MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 103346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2503	NC_015726	GC	3	6	97668	97673	0 %	0 %	50 %	50 %	339324254
2504	NC_015726	CG	3	6	97682	97687	0 %	0 %	50 %	50 %	339324254
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2742	NC_015726	CCG	2	6	105524	105529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324262
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2744	NC_015726	GCT	2	6	105592	105597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324262
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2749	NC_015726	GTC	2	6	105724	105729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324262
2750	NC_015726	GCA	2	6	105775	105780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324262
2751	NC_015726	AAC	2	6	105821	105826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324262
2752	NC_015726	GCT	2	6	105838	105843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324262
2753	NC_015726	GCA	2	6	105853	105858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324262
2754	NC_015726	GCC	2	6	105878	105883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324262
2755	NC_015726	CG	4	8	105898	105905	0 %	0 %	50 %	50 %	339324262
2756	NC_015726	CAGC	2	8	105913	105920	25 %	0 %	25 %	50 %	339324262
2757	NC_015726	CAGC	2	8	105940	105947	25 %	0 %	25 %	50 %	339324262
2758	NC_015726	CGA	2	6	105976	105981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324262
2759	NC_015726	GCG	2	6	105984	105989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324262
2760	NC_015726	TGG	2	6	105990	105995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324262
2761	NC_015726	CG	3	6	106005	106010	0 %	0 %	50 %	50 %	339324262
2762	NC_015726	GCT	2	6	106036	106041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324262
2763	NC_015726	GGT	2	6	106072	106077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324262
2764	NC_015726	CGG	2	6	106105	106110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324262
2765	NC_015726	CG	5	10	106111	106120	0 %	0 %	50 %	50 %	339324262
2766	NC_015726	GCC	4	12	106145	106156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324262
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2768	NC_015726	CTG	2	6	106175	106180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324262
2769	NC_015726	CCG	2	6	106208	106213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324262
2770	NC_015726	ATC	2	6	106232	106237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324262
2771	NC_015726	CG	3	6	106269	106274	0 %	0 %	50 %	50 %	339324262
2772	NC_015726	GC	4	8	106300	106307	0 %	0 %	50 %	50 %	339324262
2773	NC_015726	GCT	2	6	106315	106320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324262
2774	NC_015726	GGT	2	6	106321	106326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324262
2775	NC_015726	ACG	2	6	106332	106337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324262
2776	NC_015726	CG	4	8	106348	106355	0 %	0 %	50 %	50 %	339324262
2777	NC_015726	CCG	2	6	106401	106406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324262
2778	NC_015726	GC	4	8	106409	106416	0 %	0 %	50 %	50 %	339324262
2779	NC_015726	GCC	2	6	106418	106423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324262
2780	NC_015726	GCG	2	6	106430	106435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324262
2781	NC_015726	CGCC	2	8	106449	106456	0 %	0 %	25 %	75 %	339324262
2782	NC_015726	AGG	2	6	106458	106463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324262
2783	NC_015726	CAC	2	6	106464	106469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324262
2784	NC_015726	CTG	2	6	106489	106494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2785	NC_015726	CAC	2	6	106566	106571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324263
2786	NC_015726	TGG	2	6	106589	106594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324263
2787	NC_015726	GCTGGT	2	12	106596	106607	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339324263
2788	NC_015726	CCA	2	6	106620	106625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324263
2789	NC_015726	CTG	2	6	106657	106662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2790	NC_015726	CTG	2	6	106666	106671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2791	NC_015726	GCT	2	6	106692	106697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2792	NC_015726	CTG	2	6	106723	106728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
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2794	NC_015726	TGC	2	6	106796	106801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
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2796	NC_015726	CGGTGC	2	12	106823	106834	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339324263
2797	NC_015726	GC	3	6	106853	106858	0 %	0 %	50 %	50 %	339324263
2798	NC_015726	GCT	2	6	106902	106907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2799	NC_015726	CCA	2	6	106919	106924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324263
2800	NC_015726	CTG	3	9	106927	106935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2801	NC_015726	CGA	2	6	106962	106967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324263
2802	NC_015726	CGC	2	6	106984	106989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2803	NC_015726	GGC	2	6	107090	107095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324264
2804	NC_015726	CTG	2	6	107127	107132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324264
2805	NC_015726	CAT	3	9	107234	107242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324264
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2807	NC_015726	ATT	2	6	107272	107277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339324264
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2810	NC_015726	CG	3	6	107368	107373	0 %	0 %	50 %	50 %	339324264
2811	NC_015726	CAGC	2	8	107435	107442	25 %	0 %	25 %	50 %	339324264
2812	NC_015726	CGA	2	6	107447	107452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324264
2813	NC_015726	GCTTCC	2	12	107479	107490	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	339324264
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2815	NC_015726	GAGC	2	8	107717	107724	25 %	0 %	50 %	25 %	339324264
2816	NC_015726	GGAAGT	2	12	107747	107758	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	339324264
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2822	NC_015726	TCG	2	6	107962	107967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324264
2823	NC_015726	CAA	2	6	107999	108004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324264
2824	NC_015726	CCCG	2	8	108050	108057	0 %	0 %	25 %	75 %	339324264
2825	NC_015726	GGC	2	6	108086	108091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324264
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2827	NC_015726	CTT	2	6	108140	108145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324264
2828	NC_015726	CGA	2	6	108170	108175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324264
2829	NC_015726	GGC	2	6	108183	108188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324264
2830	NC_015726	CTA	3	9	108236	108244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324264
