6	74308	74313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_015736	TGT	2	6	74379	74384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015736	GA	3	6	74462	74467	50 %	0 %	50 %	0 %	339478187
1510	NC_015736	GCTCT	2	10	74471	74480	0 %	40 %	20 %	40 %	339478187
1511	NC_015736	TCC	2	6	74509	74514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478187
1512	NC_015736	AGGC	2	8	74540	74547	25 %	0 %	50 %	25 %	339478187
1513	NC_015736	GGTG	2	8	74575	74582	0 %	25 %	75 %	0 %	339478187
1514	NC_015736	GTG	2	6	74650	74655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478187
1515	NC_015736	GCC	2	6	74678	74683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478187
1516	NC_015736	TAC	2	6	74707	74712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478187
1517	NC_015736	CCT	2	6	74730	74735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478187
1518	NC_015736	GCA	2	6	74767	74772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478187
1519	NC_015736	TCAT	2	8	74787	74794	25 %	50 %	0 %	25 %	339478187
1520	NC_015736	TGG	2	6	74827	74832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478187
1521	NC_015736	CTA	2	6	74842	74847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478187
1522	NC_015736	GCG	2	6	74890	74895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478187
1523	NC_015736	GGC	2	6	74904	74909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478187
1524	NC_015736	GCT	2	6	74953	74958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478187
1525	NC_015736	TTG	2	6	74995	75000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339478187
1526	NC_015736	AGGG	2	8	75060	75067	25 %	0 %	75 %	0 %	339478187
1527	NC_015736	GCA	2	6	75085	75090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478187
1528	NC_015736	ACC	2	6	75092	75097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478187
1529	NC_015736	TGT	3	9	75104	75112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339478187
1530	NC_015736	AGC	2	6	75259	75264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_015736	GCC	2	6	75288	75293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_015736	GCA	2	6	75398	75403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_015736	GCA	2	6	75444	75449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_015736	GTC	2	6	75504	75509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_015736	GCAG	2	8	75650	75657	25 %	0 %	50 %	25 %	339478188
1536	NC_015736	ACAGC	2	10	75676	75685	40 %	0 %	20 %	40 %	339478188
1537	NC_015736	CT	3	6	75694	75699	0 %	50 %	0 %	50 %	339478188
1538	NC_015736	GCG	2	6	75747	75752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478188
1539	NC_015736	TGC	2	6	75770	75775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478188
1540	NC_015736	GCGTA	2	10	75787	75796	20 %	20 %	40 %	20 %	339478188
1541	NC_015736	ACG	2	6	75824	75829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478188
1542	NC_015736	CTG	3	9	75856	75864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478188
1543	NC_015736	GCA	3	9	75904	75912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478188
1544	NC_015736	GCT	2	6	75925	75930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478188
1545	NC_015736	CG	3	6	75940	75945	0 %	0 %	50 %	50 %	339478188
1546	NC_015736	AGC	2	6	75964	75969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478188
1547	NC_015736	CAC	2	6	75980	75985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478188
1548	NC_015736	C	6	6	76018	76023	0 %	0 %	0 %	100 %	339478188
1549	NC_015736	GC	3	6	76027	76032	0 %	0 %	50 %	50 %	339478188
1550	NC_015736	CCT	2	6	76053	76058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478188
1551	NC_015736	TGG	2	6	76070	76075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478188
1552	NC_015736	GAA	2	6	76113	76118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339478188
1553	NC_015736	CTGCG	2	10	76184	76193	0 %	20 %	40 %	40 %	339478188
1554	NC_015736	CG	3	6	76285	76290	0 %	0 %	50 %	50 %	339478188
1555	NC_015736	AC	3	6	76317	76322	50 %	0 %	0 %	50 %	339478188
1556	NC_015736	GGC	2	6	76374	76379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478188
1557	NC_015736	TTA	2	6	76511	76516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339478188
1558	NC_015736	GCA	2	6	76570	76575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478188
1559	NC_015736	CGC	2	6	76583	76588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478188
1560	NC_015736	GCA	4	12	76648	76659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478188
1561	NC_015736	AGGCTC	2	12	76662	76673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339478188
1562	NC_015736	CGA	2	6	76733	76738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478188
1563	NC_015736	CAC	2	6	76836	76841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478188
