MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 1183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015727	CTTGA	2	10	713	722	20 %	40 %	20 %	20 %	339327782
2	NC_015727	GCGTC	2	10	1475	1484	0 %	20 %	40 %	40 %	339327783
3	NC_015727	GCGCC	2	10	5545	5554	0 %	0 %	40 %	60 %	339327785
4	NC_015727	TGCGC	2	10	6445	6454	0 %	20 %	40 %	40 %	339327787
5	NC_015727	GCGCG	2	10	7079	7088	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015727	CGCTC	2	10	7600	7609	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_015727	GGGCA	2	10	7808	7817	20 %	0 %	60 %	20 %	339327791
8	NC_015727	CGTGC	2	10	10432	10441	0 %	20 %	40 %	40 %	339327793
9	NC_015727	TGCCG	2	10	11194	11203	0 %	20 %	40 %	40 %	339327793
10	NC_015727	GCCGT	2	10	12655	12664	0 %	20 %	40 %	40 %	339327795
11	NC_015727	GGCCG	2	10	13491	13500	0 %	0 %	60 %	40 %	339327796
12	NC_015727	CGGCA	2	10	13883	13892	20 %	0 %	40 %	40 %	339327797
13	NC_015727	ATGGA	2	10	16796	16805	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015727	AGTGC	2	10	17254	17263	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015727	CTGCG	2	10	18956	18965	0 %	20 %	40 %	40 %	339327799
16	NC_015727	TGACA	2	10	21826	21835	40 %	20 %	20 %	20 %	339327801
17	NC_015727	CGAGG	2	10	23817	23826	20 %	0 %	60 %	20 %	339327803
18	NC_015727	CAGCG	2	10	24548	24557	20 %	0 %	40 %	40 %	339327804
19	NC_015727	CAAGC	2	10	24562	24571	40 %	0 %	20 %	40 %	339327804
20	NC_015727	TCGCC	2	10	25347	25356	0 %	20 %	20 %	60 %	339327804
21	NC_015727	GCAGG	2	10	27310	27319	20 %	0 %	60 %	20 %	339327807
22	NC_015727	GCAGG	2	10	27374	27383	20 %	0 %	60 %	20 %	339327807
23	NC_015727	CAGTC	2	10	29711	29720	20 %	20 %	20 %	40 %	339327809
24	NC_015727	GCCCA	2	10	29972	29981	20 %	0 %	20 %	60 %	339327809
25	NC_015727	TGCGC	2	10	29997	30006	0 %	20 %	40 %	40 %	339327809
26	NC_015727	GCCCG	2	10	30608	30617	0 %	0 %	40 %	60 %	339327809
27	NC_015727	TGCAT	2	10	33190	33199	20 %	40 %	20 %	20 %	339327812
28	NC_015727	CGGTT	2	10	35007	35016	0 %	40 %	40 %	20 %	339327814
29	NC_015727	GCCGA	2	10	35146	35155	20 %	0 %	40 %	40 %	339327814
30	NC_015727	CAGGC	2	10	37378	37387	20 %	0 %	40 %	40 %	339327818
31	NC_015727	GCCCG	2	10	39148	39157	0 %	0 %	40 %	60 %	339327820
32	NC_015727	CGTGG	2	10	39715	39724	0 %	20 %	60 %	20 %	339327820
33	NC_015727	TGCCA	2	10	40369	40378	20 %	20 %	20 %	40 %	339327821
34	NC_015727	GGGCG	2	10	41750	41759	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015727	TCAAC	2	10	42987	42996	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_015727	CCGGA	2	10	43552	43561	20 %	0 %	40 %	40 %	339327823
37	NC_015727	TGCGG	2	10	45512	45521	0 %	20 %	60 %	20 %	339327825
38	NC_015727	CTGAC	2	10	46504	46513	20 %	20 %	20 %	40 %	339327827
39	NC_015727	GCCTG	2	10	47207	47216	0 %	20 %	40 %	40 %	339327827
40	NC_015727	GGCCT	2	10	48416	48425	0 %	20 %	40 %	40 %	339327828
41	NC_015727	TCGGT	2	10	50706	50715	0 %	40 %	40 %	20 %	339327831
42	NC_015727	GTGCA	2	10	52102	52111	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015727	GGCAG	2	10	54330	54339	20 %	0 %	60 %	20 %	339327833
44	NC_015727	CGGCG	2	10	54790	54799	0 %	0 %	60 %	40 %	339327834
45	NC_015727	GTTGT	2	10	55601	55610	0 %	60 %	40 %	0 %	339327835
46	NC_015727	TAGCC	2	10	56436	56445	20 %	20 %	20 %	40 %	339327835
47	NC_015727	CTGAA	2	10	57407	57416	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015727	GCCTT	2	10	57466	57475	0 %	40 %	20 %	40 %	339327836
49	NC_015727	CGAGG	2	10	57838	57847	20 %	0 %	60 %	20 %	339327836
50	NC_015727	CAATT	2	10	58097	58106	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015727	GCACC	2	10	62401	62410	20 %	0 %	20 %	60 %	339327840
52	NC_015727	GCGGA	2	10	62883	62892	20 %	0 %	60 %	20 %	339327841
53	NC_015727	CGTCG	2	10	63017	63026	0 %	20 %	40 %	40 %	339327841
