MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 103346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015726	GGT	2	6	41835	41840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324194
1002	NC_015726	TGGC	2	8	41946	41953	0 %	25 %	50 %	25 %	339324194
1003	NC_015726	TGG	2	6	41959	41964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324194
1004	NC_015726	GCG	3	9	41998	42006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324194
1005	NC_015726	CCG	2	6	42029	42034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324194
1006	NC_015726	TCA	2	6	42134	42139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324194
1007	NC_015726	GGT	2	6	42141	42146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324194
1008	NC_015726	GTC	2	6	42280	42285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324194
1009	NC_015726	GCG	2	6	42331	42336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324194
1010	NC_015726	CCCGG	2	10	42351	42360	0 %	0 %	40 %	60 %	339324194
1011	NC_015726	GC	3	6	42369	42374	0 %	0 %	50 %	50 %	339324194
1012	NC_015726	GGT	2	6	42384	42389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324194
1013	NC_015726	TTG	3	9	42428	42436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324194
1014	NC_015726	GCT	2	6	42459	42464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324194
1015	NC_015726	GC	4	8	42486	42493	0 %	0 %	50 %	50 %	339324194
1016	NC_015726	TCG	2	6	42527	42532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324194
1017	NC_015726	CG	3	6	42665	42670	0 %	0 %	50 %	50 %	339324194
1018	NC_015726	GTGC	2	8	42705	42712	0 %	25 %	50 %	25 %	339324194
1019	NC_015726	CTG	2	6	42751	42756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324194
1020	NC_015726	GC	3	6	42819	42824	0 %	0 %	50 %	50 %	339324194
1021	NC_015726	ACG	2	6	42834	42839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324194
1022	NC_015726	CG	3	6	42838	42843	0 %	0 %	50 %	50 %	339324194
1023	NC_015726	GGTC	2	8	42887	42894	0 %	25 %	50 %	25 %	339324194
1024	NC_015726	GTG	2	6	42898	42903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324194
1025	NC_015726	GCT	2	6	42972	42977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324194
1026	NC_015726	GCTG	2	8	42987	42994	0 %	25 %	50 %	25 %	339324194
1027	NC_015726	GATG	2	8	43044	43051	25 %	25 %	50 %	0 %	339324194
1028	NC_015726	GGT	2	6	43081	43086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015726	GCG	2	6	43291	43296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324195
1030	NC_015726	GC	3	6	43311	43316	0 %	0 %	50 %	50 %	339324195
1031	NC_015726	GCTG	2	8	43319	43326	0 %	25 %	50 %	25 %	339324195
1032	NC_015726	GCC	2	6	43353	43358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324195
1033	NC_015726	CGG	2	6	43361	43366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324195
1034	NC_015726	TCT	2	6	43399	43404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324195
1035	NC_015726	GC	3	6	43420	43425	0 %	0 %	50 %	50 %	339324195
1036	NC_015726	TTC	2	6	43428	43433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324195
1037	NC_015726	CGC	2	6	43484	43489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324195
1038	NC_015726	GGC	2	6	43512	43517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324195
1039	NC_015726	TGA	2	6	43600	43605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324195
1040	NC_015726	TGC	2	6	43654	43659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324195
1041	NC_015726	TGC	2	6	43672	43677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324195
1042	NC_015726	GGC	2	6	43788	43793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324195
1043	NC_015726	CTG	2	6	43797	43802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324195
1044	NC_015726	GTGA	2	8	43851	43858	25 %	25 %	50 %	0 %	339324195
1045	NC_015726	TCC	2	6	43879	43884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324195
1046	NC_015726	GCG	2	6	43888	43893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324195
1047	NC_015726	GCTG	2	8	43955	43962	0 %	25 %	50 %	25 %	339324195
1048	NC_015726	GCA	2	6	43966	43971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324195
1049	NC_015726	GC	3	6	43977	43982	0 %	0 %	50 %	50 %	339324195
1050	NC_015726	TGC	2	6	44002	44007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324195
1051	NC_015726	TCG	2	6	44032	44037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324195
1052	NC_015726	CTG	2	6	44040	44045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324195
1053	NC_015726	TCG	2	6	44068	44073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324195
1054	NC_015726	TGG	2	6	44074	44079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324195
1055	NC_015726	AGA	2	6	44104	44109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324195
1056	NC_015726	CCA	2	6	44111	44116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324195
1057	NC_015726	GCGCTC	2	12	44127	44138	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339324195
1058	NC_015726	CTG	2	6	44319	44324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324195
1059	NC_015726	TCG	2	6	44332	44337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324195
1060	NC_015726	GC	3	6	44369	44374	0 %	0 %	50 %	50 %	339324195
1061	NC_015726	TC	3	6	44402	44407	0 %	50 %	0 %	50 %	339324195
1062	NC_015726	ACA	2	6	44416	44421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324195
1063	NC_015726	GGC	2	6	44439	44444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324195
1064	NC_015726	GAT	2	6	44453	44458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324195
1065	NC_015726	GCA	2	6	44474	44479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324195
1066	NC_015726	CTTG	2	8	44531	44538	0 %	50 %	25 %	25 %	339324195
1067	NC_015726	GCCAT	2	10	44563	44572	20 %	20 %	20 %	40 %	339324195
1068	NC_015726	ACG	2	6	44637	44642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324196
1069	NC_015726	CCA	2	6	44652	44657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324196
1070	NC_015726	CTG	2	6	44664	44669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324196
1071	NC_015726	GCTG	2	8	44681	44688	0 %	25 %	50 %	25 %	339324196
1072	NC_015726	GGCC	2	8	44791	44798	0 %	0 %	50 %	50 %	339324196
1073	NC_015726	CAA	2	6	44858	44863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324196
