MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Moranella endobia PCIT chromosome

Total Repeats: 12091

< Previous12...13141516171819202122232425Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_015735	A	6	6	534046	534051	100 %	0 %	0 %	0 %	339478127
12002	NC_015735	CAAG	2	8	534146	534153	50 %	0 %	25 %	25 %	339478127
12003	NC_015735	GAT	2	6	534167	534172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478127
12004	NC_015735	AGCC	2	8	534201	534208	25 %	0 %	25 %	50 %	339478127
12005	NC_015735	GGCCG	2	10	534210	534219	0 %	0 %	60 %	40 %	339478127
12006	NC_015735	GCC	2	6	534295	534300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478127
12007	NC_015735	GCC	2	6	534307	534312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339478127
12008	NC_015735	CG	3	6	534325	534330	0 %	0 %	50 %	50 %	339478127
12009	NC_015735	GCT	3	9	534337	534345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478127
12010	NC_015735	GTCGA	2	10	534361	534370	20 %	20 %	40 %	20 %	339478127
12011	NC_015735	AACTT	2	10	534391	534400	40 %	40 %	0 %	20 %	339478127
12012	NC_015735	TGAT	2	8	534463	534470	25 %	50 %	25 %	0 %	339478127
12013	NC_015735	GTA	2	6	534482	534487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478127
12014	NC_015735	AAC	2	6	534583	534588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339478127
12015	NC_015735	CGG	2	6	534622	534627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478127
12016	NC_015735	GTC	2	6	534651	534656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478127
12017	NC_015735	GTAT	2	8	534658	534665	25 %	50 %	25 %	0 %	339478127
12018	NC_015735	AGC	2	6	534735	534740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12019	NC_015735	ATA	2	6	534765	534770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_015735	TTA	2	6	534862	534867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339478128
12021	NC_015735	GTT	3	9	534902	534910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339478128
12022	NC_015735	TCT	2	6	534913	534918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339478128
12023	NC_015735	TTA	2	6	534945	534950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339478128
12024	NC_015735	GCT	2	6	534952	534957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478128
12025	NC_015735	ATC	2	6	535001	535006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478128
12026	NC_015735	ACC	2	6	535037	535042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478128
12027	NC_015735	CGG	2	6	535094	535099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339478128
12028	NC_015735	T	8	8	535124	535131	0 %	100 %	0 %	0 %	339478128
12029	NC_015735	TTA	2	6	535191	535196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339478128
12030	NC_015735	TAG	2	6	535267	535272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478128
12031	NC_015735	AGC	2	6	535283	535288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478128
12032	NC_015735	GAA	2	6	535296	535301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339478128
12033	NC_015735	ACC	2	6	535341	535346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478128
12034	NC_015735	GCATA	2	10	535351	535360	40 %	20 %	20 %	20 %	339478128
12035	NC_015735	AGC	2	6	535373	535378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478128
12036	NC_015735	CT	4	8	535393	535400	0 %	50 %	0 %	50 %	339478128
12037	NC_015735	CCA	2	6	535479	535484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478128
12038	NC_015735	GAT	2	6	535572	535577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339478128
12039	NC_015735	T	6	6	535713	535718	0 %	100 %	0 %	0 %	339478128
12040	NC_015735	GCT	2	6	535741	535746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478128
12041	NC_015735	TCA	2	6	535761	535766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478128
12042	NC_015735	GCTC	2	8	535798	535805	0 %	25 %	25 %	50 %	339478128
12043	NC_015735	GCGCC	2	10	535850	535859	0 %	0 %	40 %	60 %	339478128
12044	NC_015735	CAC	2	6	535921	535926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478128
12045	NC_015735	ACT	2	6	535941	535946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478128
12046	NC_015735	CCT	2	6	535999	536004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478128
12047	NC_015735	GGT	2	6	536045	536050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339478128
12048	NC_015735	TA	3	6	536287	536292	50 %	50 %	0 %	0 %	339478128
12049	NC_015735	CTA	2	6	536314	536319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478128
12050	NC_015735	GAC	2	6	536356	536361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478128
12051	NC_015735	ATA	2	6	536366	536371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339478128
12052	NC_015735	AGCT	2	8	536374	536381	25 %	25 %	25 %	25 %	339478128
12053	NC_015735	TGC	2	6	536461	536466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478128
12054	NC_015735	CGA	2	6	536476	536481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478128
12055	NC_015735	AACG	2	8	536517	536524	50 %	0 %	25 %	25 %	339478128
12056	NC_015735	GCT	2	6	536554	536559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478128
12057	NC_015735	TCC	2	6	536573	536578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339478128
12058	NC_015735	TGTAC	2	10	536580	536589	20 %	40 %	20 %	20 %	339478128
12059	NC_015735	CAG	2	6	536593	536598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478128
12060	NC_015735	AGAT	2	8	536623	536630	50 %	25 %	25 %	0 %	339478128
12061	NC_015735	GC	3	6	536712	536717	0 %	0 %	50 %	50 %	339478128
12062	NC_015735	TCA	2	6	536761	536766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339478128
12063	NC_015735	AGC	2	6	536985	536990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478128
12064	NC_015735	ATAA	2	8	537119	537126	75 %	25 %	0 %	0 %	339478128
12065	NC_015735	CAA	2	6	537134	537139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339478128
12066	NC_015735	CAG	2	6	537261	537266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12067	NC_015735	CAA	2	6	537281	537286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12068	NC_015735	ATTGA	2	10	537299	537308	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12069	NC_015735	AT	3	6	537316	537321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12070	NC_015735	GCC	2	6	537354	537359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12071	NC_015735	CTG	2	6	537365	537370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12072	NC_015735	TTA	2	6	537441	537446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12073	NC_015735	ACT	2	6	537457	537462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12074	NC_015735	TAT	2	6	537487	537492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12075	NC_015735	GCT	2	6	537607	537612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12076	NC_015735	CAA	2	6	537631	537636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12077	NC_015735	TCT	2	6	537643	537648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12078	NC_015735	A	9	9	537818	537826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12079	NC_015735	GATCA	2	10	537844	537853	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12080	NC_015735	TAT	2	6	537888	537893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12081	NC_015735	TACA	2	8	537895	537902	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12082	NC_015735	A	6	6	537924	537929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12083	NC_015735	TAAT	2	8	538017	538024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12084	NC_015735	ATTG	2	8	538038	538045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12085	NC_015735	GT	3	6	538090	538095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12086	NC_015735	ACT	2	6	538116	538121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12087	NC_015735	TGC	2	6	538193	538198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12088	NC_015735	TTA	2	6	538203	538208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12089	NC_015735	TAT	2	6	538214	538219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12090	NC_015735	ATC	2	6	538241	538246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12091	NC_015735	TAAAA	2	10	538275	538284	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...13141516171819202122232425Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.