MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 2

Total Repeats: 2511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015723	TGCGC	2	10	3816	3825	0 %	20 %	40 %	40 %	339321335
2	NC_015723	GCCGC	2	10	4194	4203	0 %	0 %	40 %	60 %	339321335
3	NC_015723	GCAGG	2	10	6212	6221	20 %	0 %	60 %	20 %	339321336
4	NC_015723	GGGCC	2	10	6549	6558	0 %	0 %	60 %	40 %	339321336
5	NC_015723	GCCGC	2	10	6833	6842	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_015723	AATGA	2	10	6930	6939	60 %	20 %	20 %	0 %	339321337
7	NC_015723	GGCAG	2	10	8424	8433	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015723	CAGCC	2	10	11725	11734	20 %	0 %	20 %	60 %	339321341
9	NC_015723	GCGCG	2	10	12454	12463	0 %	0 %	60 %	40 %	339321341
10	NC_015723	CGCGG	2	10	12787	12796	0 %	0 %	60 %	40 %	339321341
11	NC_015723	GTCAG	2	10	13272	13281	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015723	CCCGG	2	10	13780	13789	0 %	0 %	40 %	60 %	339321342
13	NC_015723	GGGTA	2	10	13974	13983	20 %	20 %	60 %	0 %	339321342
14	NC_015723	TCCGG	2	10	14995	15004	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015723	ACGTC	2	10	17696	17705	20 %	20 %	20 %	40 %	339321344
16	NC_015723	ACAGG	2	10	21300	21309	40 %	0 %	40 %	20 %	339321347
17	NC_015723	GCCGC	2	10	21441	21450	0 %	0 %	40 %	60 %	339321347
18	NC_015723	GGCGA	2	10	21881	21890	20 %	0 %	60 %	20 %	339321347
19	NC_015723	CCGGT	2	10	23761	23770	0 %	20 %	40 %	40 %	339321349
20	NC_015723	GCCAG	2	10	24736	24745	20 %	0 %	40 %	40 %	339321349
21	NC_015723	GCGCG	2	10	25024	25033	0 %	0 %	60 %	40 %	339321350
22	NC_015723	CGTCG	2	10	26158	26167	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015723	CGACC	2	10	27579	27588	20 %	0 %	20 %	60 %	339321351
24	NC_015723	TGCAC	2	10	27839	27848	20 %	20 %	20 %	40 %	339321351
25	NC_015723	AGCCC	2	10	28801	28810	20 %	0 %	20 %	60 %	339321352
26	NC_015723	CCACG	2	10	29002	29011	20 %	0 %	20 %	60 %	339321352
27	NC_015723	GCGCG	2	10	29020	29029	0 %	0 %	60 %	40 %	339321352
28	NC_015723	GCGGG	2	10	29913	29922	0 %	0 %	80 %	20 %	339321353
29	NC_015723	GGTCC	2	10	31038	31047	0 %	20 %	40 %	40 %	339321353
30	NC_015723	AGCCC	2	10	33544	33553	20 %	0 %	20 %	60 %	339321355
31	NC_015723	CGTGC	2	10	33667	33676	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015723	CATGC	2	10	33737	33746	20 %	20 %	20 %	40 %	339321356
33	NC_015723	GCCGC	2	10	34747	34756	0 %	0 %	40 %	60 %	339321356
34	NC_015723	CGTCG	2	10	34846	34855	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015723	GCGCC	2	10	34918	34927	0 %	0 %	40 %	60 %	339321357
36	NC_015723	GCCGC	2	10	35008	35017	0 %	0 %	40 %	60 %	339321357
37	NC_015723	TGCGC	2	10	35308	35317	0 %	20 %	40 %	40 %	339321357
38	NC_015723	CGGTC	2	10	36369	36378	0 %	20 %	40 %	40 %	339321358
39	NC_015723	CCGCA	2	10	36890	36899	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_015723	GAACG	2	10	37088	37097	40 %	0 %	40 %	20 %	339321359
41	NC_015723	CGGGC	2	10	37133	37142	0 %	0 %	60 %	40 %	339321359
42	NC_015723	ATGGC	2	10	38399	38408	20 %	20 %	40 %	20 %	339321360
43	NC_015723	TGGGG	2	10	38422	38431	0 %	20 %	80 %	0 %	339321360
44	NC_015723	TGCGC	2	10	38961	38970	0 %	20 %	40 %	40 %	339321361
45	NC_015723	GCTTC	2	10	41063	41072	0 %	40 %	20 %	40 %	339321363
46	NC_015723	TGGCC	2	10	41165	41174	0 %	20 %	40 %	40 %	339321363
47	NC_015723	GCGCC	2	10	44110	44119	0 %	0 %	40 %	60 %	339321364
48	NC_015723	AAGCG	2	10	45240	45249	40 %	0 %	40 %	20 %	339321365
49	NC_015723	GAATG	2	10	45795	45804	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015723	AGGGC	2	10	46228	46237	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015723	GCCAC	2	10	48443	48452	20 %	0 %	20 %	60 %	339321370
52	NC_015723	CCTCG	2	10	49820	49829	0 %	20 %	20 %	60 %	339321372
53	NC_015723	CGCGC	2	10	49883	49892	0 %	0 %	40 %	60 %	339321372
