MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 2

Total Repeats: 70265

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015723	ATG	2	6	18672	18677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321345
502	NC_015723	GGT	3	9	18794	18802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321345
503	NC_015723	GGC	2	6	18860	18865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321345
504	NC_015723	CAG	2	6	18875	18880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321345
505	NC_015723	GCA	2	6	18898	18903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321345
506	NC_015723	CGC	2	6	18908	18913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321345
507	NC_015723	GGCA	2	8	18994	19001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
508	NC_015723	AC	3	6	19069	19074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_015723	AGC	2	6	19115	19120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_015723	ACGG	2	8	19126	19133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
511	NC_015723	CTC	2	6	19142	19147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_015723	AGG	2	6	19152	19157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015723	GAT	2	6	19171	19176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015723	GCC	2	6	19180	19185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_015723	AC	3	6	19210	19215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_015723	G	6	6	19302	19307	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015723	G	6	6	19328	19333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015723	TCA	2	6	19424	19429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015723	GC	3	6	19457	19462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_015723	GC	3	6	19558	19563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_015723	CGG	2	6	19572	19577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015723	TCT	2	6	19602	19607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_015723	GA	3	6	19613	19618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015723	CTGG	2	8	19654	19661	0 %	25 %	50 %	25 %	339321346
525	NC_015723	GGT	2	6	19681	19686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321346
526	NC_015723	CGG	2	6	19782	19787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321346
527	NC_015723	GCCG	2	8	19843	19850	0 %	0 %	50 %	50 %	339321346
528	NC_015723	GCT	2	6	19861	19866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321346
529	NC_015723	GCC	2	6	19895	19900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321346
530	NC_015723	GTG	2	6	19901	19906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321346
531	NC_015723	CTG	2	6	19913	19918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321346
532	NC_015723	TGG	2	6	19923	19928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321346
533	NC_015723	GAC	2	6	19946	19951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321346
534	NC_015723	TCA	2	6	19974	19979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321346
535	NC_015723	GCC	2	6	20049	20054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321346
536	NC_015723	GAT	2	6	20092	20097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321346
537	NC_015723	GGCA	2	8	20119	20126	25 %	0 %	50 %	25 %	339321346
538	NC_015723	GTG	2	6	20153	20158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321346
539	NC_015723	TGT	2	6	20172	20177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339321346
540	NC_015723	TGC	2	6	20184	20189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321346
541	NC_015723	CTA	2	6	20197	20202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321346
542	NC_015723	TGG	2	6	20362	20367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321346
543	NC_015723	GCC	2	6	20372	20377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321346
544	NC_015723	ATG	2	6	20402	20407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321346
545	NC_015723	TCG	2	6	20418	20423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321346
546	NC_015723	TGA	2	6	20442	20447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321346
547	NC_015723	CGT	2	6	20494	20499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321346
548	NC_015723	GC	3	6	20550	20555	0 %	0 %	50 %	50 %	339321346
549	NC_015723	ATC	2	6	20561	20566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321346
550	NC_015723	ATG	2	6	20589	20594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321346
551	NC_015723	CTG	2	6	20606	20611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321346
552	NC_015723	GCT	2	6	20662	20667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321346
553	NC_015723	CTGG	2	8	20692	20699	0 %	25 %	50 %	25 %	339321346
554	NC_015723	GCT	2	6	20710	20715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321346
555	NC_015723	TGG	2	6	20736	20741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321346
556	NC_015723	CTT	2	6	20830	20835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339321346
557	NC_015723	GC	3	6	20886	20891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_015723	GGC	2	6	20896	20901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015723	CTTG	2	8	20907	20914	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
560	NC_015723	TCA	2	6	20954	20959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321347
561	NC_015723	TCT	2	6	21074	21079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339321347
562	NC_015723	GCG	2	6	21101	21106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321347
563	NC_015723	CGC	2	6	21111	21116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321347
564	NC_015723	ACT	2	6	21119	21124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321347
565	NC_015723	CG	3	6	21167	21172	0 %	0 %	50 %	50 %	339321347
566	NC_015723	CTG	2	6	21265	21270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321347
567	NC_015723	TGC	2	6	21284	21289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321347
568	NC_015723	ACAGG	2	10	21300	21309	40 %	0 %	40 %	20 %	339321347
569	NC_015723	GTG	2	6	21334	21339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321347
570	NC_015723	TGC	3	9	21344	21352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321347
571	NC_015723	GCC	2	6	21373	21378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321347
572	NC_015723	CCA	2	6	21407	21412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321347
573	NC_015723	GCCGC	2	10	21441	21450	0 %	0 %	40 %	60 %	339321347
574	NC_015723	ATC	2	6	21463	21468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321347
