MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 103346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015726	CAG	2	6	185154	185159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324341
5002	NC_015726	CG	3	6	185174	185179	0 %	0 %	50 %	50 %	339324341
5003	NC_015726	TGG	2	6	185210	185215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324341
5004	NC_015726	TGGTC	2	10	185264	185273	0 %	40 %	40 %	20 %	339324341
5005	NC_015726	TTC	2	6	185278	185283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324341
5006	NC_015726	TCG	2	6	185290	185295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324341
5007	NC_015726	GCT	2	6	185300	185305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324341
5008	NC_015726	GAA	2	6	185319	185324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324341
5009	NC_015726	TCAG	2	8	185380	185387	25 %	25 %	25 %	25 %	339324341
5010	NC_015726	TGC	2	6	185396	185401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324341
5011	NC_015726	TGC	2	6	185409	185414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324341
5012	NC_015726	TTG	2	6	185423	185428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324341
5013	NC_015726	CGGC	2	8	185432	185439	0 %	0 %	50 %	50 %	339324341
5014	NC_015726	CG	3	6	185469	185474	0 %	0 %	50 %	50 %	339324341
5015	NC_015726	GC	3	6	185478	185483	0 %	0 %	50 %	50 %	339324341
5016	NC_015726	CTGG	2	8	185499	185506	0 %	25 %	50 %	25 %	339324341
5017	NC_015726	TGC	2	6	185516	185521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324341
5018	NC_015726	GCC	2	6	185617	185622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324341
5019	NC_015726	TGC	2	6	185636	185641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324341
5020	NC_015726	CTTT	2	8	185644	185651	0 %	75 %	0 %	25 %	339324341
5021	NC_015726	CT	4	8	185681	185688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_015726	GTCA	2	8	185692	185699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5023	NC_015726	GC	3	6	185706	185711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_015726	A	6	6	185731	185736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_015726	CGG	2	6	185773	185778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_015726	GAC	2	6	185792	185797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_015726	CCG	2	6	185800	185805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_015726	CCA	2	6	185816	185821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_015726	G	6	6	185959	185964	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_015726	G	6	6	185987	185992	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_015726	CAGGC	2	10	186020	186029	20 %	0 %	40 %	40 %	339324342
5032	NC_015726	TCC	2	6	186107	186112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324342
5033	NC_015726	TGG	2	6	186143	186148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324342
5034	NC_015726	AT	3	6	186185	186190	50 %	50 %	0 %	0 %	339324342
5035	NC_015726	GCA	2	6	186207	186212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324342
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5037	NC_015726	ACGA	2	8	186293	186300	50 %	0 %	25 %	25 %	339324342
5038	NC_015726	CGGT	2	8	186308	186315	0 %	25 %	50 %	25 %	339324342
5039	NC_015726	TGG	4	12	186317	186328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324342
5040	NC_015726	TGG	2	6	186332	186337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324342
5041	NC_015726	GTC	2	6	186391	186396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324342
5042	NC_015726	GTC	2	6	186439	186444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324342
5043	NC_015726	GC	3	6	186446	186451	0 %	0 %	50 %	50 %	339324342
5044	NC_015726	GC	4	8	186552	186559	0 %	0 %	50 %	50 %	339324342
5045	NC_015726	GCA	2	6	186570	186575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324342
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5050	NC_015726	CAG	2	6	186856	186861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324342
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5052	NC_015726	GCA	2	6	186898	186903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324342
5053	NC_015726	GGT	2	6	187045	187050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324342
5054	NC_015726	TTG	2	6	187104	187109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324342
5055	NC_015726	GA	3	6	187122	187127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_015726	GCC	2	6	187147	187152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324343
5057	NC_015726	GGCG	2	8	187159	187166	0 %	0 %	75 %	25 %	339324343
5058	NC_015726	CG	3	6	187239	187244	0 %	0 %	50 %	50 %	339324343
5059	NC_015726	CGGC	2	8	187248	187255	0 %	0 %	50 %	50 %	339324343
5060	NC_015726	GC	5	10	187338	187347	0 %	0 %	50 %	50 %	339324343
5061	NC_015726	CCA	2	6	187419	187424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324343
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5063	NC_015726	CG	4	8	187563	187570	0 %	0 %	50 %	50 %	339324343
5064	NC_015726	GGC	2	6	187594	187599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324343
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5066	NC_015726	CAG	2	6	187718	187723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5068	NC_015726	GAC	2	6	187811	187816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_015726	GC	3	6	187835	187840	0 %	0 %	50 %	50 %	339324344