54	NC_015723	CTTGC	2	10	51125	51134	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015723	GCGCG	2	10	51474	51483	0 %	0 %	60 %	40 %	339321374
56	NC_015723	CGCGG	2	10	53600	53609	0 %	0 %	60 %	40 %	339321376
57	NC_015723	CTCGA	2	10	53958	53967	20 %	20 %	20 %	40 %	339321377
58	NC_015723	GCGCC	2	10	53992	54001	0 %	0 %	40 %	60 %	339321377
59	NC_015723	CGCGG	2	10	54707	54716	0 %	0 %	60 %	40 %	339321377
60	NC_015723	TGGCA	2	10	54767	54776	20 %	20 %	40 %	20 %	339321377
61	NC_015723	CGGCG	2	10	55890	55899	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_015723	GGCTG	2	10	57008	57017	0 %	20 %	60 %	20 %	339321379
63	NC_015723	GCCGG	2	10	57816	57825	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_015723	CTGGC	2	10	58054	58063	0 %	20 %	40 %	40 %	339321380
65	NC_015723	GGCAT	2	10	59197	59206	20 %	20 %	40 %	20 %	339321382
66	NC_015723	CAACG	2	10	59928	59937	40 %	0 %	20 %	40 %	339321382
67	NC_015723	TGCCG	2	10	62447	62456	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_015723	CCGGT	2	10	62627	62636	0 %	20 %	40 %	40 %	339321385
69	NC_015723	GCGCC	2	10	63231	63240	0 %	0 %	40 %	60 %	339321385
70	NC_015723	GCGCC	2	10	63471	63480	0 %	0 %	40 %	60 %	339321385
71	NC_015723	TCGTC	2	10	63608	63617	0 %	40 %	20 %	40 %	339321385
72	NC_015723	ACGGC	2	10	64705	64714	20 %	0 %	40 %	40 %	339321387
73	NC_015723	CGCGC	2	10	65355	65364	0 %	0 %	40 %	60 %	339321387
74	NC_015723	GGCGC	2	10	65698	65707	0 %	0 %	60 %	40 %	339321388
75	NC_015723	CGCGC	2	10	65872	65881	0 %	0 %	40 %	60 %	339321388
76	NC_015723	CGGCC	2	10	66793	66802	0 %	0 %	40 %	60 %	339321388
77	NC_015723	GGCCA	2	10	67463	67472	20 %	0 %	40 %	40 %	339321390
78	NC_015723	ATGAG	2	10	68043	68052	40 %	20 %	40 %	0 %	339321390
79	NC_015723	GCGCG	2	10	70103	70112	0 %	0 %	60 %	40 %	339321392
80	NC_015723	CGCGC	2	10	70475	70484	0 %	0 %	40 %	60 %	339321393
81	NC_015723	CGGCA	2	10	71578	71587	20 %	0 %	40 %	40 %	339321394
82	NC_015723	GGGCT	2	10	73239	73248	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015723	GGGGC	2	10	73489	73498	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015723	CGCTG	2	10	73816	73825	0 %	20 %	40 %	40 %	339321396
85	NC_015723	AGTCC	2	10	74326	74335	20 %	20 %	20 %	40 %	339321396
86	NC_015723	GGCAT	2	10	74730	74739	20 %	20 %	40 %	20 %	339321396
87	NC_015723	CGCTG	2	10	75691	75700	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_015723	CCGGT	2	10	77025	77034	0 %	20 %	40 %	40 %	339321397
89	NC_015723	ACGGT	2	10	77163	77172	20 %	20 %	40 %	20 %	339321397
90	NC_015723	CGTTT	2	10	77224	77233	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015723	GCCAG	2	10	77387	77396	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_015723	GCGCG	2	10	77797	77806	0 %	0 %	60 %	40 %	339321398
93	NC_015723	GCCGC	2	10	79347	79356	0 %	0 %	40 %	60 %	339321399
94	NC_015723	CACCG	2	10	81646	81655	20 %	0 %	20 %	60 %	339321402
95	NC_015723	GCGCA	2	10	81881	81890	20 %	0 %	40 %	40 %	339321402
96	NC_015723	GCTGG	2	10	81976	81985	0 %	20 %	60 %	20 %	339321402
97	NC_015723	GCGCC	2	10	82759	82768	0 %	0 %	40 %	60 %	339321402
98	NC_015723	GGCGT	2	10	84645	84654	0 %	20 %	60 %	20 %	339321404
99	NC_015723	GGGCT	2	10	84798	84807	0 %	20 %	60 %	20 %	339321404
100	NC_015723	CGCGC	2	10	86549	86558	0 %	0 %	40 %	60 %	339321405
101	NC_015723	TTTGT	2	10	87407	87416	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015723	GCGCA	2	10	88290	88299	20 %	0 %	40 %	40 %	339321406
103	NC_015723	TGCGA	2	10	91114	91123	20 %	20 %	40 %	20 %	339321409
104	NC_015723	GGCGC	2	10	92116	92125	0 %	0 %	60 %	40 %	339321410
105	NC_015723	GTCGG	2	10	92277	92286	0 %	20 %	60 %	20 %	339321410
106	NC_015723	GCCGG	2	10	92958	92967	0 %	0 %	60 %	40 %	339321411
107	NC_015723	GGGCA	2	10	93367	93376	20 %	0 %	60 %	20 %	339321411
