MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 103346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015726	GCC	2	6	167703	167708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324325
4502	NC_015726	GC	3	6	167764	167769	0 %	0 %	50 %	50 %	339324325
4503	NC_015726	AGG	2	6	167770	167775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324325
4504	NC_015726	AGC	2	6	167788	167793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324325
4505	NC_015726	TAC	2	6	167829	167834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324325
4506	NC_015726	GAC	2	6	167853	167858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324325
4507	NC_015726	CGA	2	6	167930	167935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324325
4508	NC_015726	ACT	2	6	167977	167982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_015726	CGCC	2	8	168017	168024	0 %	0 %	25 %	75 %	339324326
4510	NC_015726	GC	3	6	168114	168119	0 %	0 %	50 %	50 %	339324326
4511	NC_015726	GGT	2	6	168137	168142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324326
4512	NC_015726	TGC	2	6	168145	168150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324326
4513	NC_015726	GGC	2	6	168155	168160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324326
4514	NC_015726	TGG	2	6	168226	168231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324326
4515	NC_015726	GCCGG	2	10	168251	168260	0 %	0 %	60 %	40 %	339324326
4516	NC_015726	GC	5	10	168275	168284	0 %	0 %	50 %	50 %	339324326
4517	NC_015726	GTG	2	6	168327	168332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324326
4518	NC_015726	GC	3	6	168354	168359	0 %	0 %	50 %	50 %	339324326
4519	NC_015726	GCG	2	6	168364	168369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324326
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4521	NC_015726	ATG	2	6	168408	168413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324326
4522	NC_015726	CGA	2	6	168419	168424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324326
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4527	NC_015726	GC	4	8	168735	168742	0 %	0 %	50 %	50 %	339324326
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4534	NC_015726	GCGCCG	2	12	169121	169132	0 %	0 %	50 %	50 %	339324327
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4539	NC_015726	CGG	2	6	169272	169277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324327
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4542	NC_015726	CTG	2	6	169357	169362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324327
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4545	NC_015726	CGC	2	6	169414	169419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324327
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4551	NC_015726	TGG	2	6	169535	169540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324327
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4553	NC_015726	CGT	2	6	169706	169711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324327
4554	NC_015726	A	6	6	169751	169756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_015726	GCG	2	6	169953	169958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324328
4556	NC_015726	CG	5	10	169957	169966	0 %	0 %	50 %	50 %	339324328
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4559	NC_015726	CGA	3	9	170086	170094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324328
4560	NC_015726	GCG	2	6	170118	170123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324328
4561	NC_015726	ATG	2	6	170139	170144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324328
4562	NC_015726	GCC	2	6	170151	170156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324328
4563	NC_015726	CCA	2	6	170169	170174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324328
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4605	NC_015726	CTG	2	6	171335	171340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324328
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4613	NC_015726	GC	3	6	171478	171483	0 %	0 %	50 %	50 %	339324329
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4622	NC_015726	GC	3	6	171714	171719	0 %	0 %	50 %	50 %	339324329
4623	NC_015726	CGG	2	6	171778	171783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324329
4624	NC_015726	CG	4	8	171842	171849	0 %	0 %	50 %	50 %	339324329
4625	NC_015726	CCG	2	6	171880	171885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324329
4626	NC_015726	GCT	2	6	171896	171901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324329
4627	NC_015726	GGC	2	6	171902	171907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324329
4628	NC_015726	AGCG	2	8	171915	171922	25 %	0 %	50 %	25 %	339324329
4629	NC_015726	CGC	2	6	171970	171975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324329
4630	NC_015726	GCT	2	6	171983	171988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324329
4631	NC_015726	ATC	2	6	172017	172022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324329
4632	NC_015726	CGA	2	6	172025	172030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324329
4633	NC_015726	GTC	2	6	172091	172096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324329
4634	NC_015726	GCC	2	6	172131	172136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324329
4635	NC_015726	CGC	2	6	172157	172162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324329
