MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 32101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015727	GCT	3	9	165152	165160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327936
3502	NC_015727	GCAG	2	8	165201	165208	25 %	0 %	50 %	25 %	339327936
3503	NC_015727	CAGC	2	8	165244	165251	25 %	0 %	25 %	50 %	339327936
3504	NC_015727	TCG	2	6	165258	165263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327936
3505	NC_015727	CTG	2	6	165267	165272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327936
3506	NC_015727	GCT	2	6	165287	165292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327936
3507	NC_015727	GCT	4	12	165371	165382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327936
3508	NC_015727	GCG	2	6	165399	165404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327936
3509	NC_015727	CTG	2	6	165423	165428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327936
3510	NC_015727	CGC	2	6	165486	165491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327936
3511	NC_015727	GCC	2	6	165501	165506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327936
3512	NC_015727	TCG	2	6	165511	165516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327936
3513	NC_015727	GTG	2	6	165519	165524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327936
3514	NC_015727	CGA	2	6	165568	165573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327936
3515	NC_015727	GGA	2	6	165590	165595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327936
3516	NC_015727	CAA	2	6	165620	165625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327936
3517	NC_015727	GCC	2	6	165627	165632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327936
3518	NC_015727	GAT	3	9	165650	165658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327936
3519	NC_015727	GGC	2	6	165699	165704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327936
3520	NC_015727	GAT	3	9	165707	165715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327936
3521	NC_015727	GCG	2	6	165735	165740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327936
3522	NC_015727	CGC	2	6	165799	165804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327936
3523	NC_015727	CCG	2	6	165808	165813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327936
3524	NC_015727	CTGC	2	8	165869	165876	0 %	25 %	25 %	50 %	339327936
3525	NC_015727	CAA	2	6	165905	165910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327936
3526	NC_015727	TCG	2	6	165928	165933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327936
3527	NC_015727	ACA	2	6	166033	166038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327936
3528	NC_015727	GC	3	6	166052	166057	0 %	0 %	50 %	50 %	339327936
3529	NC_015727	ACT	2	6	166084	166089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327936
3530	NC_015727	CCA	2	6	166118	166123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327936
3531	NC_015727	CTG	2	6	166170	166175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327936
3532	NC_015727	CGG	2	6	166244	166249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327936
3533	NC_015727	GGC	2	6	166262	166267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327936
3534	NC_015727	CG	3	6	166314	166319	0 %	0 %	50 %	50 %	339327936
3535	NC_015727	GGC	2	6	166338	166343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327936
3536	NC_015727	GCG	2	6	166344	166349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327936
3537	NC_015727	GC	3	6	166436	166441	0 %	0 %	50 %	50 %	339327936
3538	NC_015727	CACG	2	8	166482	166489	25 %	0 %	25 %	50 %	339327936
3539	NC_015727	GAC	2	6	166521	166526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327936
3540	NC_015727	GCA	2	6	166767	166772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327937
3541	NC_015727	AC	3	6	166785	166790	50 %	0 %	0 %	50 %	339327937
3542	NC_015727	CGT	2	6	166814	166819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327937
3543	NC_015727	TGG	2	6	166825	166830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327937
3544	NC_015727	GCC	2	6	166836	166841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327937
3545	NC_015727	GGC	2	6	166849	166854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327937
3546	NC_015727	CCG	2	6	166864	166869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327937
3547	NC_015727	TGA	2	6	166916	166921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327937
3548	NC_015727	CGC	2	6	166925	166930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327937
3549	NC_015727	CGG	2	6	167021	167026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327937
3550	NC_015727	ACG	2	6	167067	167072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327937
3551	NC_015727	GCT	2	6	167129	167134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327937
3552	NC_015727	TCT	3	9	167140	167148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327937
3553	NC_015727	CA	3	6	167155	167160	50 %	0 %	0 %	50 %	339327937
3554	NC_015727	GGA	2	6	167315	167320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327937
3555	NC_015727	CGG	2	6	167338	167343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327937
3556	NC_015727	GAA	2	6	167369	167374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327937
3557	NC_015727	ATGCG	2	10	167564	167573	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3558	NC_015727	CGC	2	6	167712	167717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_015727	CCG	2	6	167757	167762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_015727	C	6	6	167813	167818	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3561	NC_015727	AAATC	2	10	167988	167997	60 %	20 %	0 %	20 %	339327938
3562	NC_015727	ATCT	2	8	168004	168011	25 %	50 %	0 %	25 %	339327938
3563	NC_015727	CG	4	8	168096	168103	0 %	0 %	50 %	50 %	339327938
3564	NC_015727	CTG	2	6	168179	168184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327938
3565	NC_015727	TGC	2	6	168204	168209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327938