2831	NC_015726	GC	3	6	108252	108257	0 %	0 %	50 %	50 %	339324264
2832	NC_015726	CATCGA	2	12	108320	108331	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339324264
2833	NC_015726	CGAC	2	8	108358	108365	25 %	0 %	25 %	50 %	339324264
2834	NC_015726	CG	3	6	108375	108380	0 %	0 %	50 %	50 %	339324264
2835	NC_015726	AGC	2	6	108394	108399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324264
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2838	NC_015726	CAA	2	6	108497	108502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324264
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2843	NC_015726	CGG	2	6	108697	108702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324264
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2846	NC_015726	CG	3	6	108887	108892	0 %	0 %	50 %	50 %	339324264
2847	NC_015726	ACT	2	6	108904	108909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324264
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2849	NC_015726	GCC	2	6	108976	108981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324264
2850	NC_015726	ACC	2	6	109008	109013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324264
2851	NC_015726	GCG	2	6	109072	109077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324264
2852	NC_015726	GCC	2	6	109080	109085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324264
2853	NC_015726	GC	3	6	109108	109113	0 %	0 %	50 %	50 %	339324264
2854	NC_015726	CGC	2	6	109115	109120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324264
2855	NC_015726	CGG	2	6	109138	109143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324264
2856	NC_015726	TGC	2	6	109201	109206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324264
2857	NC_015726	GCC	2	6	109235	109240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324264
2858	NC_015726	GCGCCC	2	12	109269	109280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324264
2859	NC_015726	CAGC	2	8	109312	109319	25 %	0 %	25 %	50 %	339324264
2860	NC_015726	CGC	2	6	109361	109366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324265
2861	NC_015726	CTG	2	6	109430	109435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
2862	NC_015726	GCC	2	6	109466	109471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324265
2863	NC_015726	GCCGG	2	10	109480	109489	0 %	0 %	60 %	40 %	339324265
2864	NC_015726	CTG	2	6	109514	109519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
2865	NC_015726	TGA	2	6	109530	109535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324265
2866	NC_015726	GCT	2	6	109606	109611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
2867	NC_015726	GC	4	8	109647	109654	0 %	0 %	50 %	50 %	339324265
2868	NC_015726	GTG	2	6	109772	109777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324265
2869	NC_015726	TGC	3	9	109785	109793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
2870	NC_015726	GCT	2	6	109840	109845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
2871	NC_015726	GCT	2	6	109909	109914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
2872	NC_015726	GCT	2	6	109918	109923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
2873	NC_015726	GGT	2	6	109924	109929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324265
2874	NC_015726	GCT	2	6	109939	109944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
2875	NC_015726	GC	3	6	109968	109973	0 %	0 %	50 %	50 %	339324265
2876	NC_015726	TGC	2	6	109992	109997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
2877	NC_015726	CAG	2	6	110006	110011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324265
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2879	NC_015726	ATC	2	6	110081	110086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324265
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2882	NC_015726	TGC	2	6	110223	110228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
2883	NC_015726	CTG	2	6	110240	110245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
2884	NC_015726	GCT	2	6	110299	110304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324265
2885	NC_015726	GATC	2	8	110310	110317	25 %	25 %	25 %	25 %	339324265
2886	NC_015726	TCT	2	6	110325	110330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324265
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2889	NC_015726	TGA	2	6	110400	110405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324265
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2891	NC_015726	TGA	2	6	110454	110459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324265
2892	NC_015726	CCAC	2	8	110521	110528	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2893	NC_015726	GCC	2	6	110571	110576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324266
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2913	NC_015726	GCCG	2	8	111275	111282	0 %	0 %	50 %	50 %	339324267
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2942	NC_015726	GC	4	8	112276	112283	0 %	0 %	50 %	50 %	339324267
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2977	NC_015726	GCCGC	2	10	113194	113203	0 %	0 %	40 %	60 %	339324268
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2979	NC_015726	CG	3	6	113263	113268	0 %	0 %	50 %	50 %	339324268
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2981	NC_015726	GT	3	6	113321	113326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2982	NC_015726	AACAAG	2	12	113341	113352	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2983	NC_015726	AT	3	6	113357	113362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2984	NC_015726	CGC	2	6	113489	113494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2985	NC_015726	CCG	2	6	113521	113526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2986	NC_015726	ACC	2	6	113545	113550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2987	NC_015726	CAC	2	6	113601	113606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324269
2988	NC_015726	TGC	2	6	113619	113624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324269
2989	NC_015726	ACT	2	6	113693	113698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324269
2990	NC_015726	GGC	2	6	113710	113715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324269
2991	NC_015726	CTG	3	9	113719	113727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324269
2992	NC_015726	GGT	2	6	113742	113747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324269
2993	NC_015726	GC	3	6	113803	113808	0 %	0 %	50 %	50 %	339324269
2994	NC_015726	GGCGCT	2	12	113814	113825	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339324269
2995	NC_015726	ACCAGG	2	12	113894	113905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324269
2996	NC_015726	CACAT	2	10	113944	113953	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2997	NC_015726	CTGGT	2	10	113975	113984	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2998	NC_015726	GCA	2	6	114031	114036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2999	NC_015726	GC	3	6	114153	114158	0 %	0 %	50 %	50 %	339324270
3000	NC_015726	CCG	2	6	114164	114169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324270

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