4636	NC_015726	CAT	2	6	172172	172177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324329
4637	NC_015726	CG	3	6	172196	172201	0 %	0 %	50 %	50 %	339324329
4638	NC_015726	GCCGC	2	10	172221	172230	0 %	0 %	40 %	60 %	339324329
4639	NC_015726	GCT	2	6	172247	172252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324329
4640	NC_015726	GGCA	2	8	172284	172291	25 %	0 %	50 %	25 %	339324329
4641	NC_015726	TGC	2	6	172324	172329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324329
4642	NC_015726	TCG	2	6	172405	172410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324329
4643	NC_015726	GCC	2	6	172481	172486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324329
4644	NC_015726	CG	3	6	172505	172510	0 %	0 %	50 %	50 %	339324329
4645	NC_015726	GCG	2	6	172553	172558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324329
4646	NC_015726	CTG	2	6	172560	172565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324329
4647	NC_015726	GCC	2	6	172578	172583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324329
4648	NC_015726	CG	4	8	172611	172618	0 %	0 %	50 %	50 %	339324330
4649	NC_015726	GCT	2	6	172681	172686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324330
4650	NC_015726	GCC	2	6	172700	172705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324330
4651	NC_015726	ACCGC	2	10	172710	172719	20 %	0 %	20 %	60 %	339324330
4652	NC_015726	AGTG	2	8	172745	172752	25 %	25 %	50 %	0 %	339324330
4653	NC_015726	ACG	3	9	172773	172781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324330
4654	NC_015726	GC	3	6	172792	172797	0 %	0 %	50 %	50 %	339324330
4655	NC_015726	CTG	2	6	172841	172846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324330
4656	NC_015726	CGC	2	6	172860	172865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324330
4657	NC_015726	GCC	2	6	172871	172876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324330
4658	NC_015726	CG	4	8	172899	172906	0 %	0 %	50 %	50 %	339324330
4659	NC_015726	GCC	2	6	172935	172940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324330
4660	NC_015726	GTG	2	6	172955	172960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324330
4661	NC_015726	CCG	2	6	173016	173021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324330
4662	NC_015726	GTG	2	6	173048	173053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324330
4663	NC_015726	TGG	2	6	173055	173060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324330
4664	NC_015726	CGGCT	2	10	173069	173078	0 %	20 %	40 %	40 %	339324330
4665	NC_015726	CCG	2	6	173100	173105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324330
4666	NC_015726	CG	5	10	173114	173123	0 %	0 %	50 %	50 %	339324330
4667	NC_015726	TGC	2	6	173169	173174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324330
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4670	NC_015726	CGC	3	9	173293	173301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324330
4671	NC_015726	GCC	2	6	173321	173326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324330
4672	NC_015726	TGC	2	6	173332	173337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324330
4673	NC_015726	ACC	2	6	173382	173387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324331
4674	NC_015726	TAC	2	6	173390	173395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324331
4675	NC_015726	GC	4	8	173422	173429	0 %	0 %	50 %	50 %	339324331
4676	NC_015726	CGC	2	6	173450	173455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324331
4677	NC_015726	TGT	2	6	173506	173511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324331
4678	NC_015726	GCT	2	6	173570	173575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324331
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4680	NC_015726	GC	3	6	173626	173631	0 %	0 %	50 %	50 %	339324331
4681	NC_015726	CGC	2	6	173687	173692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324331
4682	NC_015726	GC	4	8	173691	173698	0 %	0 %	50 %	50 %	339324331
4683	NC_015726	GGCCAA	2	12	173699	173710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324331
4684	NC_015726	GCC	2	6	173736	173741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324331
4685	NC_015726	GCA	2	6	173855	173860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324331
4686	NC_015726	ACT	2	6	173881	173886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324331
4687	NC_015726	ACAACC	2	12	173887	173898	50 %	0 %	0 %	50 %	339324331
4688	NC_015726	ATC	2	6	173928	173933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324331
4689	NC_015726	CTG	2	6	173999	174004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324331
4690	NC_015726	CGG	2	6	174005	174010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324331
4691	NC_015726	GC	3	6	174030	174035	0 %	0 %	50 %	50 %	339324331
4692	NC_015726	GC	4	8	174039	174046	0 %	0 %	50 %	50 %	339324331
4693	NC_015726	CAA	2	6	174101	174106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324331
4694	NC_015726	CGC	2	6	174127	174132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324331
4695	NC_015726	GC	3	6	174186	174191	0 %	0 %	50 %	50 %	339324331
4696	NC_015726	CG	3	6	174202	174207	0 %	0 %	50 %	50 %	339324331
4697	NC_015726	CCG	2	6	174223	174228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324331
4698	NC_015726	T	6	6	174289	174294	0 %	100 %	0 %	0 %	339324331
