MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 4188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015727	CTTG	2	8	898	905	0 %	50 %	25 %	25 %	339327782
2	NC_015727	CGTG	2	8	1090	1097	0 %	25 %	50 %	25 %	339327782
3	NC_015727	TCGA	2	8	1133	1140	25 %	25 %	25 %	25 %	339327782
4	NC_015727	CTGT	2	8	1786	1793	0 %	50 %	25 %	25 %	339327783
5	NC_015727	AAGT	2	8	2275	2282	50 %	25 %	25 %	0 %	339327783
6	NC_015727	CGCA	2	8	2460	2467	25 %	0 %	25 %	50 %	339327784
7	NC_015727	CGCA	2	8	2617	2624	25 %	0 %	25 %	50 %	339327784
8	NC_015727	CGGC	2	8	4311	4318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015727	TGGC	2	8	4519	4526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015727	CGGC	2	8	4825	4832	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
11	NC_015727	CCAG	2	8	5325	5332	25 %	0 %	25 %	50 %	339327785
12	NC_015727	GCGG	2	8	5450	5457	0 %	0 %	75 %	25 %	339327785
13	NC_015727	GGCC	2	8	5513	5520	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
14	NC_015727	ACTG	2	8	5565	5572	25 %	25 %	25 %	25 %	339327785
15	NC_015727	GCCC	2	8	5649	5656	0 %	0 %	25 %	75 %	339327785
16	NC_015727	TCCG	2	8	5877	5884	0 %	25 %	25 %	50 %	339327786
17	NC_015727	GAAG	2	8	5922	5929	50 %	0 %	50 %	0 %	339327786
18	NC_015727	ACGG	2	8	6101	6108	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015727	CCGC	2	8	6253	6260	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_015727	GCCA	2	8	6302	6309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015727	GGCG	2	8	6428	6435	0 %	0 %	75 %	25 %	339327787
22	NC_015727	GCTC	2	8	6629	6636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015727	CCTG	2	8	7040	7047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015727	GGCG	2	8	7309	7316	0 %	0 %	75 %	25 %	339327789
25	NC_015727	CGAG	2	8	7903	7910	25 %	0 %	50 %	25 %	339327791
26	NC_015727	GCAG	2	8	8163	8170	25 %	0 %	50 %	25 %	339327791
27	NC_015727	GGCC	2	8	8203	8210	0 %	0 %	50 %	50 %	339327791
28	NC_015727	CCGG	2	8	8317	8324	0 %	0 %	50 %	50 %	339327791
29	NC_015727	TGGT	2	8	8475	8482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015727	CCGG	2	8	8601	8608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015727	GCGG	2	8	9381	9388	0 %	0 %	75 %	25 %	339327792
32	NC_015727	CAGC	2	8	9687	9694	25 %	0 %	25 %	50 %	339327792
33	NC_015727	CGCC	2	8	9987	9994	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_015727	TGGC	2	8	10396	10403	0 %	25 %	50 %	25 %	339327793
35	NC_015727	CGTG	2	8	10472	10479	0 %	25 %	50 %	25 %	339327793
36	NC_015727	GGAA	2	8	11259	11266	50 %	0 %	50 %	0 %	339327794
37	NC_015727	GGGC	2	8	11302	11309	0 %	0 %	75 %	25 %	339327794
38	NC_015727	GGCA	2	8	12022	12029	25 %	0 %	50 %	25 %	339327794
39	NC_015727	GGCG	2	8	12635	12642	0 %	0 %	75 %	25 %	339327795
40	NC_015727	TGGC	2	8	12820	12827	0 %	25 %	50 %	25 %	339327795
41	NC_015727	CGAC	2	8	12922	12929	25 %	0 %	25 %	50 %	339327795
42	NC_015727	TCGA	2	8	13082	13089	25 %	25 %	25 %	25 %	339327796
43	NC_015727	TGGA	2	8	13220	13227	25 %	25 %	50 %	0 %	339327796
44	NC_015727	GGCG	2	8	13400	13407	0 %	0 %	75 %	25 %	339327796
45	NC_015727	GGAA	2	8	13864	13871	50 %	0 %	50 %	0 %	339327797
46	NC_015727	CGCC	2	8	14632	14639	0 %	0 %	25 %	75 %	339327797