108	NC_015723	CGGCC	2	10	94451	94460	0 %	0 %	40 %	60 %	339321412
109	NC_015723	CGCGG	2	10	94604	94613	0 %	0 %	60 %	40 %	339321412
110	NC_015723	CTGGA	2	10	95732	95741	20 %	20 %	40 %	20 %	339321414
111	NC_015723	AGGCC	2	10	98124	98133	20 %	0 %	40 %	40 %	339321416
112	NC_015723	GCGCC	2	10	99883	99892	0 %	0 %	40 %	60 %	339321417
113	NC_015723	CTGCG	2	10	100012	100021	0 %	20 %	40 %	40 %	339321417
114	NC_015723	CCGGC	2	10	100129	100138	0 %	0 %	40 %	60 %	339321418
115	NC_015723	TGGTC	2	10	100483	100492	0 %	40 %	40 %	20 %	339321418
116	NC_015723	GCGCG	2	10	100789	100798	0 %	0 %	60 %	40 %	339321418
117	NC_015723	CCGCA	2	10	100950	100959	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_015723	CTTGC	2	10	103428	103437	0 %	40 %	20 %	40 %	339321421
119	NC_015723	GCACC	2	10	103958	103967	20 %	0 %	20 %	60 %	339321421
120	NC_015723	GCCGC	2	10	108812	108821	0 %	0 %	40 %	60 %	339321425
121	NC_015723	CTGCG	2	10	111026	111035	0 %	20 %	40 %	40 %	339321425
122	NC_015723	GGCCT	2	10	112370	112379	0 %	20 %	40 %	40 %	339321427
123	NC_015723	GCCGC	2	10	114321	114330	0 %	0 %	40 %	60 %	339321428
124	NC_015723	CTGGG	2	10	114843	114852	0 %	20 %	60 %	20 %	339321428
125	NC_015723	GAAGG	2	10	115101	115110	40 %	0 %	60 %	0 %	339321428
126	NC_015723	CAGGC	2	10	115208	115217	20 %	0 %	40 %	40 %	339321429
127	NC_015723	TTTAA	2	10	115769	115778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015723	ACCGG	2	10	116479	116488	20 %	0 %	40 %	40 %	339321430
129	NC_015723	GCGCG	2	10	117663	117672	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
130	NC_015723	CCGGC	2	10	117720	117729	0 %	0 %	40 %	60 %	339321432
131	NC_015723	CCCGG	2	10	118192	118201	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_015723	GCATG	2	10	119404	119413	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015723	CGCGG	2	10	120691	120700	0 %	0 %	60 %	40 %	339321436
134	NC_015723	CGCGC	2	10	121007	121016	0 %	0 %	40 %	60 %	339321437
135	NC_015723	CACGC	2	10	121577	121586	20 %	0 %	20 %	60 %	339321437
136	NC_015723	GCCGC	2	10	121901	121910	0 %	0 %	40 %	60 %	339321437
137	NC_015723	CGCGC	2	10	124869	124878	0 %	0 %	40 %	60 %	339321439
138	NC_015723	TGCGG	2	10	127019	127028	0 %	20 %	60 %	20 %	339321441
139	NC_015723	GCCGC	2	10	128358	128367	0 %	0 %	40 %	60 %	339321442
140	NC_015723	CGCAG	2	10	129134	129143	20 %	0 %	40 %	40 %	339321443
141	NC_015723	CGATG	2	10	129474	129483	20 %	20 %	40 %	20 %	339321443
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147	NC_015723	GCGCG	2	10	135165	135174	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
148	NC_015723	CGCGG	2	10	135699	135708	0 %	0 %	60 %	40 %	339321448
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156	NC_015723	CGCGG	2	10	141629	141638	0 %	0 %	60 %	40 %	339321453
157	NC_015723	CCGGC	2	10	142587	142596	0 %	0 %	40 %	60 %	339321453
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161	NC_015723	GGCCA	2	10	144965	144974	20 %	0 %	40 %	40 %	339321455
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165	NC_015723	CCGCA	2	10	150482	150491	20 %	0 %	20 %	60 %	339321458
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167	NC_015723	CCGCG	2	10	154521	154530	0 %	0 %	40 %	60 %	339321463
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169	NC_015723	TCGTG	2	10	157404	157413	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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172	NC_015723	AGCCG	2	10	161913	161922	20 %	0 %	40 %	40 %	339321465
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179	NC_015723	GCGTC	2	10	169170	169179	0 %	20 %	40 %	40 %	339321472
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240	NC_015723	TGCGC	2	10	233263	233272	0 %	20 %	40 %	40 %	339321531
