MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 3540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015726	ACCCC	2	10	501	510	20 %	0 %	0 %	80 %	339324159
2	NC_015726	ACCAC	2	10	1737	1746	40 %	0 %	0 %	60 %	339324159
3	NC_015726	CGGGA	2	10	2018	2027	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015726	CCCGC	2	10	2086	2095	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5	NC_015726	GACCA	2	10	3342	3351	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015726	CCGGC	2	10	3515	3524	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_015726	AGCGC	2	10	3852	3861	20 %	0 %	40 %	40 %	339324161
8	NC_015726	GCTCA	2	10	9176	9185	20 %	20 %	20 %	40 %	339324164
9	NC_015726	GCCAC	2	10	10254	10263	20 %	0 %	20 %	60 %	339324165
10	NC_015726	TGCGC	2	10	14909	14918	0 %	20 %	40 %	40 %	339324169
11	NC_015726	CCCAG	2	10	15685	15694	20 %	0 %	20 %	60 %	339324170
12	NC_015726	GCCGC	2	10	15965	15974	0 %	0 %	40 %	60 %	339324170
13	NC_015726	GGGCA	2	10	16256	16265	20 %	0 %	60 %	20 %	339324170
14	NC_015726	GCCGC	3	15	17618	17632	0 %	0 %	40 %	60 %	339324172
15	NC_015726	CGCGC	2	10	18625	18634	0 %	0 %	40 %	60 %	339324173
16	NC_015726	GCCGC	2	10	18673	18682	0 %	0 %	40 %	60 %	339324173
17	NC_015726	CGGGC	2	10	21687	21696	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015726	TCGGC	2	10	24057	24066	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015726	GCGCA	2	10	26555	26564	20 %	0 %	40 %	40 %	339324180
20	NC_015726	GTCAT	2	10	27735	27744	20 %	40 %	20 %	20 %	339324180
21	NC_015726	CGCAG	2	10	29065	29074	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015726	GCCGG	2	10	29160	29169	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015726	CCGAT	2	10	29530	29539	20 %	20 %	20 %	40 %	339324181
24	NC_015726	GGCGA	2	10	30307	30316	20 %	0 %	60 %	20 %	339324182
25	NC_015726	GCGCG	2	10	31136	31145	0 %	0 %	60 %	40 %	339324183
26	NC_015726	GCCTG	2	10	33403	33412	0 %	20 %	40 %	40 %	339324184
27	NC_015726	CACGC	2	10	33662	33671	20 %	0 %	20 %	60 %	339324184
28	NC_015726	CGATG	2	10	35093	35102	20 %	20 %	40 %	20 %	339324185
29	NC_015726	GCTCG	2	10	35454	35463	0 %	20 %	40 %	40 %	339324186
30	NC_015726	GACCA	2	10	35500	35509	40 %	0 %	20 %	40 %	339324186
31	NC_015726	CAGGG	2	10	36726	36735	20 %	0 %	60 %	20 %	339324187
32	NC_015726	CCCGA	2	10	37352	37361	20 %	0 %	20 %	60 %	339324187
33	NC_015726	GCGGT	2	10	38019	38028	0 %	20 %	60 %	20 %	339324188
34	NC_015726	CGCGG	2	10	39160	39169	0 %	0 %	60 %	40 %	339324189
35	NC_015726	CGCGG	2	10	39424	39433	0 %	0 %	60 %	40 %	339324189
36	NC_015726	CTCCG	2	10	40165	40174	0 %	20 %	20 %	60 %	339324190
37	NC_015726	GCAGG	2	10	40529	40538	20 %	0 %	60 %	20 %	339324191
38	NC_015726	GTTTG	2	10	40945	40954	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015726	GTGAA	2	10	41120	41129	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015726	ATGCG	2	10	41539	41548	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015726	CGTCA	2	10	41713	41722	20 %	20 %	20 %	40 %	339324194
42	NC_015726	CCCGG	2	10	42351	42360	0 %	0 %	40 %	60 %	339324194
