MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 103346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015726	CACG	2	8	114170	114177	25 %	0 %	25 %	50 %	339324270
3002	NC_015726	CTGG	2	8	114198	114205	0 %	25 %	50 %	25 %	339324270
3003	NC_015726	CCG	2	6	114214	114219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324270
3004	NC_015726	GGCG	2	8	114237	114244	0 %	0 %	75 %	25 %	339324270
3005	NC_015726	CTG	2	6	114256	114261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324270
3006	NC_015726	GAC	2	6	114268	114273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324270
3007	NC_015726	CGT	2	6	114282	114287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324270
3008	NC_015726	GATC	2	8	114291	114298	25 %	25 %	25 %	25 %	339324270
3009	NC_015726	GCC	4	12	114362	114373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324270
3010	NC_015726	CGG	3	9	114662	114670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324270
3011	NC_015726	CAA	2	6	114706	114711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324270
3012	NC_015726	GGC	2	6	114732	114737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324270
3013	NC_015726	CG	3	6	114772	114777	0 %	0 %	50 %	50 %	339324270
3014	NC_015726	GCC	2	6	114796	114801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324270
3015	NC_015726	AAGCA	2	10	114809	114818	60 %	0 %	20 %	20 %	339324270
3016	NC_015726	CCT	2	6	114839	114844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324270
3017	NC_015726	GACCC	2	10	114947	114956	20 %	0 %	20 %	60 %	339324271
3018	NC_015726	CGCA	2	8	114982	114989	25 %	0 %	25 %	50 %	339324271
3019	NC_015726	GCCG	2	8	115006	115013	0 %	0 %	50 %	50 %	339324271
3020	NC_015726	AAG	2	6	115022	115027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324271
3021	NC_015726	GCC	2	6	115049	115054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324271
3022	NC_015726	GC	3	6	115093	115098	0 %	0 %	50 %	50 %	339324271
3023	NC_015726	CAA	2	6	115099	115104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324271
3024	NC_015726	GAA	2	6	115121	115126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324271
3025	NC_015726	CGC	2	6	115202	115207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324271
3026	NC_015726	GCC	2	6	115233	115238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324271
3027	NC_015726	TCA	2	6	115311	115316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324271
3028	NC_015726	CGA	2	6	115330	115335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324271
3029	NC_015726	GGC	2	6	115346	115351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324271
3030	NC_015726	CG	3	6	115383	115388	0 %	0 %	50 %	50 %	339324271
3031	NC_015726	CCG	2	6	115475	115480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324271
3032	NC_015726	TGA	2	6	115485	115490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324271
3033	NC_015726	GCCC	2	8	115529	115536	0 %	0 %	25 %	75 %	339324271
3034	NC_015726	GCT	2	6	115564	115569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324271
3035	NC_015726	TGG	2	6	115620	115625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324271
3036	NC_015726	CGA	2	6	115639	115644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324271
3037	NC_015726	GC	3	6	115672	115677	0 %	0 %	50 %	50 %	339324271
3038	NC_015726	CGACAT	2	12	115681	115692	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339324271
3039	NC_015726	ACC	3	9	115725	115733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324271
3040	NC_015726	TGC	2	6	115740	115745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324271
3041	NC_015726	ATG	2	6	116028	116033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_015726	TGCC	2	8	116083	116090	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_015726	GCT	2	6	116159	116164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324272
3044	NC_015726	C	6	6	116178	116183	0 %	0 %	0 %	100 %	339324272
3045	NC_015726	GGT	2	6	116246	116251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324272
3046	NC_015726	GTG	2	6	116256	116261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324272
3047	NC_015726	AAC	2	6	116271	116276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324272
3048	NC_015726	GC	3	6	116355	116360	0 %	0 %	50 %	50 %	339324272
3049	NC_015726	TGG	2	6	116377	116382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324272
3050	NC_015726	CGG	2	6	116399	116404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324272
3051	NC_015726	GGC	2	6	116432	116437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324272
3052	NC_015726	CGC	2	6	116452	116457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324272
3053	NC_015726	GTG	2	6	116463	116468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324272
3054	NC_015726	CGC	2	6	116469	116474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324272
3055	NC_015726	GTC	2	6	116493	116498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324272
3056	NC_015726	GGGC	2	8	116534	116541	0 %	0 %	75 %	25 %	339324272
3057	NC_015726	CGC	2	6	116560	116565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324272