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242	NC_015723	GGCGC	2	10	237154	237163	0 %	0 %	60 %	40 %	339321536
243	NC_015723	GCCAG	2	10	237672	237681	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
244	NC_015723	GCCGA	2	10	238071	238080	20 %	0 %	40 %	40 %	339321537
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248	NC_015723	GGCCC	2	10	240555	240564	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
249	NC_015723	GGCGC	2	10	241461	241470	0 %	0 %	60 %	40 %	339321540
250	NC_015723	GTGGA	2	10	242048	242057	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
251	NC_015723	CCGGC	2	10	242287	242296	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
252	NC_015723	AAATC	2	10	242315	242324	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
253	NC_015723	CGGCG	2	10	242433	242442	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
254	NC_015723	GCAGC	2	10	243028	243037	20 %	0 %	40 %	40 %	339321542
255	NC_015723	GCTGT	2	10	243170	243179	0 %	40 %	40 %	20 %	339321542
256	NC_015723	GACCT	2	10	243257	243266	20 %	20 %	20 %	40 %	339321542
257	NC_015723	CCGCA	2	10	244153	244162	20 %	0 %	20 %	60 %	339321542
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260	NC_015723	GCAGC	2	10	246406	246415	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
261	NC_015723	GCTGC	2	10	246440	246449	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
262	NC_015723	GGGCT	2	10	247416	247425	0 %	20 %	60 %	20 %	339321545
263	NC_015723	TGCGC	2	10	248316	248325	0 %	20 %	40 %	40 %	339321546
264	NC_015723	TGACC	2	10	248337	248346	20 %	20 %	20 %	40 %	339321546
265	NC_015723	GCAGC	2	10	248409	248418	20 %	0 %	40 %	40 %	339321546
266	NC_015723	GCGCA	2	10	248851	248860	20 %	0 %	40 %	40 %	339321546
267	NC_015723	AGCGC	3	15	250617	250631	20 %	0 %	40 %	40 %	339321547
268	NC_015723	GCCGA	2	10	252841	252850	20 %	0 %	40 %	40 %	339321550
269	NC_015723	AGCGC	2	10	254789	254798	20 %	0 %	40 %	40 %	339321552
270	NC_015723	GCGAT	2	10	257852	257861	20 %	20 %	40 %	20 %	339321554
271	NC_015723	AAACC	2	10	259601	259610	60 %	0 %	0 %	40 %	339321556
272	NC_015723	CGCGC	2	10	261314	261323	0 %	0 %	40 %	60 %	339321559
273	NC_015723	TGAGC	2	10	261841	261850	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
274	NC_015723	CTGGG	2	10	262200	262209	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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276	NC_015723	CGAAG	2	10	263879	263888	40 %	0 %	40 %	20 %	339321562
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278	NC_015723	CGCGC	2	10	266495	266504	0 %	0 %	40 %	60 %	339321564
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282	NC_015723	ACGGC	2	10	273790	273799	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
283	NC_015723	GCGCA	2	10	276815	276824	20 %	0 %	40 %	40 %	339321575
284	NC_015723	GCTGA	2	10	276900	276909	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
285	NC_015723	GACCA	2	10	277888	277897	40 %	0 %	20 %	40 %	339321577
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287	NC_015723	AGCGC	2	10	280447	280456	20 %	0 %	40 %	40 %	339321580
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289	NC_015723	AGGCC	2	10	281045	281054	20 %	0 %	40 %	40 %	339321580
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291	NC_015723	GACCT	2	10	285985	285994	20 %	20 %	20 %	40 %	339321583
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295	NC_015723	ATCTG	2	10	291013	291022	20 %	40 %	20 %	20 %	339321590
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497	NC_015723	ATCCG	2	10	521378	521387	20 %	20 %	20 %	40 %	339321807
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500	NC_015723	CGGCG	2	10	527322	527331	0 %	0 %	60 %	40 %	339321813

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