5070	NC_015726	GCG	2	6	187904	187909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324344
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5088	NC_015726	GGCAG	2	10	188873	188882	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5089	NC_015726	AGCC	2	8	188886	188893	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_015726	GCCGG	2	10	188955	188964	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5091	NC_015726	GAA	2	6	189005	189010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_015726	GGC	2	6	189070	189075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324345
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5096	NC_015726	GCG	2	6	189225	189230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324345
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5107	NC_015726	CTG	2	6	189524	189529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324345
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5112	NC_015726	CGC	2	6	189698	189703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324345
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5118	NC_015726	GC	3	6	190022	190027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_015726	CG	3	6	190039	190044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_015726	GGCA	2	8	190115	190122	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5121	NC_015726	GCG	2	6	190144	190149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_015726	CCA	2	6	190225	190230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324346
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5124	NC_015726	GGTCA	2	10	190299	190308	20 %	20 %	40 %	20 %	339324346
5125	NC_015726	TGA	2	6	190324	190329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324346
5126	NC_015726	CG	3	6	190337	190342	0 %	0 %	50 %	50 %	339324346
5127	NC_015726	GCA	2	6	190390	190395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324346
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5129	NC_015726	GCT	2	6	190412	190417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324346
5130	NC_015726	CGC	2	6	190466	190471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324346
5131	NC_015726	CCG	2	6	190537	190542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324346
5132	NC_015726	CGC	2	6	190604	190609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324346
5133	NC_015726	GCC	2	6	190641	190646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324346
5134	NC_015726	ACACCA	2	12	190729	190740	50 %	0 %	0 %	50 %	339324346
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5136	NC_015726	GC	3	6	190793	190798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5176	NC_015726	T	12	12	192192	192203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5240	NC_015726	CGC	2	6	194506	194511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324350
5241	NC_015726	CCA	2	6	194548	194553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324350
5242	NC_015726	GGCGCA	2	12	194608	194619	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339324350
5243	NC_015726	CAG	2	6	194627	194632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324350
5244	NC_015726	ACC	2	6	194658	194663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324350
5245	NC_015726	AGC	2	6	194664	194669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324350
5246	NC_015726	CAG	2	6	194735	194740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324350
5247	NC_015726	GGCG	2	8	194785	194792	0 %	0 %	75 %	25 %	339324350
5248	NC_015726	CCG	2	6	194800	194805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324350
5249	NC_015726	GCG	2	6	194850	194855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324350
5250	NC_015726	GTGC	2	8	194898	194905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5251	NC_015726	GCGCC	2	10	194923	194932	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5252	NC_015726	GGGC	2	8	194933	194940	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5253	NC_015726	CGGG	2	8	194992	194999	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5254	NC_015726	GCG	2	6	195091	195096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324351
5255	NC_015726	TGC	2	6	195191	195196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324351
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5258	NC_015726	ATGCGC	2	12	195283	195294	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339324351
5259	NC_015726	GGC	2	6	195346	195351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324351
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5262	NC_015726	GCG	2	6	195500	195505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324351
5263	NC_015726	TCCA	2	8	195552	195559	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5264	NC_015726	CCCA	2	8	195560	195567	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5265	NC_015726	TCA	2	6	195569	195574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5266	NC_015726	CAA	2	6	195579	195584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5267	NC_015726	GCA	2	6	195585	195590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5268	NC_015726	CTG	2	6	195644	195649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5269	NC_015726	GCCA	2	8	195684	195691	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5270	NC_015726	GCC	2	6	195748	195753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324352