3058	NC_015726	GCCG	2	8	116591	116598	0 %	0 %	50 %	50 %	339324272
3059	NC_015726	TCGG	2	8	116601	116608	0 %	25 %	50 %	25 %	339324272
3060	NC_015726	GGC	2	6	116613	116618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324272
3061	NC_015726	CGG	2	6	116638	116643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324272
3062	NC_015726	TGC	2	6	116644	116649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324272
3063	NC_015726	GGC	2	6	116652	116657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324272
3064	NC_015726	CCG	2	6	116709	116714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324272
3065	NC_015726	TTG	2	6	116746	116751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324272
3066	NC_015726	GC	3	6	116790	116795	0 %	0 %	50 %	50 %	339324273
3067	NC_015726	GCC	2	6	116918	116923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324273
3068	NC_015726	GCCGC	2	10	116940	116949	0 %	0 %	40 %	60 %	339324273
3069	NC_015726	GCG	2	6	116997	117002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324273
3070	NC_015726	GACGCT	2	12	117061	117072	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339324273
3071	NC_015726	CG	3	6	117081	117086	0 %	0 %	50 %	50 %	339324273
3072	NC_015726	CG	3	6	117093	117098	0 %	0 %	50 %	50 %	339324273
3073	NC_015726	GGCG	2	8	117112	117119	0 %	0 %	75 %	25 %	339324273
3074	NC_015726	GCA	2	6	117150	117155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324273
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3076	NC_015726	CG	3	6	117191	117196	0 %	0 %	50 %	50 %	339324273
3077	NC_015726	CGG	2	6	117219	117224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324273
3078	NC_015726	TGG	2	6	117237	117242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324273
3079	NC_015726	TGC	2	6	117324	117329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324273
3080	NC_015726	GGCGC	2	10	117445	117454	0 %	0 %	60 %	40 %	339324273
3081	NC_015726	AGCGC	2	10	117459	117468	20 %	0 %	40 %	40 %	339324273
3082	NC_015726	CTG	2	6	117473	117478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324273
3083	NC_015726	GTG	2	6	117488	117493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324273
3084	NC_015726	GCC	2	6	117511	117516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324273
3085	NC_015726	GGC	2	6	117518	117523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324273
3086	NC_015726	ACC	2	6	117554	117559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324273
3087	NC_015726	GGC	2	6	117560	117565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324273
3088	NC_015726	GTG	2	6	117581	117586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324273
3089	NC_015726	GGC	2	6	117603	117608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324273
3090	NC_015726	GCAG	2	8	117661	117668	25 %	0 %	50 %	25 %	339324273
3091	NC_015726	GGC	2	6	117670	117675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324273
3092	NC_015726	GC	3	6	117750	117755	0 %	0 %	50 %	50 %	339324273
3093	NC_015726	GGC	2	6	117756	117761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324273
3094	NC_015726	GC	3	6	117760	117765	0 %	0 %	50 %	50 %	339324273
3095	NC_015726	AC	3	6	117766	117771	50 %	0 %	0 %	50 %	339324273
3096	NC_015726	GC	3	6	117788	117793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_015726	ACG	2	6	117886	117891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324274
3098	NC_015726	GCT	2	6	117896	117901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324274
3099	NC_015726	GCG	2	6	117991	117996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324274
3100	NC_015726	GC	3	6	118102	118107	0 %	0 %	50 %	50 %	339324274
3101	NC_015726	GC	4	8	118121	118128	0 %	0 %	50 %	50 %	339324274
3102	NC_015726	GCG	2	6	118132	118137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324274
3103	NC_015726	GC	3	6	118162	118167	0 %	0 %	50 %	50 %	339324274
3104	NC_015726	CG	3	6	118203	118208	0 %	0 %	50 %	50 %	339324274
3105	NC_015726	GC	3	6	118214	118219	0 %	0 %	50 %	50 %	339324274
3106	NC_015726	TTC	2	6	118248	118253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324274
3107	NC_015726	GAT	2	6	118271	118276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324274
3108	NC_015726	AGG	2	6	118288	118293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324274
3109	NC_015726	AGG	2	6	118312	118317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324274
3110	NC_015726	GC	3	6	118375	118380	0 %	0 %	50 %	50 %	339324274
3111	NC_015726	GC	3	6	118442	118447	0 %	0 %	50 %	50 %	339324274
3112	NC_015726	GT	3	6	118485	118490	0 %	50 %	50 %	0 %	339324274
3113	NC_015726	ACGGCG	2	12	118495	118506	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339324274
3114	NC_015726	GC	3	6	118524	118529	0 %	0 %	50 %	50 %	339324274
3115	NC_015726	CGGC	2	8	118614	118621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_015726	CGT	2	6	118624	118629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_015726	TCA	3	9	118727	118735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324275
