MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB2p

Total Repeats: 9345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015724	CCA	2	6	22228	22233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323791
502	NC_015724	GGC	2	6	22270	22275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323791
503	NC_015724	GCC	2	6	22337	22342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323792
504	NC_015724	GATG	2	8	22347	22354	25 %	25 %	50 %	0 %	339323792
505	NC_015724	CGG	2	6	22355	22360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323792
506	NC_015724	TC	3	6	22449	22454	0 %	50 %	0 %	50 %	339323792
507	NC_015724	GTC	2	6	22540	22545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323792
508	NC_015724	GCC	2	6	22584	22589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323792
509	NC_015724	CTT	2	6	22596	22601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323792
510	NC_015724	CGGA	2	8	22608	22615	25 %	0 %	50 %	25 %	339323792
511	NC_015724	CCG	2	6	22628	22633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323792
512	NC_015724	CG	3	6	22653	22658	0 %	0 %	50 %	50 %	339323792
513	NC_015724	TGA	2	6	22662	22667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323792
514	NC_015724	TCA	2	6	22682	22687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323792
515	NC_015724	CAGC	2	8	22711	22718	25 %	0 %	25 %	50 %	339323792
516	NC_015724	CGA	2	6	22722	22727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323792
517	NC_015724	TGG	2	6	22728	22733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323792
518	NC_015724	TCA	2	6	22767	22772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323792
519	NC_015724	CGC	2	6	22779	22784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323792
520	NC_015724	CGA	2	6	22788	22793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323792
521	NC_015724	CCTGG	2	10	22803	22812	0 %	20 %	40 %	40 %	339323792
522	NC_015724	ATG	2	6	22838	22843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323792
523	NC_015724	CCA	2	6	22845	22850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323792
524	NC_015724	CGGC	2	8	22864	22871	0 %	0 %	50 %	50 %	339323792
525	NC_015724	CCGAG	2	10	22875	22884	20 %	0 %	40 %	40 %	339323792
526	NC_015724	GGT	2	6	22954	22959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323792
527	NC_015724	CCA	2	6	22962	22967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323792
528	NC_015724	CGG	2	6	23005	23010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323792
529	NC_015724	GCGCC	2	10	23016	23025	0 %	0 %	40 %	60 %	339323792
530	NC_015724	CAG	2	6	23032	23037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323792
531	NC_015724	GC	3	6	23061	23066	0 %	0 %	50 %	50 %	339323792
532	NC_015724	GGC	2	6	23102	23107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323792
533	NC_015724	GTCCA	2	10	23138	23147	20 %	20 %	20 %	40 %	339323792
534	NC_015724	G	6	6	23170	23175	0 %	0 %	100 %	0 %	339323792
535	NC_015724	GCC	3	9	23185	23193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323792
536	NC_015724	GCG	2	6	23238	23243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323792
537	NC_015724	GGT	2	6	23302	23307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323792
538	NC_015724	GGT	2	6	23350	23355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323792
539	NC_015724	GCC	2	6	23356	23361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323792
540	NC_015724	GGC	2	6	23500	23505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323792
541	NC_015724	ACG	2	6	23513	23518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323792
542	NC_015724	CGC	2	6	23599	23604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323792
543	NC_015724	GGC	2	6	23608	23613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323792
544	NC_015724	CAG	2	6	23614	23619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323792
545	NC_015724	CCA	2	6	23622	23627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323792
546	NC_015724	GGT	2	6	23628	23633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323792
547	NC_015724	GGC	2	6	23644	23649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323792
548	NC_015724	CG	4	8	23715	23722	0 %	0 %	50 %	50 %	339323792
549	NC_015724	AGGTC	2	10	23736	23745	20 %	20 %	40 %	20 %	339323792
550	NC_015724	GCC	2	6	23747	23752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323792
551	NC_015724	CG	3	6	23771	23776	0 %	0 %	50 %	50 %	339323792
552	NC_015724	CGG	2	6	23787	23792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323792
553	NC_015724	AAG	2	6	23801	23806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323792
554	NC_015724	TGT	2	6	23856	23861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339323792
555	NC_015724	GCC	2	6	23929	23934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323793
556	NC_015724	GGA	2	6	23995	24000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323793
557	NC_015724	GGC	2	6	24012	24017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323793
558	NC_015724	GGTG	2	8	24022	24029	0 %	25 %	75 %	0 %	339323793
559	NC_015724	ACC	2	6	24030	24035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323793
560	NC_015724	GCC	2	6	24037	24042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323793
561	NC_015724	CAG	2	6	24134	24139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323793
562	NC_015724	CG	3	6	24150	24155	0 %	0 %	50 %	50 %	339323793
563	NC_015724	GC	3	6	24176	24181	0 %	0 %	50 %	50 %	339323793
564	NC_015724	GAC	2	6	24206	24211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323793