54	NC_015727	AGTGC	2	10	70476	70485	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015727	TCAGG	2	10	71346	71355	20 %	20 %	40 %	20 %	339327847
56	NC_015727	CTTGC	2	10	71587	71596	0 %	40 %	20 %	40 %	339327847
57	NC_015727	GCACT	2	10	71875	71884	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015727	CGGAG	2	10	72973	72982	20 %	0 %	60 %	20 %	339327848
59	NC_015727	ACCTG	2	10	75767	75776	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_015727	GCTTG	2	10	78105	78114	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015727	CGCGA	2	10	81270	81279	20 %	0 %	40 %	40 %	339327855
62	NC_015727	TTGCG	2	10	81430	81439	0 %	40 %	40 %	20 %	339327855
63	NC_015727	GAGGG	2	10	81672	81681	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015727	GTTCG	2	10	82384	82393	0 %	40 %	40 %	20 %	339327856
65	NC_015727	CGCCT	2	10	85339	85348	0 %	20 %	20 %	60 %	339327858
66	NC_015727	GGGGC	2	10	85349	85358	0 %	0 %	80 %	20 %	339327858
67	NC_015727	TGGTG	2	10	85413	85422	0 %	40 %	60 %	0 %	339327858
68	NC_015727	CCAGC	2	10	87489	87498	20 %	0 %	20 %	60 %	339327860
69	NC_015727	GAACG	2	10	88669	88678	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015727	AGCGG	2	10	88892	88901	20 %	0 %	60 %	20 %	339327861
71	NC_015727	CTGGA	2	10	89851	89860	20 %	20 %	40 %	20 %	339327862
72	NC_015727	AGGGA	2	10	91385	91394	40 %	0 %	60 %	0 %	339327863
73	NC_015727	CGGGC	2	10	91645	91654	0 %	0 %	60 %	40 %	339327863
74	NC_015727	ATGGC	2	10	91929	91938	20 %	20 %	40 %	20 %	339327863
75	NC_015727	CCCGC	2	10	93331	93340	0 %	0 %	20 %	80 %	339327864
76	NC_015727	GTCCG	2	10	93978	93987	0 %	20 %	40 %	40 %	339327864
77	NC_015727	GCTGC	2	10	94111	94120	0 %	20 %	40 %	40 %	339327864
78	NC_015727	CGGCG	2	10	95252	95261	0 %	0 %	60 %	40 %	339327866
79	NC_015727	GGAGC	2	10	95388	95397	20 %	0 %	60 %	20 %	339327866
80	NC_015727	CCGGG	2	10	97903	97912	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
81	NC_015727	CGGCG	2	10	98870	98879	0 %	0 %	60 %	40 %	339327871
82	NC_015727	GGAGC	2	10	99006	99015	20 %	0 %	60 %	20 %	339327871
83	NC_015727	ATCGC	2	10	100870	100879	20 %	20 %	20 %	40 %	339327874
84	NC_015727	TGGCC	2	10	101534	101543	0 %	20 %	40 %	40 %	339327875
85	NC_015727	GAGGG	2	10	102653	102662	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015727	GCCAA	2	10	104301	104310	40 %	0 %	20 %	40 %	339327878
87	NC_015727	GCCGA	2	10	104559	104568	20 %	0 %	40 %	40 %	339327878
88	NC_015727	TGCCA	2	10	108116	108125	20 %	20 %	20 %	40 %	339327881
89	NC_015727	ATGCG	2	10	108191	108200	20 %	20 %	40 %	20 %	339327881
90	NC_015727	GACAC	2	10	108957	108966	40 %	0 %	20 %	40 %	339327882
91	NC_015727	GGCGC	2	10	112120	112129	0 %	0 %	60 %	40 %	339327887
92	NC_015727	GCATT	2	10	112245	112254	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015727	AGTTC	2	10	115126	115135	20 %	40 %	20 %	20 %	339327893
94	NC_015727	GTACG	2	10	119213	119222	20 %	20 %	40 %	20 %	339327897
95	NC_015727	GTGCG	2	10	120067	120076	0 %	20 %	60 %	20 %	339327897
96	NC_015727	AAAGC	2	10	120472	120481	60 %	0 %	20 %	20 %	339327898
97	NC_015727	GACGG	2	10	127552	127561	20 %	0 %	60 %	20 %	339327905
98	NC_015727	CGGGG	2	10	128868	128877	0 %	0 %	80 %	20 %	339327907
99	NC_015727	ATTCA	2	10	129378	129387	40 %	40 %	0 %	20 %	339327907
100	NC_015727	CACGA	2	10	133304	133313	40 %	0 %	20 %	40 %	339327910
101	NC_015727	ACCGC	2	10	133945	133954	20 %	0 %	20 %	60 %	339327911
102	NC_015727	GCCGA	2	10	137175	137184	20 %	0 %	40 %	40 %	339327914
103	NC_015727	GCGCC	2	10	138181	138190	0 %	0 %	40 %	60 %	339327914
104	NC_015727	GCCAG	2	10	139753	139762	20 %	0 %	40 %	40 %	339327915
105	NC_015727	GTGGG	2	10	140147	140156	0 %	20 %	80 %	0 %	339327916
106	NC_015727	GCAGG	2	10	142893	142902	20 %	0 %	60 %	20 %	339327917
107	NC_015727	GCGCC	2	10	143099	143108	0 %	0 %	40 %	60 %	339327918
