MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 32101

< Previous12...53545556575859606162636465Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32001	NC_015727	GAC	2	6	1493933	1493938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339329163
32002	NC_015727	TCA	2	6	1494022	1494027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339329164
32003	NC_015727	AGC	2	6	1494036	1494041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339329164
32004	NC_015727	CG	3	6	1494048	1494053	0 %	0 %	50 %	50 %	339329164
32005	NC_015727	GCCG	2	8	1494061	1494068	0 %	0 %	50 %	50 %	339329164
32006	NC_015727	GC	3	6	1494069	1494074	0 %	0 %	50 %	50 %	339329164
32007	NC_015727	AGC	2	6	1494075	1494080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339329164
32008	NC_015727	CGG	2	6	1494127	1494132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339329164
32009	NC_015727	CGT	2	6	1494136	1494141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339329164
32010	NC_015727	CGG	2	6	1494196	1494201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339329164
32011	NC_015727	CG	3	6	1494320	1494325	0 %	0 %	50 %	50 %	339329164
32012	NC_015727	GTT	2	6	1494332	1494337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339329164
32013	NC_015727	GTCGAG	2	12	1494353	1494364	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339329164
32014	NC_015727	GCC	2	6	1494401	1494406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339329164
32015	NC_015727	TGC	2	6	1494439	1494444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339329164
32016	NC_015727	GAA	2	6	1494458	1494463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339329164
32017	NC_015727	TCC	2	6	1494483	1494488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339329164
32018	NC_015727	TCGG	2	8	1494501	1494508	0 %	25 %	50 %	25 %	339329164
32019	NC_015727	GC	3	6	1494536	1494541	0 %	0 %	50 %	50 %	339329164
32020	NC_015727	ACG	2	6	1494570	1494575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339329164
32021	NC_015727	GCG	2	6	1494607	1494612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339329164
32022	NC_015727	CCG	2	6	1494632	1494637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339329164
32023	NC_015727	GCT	2	6	1494700	1494705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339329164
32024	NC_015727	CGG	2	6	1494733	1494738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339329164
32025	NC_015727	GGTC	2	8	1494739	1494746	0 %	25 %	50 %	25 %	339329164
32026	NC_015727	GCC	3	9	1494761	1494769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339329164
32027	NC_015727	GGC	2	6	1494790	1494795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339329164
32028	NC_015727	GC	3	6	1494794	1494799	0 %	0 %	50 %	50 %	339329164
32029	NC_015727	ATGC	2	8	1494956	1494963	25 %	25 %	25 %	25 %	339329164
32030	NC_015727	CG	3	6	1494989	1494994	0 %	0 %	50 %	50 %	339329164
32031	NC_015727	AGGC	2	8	1495075	1495082	25 %	0 %	50 %	25 %	339329164
32032	NC_015727	CGG	2	6	1495103	1495108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339329164
32033	NC_015727	GCA	2	6	1495114	1495119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339329164
32034	NC_015727	GCC	2	6	1495162	1495167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32035	NC_015727	GAC	2	6	1495189	1495194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32036	NC_015727	GGC	2	6	1495292	1495297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32037	NC_015727	TC	3	6	1495332	1495337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32038	NC_015727	ACA	2	6	1495338	1495343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32039	NC_015727	AGC	2	6	1495379	1495384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32040	NC_015727	GTG	2	6	1495479	1495484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32041	NC_015727	G	7	7	1495525	1495531	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32042	NC_015727	TGC	2	6	1495576	1495581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32043	NC_015727	AG	3	6	1495630	1495635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32044	NC_015727	ATCG	2	8	1495714	1495721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32045	NC_015727	CTCG	2	8	1495798	1495805	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32046	NC_015727	ACGGCC	2	12	1495912	1495923	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32047	NC_015727	CGT	2	6	1495961	1495966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32048	NC_015727	C	6	6	1495998	1496003	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32049	NC_015727	AGCGC	2	10	1496028	1496037	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32050	NC_015727	GGC	2	6	1496097	1496102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32051	NC_015727	TGC	2	6	1496172	1496177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32052	NC_015727	ATC	2	6	1496191	1496196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32053	NC_015727	CGG	2	6	1496200	1496205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32054	NC_015727	CGC	2	6	1496244	1496249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32055	NC_015727	GA	3	6	1496289	1496294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32056	NC_015727	GAC	2	6	1496305	1496310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32057	NC_015727	CCG	2	6	1496353	1496358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32058	NC_015727	GC	3	6	1496411	1496416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32059	NC_015727	CGCGC	2	10	1496453	1496462	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32060	NC_015727	GTT	2	6	1496467	1496472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32061	NC_015727	GC	3	6	1496475	1496480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32062	NC_015727	CAGG	2	8	1496494	1496501	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32063	NC_015727	GC	3	6	1496519	1496524	0 %	0 %	50 %	50 %	339329165
32064	NC_015727	AGG	2	6	1496526	1496531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339329165
32065	NC_015727	GAT	2	6	1496587	1496592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339329165
32066	NC_015727	CG	3	6	1496649	1496654	0 %	0 %	50 %	50 %	339329165
32067	NC_015727	TTC	2	6	1496731	1496736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339329165
32068	NC_015727	TTC	2	6	1496824	1496829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339329165
32069	NC_015727	AGC	2	6	1496837	1496842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339329165
32070	NC_015727	CTGGAC	2	12	1496848	1496859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339329165
32071	NC_015727	TCA	2	6	1496907	1496912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339329165
32072	NC_015727	CTT	2	6	1496929	1496934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339329165
32073	NC_015727	ATC	2	6	1496989	1496994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339329165
32074	NC_015727	TGGC	2	8	1497077	1497084	0 %	25 %	50 %	25 %	339329165
32075	NC_015727	GAG	2	6	1497130	1497135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339329165
32076	NC_015727	CTT	2	6	1497154	1497159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339329165
32077	NC_015727	CCAG	2	8	1497237	1497244	25 %	0 %	25 %	50 %	339329165
32078	NC_015727	TCA	2	6	1497308	1497313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339329165
32079	NC_015727	CG	3	6	1497374	1497379	0 %	0 %	50 %	50 %	339329165
32080	NC_015727	CCA	2	6	1497498	1497503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339329165
32081	NC_015727	CTGGAC	2	12	1497514	1497525	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339329165
32082	NC_015727	AGT	2	6	1497657	1497662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339329165
32083	NC_015727	CGT	2	6	1497734	1497739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339329165
32084	NC_015727	GCC	2	6	1497740	1497745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339329165
32085	NC_015727	GAA	2	6	1497769	1497774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339329165
32086	NC_015727	TTG	2	6	1497776	1497781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339329165
32087	NC_015727	CGT	2	6	1497871	1497876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339329165
32088	NC_015727	CAACA	2	10	1497974	1497983	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
32089	NC_015727	CAAC	2	8	1498061	1498068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32090	NC_015727	TCA	2	6	1498212	1498217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32091	NC_015727	CA	3	6	1498216	1498221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32092	NC_015727	AC	3	6	1498240	1498245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32093	NC_015727	CAA	2	6	1498300	1498305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32094	NC_015727	GGT	2	6	1498335	1498340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32095	NC_015727	CCAA	2	8	1498356	1498363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32096	NC_015727	TGAT	2	8	1498446	1498453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32097	NC_015727	T	6	6	1498599	1498604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32098	NC_015727	CGA	2	6	1498757	1498762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32099	NC_015727	GAT	2	6	1498763	1498768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32100	NC_015727	TGC	2	6	1498786	1498791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32101	NC_015727	AGC	2	6	1498794	1498799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12...53545556575859606162636465Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.