43	NC_015726	GCCAT	2	10	44563	44572	20 %	20 %	20 %	40 %	339324195
44	NC_015726	CGCCA	2	10	45290	45299	20 %	0 %	20 %	60 %	339324196
45	NC_015726	CAGCC	2	10	47482	47491	20 %	0 %	20 %	60 %	339324200
46	NC_015726	TGGCC	2	10	47700	47709	0 %	20 %	40 %	40 %	339324200
47	NC_015726	CAACC	2	10	52137	52146	40 %	0 %	0 %	60 %	339324206
48	NC_015726	GATGG	2	10	52438	52447	20 %	20 %	60 %	0 %	339324206
49	NC_015726	GGACC	2	10	53844	53853	20 %	0 %	40 %	40 %	339324208
50	NC_015726	CGGCG	2	10	54352	54361	0 %	0 %	60 %	40 %	339324209
51	NC_015726	GCGCT	2	10	54435	54444	0 %	20 %	40 %	40 %	339324209
52	NC_015726	GGGCA	2	10	55117	55126	20 %	0 %	60 %	20 %	339324210
53	NC_015726	GTGAA	2	10	55616	55625	40 %	20 %	40 %	0 %	339324210
54	NC_015726	GAGCA	2	10	55735	55744	40 %	0 %	40 %	20 %	339324210
55	NC_015726	AACCG	2	10	56028	56037	40 %	0 %	20 %	40 %	339324210
56	NC_015726	CTGGA	2	10	57235	57244	20 %	20 %	40 %	20 %	339324211
57	NC_015726	TGCGG	2	10	60311	60320	0 %	20 %	60 %	20 %	339324214
58	NC_015726	GCATT	2	10	60757	60766	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015726	GCCGC	2	10	62115	62124	0 %	0 %	40 %	60 %	339324216
60	NC_015726	GTGAT	2	10	62345	62354	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015726	GCGCC	2	10	63360	63369	0 %	0 %	40 %	60 %	339324217
62	NC_015726	TGCCC	2	10	63471	63480	0 %	20 %	20 %	60 %	339324217
63	NC_015726	CGATC	2	10	65460	65469	20 %	20 %	20 %	40 %	339324219
64	NC_015726	CCCTG	2	10	67983	67992	0 %	20 %	20 %	60 %	339324222
65	NC_015726	CGGCG	2	10	68409	68418	0 %	0 %	60 %	40 %	339324222
66	NC_015726	GCGCG	2	10	68911	68920	0 %	0 %	60 %	40 %	339324223
67	NC_015726	CGGCG	2	10	70692	70701	0 %	0 %	60 %	40 %	339324224
68	NC_015726	CTGCG	2	10	70707	70716	0 %	20 %	40 %	40 %	339324224
69	NC_015726	CGAGC	2	10	71648	71657	20 %	0 %	40 %	40 %	339324225
70	NC_015726	CGGCG	2	10	73207	73216	0 %	0 %	60 %	40 %	339324227
71	NC_015726	AGGGC	2	10	73957	73966	20 %	0 %	60 %	20 %	339324227
72	NC_015726	CTGCG	2	10	74491	74500	0 %	20 %	40 %	40 %	339324228
73	NC_015726	TGCGA	2	10	74776	74785	20 %	20 %	40 %	20 %	339324228
74	NC_015726	CCGGC	2	10	75475	75484	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_015726	GCCCG	2	10	77964	77973	0 %	0 %	40 %	60 %	339324231
76	NC_015726	TGGCT	2	10	79040	79049	0 %	40 %	40 %	20 %	339324232
77	NC_015726	GGCCA	2	10	80192	80201	20 %	0 %	40 %	40 %	339324234
78	NC_015726	GGCGC	2	10	81091	81100	0 %	0 %	60 %	40 %	339324235
79	NC_015726	GGGTC	2	10	81417	81426	0 %	20 %	60 %	20 %	339324235
80	NC_015726	AAGGA	2	10	83553	83562	60 %	0 %	40 %	0 %	339324238
81	NC_015726	CGCAG	2	10	85191	85200	20 %	0 %	40 %	40 %	339324240
82	NC_015726	CCGCA	2	10	86725	86734	20 %	0 %	20 %	60 %	339324242
83	NC_015726	GCCTG	2	10	89082	89091	0 %	20 %	40 %	40 %	339324244
84	NC_015726	GCCGG	2	10	89326	89335	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_015726	CACCG	2	10	90485	90494	20 %	0 %	20 %	60 %	339324246
86	NC_015726	GCCGC	2	10	92547	92556	0 %	0 %	40 %	60 %	339324249
87	NC_015726	AGGCC	2	10	94165	94174	20 %	0 %	40 %	40 %	339324250