565	NC_015724	CTG	2	6	24260	24265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323793
566	NC_015724	CGCC	2	8	24397	24404	0 %	0 %	25 %	75 %	339323793
567	NC_015724	GC	3	6	24501	24506	0 %	0 %	50 %	50 %	339323793
568	NC_015724	GCG	2	6	24554	24559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323793
569	NC_015724	CTA	2	6	24577	24582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323793
570	NC_015724	AGA	2	6	24589	24594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323793
571	NC_015724	GCTACA	2	12	24633	24644	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339323793
572	NC_015724	AAG	2	6	24711	24716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015724	CGT	2	6	24748	24753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323794
574	NC_015724	GCC	2	6	24766	24771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323794
575	NC_015724	ACGT	2	8	24775	24782	25 %	25 %	25 %	25 %	339323794
576	NC_015724	CCG	2	6	24799	24804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323794
577	NC_015724	ATTG	2	8	24849	24856	25 %	50 %	25 %	0 %	339323794
578	NC_015724	GCTG	2	8	24896	24903	0 %	25 %	50 %	25 %	339323794
579	NC_015724	C	6	6	24913	24918	0 %	0 %	0 %	100 %	339323794
580	NC_015724	CGG	2	6	24926	24931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323794
581	NC_015724	CGG	2	6	24953	24958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323794
582	NC_015724	CG	3	6	24971	24976	0 %	0 %	50 %	50 %	339323794
583	NC_015724	CAG	2	6	25077	25082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323794
584	NC_015724	CAT	2	6	25142	25147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323794
585	NC_015724	CAT	2	6	25151	25156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323794
586	NC_015724	CGC	2	6	25160	25165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323794
587	NC_015724	CTG	2	6	25260	25265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323794
588	NC_015724	TCCCAG	2	12	25294	25305	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339323794
589	NC_015724	CGC	2	6	25351	25356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323794
590	NC_015724	GTA	2	6	25407	25412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323794
591	NC_015724	GTC	2	6	25494	25499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323794
592	NC_015724	CCGG	2	8	25523	25530	0 %	0 %	50 %	50 %	339323794
593	NC_015724	GGC	2	6	25560	25565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323794
594	NC_015724	GCC	2	6	25566	25571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323794
595	NC_015724	ACG	2	6	25593	25598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323794
596	NC_015724	GGC	2	6	25655	25660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323794
597	NC_015724	CGG	2	6	25752	25757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323794
598	NC_015724	GGT	2	6	25784	25789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323794
599	NC_015724	ATAG	2	8	25859	25866	50 %	25 %	25 %	0 %	339323794
600	NC_015724	CGG	2	6	25871	25876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323794
601	NC_015724	CGG	2	6	25901	25906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323794
602	NC_015724	AGT	2	6	25907	25912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323794
603	NC_015724	CGC	2	6	25934	25939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323794
604	NC_015724	GCGCC	2	10	26004	26013	0 %	0 %	40 %	60 %	339323794
605	NC_015724	AGGC	2	8	26060	26067	25 %	0 %	50 %	25 %	339323794
606	NC_015724	GCG	2	6	26081	26086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323794
607	NC_015724	GC	3	6	26102	26107	0 %	0 %	50 %	50 %	339323794
608	NC_015724	CGG	2	6	26117	26122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323794
609	NC_015724	GC	4	8	26206	26213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_015724	GGC	2	6	26266	26271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_015724	GCG	2	6	26341	26346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_015724	CTG	2	6	26375	26380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015724	AGCG	2	8	26391	26398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
614	NC_015724	GCG	2	6	26424	26429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_015724	CGC	2	6	26462	26467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323795
616	NC_015724	CAG	2	6	26505	26510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323795
617	NC_015724	TTG	2	6	26550	26555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339323795
618	NC_015724	TCG	2	6	26560	26565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323795
619	NC_015724	CAC	2	6	26616	26621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323795
620	NC_015724	GAT	2	6	26769	26774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323795
621	NC_015724	CCG	2	6	26801	26806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323795
622	NC_015724	CGA	2	6	26807	26812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323795
623	NC_015724	TGCG	2	8	26846	26853	0 %	25 %	50 %	25 %	339323795
624	NC_015724	G	6	6	26867	26872	0 %	0 %	100 %	0 %	339323795
625	NC_015724	GGT	2	6	26928	26933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323795
626	NC_015724	GCG	2	6	26974	26979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323795
627	NC_015724	GGCATG	2	12	26998	27009	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339323795
628	NC_015724	CAG	2	6	27048	27053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323795
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