MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 103346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015726	TGG	2	6	204269	204274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324361
5502	NC_015726	GTG	2	6	204304	204309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324361
5503	NC_015726	TGC	2	6	204344	204349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5504	NC_015726	CCAA	2	8	204362	204369	50 %	0 %	0 %	50 %	339324361
5505	NC_015726	GCG	3	9	204390	204398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324361
5506	NC_015726	GGA	2	6	204437	204442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_015726	GGC	2	6	204559	204564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324362
5508	NC_015726	GCC	2	6	204569	204574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324362
5509	NC_015726	GAC	2	6	204593	204598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324362
5510	NC_015726	GCGCTG	2	12	204599	204610	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339324362
5511	NC_015726	GCCG	2	8	204613	204620	0 %	0 %	50 %	50 %	339324362
5512	NC_015726	CAC	2	6	204643	204648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324362
5513	NC_015726	CGG	2	6	204679	204684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324362
5514	NC_015726	CCG	2	6	204690	204695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324362
5515	NC_015726	GCT	2	6	204700	204705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324362
5516	NC_015726	GGC	2	6	204709	204714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324362
5517	NC_015726	GC	3	6	204803	204808	0 %	0 %	50 %	50 %	339324362
5518	NC_015726	CCA	2	6	204873	204878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324362
5519	NC_015726	GCG	2	6	204921	204926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324362
5520	NC_015726	GCG	2	6	205026	205031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324362
5521	NC_015726	GC	3	6	205103	205108	0 %	0 %	50 %	50 %	339324362
5522	NC_015726	CGC	2	6	205120	205125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324362
5523	NC_015726	GGC	2	6	205129	205134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324362
5524	NC_015726	GC	3	6	205171	205176	0 %	0 %	50 %	50 %	339324362
5525	NC_015726	GCCG	2	8	205186	205193	0 %	0 %	50 %	50 %	339324362
5526	NC_015726	ACC	2	6	205208	205213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324362
5527	NC_015726	GC	3	6	205272	205277	0 %	0 %	50 %	50 %	339324362
5528	NC_015726	CAGG	2	8	205291	205298	25 %	0 %	50 %	25 %	339324362
5529	NC_015726	CTT	2	6	205300	205305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324362
5530	NC_015726	GC	4	8	205312	205319	0 %	0 %	50 %	50 %	339324362
5531	NC_015726	CTA	2	6	205369	205374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324362
5532	NC_015726	AGGC	2	8	205384	205391	25 %	0 %	50 %	25 %	339324362
5533	NC_015726	CG	3	6	205412	205417	0 %	0 %	50 %	50 %	339324363
5534	NC_015726	AGC	2	6	205459	205464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5535	NC_015726	CCA	3	9	205481	205489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324363
5536	NC_015726	GAG	2	6	205540	205545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324363
5537	NC_015726	CAG	2	6	205584	205589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5538	NC_015726	TCA	2	6	205628	205633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324363
5539	NC_015726	CGA	2	6	205640	205645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5540	NC_015726	GCC	2	6	205648	205653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324363
5541	NC_015726	GCG	3	9	205712	205720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324363
5542	NC_015726	GCA	2	6	205760	205765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5543	NC_015726	AGCG	2	8	205780	205787	25 %	0 %	50 %	25 %	339324363
5544	NC_015726	GCC	2	6	205815	205820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324363
5545	NC_015726	GC	3	6	205826	205831	0 %	0 %	50 %	50 %	339324363
5546	NC_015726	GAT	2	6	205833	205838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324363
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5549	NC_015726	CGCC	2	8	205880	205887	0 %	0 %	25 %	75 %	339324363
5550	NC_015726	CGC	2	6	205898	205903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324363
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5552	NC_015726	CAG	4	12	205965	205976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5553	NC_015726	CCA	2	6	205977	205982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324363
5554	NC_015726	GGC	2	6	205991	205996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324363
5555	NC_015726	AAG	2	6	205999	206004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324363
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5557	NC_015726	GCG	2	6	206042	206047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324363
5558	NC_015726	GC	3	6	206049	206054	0 %	0 %	50 %	50 %	339324363
5559	NC_015726	CAG	2	6	206079	206084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5560	NC_015726	GCC	2	6	206110	206115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324363
5561	NC_015726	CAG	2	6	206118	206123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5562	NC_015726	CTG	2	6	206130	206135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5563	NC_015726	GCCA	2	8	206155	206162	25 %	0 %	25 %	50 %	339324363
5564	NC_015726	GCC	2	6	206172	206177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324363
5565	NC_015726	GCGCCG	2	12	206221	206232	0 %	0 %	50 %	50 %	339324363
5566	NC_015726	GCA	2	6	206246	206251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
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5569	NC_015726	CG	3	6	206342	206347	0 %	0 %	50 %	50 %	339324363