88	NC_015726	CCGCG	2	10	94387	94396	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
89	NC_015726	CGGCG	2	10	94944	94953	0 %	0 %	60 %	40 %	339324251
90	NC_015726	CGGCG	2	10	96818	96827	0 %	0 %	60 %	40 %	339324252
91	NC_015726	GCTGC	2	10	97215	97224	0 %	20 %	40 %	40 %	339324253
92	NC_015726	GGCCG	2	10	97956	97965	0 %	0 %	60 %	40 %	339324255
93	NC_015726	GCCCG	2	10	98421	98430	0 %	0 %	40 %	60 %	339324255
94	NC_015726	CCAGC	2	10	100602	100611	20 %	0 %	20 %	60 %	339324257
95	NC_015726	CGGCG	2	10	100676	100685	0 %	0 %	60 %	40 %	339324257
96	NC_015726	CGCGG	2	10	101398	101407	0 %	0 %	60 %	40 %	339324258
97	NC_015726	GCACG	2	10	101905	101914	20 %	0 %	40 %	40 %	339324259
98	NC_015726	GCGCG	2	10	102384	102393	0 %	0 %	60 %	40 %	339324259
99	NC_015726	CCGGG	2	10	103351	103360	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_015726	ATCCC	2	10	104113	104122	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_015726	CGTGC	2	10	104610	104619	0 %	20 %	40 %	40 %	339324261
102	NC_015726	GCGCC	2	10	104637	104646	0 %	0 %	40 %	60 %	339324261
103	NC_015726	TCGGC	2	10	104936	104945	0 %	20 %	40 %	40 %	339324261
104	NC_015726	GCCGG	2	10	109480	109489	0 %	0 %	60 %	40 %	339324265
105	NC_015726	GCCGC	2	10	113194	113203	0 %	0 %	40 %	60 %	339324268
106	NC_015726	CACAT	2	10	113944	113953	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_015726	CTGGT	2	10	113975	113984	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015726	AAGCA	2	10	114809	114818	60 %	0 %	20 %	20 %	339324270
109	NC_015726	GACCC	2	10	114947	114956	20 %	0 %	20 %	60 %	339324271
110	NC_015726	GCCGC	2	10	116940	116949	0 %	0 %	40 %	60 %	339324273
111	NC_015726	GGCGC	2	10	117445	117454	0 %	0 %	60 %	40 %	339324273
112	NC_015726	AGCGC	2	10	117459	117468	20 %	0 %	40 %	40 %	339324273
113	NC_015726	GCGCC	2	10	119677	119686	0 %	0 %	40 %	60 %	339324276
114	NC_015726	GCTGG	2	10	119926	119935	0 %	20 %	60 %	20 %	339324276
115	NC_015726	CGGCG	2	10	120526	120535	0 %	0 %	60 %	40 %	339324277
116	NC_015726	CCAGC	2	10	120931	120940	20 %	0 %	20 %	60 %	339324277
117	NC_015726	TGGCG	2	10	121104	121113	0 %	20 %	60 %	20 %	339324278
118	NC_015726	CCCAG	2	10	121173	121182	20 %	0 %	20 %	60 %	339324278
119	NC_015726	AAGCA	2	10	122192	122201	60 %	0 %	20 %	20 %	339324278
120	NC_015726	TCGAC	2	10	123758	123767	20 %	20 %	20 %	40 %	339324280
121	NC_015726	CGGGT	2	10	124554	124563	0 %	20 %	60 %	20 %	339324281
122	NC_015726	GGCGT	2	10	124803	124812	0 %	20 %	60 %	20 %	339324281
123	NC_015726	GCATC	2	10	125217	125226	20 %	20 %	20 %	40 %	339324282
124	NC_015726	CCCGC	2	10	125998	126007	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
125	NC_015726	GGCGC	2	10	126817	126826	0 %	0 %	60 %	40 %	339324283
126	NC_015726	GCGCC	2	10	128211	128220	0 %	0 %	40 %	60 %	339324285
127	NC_015726	GGCCT	2	10	129273	129282	0 %	20 %	40 %	40 %	339324286
128	NC_015726	ATTTT	2	10	129389	129398	20 %	80 %	0 %	0 %	339324286
129	NC_015726	GCCCA	2	10	131667	131676	20 %	0 %	20 %	60 %	339324288
130	NC_015726	TGCCG	2	10	131887	131896	0 %	20 %	40 %	40 %	339324288