1564	NC_015736	TAG	2	6	76884	76889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_015736	GCCAT	2	10	76926	76935	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1566	NC_015736	CTG	2	6	76942	76947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_015736	GCG	2	6	77065	77070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_015736	ATT	2	6	77075	77080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_015736	GCA	2	6	77203	77208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_015736	CCA	2	6	77209	77214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_015736	AGG	2	6	77309	77314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_015736	GCA	2	6	77381	77386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_015736	AGG	2	6	77423	77428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_015736	CG	3	6	77465	77470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_015736	AGC	2	6	77560	77565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_015736	GTG	2	6	77597	77602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_015736	CGG	2	6	77637	77642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_015736	TG	3	6	77678	77683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_015736	TGG	2	6	77775	77780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_015736	GAC	2	6	77796	77801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_015736	AGC	2	6	77887	77892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_015736	AGCC	2	8	77962	77969	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_015736	GC	3	6	78004	78009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_015736	AAG	2	6	78016	78021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015736	GCG	2	6	78033	78038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_015736	GTG	2	6	78084	78089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_015736	AACA	2	8	78123	78130	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_015736	CG	3	6	78206	78211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_015736	AGCGA	2	10	78223	78232	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1590	NC_015736	GC	3	6	78317	78322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_015736	CGG	2	6	78346	78351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_015736	CTG	2	6	78389	78394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_015736	CGC	2	6	78395	78400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_015736	GA	3	6	78409	78414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015736	CATC	2	8	78475	78482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_015736	AGA	2	6	78684	78689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339478189
1597	NC_015736	TGA	2	6	78774	78779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478189
1598	NC_015736	GC	3	6	78927	78932	0 %	0 %	50 %	50 %	339478189
1599	NC_015736	CGCACC	2	12	78980	78991	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	339478189
1600	NC_015736	GAC	2	6	79039	79044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478189
1601	NC_015736	GGC	2	6	79083	79088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478189
1602	NC_015736	GCA	2	6	79141	79146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478189
1603	NC_015736	GC	3	6	79149	79154	0 %	0 %	50 %	50 %	339478189
1604	NC_015736	GTGC	2	8	79200	79207	0 %	25 %	50 %	25 %	339478189
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1607	NC_015736	GC	3	6	79423	79428	0 %	0 %	50 %	50 %	339478190
1608	NC_015736	GCT	2	6	79439	79444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478190
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1610	NC_015736	CA	3	6	79492	79497	50 %	0 %	0 %	50 %	339478190
1611	NC_015736	GGCGA	2	10	79541	79550	20 %	0 %	60 %	20 %	339478190
1612	NC_015736	GCT	2	6	79661	79666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478190
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1614	NC_015736	GC	3	6	79785	79790	0 %	0 %	50 %	50 %	339478190
1615	NC_015736	GGCCT	2	10	79792	79801	0 %	20 %	40 %	40 %	339478190
1616	NC_015736	TGG	2	6	79970	79975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478190
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1618	NC_015736	ATGC	2	8	80199	80206	25 %	25 %	25 %	25 %	339478190
1619	NC_015736	ACT	2	6	80302	80307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_015736	GCT	2	6	80332	80337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_015736	GTT	2	6	80432	80437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_015736	GCT	2	6	80438	80443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_015736	CAA	2	6	80465	80470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_015736	GCC	2	6	80523	80528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_015736	CGT	2	6	80567	80572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_015736	ATGTA	2	10	80624	80633	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_015736	GTG	3	9	80655	80663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_015736	GC	4	8	80684	80691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_015736	TTG	2	6	80694	80699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1631	NC_015736	CAG	2	6	80769	80774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1755	NC_015736	TGC	2	6	86724	86729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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