MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 32101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015727	GGC	2	6	48314	48319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327828
1002	NC_015727	GGCCT	2	10	48416	48425	0 %	20 %	40 %	40 %	339327828
1003	NC_015727	TCG	2	6	48438	48443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327828
1004	NC_015727	TGCA	2	8	48473	48480	25 %	25 %	25 %	25 %	339327828
1005	NC_015727	GGC	2	6	48493	48498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327828
1006	NC_015727	CGT	2	6	48508	48513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327828
1007	NC_015727	TGG	2	6	48618	48623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327828
1008	NC_015727	CCACAC	2	12	48646	48657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327828
1009	NC_015727	TCTG	2	8	48687	48694	0 %	50 %	25 %	25 %	339327828
1010	NC_015727	TCG	2	6	48695	48700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327828
1011	NC_015727	GAT	2	6	48811	48816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327829
1012	NC_015727	CCG	2	6	48884	48889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327829
1013	NC_015727	AAG	2	6	48934	48939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327829
1014	NC_015727	CGA	2	6	48945	48950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327829
1015	NC_015727	GCC	2	6	48960	48965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327829
1016	NC_015727	GCC	2	6	49012	49017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327829
1017	NC_015727	TGGA	2	8	49099	49106	25 %	25 %	50 %	0 %	339327829
1018	NC_015727	GAC	2	6	49153	49158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327829
1019	NC_015727	TGG	2	6	49179	49184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327829
1020	NC_015727	GCT	2	6	49224	49229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327829
1021	NC_015727	CGA	2	6	49269	49274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327829
1022	NC_015727	CATT	2	8	49325	49332	25 %	50 %	0 %	25 %	339327829
1023	NC_015727	GCA	2	6	49368	49373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327829
1024	NC_015727	TCA	2	6	49382	49387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327829
1025	NC_015727	GCC	2	6	49422	49427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327829
1026	NC_015727	GAT	2	6	49453	49458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327829
1027	NC_015727	GCA	2	6	49490	49495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_015727	CCGC	2	8	49537	49544	0 %	0 %	25 %	75 %	339327830
1029	NC_015727	CGGT	2	8	49545	49552	0 %	25 %	50 %	25 %	339327830
1030	NC_015727	GCC	2	6	49634	49639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327830
1031	NC_015727	CAG	2	6	49643	49648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327830
1032	NC_015727	GT	3	6	49734	49739	0 %	50 %	50 %	0 %	339327830
1033	NC_015727	CG	3	6	49753	49758	0 %	0 %	50 %	50 %	339327830
1034	NC_015727	ATC	2	6	49770	49775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327830
1035	NC_015727	CGA	2	6	49809	49814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327830
1036	NC_015727	CGT	2	6	49919	49924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327830
1037	NC_015727	ATG	2	6	49973	49978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327830
1038	NC_015727	TGT	2	6	50062	50067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327830
1039	NC_015727	CGT	2	6	50068	50073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327830
1040	NC_015727	GAG	2	6	50177	50182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327830
1041	NC_015727	CGT	2	6	50330	50335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327830
1042	NC_015727	GC	3	6	50390	50395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_015727	CA	3	6	50409	50414	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_015727	AC	3	6	50448	50453	50 %	0 %	0 %	50 %	339327831
1045	NC_015727	AGGC	2	8	50487	50494	25 %	0 %	50 %	25 %	339327831
1046	NC_015727	GACG	2	8	50599	50606	25 %	0 %	50 %	25 %	339327831
1047	NC_015727	GGT	2	6	50690	50695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327831
1048	NC_015727	TCGGT	2	10	50706	50715	0 %	40 %	40 %	20 %	339327831
1049	NC_015727	GCA	2	6	50761	50766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327831
1050	NC_015727	CAC	2	6	50794	50799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327831
1051	NC_015727	CTCA	2	8	50804	50811	25 %	25 %	0 %	50 %	339327831
1052	NC_015727	GTG	2	6	50855	50860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327831
1053	NC_015727	CTT	2	6	50902	50907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327831
1054	NC_015727	GAG	2	6	50912	50917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327831
1055	NC_015727	GTG	2	6	50921	50926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327831
1056	NC_015727	G	6	6	50946	50951	0 %	0 %	100 %	0 %	339327831
1057	NC_015727	CTT	2	6	51017	51022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327831
1058	NC_015727	GCG	2	6	51040	51045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327831
1059	NC_015727	CGA	2	6	51063	51068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327831
1060	NC_015727	TGG	2	6	51102	51107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327831
1061	NC_015727	GTG	2	6	51128	51133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327831
1062	NC_015727	CGC	2	6	51192	51197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327831
1063	NC_015727	CGC	2	6	51206	51211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327831
1064	NC_015727	TC	3	6	51250	51255	0 %	50 %	0 %	50 %	339327831
1065	NC_015727	TGC	2	6	51261	51266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327831