3118	NC_015726	TGC	2	6	118745	118750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324275
3119	NC_015726	TGG	3	9	118766	118774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324275
3120	NC_015726	CGC	2	6	118779	118784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324275
3121	NC_015726	TCT	2	6	118826	118831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324275
3122	NC_015726	GC	3	6	118858	118863	0 %	0 %	50 %	50 %	339324275
3123	NC_015726	ATC	2	6	118876	118881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324275
3124	NC_015726	CTG	2	6	118906	118911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324275
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3132	NC_015726	TCG	2	6	119242	119247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324275
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3240	NC_015726	TCG	2	6	122625	122630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324279
3241	NC_015726	CTGCGC	2	12	122684	122695	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339324279
3242	NC_015726	AGA	2	6	122710	122715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324279
3243	NC_015726	CCAG	2	8	122728	122735	25 %	0 %	25 %	50 %	339324279
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3245	NC_015726	CGG	2	6	122816	122821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324279
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3249	NC_015726	CGG	2	6	122890	122895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324279
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3253	NC_015726	CGG	2	6	122968	122973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324279
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3321	NC_015726	TCG	2	6	125651	125656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324282
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3329	NC_015726	TGG	2	6	125852	125857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324282
3330	NC_015726	CG	3	6	125919	125924	0 %	0 %	50 %	50 %	339324282
3331	NC_015726	CGT	2	6	125941	125946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324282
3332	NC_015726	CCCGC	2	10	125998	126007	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3333	NC_015726	GGC	3	9	126030	126038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3334	NC_015726	GCA	2	6	126059	126064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3338	NC_015726	TGG	2	6	126258	126263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324283
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3342	NC_015726	GCCG	2	8	126378	126385	0 %	0 %	50 %	50 %	339324283
3343	NC_015726	GGCAGG	2	12	126387	126398	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	339324283
3344	NC_015726	CGCTGG	2	12	126426	126437	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339324283
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3346	NC_015726	ATCGGC	2	12	126629	126640	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339324283
3347	NC_015726	GGCG	2	8	126691	126698	0 %	0 %	75 %	25 %	339324283
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3352	NC_015726	GCT	2	6	126865	126870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324283
3353	NC_015726	GC	3	6	126902	126907	0 %	0 %	50 %	50 %	339324283
3354	NC_015726	CGA	2	6	126913	126918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324283
3355	NC_015726	GGCC	2	8	126919	126926	0 %	0 %	50 %	50 %	339324283
3356	NC_015726	CTG	3	9	126929	126937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324283
3357	NC_015726	CGG	2	6	126945	126950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324283
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3359	NC_015726	GC	3	6	127019	127024	0 %	0 %	50 %	50 %	339324284
3360	NC_015726	CTG	2	6	127030	127035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324284
3361	NC_015726	GCG	2	6	127084	127089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324284
3362	NC_015726	GC	3	6	127103	127108	0 %	0 %	50 %	50 %	339324284
3363	NC_015726	GCA	2	6	127122	127127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324284
3364	NC_015726	CGG	2	6	127128	127133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324284
3365	NC_015726	GC	3	6	127157	127162	0 %	0 %	50 %	50 %	339324284
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3492	NC_015726	GCCCA	2	10	131667	131676	20 %	0 %	20 %	60 %	339324288
3493	NC_015726	CAGC	2	8	131690	131697	25 %	0 %	25 %	50 %	339324288
3494	NC_015726	GC	4	8	131696	131703	0 %	0 %	50 %	50 %	339324288
3495	NC_015726	GCA	2	6	131719	131724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324288
3496	NC_015726	CGT	2	6	131740	131745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324288
3497	NC_015726	GCC	2	6	131769	131774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324288
3498	NC_015726	TG	3	6	131781	131786	0 %	50 %	50 %	0 %	339324288
3499	NC_015726	GAT	2	6	131855	131860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324288
3500	NC_015726	TGCCG	2	10	131887	131896	0 %	20 %	40 %	40 %	339324288

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