5570	NC_015726	CAG	2	6	206400	206405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5571	NC_015726	CAG	2	6	206424	206429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5572	NC_015726	CGG	2	6	206430	206435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324363
5573	NC_015726	GCG	2	6	206453	206458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324363
5574	NC_015726	CCA	2	6	206489	206494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324363
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5576	NC_015726	GCG	2	6	206616	206621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324363
5577	NC_015726	CG	3	6	206679	206684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5578	NC_015726	TAT	2	6	206702	206707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_015726	TGCC	2	8	206721	206728	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_015726	GCCT	2	8	206776	206783	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5581	NC_015726	CCG	2	6	206818	206823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324364
5582	NC_015726	CG	3	6	206864	206869	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
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5584	NC_015726	GCCC	2	8	206911	206918	0 %	0 %	25 %	75 %	339324364
5585	NC_015726	GGC	2	6	206939	206944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324364
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5587	NC_015726	AGC	2	6	207027	207032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324364
5588	NC_015726	GCC	3	9	207065	207073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324364
5589	NC_015726	GCT	2	6	207115	207120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324364
5590	NC_015726	GC	4	8	207145	207152	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
5591	NC_015726	GGCAGT	2	12	207153	207164	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339324364
5592	NC_015726	CAGG	2	8	207187	207194	25 %	0 %	50 %	25 %	339324364
5593	NC_015726	GGC	2	6	207215	207220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324364
5594	NC_015726	CGA	3	9	207265	207273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324364
5595	NC_015726	GC	3	6	207323	207328	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
5596	NC_015726	GC	3	6	207331	207336	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
5597	NC_015726	TTCGGC	2	12	207386	207397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324364
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5601	NC_015726	GC	4	8	207500	207507	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
5602	NC_015726	CG	4	8	207519	207526	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
5603	NC_015726	AGA	2	6	207543	207548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324364
5604	NC_015726	TCCG	2	8	207592	207599	0 %	25 %	25 %	50 %	339324364
5605	NC_015726	TGC	2	6	207642	207647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324364
5606	NC_015726	GC	4	8	207656	207663	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
5607	NC_015726	GCC	2	6	207688	207693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324364
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5609	NC_015726	GCG	2	6	207738	207743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324364
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5611	NC_015726	CTG	2	6	207781	207786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_015726	A	6	6	207796	207801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_015726	CTG	2	6	207835	207840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_015726	GC	3	6	207850	207855	0 %	0 %	50 %	50 %	339324365
5615	NC_015726	CCG	2	6	207902	207907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324365
5616	NC_015726	GCCG	2	8	207909	207916	0 %	0 %	50 %	50 %	339324365
5617	NC_015726	CCA	2	6	207944	207949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324365
5618	NC_015726	CGAACA	2	12	207971	207982	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	339324365
5619	NC_015726	GTT	2	6	208002	208007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324365
5620	NC_015726	GAA	2	6	208020	208025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324365
5621	NC_015726	GCC	2	6	208026	208031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324365
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5623	NC_015726	CGA	2	6	208106	208111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324365
5624	NC_015726	GC	3	6	208131	208136	0 %	0 %	50 %	50 %	339324365
5625	NC_015726	CGA	2	6	208190	208195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324365
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5858	NC_015726	T	7	7	217216	217222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5990	NC_015726	TGCGCG	2	12	221531	221542	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339324376
5991	NC_015726	CGG	2	6	221592	221597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324376
5992	NC_015726	CAT	2	6	221616	221621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324376
5993	NC_015726	GC	4	8	221631	221638	0 %	0 %	50 %	50 %	339324376
5994	NC_015726	TGC	2	6	221669	221674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324376
5995	NC_015726	CG	3	6	221719	221724	0 %	0 %	50 %	50 %	339324377
5996	NC_015726	GCATCC	2	12	221748	221759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339324377
5997	NC_015726	TGC	2	6	221781	221786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324377
5998	NC_015726	CGA	2	6	221803	221808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324377
5999	NC_015726	GCG	2	6	221885	221890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324377
6000	NC_015726	CAG	2	6	221903	221908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324377

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