4699	NC_015726	GCT	2	6	174305	174310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324331
4700	NC_015726	ACC	2	6	174312	174317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324331
4701	NC_015726	CTG	2	6	174348	174353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324331
4702	NC_015726	GAT	2	6	174388	174393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324331
4703	NC_015726	AGG	2	6	174447	174452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4704	NC_015726	CAA	2	6	174462	174467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324332
4705	NC_015726	GCC	2	6	174508	174513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324332
4706	NC_015726	GCC	2	6	174518	174523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324332
4707	NC_015726	GCCGAC	2	12	174559	174570	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339324332
4708	NC_015726	GC	3	6	174571	174576	0 %	0 %	50 %	50 %	339324332
4709	NC_015726	CGA	2	6	174591	174596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324332
4710	NC_015726	CGG	2	6	174609	174614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324332
4711	NC_015726	CG	4	8	174621	174628	0 %	0 %	50 %	50 %	339324332
4712	NC_015726	GC	3	6	174639	174644	0 %	0 %	50 %	50 %	339324332
4713	NC_015726	CAT	2	6	174651	174656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324332
4714	NC_015726	CGG	2	6	174746	174751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324332
4715	NC_015726	CCG	2	6	174769	174774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324332
4716	NC_015726	GCA	2	6	174797	174802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324332
4717	NC_015726	GGA	2	6	174864	174869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324332
4718	NC_015726	GCT	2	6	174882	174887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324332
4719	NC_015726	TGC	2	6	174920	174925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324332
4720	NC_015726	GGC	4	12	174940	174951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324332
4721	NC_015726	GCCAGC	2	12	175018	175029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339324332
4722	NC_015726	TGG	2	6	175049	175054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324332
4723	NC_015726	GCC	2	6	175154	175159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324332
4724	NC_015726	GAA	2	6	175174	175179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324332
4725	NC_015726	GAG	2	6	175201	175206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324332
4726	NC_015726	CGC	2	6	175207	175212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324332
4727	NC_015726	GCG	2	6	175228	175233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324332
4728	NC_015726	CGC	2	6	175401	175406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324332
4729	NC_015726	CGC	2	6	175535	175540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324332
4730	NC_015726	CGG	2	6	175541	175546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324332
4731	NC_015726	CGG	2	6	175580	175585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324332
4732	NC_015726	GCGT	2	8	175604	175611	0 %	25 %	50 %	25 %	339324332
4733	NC_015726	GAT	2	6	175644	175649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324332
4734	NC_015726	CGA	2	6	175680	175685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324332
4735	NC_015726	GC	3	6	175693	175698	0 %	0 %	50 %	50 %	339324332
4736	NC_015726	GGC	2	6	175713	175718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324332
4737	NC_015726	GTC	2	6	175770	175775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324332
4738	NC_015726	CCG	2	6	175790	175795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324332
4739	NC_015726	CGC	2	6	175841	175846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324332
4740	NC_015726	TGGCGG	2	12	175877	175888	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	339324332
4741	NC_015726	CGC	2	6	175926	175931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324332
4742	NC_015726	GGC	2	6	175957	175962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324332
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4744	NC_015726	CGG	2	6	175977	175982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324332
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4990	NC_015726	CAG	2	6	184688	184693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324340
4991	NC_015726	GTG	2	6	184761	184766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4992	NC_015726	GAC	2	6	184772	184777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4993	NC_015726	GCTG	2	8	184796	184803	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4994	NC_015726	GTT	2	6	184805	184810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4995	NC_015726	CAA	2	6	184812	184817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4996	NC_015726	GGC	2	6	184844	184849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4997	NC_015726	GCG	2	6	184978	184983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4998	NC_015726	TGC	2	6	185023	185028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324341
4999	NC_015726	AGG	2	6	185062	185067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324341
5000	NC_015726	CTT	2	6	185148	185153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324341

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