MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB2p

Total Repeats: 9345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_015724	CCGCC	2	10	386427	386436	0 %	0 %	20 %	80 %	339324125
8502	NC_015724	CG	3	6	386498	386503	0 %	0 %	50 %	50 %	339324125
8503	NC_015724	TCT	2	6	386548	386553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324125
8504	NC_015724	TCA	2	6	386563	386568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324125
8505	NC_015724	GGC	2	6	386642	386647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324125
8506	NC_015724	GC	3	6	386655	386660	0 %	0 %	50 %	50 %	339324125
8507	NC_015724	TGC	2	6	386662	386667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324125
8508	NC_015724	CAC	2	6	386748	386753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324125
8509	NC_015724	CGG	2	6	386815	386820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324125
8510	NC_015724	TTG	2	6	386833	386838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324125
8511	NC_015724	AAG	2	6	386847	386852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324125
8512	NC_015724	CG	3	6	386904	386909	0 %	0 %	50 %	50 %	339324125
8513	NC_015724	GCA	2	6	386981	386986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324125
8514	NC_015724	TCGCCG	2	12	387028	387039	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339324125
8515	NC_015724	AGG	2	6	387205	387210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324125
8516	NC_015724	AGT	2	6	387215	387220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324125
8517	NC_015724	CAGGC	2	10	387264	387273	20 %	0 %	40 %	40 %	339324125
8518	NC_015724	CAA	2	6	387276	387281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324125
8519	NC_015724	AG	3	6	387288	387293	50 %	0 %	50 %	0 %	339324125
8520	NC_015724	CGC	2	6	387338	387343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324125
8521	NC_015724	CCA	2	6	387367	387372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324125
8522	NC_015724	CCA	2	6	387527	387532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324125
8523	NC_015724	CAG	2	6	387544	387549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324125
8524	NC_015724	GA	3	6	387562	387567	50 %	0 %	50 %	0 %	339324125
8525	NC_015724	ACG	2	6	387579	387584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324126
8526	NC_015724	AAG	2	6	387592	387597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324126
8527	NC_015724	TC	3	6	387660	387665	0 %	50 %	0 %	50 %	339324126
8528	NC_015724	GAT	2	6	387708	387713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324126
8529	NC_015724	AAG	2	6	387724	387729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324126
8530	NC_015724	GCTT	2	8	387832	387839	0 %	50 %	25 %	25 %	339324126
8531	NC_015724	CTCCAC	2	12	387849	387860	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	339324126
8532	NC_015724	ACG	2	6	387959	387964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324126
8533	NC_015724	CTC	2	6	387994	387999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324126
8534	NC_015724	GCA	2	6	388041	388046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324126
8535	NC_015724	TCA	2	6	388066	388071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324126
8536	NC_015724	GTT	2	6	388083	388088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324126
8537	NC_015724	AAGC	2	8	388124	388131	50 %	0 %	25 %	25 %	339324126
8538	NC_015724	GGT	2	6	388132	388137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324126
8539	NC_015724	GTT	2	6	388308	388313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324126
8540	NC_015724	TCCG	2	8	388371	388378	0 %	25 %	25 %	50 %	339324126
8541	NC_015724	CGG	2	6	388472	388477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324126
8542	NC_015724	CGA	2	6	388536	388541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324126
8543	NC_015724	CAG	2	6	388553	388558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324126
8544	NC_015724	GC	3	6	388560	388565	0 %	0 %	50 %	50 %	339324126
8545	NC_015724	TTG	2	6	388573	388578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324126
8546	NC_015724	AAG	2	6	388744	388749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324126
8547	NC_015724	CGCC	2	8	388953	388960	0 %	0 %	25 %	75 %	339324127
8548	NC_015724	ACT	2	6	388982	388987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324127
8549	NC_015724	CTG	2	6	389077	389082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324127
8550	NC_015724	GGCT	2	8	389194	389201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8551	NC_015724	GGT	2	6	389257	389262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_015724	CGGC	2	8	389267	389274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8553	NC_015724	GC	3	6	389303	389308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8554	NC_015724	GC	3	6	389344	389349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8555	NC_015724	ACA	2	6	389373	389378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8556	NC_015724	AAC	2	6	389384	389389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324128
8557	NC_015724	TC	4	8	389413	389420	0 %	50 %	0 %	50 %	339324128
8558	NC_015724	GCC	2	6	389439	389444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324128
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8560	NC_015724	CGA	2	6	389465	389470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324128
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8562	NC_015724	CTCCG	2	10	389504	389513	0 %	20 %	20 %	60 %	339324128
8563	NC_015724	CGG	2	6	389545	389550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324128
8564	NC_015724	GTG	2	6	389571	389576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324128