1074	NC_015726	GCG	2	6	45025	45030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324196
1075	NC_015726	CGC	2	6	45047	45052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324196
1076	NC_015726	GGC	2	6	45119	45124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324196
1077	NC_015726	TGC	2	6	45196	45201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324196
1078	NC_015726	CGCCA	2	10	45290	45299	20 %	0 %	20 %	60 %	339324196
1079	NC_015726	GTT	2	6	45336	45341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324197
1080	NC_015726	TGG	2	6	45372	45377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324197
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1082	NC_015726	GCC	2	6	45421	45426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324197
1083	NC_015726	GTTC	2	8	45470	45477	0 %	50 %	25 %	25 %	339324197
1084	NC_015726	GCA	2	6	45486	45491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324197
1085	NC_015726	CGA	2	6	45516	45521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324197
1086	NC_015726	GCG	2	6	45561	45566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_015726	GGC	2	6	45570	45575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_015726	GGC	2	6	45590	45595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_015726	G	6	6	45706	45711	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015726	CTG	2	6	45719	45724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_015726	CG	4	8	45761	45768	0 %	0 %	50 %	50 %	339324198
1092	NC_015726	TGG	2	6	45772	45777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324198
1093	NC_015726	GCG	2	6	45834	45839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324198
1094	NC_015726	TCC	2	6	45856	45861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324198
1095	NC_015726	GGC	2	6	45885	45890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324198
1096	NC_015726	GC	3	6	45972	45977	0 %	0 %	50 %	50 %	339324198
1097	NC_015726	GGC	2	6	46088	46093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324198
1098	NC_015726	TGA	3	9	46217	46225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324198
1099	NC_015726	GC	4	8	46259	46266	0 %	0 %	50 %	50 %	339324198
1100	NC_015726	GCC	3	9	46299	46307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324198
1101	NC_015726	CGC	2	6	46325	46330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324198
1102	NC_015726	GC	3	6	46329	46334	0 %	0 %	50 %	50 %	339324198
1103	NC_015726	CGCCAG	2	12	46356	46367	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339324198
1104	NC_015726	CGT	2	6	46388	46393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324198
1105	NC_015726	CGT	2	6	46412	46417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324198
1106	NC_015726	GGC	2	6	46493	46498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324198
1107	NC_015726	GCA	2	6	46508	46513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324198
1108	NC_015726	GCC	2	6	46551	46556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324198
1109	NC_015726	CTG	2	6	46571	46576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324198
1110	NC_015726	GTG	2	6	46609	46614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324198
1111	NC_015726	CGT	2	6	46628	46633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324198
1112	NC_015726	CG	3	6	46705	46710	0 %	0 %	50 %	50 %	339324199
1113	NC_015726	CGG	2	6	46745	46750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324199
1114	NC_015726	GAT	2	6	46760	46765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324199
1115	NC_015726	GCC	2	6	46766	46771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324199
1116	NC_015726	CCAT	2	8	46773	46780	25 %	25 %	0 %	50 %	339324199
1117	NC_015726	GAC	3	9	46781	46789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324199
1118	NC_015726	CGG	2	6	46852	46857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324199
1119	NC_015726	TCA	2	6	46867	46872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324199
1120	NC_015726	GCA	2	6	46876	46881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324199
1121	NC_015726	CCA	2	6	46888	46893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324199
1122	NC_015726	TCG	2	6	46920	46925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324199
1123	NC_015726	CG	3	6	46936	46941	0 %	0 %	50 %	50 %	339324199
1124	NC_015726	GCT	2	6	46975	46980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324199
1125	NC_015726	GCC	2	6	46985	46990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324199
1126	NC_015726	CG	3	6	47074	47079	0 %	0 %	50 %	50 %	339324199
1127	NC_015726	GCA	2	6	47089	47094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324199
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1129	NC_015726	GCA	2	6	47119	47124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324199
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1246	NC_015726	CTT	2	6	51532	51537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324205
1247	NC_015726	GGC	2	6	51616	51621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324205
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1377	NC_015726	TGAC	2	8	57258	57265	25 %	25 %	25 %	25 %	339324211
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1469	NC_015726	GCATT	2	10	60757	60766	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1474	NC_015726	CG	3	6	60991	60996	0 %	0 %	50 %	50 %	339324215
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1486	NC_015726	GCC	2	6	61311	61316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324216
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1492	NC_015726	CCG	2	6	61635	61640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324216
1493	NC_015726	GCG	2	6	61641	61646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324216
1494	NC_015726	GC	4	8	61654	61661	0 %	0 %	50 %	50 %	339324216
1495	NC_015726	GC	3	6	61706	61711	0 %	0 %	50 %	50 %	339324216
1496	NC_015726	GGC	2	6	61737	61742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324216
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1499	NC_015726	GTG	2	6	61825	61830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324216
1500	NC_015726	CGT	2	6	61843	61848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324216

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