MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB2p

Total Repeats: 9345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015724	AGG	2	6	145898	145903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_015724	CCG	3	9	145969	145977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323918
3503	NC_015724	TCA	2	6	146005	146010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323918
3504	NC_015724	GAA	2	6	146078	146083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323918
3505	NC_015724	CGA	2	6	146099	146104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323918
3506	NC_015724	GAG	2	6	146109	146114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323918
3507	NC_015724	CCAC	2	8	146256	146263	25 %	0 %	0 %	75 %	339323918
3508	NC_015724	CTG	2	6	146316	146321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323918
3509	NC_015724	ACC	2	6	146331	146336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323918
3510	NC_015724	GCG	2	6	146353	146358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323918
3511	NC_015724	CAT	2	6	146366	146371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323918
3512	NC_015724	GC	3	6	146381	146386	0 %	0 %	50 %	50 %	339323918
3513	NC_015724	CGAC	2	8	146431	146438	25 %	0 %	25 %	50 %	339323918
3514	NC_015724	TCA	2	6	146476	146481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323918
3515	NC_015724	TTGC	2	8	146508	146515	0 %	50 %	25 %	25 %	339323918
3516	NC_015724	GCG	2	6	146536	146541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323918
3517	NC_015724	GAT	2	6	146561	146566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323918
3518	NC_015724	CG	3	6	146584	146589	0 %	0 %	50 %	50 %	339323918
3519	NC_015724	CGG	2	6	146615	146620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323918
3520	NC_015724	TAC	2	6	146622	146627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323918
3521	NC_015724	GCA	2	6	146723	146728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323918
3522	NC_015724	CGT	2	6	146738	146743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323918
3523	NC_015724	CAA	2	6	146771	146776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323918
3524	NC_015724	ACA	2	6	146830	146835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323918
3525	NC_015724	CG	3	6	146837	146842	0 %	0 %	50 %	50 %	339323918
3526	NC_015724	CGA	2	6	146897	146902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323918
3527	NC_015724	CGC	2	6	146972	146977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323918
3528	NC_015724	CGA	2	6	146993	146998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323918
3529	NC_015724	GCA	2	6	147030	147035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323918
3530	NC_015724	ACC	2	6	147076	147081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323918
3531	NC_015724	CAA	2	6	147104	147109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323918
3532	NC_015724	GGC	2	6	147186	147191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323918
3533	NC_015724	ATC	2	6	147280	147285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323918
3534	NC_015724	GCC	2	6	147331	147336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323918
3535	NC_015724	CG	3	6	147430	147435	0 %	0 %	50 %	50 %	339323919
3536	NC_015724	TAC	2	6	147514	147519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323919
3537	NC_015724	GCA	2	6	147547	147552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323919
3538	NC_015724	CAG	2	6	147679	147684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323919
3539	NC_015724	CGG	2	6	147714	147719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323919
3540	NC_015724	GCC	2	6	147721	147726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323919
3541	NC_015724	TCG	2	6	147730	147735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323919
3542	NC_015724	TCA	2	6	147746	147751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323919
3543	NC_015724	AGG	2	6	147755	147760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323919
3544	NC_015724	GGT	2	6	147842	147847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323919
3545	NC_015724	GAA	2	6	147912	147917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323919
3546	NC_015724	GCT	2	6	147957	147962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323919
3547	NC_015724	TCG	2	6	148004	148009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323919
3548	NC_015724	GCC	2	6	148135	148140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323919
3549	NC_015724	AAG	2	6	148153	148158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323919
3550	NC_015724	AT	3	6	148234	148239	50 %	50 %	0 %	0 %	339323919
3551	NC_015724	TAA	2	6	148278	148283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339323919
3552	NC_015724	GCC	2	6	148339	148344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323919
3553	NC_015724	CAT	2	6	148410	148415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323919
3554	NC_015724	GAG	2	6	148456	148461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323919
3555	NC_015724	ACC	2	6	148478	148483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323919
3556	NC_015724	TCA	2	6	148487	148492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323919
3557	NC_015724	ACT	2	6	148496	148501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323919
3558	NC_015724	GAA	3	9	148515	148523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323919
3559	NC_015724	GAC	2	6	148543	148548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323919
3560	NC_015724	GTC	3	9	148563	148571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323919
3561	NC_015724	GTC	2	6	148631	148636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_015724	TCGG	2	8	148703	148710	0 %	25 %	50 %	25 %	339323920
3563	NC_015724	CAT	2	6	148717	148722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323920
3564	NC_015724	CGC	2	6	148783	148788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323920
3565	NC_015724	CTT	2	6	148789	148794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323920
3566	NC_015724	TCGT	2	8	148838	148845	0 %	50 %	25 %	25 %	339323920
3567	NC_015724	GCC	2	6	149002	149007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323920
3568	NC_015724	AGC	2	6	149018	149023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323920
3569	NC_015724	TGA	2	6	149028	149033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323920
3570	NC_015724	TCATCG	2	12	149067	149078	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339323920
3571	NC_015724	GCG	2	6	149096	149101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323920
3572	NC_015724	TGG	2	6	149105	149110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323920
3573	NC_015724	GAAC	2	8	149152	149159	50 %	0 %	25 %	25 %	339323920
3574	NC_015724	GCT	2	6	149176	149181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323920
3575	NC_015724	GTG	2	6	149318	149323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323920
3576	NC_015724	GTC	2	6	149324	149329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323920
3577	NC_015724	CGG	2	6	149332	149337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323920