3566	NC_015727	TGC	2	6	168231	168236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327938
3567	NC_015727	CTG	2	6	168251	168256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327938
3568	NC_015727	GAC	2	6	168259	168264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327938
3569	NC_015727	CCTT	2	8	168362	168369	0 %	50 %	0 %	50 %	339327938
3570	NC_015727	CTGCG	2	10	168375	168384	0 %	20 %	40 %	40 %	339327938
3571	NC_015727	CCG	2	6	168387	168392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327938
3572	NC_015727	GCG	2	6	168432	168437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327938
3573	NC_015727	GCG	2	6	168456	168461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327938
3574	NC_015727	GCT	2	6	168517	168522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327938
3575	NC_015727	CGTT	2	8	168534	168541	0 %	50 %	25 %	25 %	339327938
3576	NC_015727	GGA	2	6	168569	168574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327938
3577	NC_015727	CTG	2	6	168644	168649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327938
3578	NC_015727	GCAA	2	8	168675	168682	50 %	0 %	25 %	25 %	339327938
3579	NC_015727	GGC	2	6	168683	168688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327938
3580	NC_015727	GTG	2	6	168698	168703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327938
3581	NC_015727	GGC	2	6	168724	168729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327938
3582	NC_015727	GGC	2	6	168786	168791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327938
3583	NC_015727	CGT	3	9	168808	168816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327938
3584	NC_015727	GCTT	2	8	168823	168830	0 %	50 %	25 %	25 %	339327938
3585	NC_015727	CACC	2	8	168874	168881	25 %	0 %	0 %	75 %	339327938
3586	NC_015727	GC	3	6	168919	168924	0 %	0 %	50 %	50 %	339327938
3587	NC_015727	CCCG	2	8	168929	168936	0 %	0 %	25 %	75 %	339327938
3588	NC_015727	AGT	2	6	168959	168964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_015727	CAGA	2	8	169035	169042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3590	NC_015727	GCT	2	6	169116	169121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327939
3591	NC_015727	TAG	2	6	169175	169180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327939
3592	NC_015727	CCCG	2	8	169188	169195	0 %	0 %	25 %	75 %	339327939
3593	NC_015727	GCG	2	6	169199	169204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327939
3594	NC_015727	ACC	2	6	169210	169215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327939
3595	NC_015727	GC	3	6	169216	169221	0 %	0 %	50 %	50 %	339327939
3596	NC_015727	GGT	3	9	169260	169268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327939
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3598	NC_015727	GGT	3	9	169458	169466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327939
3599	NC_015727	CTTC	2	8	169581	169588	0 %	50 %	0 %	50 %	339327939
3600	NC_015727	CGG	2	6	169656	169661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327939
3601	NC_015727	TTTGCC	2	12	169672	169683	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	339327939
3602	NC_015727	GTT	2	6	169696	169701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327939
3603	NC_015727	TAC	2	6	169807	169812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327939
3604	NC_015727	T	6	6	169948	169953	0 %	100 %	0 %	0 %	339327939
3605	NC_015727	GCAG	2	8	170007	170014	25 %	0 %	50 %	25 %	339327939
3606	NC_015727	GAC	2	6	170056	170061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327940
3607	NC_015727	GC	3	6	170096	170101	0 %	0 %	50 %	50 %	339327940
3608	NC_015727	CTTC	2	8	170167	170174	0 %	50 %	0 %	50 %	339327940
3609	NC_015727	GGCG	2	8	170182	170189	0 %	0 %	75 %	25 %	339327940
3610	NC_015727	GCC	2	6	170209	170214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327940
3611	NC_015727	GTCGC	2	10	170233	170242	0 %	20 %	40 %	40 %	339327940
3612	NC_015727	CAA	2	6	170275	170280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327940
3613	NC_015727	TGG	2	6	170337	170342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327940
3614	NC_015727	GCCTCG	2	12	170391	170402	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339327940
3615	NC_015727	GCT	2	6	170413	170418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327940
3616	NC_015727	ATC	2	6	170484	170489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327940
3617	NC_015727	C	6	6	170554	170559	0 %	0 %	0 %	100 %	339327940
3618	NC_015727	GGCC	2	8	170571	170578	0 %	0 %	50 %	50 %	339327940
3619	NC_015727	GGT	2	6	170594	170599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327940
3620	NC_015727	TAC	2	6	170723	170728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327940
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3622	NC_015727	CAT	2	6	170824	170829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327940
3623	NC_015727	TGA	2	6	170931	170936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327940
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3988	NC_015727	ATG	2	6	188181	188186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327959
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3990	NC_015727	GTC	2	6	188230	188235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327959
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3992	NC_015727	TGACC	2	10	188308	188317	20 %	20 %	20 %	40 %	339327959
3993	NC_015727	CG	3	6	188325	188330	0 %	0 %	50 %	50 %	339327959
3994	NC_015727	TGC	2	6	188355	188360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327959
3995	NC_015727	CAC	2	6	188362	188367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327959
3996	NC_015727	GT	3	6	188381	188386	0 %	50 %	50 %	0 %	339327959
3997	NC_015727	CGG	2	6	188388	188393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327959
3998	NC_015727	GCACG	2	10	188407	188416	20 %	0 %	40 %	40 %	339327959
3999	NC_015727	GAGCC	2	10	188441	188450	20 %	0 %	40 %	40 %	339327959
4000	NC_015727	GGC	2	6	188539	188544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327959

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