1066	NC_015727	CTGA	2	8	51275	51282	25 %	25 %	25 %	25 %	339327831
1067	NC_015727	AGA	2	6	51333	51338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327831
1068	NC_015727	GAA	2	6	51427	51432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015727	ATG	2	6	51533	51538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015727	CG	3	6	51544	51549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_015727	G	6	6	51610	51615	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015727	CCCT	2	8	51618	51625	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1073	NC_015727	GGTT	2	8	51755	51762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015727	GC	4	8	51769	51776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_015727	ATT	2	6	51787	51792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015727	GCG	2	6	51808	51813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_015727	GAT	2	6	51838	51843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015727	AGC	2	6	51920	51925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_015727	GAA	2	6	51952	51957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015727	GAG	2	6	51981	51986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015727	GTT	2	6	52082	52087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015727	GTGCA	2	10	52102	52111	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1083	NC_015727	GC	3	6	52192	52197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_015727	ATT	2	6	52302	52307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015727	TAA	2	6	52391	52396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015727	GTC	2	6	52424	52429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_015727	ATG	2	6	52435	52440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015727	GTTTGC	2	12	52610	52621	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339327832
1089	NC_015727	GGA	2	6	52655	52660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327832
1090	NC_015727	GTT	2	6	52686	52691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327832
1091	NC_015727	TCT	2	6	52718	52723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327832
1092	NC_015727	GTT	2	6	52770	52775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327832
1093	NC_015727	CGG	2	6	52796	52801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327832
1094	NC_015727	CTG	2	6	52854	52859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327832
1095	NC_015727	TATC	2	8	52892	52899	25 %	50 %	0 %	25 %	339327832
1096	NC_015727	GAT	2	6	52931	52936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327832
1097	NC_015727	TCA	2	6	53008	53013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327832
1098	NC_015727	CGGC	2	8	53053	53060	0 %	0 %	50 %	50 %	339327832
1099	NC_015727	GGCC	2	8	53146	53153	0 %	0 %	50 %	50 %	339327832
1100	NC_015727	CG	3	6	53238	53243	0 %	0 %	50 %	50 %	339327832
1101	NC_015727	TGC	2	6	53275	53280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327832
1102	NC_015727	ACC	2	6	53292	53297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327832
1103	NC_015727	GGT	2	6	53332	53337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327832
1104	NC_015727	CCG	2	6	53410	53415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327832
1105	NC_015727	GCA	2	6	53426	53431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327832
1106	NC_015727	CGC	2	6	53567	53572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_015727	GAG	2	6	53657	53662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015727	GCC	2	6	53777	53782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327833
1109	NC_015727	GTG	2	6	53794	53799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327833
1110	NC_015727	CGG	2	6	53807	53812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327833
1111	NC_015727	G	6	6	53811	53816	0 %	0 %	100 %	0 %	339327833
1112	NC_015727	GCT	2	6	53862	53867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327833
1113	NC_015727	GGAT	2	8	53946	53953	25 %	25 %	50 %	0 %	339327833
1114	NC_015727	GGT	2	6	54069	54074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327833
1115	NC_015727	CGT	2	6	54078	54083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327833
1116	NC_015727	GGC	2	6	54120	54125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327833
1117	NC_015727	TGC	3	9	54203	54211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327833
1118	NC_015727	GTGAAC	2	12	54241	54252	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339327833
1119	NC_015727	GGA	2	6	54259	54264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327833
1120	NC_015727	AGG	2	6	54293	54298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327833
1121	NC_015727	CAA	2	6	54312	54317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327833
1122	NC_015727	GGCAG	2	10	54330	54339	20 %	0 %	60 %	20 %	339327833
1123	NC_015727	GGC	2	6	54346	54351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327833
1124	NC_015727	ACG	3	9	54370	54378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327833
1125	NC_015727	C	6	6	54475	54480	0 %	0 %	0 %	100 %	339327833
1126	NC_015727	AAG	2	6	54502	54507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327833
1127	NC_015727	CGG	2	6	54570	54575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327833
1128	NC_015727	CGGCG	2	10	54790	54799	0 %	0 %	60 %	40 %	339327834
1129	NC_015727	TGG	2	6	54801	54806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327834
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1500	NC_015727	CAC	2	6	73960	73965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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