47	NC_015727	CCTG	2	8	14659	14666	0 %	25 %	25 %	50 %	339327797
48	NC_015727	CTGC	2	8	14817	14824	0 %	25 %	25 %	50 %	339327798
49	NC_015727	GGGC	2	8	15183	15190	0 %	0 %	75 %	25 %	339327798
50	NC_015727	GTCC	2	8	15332	15339	0 %	25 %	25 %	50 %	339327798
51	NC_015727	GGCC	2	8	15367	15374	0 %	0 %	50 %	50 %	339327798
52	NC_015727	GGCT	3	12	15501	15512	0 %	25 %	50 %	25 %	339327798
53	NC_015727	CCTG	2	8	15606	15613	0 %	25 %	25 %	50 %	339327798
54	NC_015727	GCTT	2	8	15635	15642	0 %	50 %	25 %	25 %	339327798
55	NC_015727	CCGG	2	8	16064	16071	0 %	0 %	50 %	50 %	339327798
56	NC_015727	GATG	2	8	17046	17053	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015727	CGAC	2	8	17668	17675	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015727	GACC	2	8	18671	18678	25 %	0 %	25 %	50 %	339327799
59	NC_015727	ATCG	2	8	18768	18775	25 %	25 %	25 %	25 %	339327799
60	NC_015727	GCAC	2	8	19702	19709	25 %	0 %	25 %	50 %	339327799
61	NC_015727	CGGT	2	8	20038	20045	0 %	25 %	50 %	25 %	339327799
62	NC_015727	TTCA	2	8	20493	20500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015727	GCCG	2	8	21065	21072	0 %	0 %	50 %	50 %	339327800
64	NC_015727	CCGG	2	8	21325	21332	0 %	0 %	50 %	50 %	339327800
65	NC_015727	TGGC	2	8	21347	21354	0 %	25 %	50 %	25 %	339327800
66	NC_015727	TCCA	2	8	21577	21584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015727	CAGT	2	8	21889	21896	25 %	25 %	25 %	25 %	339327801
68	NC_015727	GGAT	2	8	22044	22051	25 %	25 %	50 %	0 %	339327801
69	NC_015727	GGTC	2	8	22201	22208	0 %	25 %	50 %	25 %	339327801
70	NC_015727	CGGG	2	8	22716	22723	0 %	0 %	75 %	25 %	339327801
71	NC_015727	CGAC	2	8	23081	23088	25 %	0 %	25 %	50 %	339327802
72	NC_015727	GGCG	2	8	23529	23536	0 %	0 %	75 %	25 %	339327802
73	NC_015727	CGGC	2	8	23849	23856	0 %	0 %	50 %	50 %	339327803
74	NC_015727	AGGC	2	8	23916	23923	25 %	0 %	50 %	25 %	339327803
75	NC_015727	TAGT	2	8	24043	24050	25 %	50 %	25 %	0 %	339327803
76	NC_015727	TCGC	2	8	24358	24365	0 %	25 %	25 %	50 %	339327803
77	NC_015727	TGGT	2	8	24602	24609	0 %	50 %	50 %	0 %	339327804
78	NC_015727	GAAC	2	8	24871	24878	50 %	0 %	25 %	25 %	339327804
79	NC_015727	ACCC	2	8	25011	25018	25 %	0 %	0 %	75 %	339327804
80	NC_015727	GCTC	2	8	25323	25330	0 %	25 %	25 %	50 %	339327804
81	NC_015727	CTTT	2	8	26164	26171	0 %	75 %	0 %	25 %	339327805
82	NC_015727	AAGG	2	8	26880	26887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015727	CGAT	2	8	27106	27113	25 %	25 %	25 %	25 %	339327807
84	NC_015727	TGCG	2	8	27261	27268	0 %	25 %	50 %	25 %	339327807
85	NC_015727	GCAG	2	8	27731	27738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015727	GGAA	2	8	27753	27760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015727	CCTG	2	8	27889	27896	0 %	25 %	25 %	50 %	339327808
88	NC_015727	CGGC	2	8	28203	28210	0 %	0 %	50 %	50 %	339327808
89	NC_015727	CGCA	2	8	28571	28578	25 %	0 %	25 %	50 %	339327808
90	NC_015727	GCCC	2	8	28765	28772	0 %	0 %	25 %	75 %	339327808
91	NC_015727	GCAG	2	8	28831	28838	25 %	0 %	50 %	25 %	339327808
92	NC_015727	GGCA	2	8	28898	28905	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015727	GGCG	2	8	28974	28981	0 %	0 %	75 %	25 %	339327809
94	NC_015727	GCCG	2	8	29185	29192	0 %	0 %	50 %	50 %	339327809
95	NC_015727	AGGA	2	8	29753	29760	50 %	0 %	50 %	0 %	339327809