131	NC_015726	TGGCG	2	10	132046	132055	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015726	GCGCC	2	10	135375	135384	0 %	0 %	40 %	60 %	339324292
133	NC_015726	GGCGA	2	10	135467	135476	20 %	0 %	60 %	20 %	339324292
134	NC_015726	GGGCG	2	10	135936	135945	0 %	0 %	80 %	20 %	339324292
135	NC_015726	GCCCG	2	10	136988	136997	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_015726	AGCCG	2	10	137242	137251	20 %	0 %	40 %	40 %	339324294
137	NC_015726	GCTGG	2	10	137947	137956	0 %	20 %	60 %	20 %	339324294
138	NC_015726	GCCAC	2	10	138095	138104	20 %	0 %	20 %	60 %	339324295
139	NC_015726	CATGG	2	10	138533	138542	20 %	20 %	40 %	20 %	339324295
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235	NC_015726	CCAAT	2	10	262617	262626	40 %	20 %	0 %	40 %	339324420
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238	NC_015726	CGGAT	2	10	264535	264544	20 %	20 %	40 %	20 %	339324423
239	NC_015726	GCCGC	2	10	265154	265163	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
240	NC_015726	GGGCT	2	10	265892	265901	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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249	NC_015726	GCCCA	2	10	273804	273813	20 %	0 %	20 %	60 %	339324431
250	NC_015726	AGGGC	2	10	276158	276167	20 %	0 %	60 %	20 %	339324432
251	NC_015726	GCCGC	2	10	277647	277656	0 %	0 %	40 %	60 %	339324433
252	NC_015726	CGCAT	2	10	277951	277960	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
253	NC_015726	GCGCC	2	10	278108	278117	0 %	0 %	40 %	60 %	339324434
254	NC_015726	CTGCA	2	10	282022	282031	20 %	20 %	20 %	40 %	339324439
255	NC_015726	GCACC	2	10	282860	282869	20 %	0 %	20 %	60 %	339324440
256	NC_015726	GGCGT	2	10	286868	286877	0 %	20 %	60 %	20 %	339324443
257	NC_015726	GGCAG	2	10	287322	287331	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
258	NC_015726	GCCCC	2	10	287969	287978	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
259	NC_015726	CGGTC	2	10	288219	288228	0 %	20 %	40 %	40 %	339324445
260	NC_015726	ATGGC	2	10	289299	289308	20 %	20 %	40 %	20 %	339324445
261	NC_015726	GGCGC	2	10	289627	289636	0 %	0 %	60 %	40 %	339324445
262	NC_015726	CGGCC	2	10	290199	290208	0 %	0 %	40 %	60 %	339324445
263	NC_015726	CGACC	2	10	291186	291195	20 %	0 %	20 %	60 %	339324445
264	NC_015726	GGCCT	2	10	292688	292697	0 %	20 %	40 %	40 %	339324447
265	NC_015726	GACAA	2	10	293092	293101	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
266	NC_015726	CGCAG	2	10	293723	293732	20 %	0 %	40 %	40 %	339324449
267	NC_015726	GGCGC	2	10	294502	294511	0 %	0 %	60 %	40 %	339324450
268	NC_015726	GACCG	2	10	294796	294805	20 %	0 %	40 %	40 %	339324451
269	NC_015726	CGGCG	2	10	295494	295503	0 %	0 %	60 %	40 %	339324452
270	NC_015726	CGGAC	2	10	295950	295959	20 %	0 %	40 %	40 %	339324452
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499	NC_015726	AGCGC	2	10	558063	558072	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
500	NC_015726	TCCGA	2	10	558222	558231	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

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