3578	NC_015724	CGG	2	6	149365	149370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323920
3579	NC_015724	ATG	2	6	149396	149401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323920
3580	NC_015724	GGAG	2	8	149416	149423	25 %	0 %	75 %	0 %	339323920
3581	NC_015724	CTTC	2	8	149437	149444	0 %	50 %	0 %	50 %	339323920
3582	NC_015724	TTC	2	6	149457	149462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323920
3583	NC_015724	GCT	2	6	149534	149539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323921
3584	NC_015724	CCA	2	6	149578	149583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323921
3585	NC_015724	CGG	2	6	149584	149589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323921
3586	NC_015724	TCG	2	6	149590	149595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323921
3587	NC_015724	TGA	2	6	149596	149601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323921
3588	NC_015724	GCT	2	6	149613	149618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323921
3589	NC_015724	GCT	2	6	149651	149656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323921
3590	NC_015724	CGGTG	2	10	149765	149774	0 %	20 %	60 %	20 %	339323921
3591	NC_015724	GCC	2	6	149775	149780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323921
3592	NC_015724	ATC	2	6	149784	149789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323921
3593	NC_015724	TTC	2	6	149859	149864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323921
3594	NC_015724	GCG	2	6	149865	149870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323921
3595	NC_015724	GCG	2	6	149893	149898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323921
3596	NC_015724	TCT	2	6	149906	149911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323921
3597	NC_015724	TCG	2	6	149974	149979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323921
3598	NC_015724	TTC	2	6	149991	149996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323921
3599	NC_015724	CG	3	6	150073	150078	0 %	0 %	50 %	50 %	339323921
3600	NC_015724	ACG	2	6	150094	150099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323921
3601	NC_015724	CGG	2	6	150102	150107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323921
3602	NC_015724	CTC	2	6	150114	150119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339323921
3603	NC_015724	GGCG	2	8	150152	150159	0 %	0 %	75 %	25 %	339323921
3604	NC_015724	TGA	2	6	150208	150213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323921
3605	NC_015724	CGG	2	6	150245	150250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323921
3606	NC_015724	TGA	2	6	150289	150294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323921
3607	NC_015724	AGC	2	6	150307	150312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323921
3608	NC_015724	CGG	2	6	150392	150397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323921
3609	NC_015724	AGT	2	6	150456	150461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323921
3610	NC_015724	TGA	2	6	150474	150479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323921
3611	NC_015724	CCA	2	6	150483	150488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323922
3612	NC_015724	CCG	2	6	150531	150536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323922
3613	NC_015724	CG	3	6	150648	150653	0 %	0 %	50 %	50 %	339323922
3614	NC_015724	GC	3	6	150722	150727	0 %	0 %	50 %	50 %	339323922
3615	NC_015724	TC	3	6	150812	150817	0 %	50 %	0 %	50 %	339323922
3616	NC_015724	TCG	2	6	150876	150881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323922
3617	NC_015724	TCGC	2	8	150891	150898	0 %	25 %	25 %	50 %	339323922
3618	NC_015724	CA	3	6	150934	150939	50 %	0 %	0 %	50 %	339323922
3619	NC_015724	TGG	2	6	150945	150950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323922
3620	NC_015724	CTG	2	6	151049	151054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323922
3621	NC_015724	TGA	2	6	151171	151176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323922
3622	NC_015724	ACT	2	6	151236	151241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323923
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3637	NC_015724	TGG	2	6	151787	151792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323923
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3644	NC_015724	GCCTG	2	10	152034	152043	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3651	NC_015724	TCG	2	6	152454	152459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323924
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3710	NC_015724	CTG	2	6	155472	155477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323925
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3733	NC_015724	GTG	2	6	156460	156465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323925
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3740	NC_015724	GGC	2	6	156885	156890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3742	NC_015724	CG	3	6	156944	156949	0 %	0 %	50 %	50 %	339323927
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3847	NC_015724	AATG	2	8	161496	161503	50 %	25 %	25 %	0 %	339323930
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3855	NC_015724	CG	3	6	161982	161987	0 %	0 %	50 %	50 %	339323930
3856	NC_015724	GTC	2	6	162009	162014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323930
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3858	NC_015724	CGG	2	6	162177	162182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323930
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3860	NC_015724	TA	3	6	162226	162231	50 %	50 %	0 %	0 %	339323930
3861	NC_015724	CGC	2	6	162240	162245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323930
3862	NC_015724	CATGC	2	10	162280	162289	20 %	20 %	20 %	40 %	339323930
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3866	NC_015724	CGG	2	6	162572	162577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323930
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3973	NC_015724	GTA	2	6	168227	168232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3975	NC_015724	T	6	6	168256	168261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3987	NC_015724	GGC	2	6	168559	168564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323934
3988	NC_015724	GGC	2	6	168589	168594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323934
3989	NC_015724	GGC	2	6	168655	168660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323934
3990	NC_015724	CG	4	8	168679	168686	0 %	0 %	50 %	50 %	339323934
3991	NC_015724	GCA	2	6	168695	168700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323934
3992	NC_015724	GC	3	6	168743	168748	0 %	0 %	50 %	50 %	339323934
3993	NC_015724	ACG	2	6	168756	168761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323934
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3995	NC_015724	CGC	2	6	168799	168804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323934
3996	NC_015724	GCGGG	2	10	168824	168833	0 %	0 %	80 %	20 %	339323934
3997	NC_015724	GC	3	6	168902	168907	0 %	0 %	50 %	50 %	339323934
3998	NC_015724	AGCG	2	8	168944	168951	25 %	0 %	50 %	25 %	339323934
3999	NC_015724	CG	3	6	168985	168990	0 %	0 %	50 %	50 %	339323934
4000	NC_015724	AGA	2	6	168993	168998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323934

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