96	NC_015727	ATGA	2	8	31653	31660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015727	ACTG	2	8	32368	32375	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015727	CTCA	2	8	32939	32946	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015727	ATTG	2	8	33302	33309	25 %	50 %	25 %	0 %	339327812
100	NC_015727	CATG	2	8	33439	33446	25 %	25 %	25 %	25 %	339327812
101	NC_015727	GCAA	2	8	33663	33670	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015727	CAGG	2	8	33827	33834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015727	GCCG	2	8	34055	34062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015727	TTGA	2	8	34204	34211	25 %	50 %	25 %	0 %	339327813
105	NC_015727	CAGG	2	8	34450	34457	25 %	0 %	50 %	25 %	339327813
106	NC_015727	GGGC	2	8	34872	34879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015727	GTGC	2	8	34885	34892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015727	GAAA	2	8	35069	35076	75 %	0 %	25 %	0 %	339327814
109	NC_015727	CCAC	2	8	35453	35460	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_015727	GGAT	2	8	35517	35524	25 %	25 %	50 %	0 %	339327815
111	NC_015727	CGTA	2	8	35738	35745	25 %	25 %	25 %	25 %	339327816
112	NC_015727	CCAG	2	8	35853	35860	25 %	0 %	25 %	50 %	339327816
113	NC_015727	GGGA	2	8	36969	36976	25 %	0 %	75 %	0 %	339327818
114	NC_015727	TGCT	2	8	36986	36993	0 %	50 %	25 %	25 %	339327818
115	NC_015727	TTCA	2	8	37129	37136	25 %	50 %	0 %	25 %	339327818
116	NC_015727	AGCG	2	8	37186	37193	25 %	0 %	50 %	25 %	339327818
117	NC_015727	GCAC	2	8	37246	37253	25 %	0 %	25 %	50 %	339327818
118	NC_015727	CGAC	2	8	37274	37281	25 %	0 %	25 %	50 %	339327818
119	NC_015727	CGAC	2	8	38074	38081	25 %	0 %	25 %	50 %	339327819
120	NC_015727	CTGG	2	8	38803	38810	0 %	25 %	50 %	25 %	339327820
121	NC_015727	ATCC	2	8	40904	40911	25 %	25 %	0 %	50 %	339327821
122	NC_015727	CCCG	2	8	42546	42553	0 %	0 %	25 %	75 %	339327822
123	NC_015727	CCAC	2	8	42865	42872	25 %	0 %	0 %	75 %	339327822
124	NC_015727	TGGA	2	8	44029	44036	25 %	25 %	50 %	0 %	339327823
125	NC_015727	TGGC	2	8	44504	44511	0 %	25 %	50 %	25 %	339327823
126	NC_015727	GCCC	2	8	44556	44563	0 %	0 %	25 %	75 %	339327823
127	NC_015727	ACGC	2	8	44712	44719	25 %	0 %	25 %	50 %	339327824
128	NC_015727	AGGA	2	8	44747	44754	50 %	0 %	50 %	0 %	339327824
129	NC_015727	CCTG	2	8	45835	45842	0 %	25 %	25 %	50 %	339327826
130	NC_015727	GCGT	2	8	46393	46400	0 %	25 %	50 %	25 %	339327827
131	NC_015727	GAGC	2	8	46953	46960	25 %	0 %	50 %	25 %	339327827
132	NC_015727	GTAT	2	8	47327	47334	25 %	50 %	25 %	0 %	339327827
133	NC_015727	GGAA	2	8	47350	47357	50 %	0 %	50 %	0 %	339327827
134	NC_015727	ATCG	2	8	47879	47886	25 %	25 %	25 %	25 %	339327828
135	NC_015727	TGCA	2	8	48473	48480	25 %	25 %	25 %	25 %	339327828
136	NC_015727	TCTG	2	8	48687	48694	0 %	50 %	25 %	25 %	339327828
137	NC_015727	TGGA	2	8	49099	49106	25 %	25 %	50 %	0 %	339327829
138	NC_015727	CATT	2	8	49325	49332	25 %	50 %	0 %	25 %	339327829
139	NC_015727	CCGC	2	8	49537	49544	0 %	0 %	25 %	75 %	339327830
140	NC_015727	CGGT	2	8	49545	49552	0 %	25 %	50 %	25 %	339327830
141	NC_015727	AGGC	2	8	50487	50494	25 %	0 %	50 %	25 %	339327831
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