108	NC_015727	TGCGT	2	10	144993	145002	0 %	40 %	40 %	20 %	339327919
109	NC_015727	CGGCG	2	10	145108	145117	0 %	0 %	60 %	40 %	339327919
110	NC_015727	GCCAC	2	10	145541	145550	20 %	0 %	20 %	60 %	339327920
111	NC_015727	TCCCT	2	10	148456	148465	0 %	40 %	0 %	60 %	339327923
112	NC_015727	CGTAC	2	10	148480	148489	20 %	20 %	20 %	40 %	339327923
113	NC_015727	CTGAT	2	10	148758	148767	20 %	40 %	20 %	20 %	339327923
114	NC_015727	ACGCC	2	10	150412	150421	20 %	0 %	20 %	60 %	339327924
115	NC_015727	CTTTG	2	10	152174	152183	0 %	60 %	20 %	20 %	339327925
116	NC_015727	CACAC	2	10	153198	153207	40 %	0 %	0 %	60 %	339327926
117	NC_015727	GCGCT	2	10	154846	154855	0 %	20 %	40 %	40 %	339327927
118	NC_015727	TCGCT	2	10	156048	156057	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_015727	CTGGG	2	10	157873	157882	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015727	CCGAG	2	10	159566	159575	20 %	0 %	40 %	40 %	339327931
121	NC_015727	GATTC	2	10	159721	159730	20 %	40 %	20 %	20 %	339327931
122	NC_015727	CTGGG	2	10	160330	160339	0 %	20 %	60 %	20 %	339327931
123	NC_015727	TGCCC	2	10	162064	162073	0 %	20 %	20 %	60 %	339327933
124	NC_015727	CCGGC	2	10	163091	163100	0 %	0 %	40 %	60 %	339327934
125	NC_015727	GCGCG	2	10	163124	163133	0 %	0 %	60 %	40 %	339327934
126	NC_015727	GCCCG	2	10	163214	163223	0 %	0 %	40 %	60 %	339327934
127	NC_015727	CGGCG	2	10	163493	163502	0 %	0 %	60 %	40 %	339327934
128	NC_015727	TCACT	2	10	164009	164018	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_015727	ATGCG	2	10	167564	167573	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015727	AAATC	2	10	167988	167997	60 %	20 %	0 %	20 %	339327938
131	NC_015727	CTGCG	2	10	168375	168384	0 %	20 %	40 %	40 %	339327938
132	NC_015727	GTCGC	2	10	170233	170242	0 %	20 %	40 %	40 %	339327940
133	NC_015727	CCGAG	2	10	170980	170989	20 %	0 %	40 %	40 %	339327940
134	NC_015727	AATGG	2	10	171842	171851	40 %	20 %	40 %	0 %	339327942
135	NC_015727	CCTGC	2	10	173622	173631	0 %	20 %	20 %	60 %	339327944
136	NC_015727	GCCAT	2	10	173824	173833	20 %	20 %	20 %	40 %	339327944
137	NC_015727	TTGGA	2	10	173920	173929	20 %	40 %	40 %	0 %	339327944
138	NC_015727	CGGAC	2	10	174479	174488	20 %	0 %	40 %	40 %	339327944
139	NC_015727	ACGCG	2	10	174997	175006	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_015727	GGCAA	2	10	175077	175086	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015727	TTGAG	2	10	176991	177000	20 %	40 %	40 %	0 %	339327946
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155	NC_015727	GAGCC	2	10	188441	188450	20 %	0 %	40 %	40 %	339327959
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256	NC_015727	AATCG	2	10	326739	326748	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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264	NC_015727	GCAGC	2	10	334958	334967	20 %	0 %	40 %	40 %	339328102
265	NC_015727	GGGCA	2	10	335378	335387	20 %	0 %	60 %	20 %	339328102
266	NC_015727	TGGGC	2	10	336033	336042	0 %	20 %	60 %	20 %	339328102
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382	NC_015727	GGCGG	2	10	473162	473171	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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389	NC_015727	CATGC	2	10	478255	478264	20 %	20 %	20 %	40 %	339328233
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391	NC_015727	TGACG	2	10	481773	481782	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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395	NC_015727	GGTTG	2	10	496204	496213	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
396	NC_015727	CGGCG	2	10	498551	498560	0 %	0 %	60 %	40 %	339328253
397	NC_015727	GCGCC	2	10	498870	498879	0 %	0 %	40 %	60 %	339328253
398	NC_015727	CGCGG	2	10	499691	499700	0 %	0 %	60 %	40 %	339328254
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