8565	NC_015724	ATCG	2	8	389618	389625	25 %	25 %	25 %	25 %	339324128
8566	NC_015724	AGC	2	6	389700	389705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324128
8567	NC_015724	TGG	2	6	389720	389725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324128
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8569	NC_015724	GCTACG	2	12	389955	389966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339324128
8570	NC_015724	TCA	2	6	390092	390097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324128
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8572	NC_015724	CTCC	2	8	390160	390167	0 %	25 %	0 %	75 %	339324128
8573	NC_015724	GCG	2	6	390169	390174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324128
8574	NC_015724	GTA	2	6	390189	390194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324128
8575	NC_015724	CT	3	6	390215	390220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8576	NC_015724	AGGA	2	8	390221	390228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_015724	ATG	2	6	390272	390277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8579	NC_015724	C	6	6	390324	390329	0 %	0 %	0 %	100 %	339324129
8580	NC_015724	CCA	2	6	390342	390347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324129
8581	NC_015724	TCG	2	6	390367	390372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324129
8582	NC_015724	CGA	2	6	390448	390453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324129
8583	NC_015724	CGA	2	6	390467	390472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324129
8584	NC_015724	CTG	2	6	390569	390574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324129
8585	NC_015724	CGC	2	6	390577	390582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324129
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8588	NC_015724	CCA	2	6	390657	390662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324129
8589	NC_015724	AATC	2	8	390686	390693	50 %	25 %	0 %	25 %	339324129
8590	NC_015724	GCC	2	6	390846	390851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324129
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8592	NC_015724	CAT	2	6	390995	391000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324129
8593	NC_015724	GGCT	2	8	391011	391018	0 %	25 %	50 %	25 %	339324129
8594	NC_015724	CGC	2	6	391049	391054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324129
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8599	NC_015724	TCG	3	9	391372	391380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324129
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8601	NC_015724	GTT	2	6	391496	391501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324129
8602	NC_015724	ATC	2	6	391512	391517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324129
8603	NC_015724	CGG	3	9	391528	391536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324129
8604	NC_015724	CCAG	2	8	391598	391605	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8605	NC_015724	ACC	2	6	391657	391662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8606	NC_015724	CAG	2	6	391670	391675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8607	NC_015724	GAG	2	6	391709	391714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_015724	CTCA	2	8	391728	391735	25 %	25 %	0 %	50 %	339324130
8609	NC_015724	TGC	2	6	391759	391764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324130
8610	NC_015724	GCC	2	6	391799	391804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324130
8611	NC_015724	ACG	2	6	391858	391863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324130
8612	NC_015724	GGC	2	6	391880	391885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324130
8613	NC_015724	GCT	2	6	391891	391896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324130
8614	NC_015724	GC	3	6	391957	391962	0 %	0 %	50 %	50 %	339324130
8615	NC_015724	CGC	3	9	391960	391968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324130
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8617	NC_015724	AC	3	6	392023	392028	50 %	0 %	0 %	50 %	339324130
8618	NC_015724	TGA	2	6	392035	392040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324130
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8620	NC_015724	GCT	2	6	392122	392127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324130
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8930	NC_015724	CAC	2	6	405640	405645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8931	NC_015724	AG	3	6	405682	405687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8932	NC_015724	TAG	2	6	405709	405714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8984	NC_015724	CGGT	2	8	407997	408004	0 %	25 %	50 %	25 %	339324146
8985	NC_015724	CGC	2	6	408022	408027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324146
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8989	NC_015724	GGC	2	6	408187	408192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324146
8990	NC_015724	GCC	2	6	408220	408225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324146
8991	NC_015724	CGC	2	6	408227	408232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324146
8992	NC_015724	GCT	2	6	408250	408255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324146
8993	NC_015724	GCG	2	6	408288	408293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324146
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8997	NC_015724	ATGG	2	8	408358	408365	25 %	25 %	50 %	0 %	339324146
8998	NC_015724	CCAC	2	8	408456	408463	25 %	0 %	0 %	75 %	339324146
8999	NC_015724	CCG	2	6	408478	408483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324146
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