5271	NC_015726	GTC	2	6	195834	195839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324352
5272	NC_015726	CGG	2	6	195849	195854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324352
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5277	NC_015726	CCA	2	6	196046	196051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324352
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5279	NC_015726	GGC	2	6	196110	196115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324352
5280	NC_015726	TGG	2	6	196174	196179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324352
5281	NC_015726	GGCT	2	8	196241	196248	0 %	25 %	50 %	25 %	339324352
5282	NC_015726	ACC	2	6	196255	196260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324352
5283	NC_015726	CG	3	6	196290	196295	0 %	0 %	50 %	50 %	339324352
5284	NC_015726	CAG	2	6	196296	196301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324352
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5286	NC_015726	CCA	2	6	196313	196318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324352
5287	NC_015726	GC	3	6	196319	196324	0 %	0 %	50 %	50 %	339324352
5288	NC_015726	CG	3	6	196357	196362	0 %	0 %	50 %	50 %	339324352
5289	NC_015726	CAG	2	6	196389	196394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324352
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5328	NC_015726	GTT	2	6	197612	197617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5329	NC_015726	CGGA	2	8	197621	197628	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5330	NC_015726	CG	3	6	197710	197715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5331	NC_015726	CAT	2	6	197805	197810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5354	NC_015726	CGGC	2	8	198782	198789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5355	NC_015726	ATC	2	6	198797	198802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5356	NC_015726	CTTC	2	8	198839	198846	0 %	50 %	0 %	50 %	339324356
5357	NC_015726	GCC	3	9	198873	198881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324356
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5360	NC_015726	TGA	2	6	198978	198983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324356
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5362	NC_015726	CGA	2	6	199012	199017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324356
5363	NC_015726	CGCGTG	2	12	199031	199042	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339324356
5364	NC_015726	ACT	2	6	199044	199049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324356
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5367	NC_015726	GC	3	6	199117	199122	0 %	0 %	50 %	50 %	339324356
5368	NC_015726	GGTGCG	2	12	199153	199164	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	339324356
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5370	NC_015726	CG	3	6	199237	199242	0 %	0 %	50 %	50 %	339324356
5371	NC_015726	GTG	2	6	199286	199291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324356
5372	NC_015726	CCG	2	6	199339	199344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324356
5373	NC_015726	TGC	2	6	199347	199352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324356
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5400	NC_015726	TGA	2	6	200483	200488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5402	NC_015726	CCA	2	6	200576	200581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5477	NC_015726	ATG	2	6	203484	203489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5478	NC_015726	CAA	2	6	203533	203538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324361
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5482	NC_015726	CGG	2	6	203658	203663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324361
5483	NC_015726	CGCTG	2	10	203664	203673	0 %	20 %	40 %	40 %	339324361
5484	NC_015726	TGGC	2	8	203727	203734	0 %	25 %	50 %	25 %	339324361
5485	NC_015726	GCG	2	6	203744	203749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324361
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5489	NC_015726	CTG	2	6	203845	203850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5490	NC_015726	CCGTTC	2	12	203878	203889	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	339324361
5491	NC_015726	CTG	2	6	203995	204000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5492	NC_015726	CTG	2	6	204007	204012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5493	NC_015726	GAC	2	6	204021	204026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5494	NC_015726	GCCAG	2	10	204057	204066	20 %	0 %	40 %	40 %	339324361
5495	NC_015726	CAC	2	6	204107	204112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324361
5496	NC_015726	CTG	2	6	204122	204127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5497	NC_015726	GGCACC	2	12	204139	204150	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339324361
5498	NC_015726	GCT	2	6	204159	204164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5499	NC_015726	GTG	2	6	204232	204237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324361
5500	NC_015726	TATC	2	8	204258	204265	25 %	50 %	0 %	25 %	339324361

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