575	NC_015723	TCGC	2	8	21523	21530	0 %	25 %	25 %	50 %	339321347
576	NC_015723	GCC	2	6	21598	21603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321347
577	NC_015723	CGG	2	6	21653	21658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321347
578	NC_015723	GGC	2	6	21718	21723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321347
579	NC_015723	GCA	2	6	21734	21739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321347
580	NC_015723	GGC	2	6	21813	21818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321347
581	NC_015723	GTG	2	6	21832	21837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321347
582	NC_015723	CTG	2	6	21838	21843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321347
583	NC_015723	GT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	50 %	0 %	339321347
584	NC_015723	GAT	2	6	21870	21875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321347
585	NC_015723	GGCGA	2	10	21881	21890	20 %	0 %	60 %	20 %	339321347
586	NC_015723	CTGC	2	8	22020	22027	0 %	25 %	25 %	50 %	339321347
587	NC_015723	GCC	2	6	22163	22168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_015723	CCATCA	2	12	22185	22196	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_015723	CCG	2	6	22198	22203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_015723	CAA	2	6	22210	22215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_015723	GCG	2	6	22229	22234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_015723	GC	3	6	22271	22276	0 %	0 %	50 %	50 %	339321348
593	NC_015723	GGC	2	6	22294	22299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321348
594	NC_015723	GCG	2	6	22369	22374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321348
595	NC_015723	CGA	3	9	22401	22409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321348
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597	NC_015723	CAG	2	6	22444	22449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321348
598	NC_015723	CTGC	2	8	22455	22462	0 %	25 %	25 %	50 %	339321348
599	NC_015723	GGC	2	6	22477	22482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321348
600	NC_015723	CG	3	6	22502	22507	0 %	0 %	50 %	50 %	339321348
601	NC_015723	GAA	2	6	22627	22632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339321348
602	NC_015723	CGA	2	6	22653	22658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321348
603	NC_015723	CAGC	2	8	22698	22705	25 %	0 %	25 %	50 %	339321348
604	NC_015723	GCC	2	6	22714	22719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321348
605	NC_015723	GCG	2	6	22721	22726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321348
606	NC_015723	AGC	2	6	22766	22771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321348
607	NC_015723	CAG	2	6	22777	22782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321348
608	NC_015723	CGC	3	9	22806	22814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321348
609	NC_015723	GCC	2	6	22859	22864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321348
610	NC_015723	CAG	2	6	22918	22923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321348
611	NC_015723	GAA	2	6	22933	22938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339321348
612	NC_015723	GACC	2	8	22963	22970	25 %	0 %	25 %	50 %	339321348
613	NC_015723	GCAG	2	8	23124	23131	25 %	0 %	50 %	25 %	339321348
614	NC_015723	GCT	2	6	23190	23195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321348
615	NC_015723	AAG	2	6	23246	23251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339321348
616	NC_015723	TTG	2	6	23398	23403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339321348
617	NC_015723	TGG	2	6	23442	23447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015723	CCG	2	6	23489	23494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_015723	CGG	2	6	23545	23550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321349
620	NC_015723	CCT	2	6	23560	23565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339321349
621	NC_015723	CGC	3	9	23570	23578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321349
622	NC_015723	GGA	2	6	23580	23585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339321349
623	NC_015723	CGG	2	6	23629	23634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321349
624	NC_015723	GCC	2	6	23654	23659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321349
625	NC_015723	CG	3	6	23688	23693	0 %	0 %	50 %	50 %	339321349
626	NC_015723	CCGGT	2	10	23761	23770	0 %	20 %	40 %	40 %	339321349
627	NC_015723	CGA	2	6	23827	23832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321349
628	NC_015723	GC	3	6	23839	23844	0 %	0 %	50 %	50 %	339321349
629	NC_015723	GGC	2	6	23900	23905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321349
630	NC_015723	GAC	2	6	23906	23911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321349
631	NC_015723	CAC	2	6	23960	23965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321349
632	NC_015723	TCG	2	6	23967	23972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321349
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634	NC_015723	CCA	2	6	24044	24049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321349
635	NC_015723	GCCC	2	8	24163	24170	0 %	0 %	25 %	75 %	339321349
636	NC_015723	GCA	2	6	24178	24183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321349
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641	NC_015723	CGA	2	6	24316	24321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321349
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643	NC_015723	GCA	2	6	24400	24405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321349
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649	NC_015723	TCC	2	6	24648	24653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339321349
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651	NC_015723	GCCAG	2	10	24736	24745	20 %	0 %	40 %	40 %	339321349
652	NC_015723	TGG	2	6	24765	24770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321349
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654	NC_015723	GCA	2	6	24912	24917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321350
655	NC_015723	AGT	2	6	24945	24950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321350
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659	NC_015723	GGA	2	6	25038	25043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339321350
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663	NC_015723	GCC	2	6	25082	25087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321350
664	NC_015723	GCC	2	6	25121	25126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321350
665	NC_015723	TCC	2	6	25160	25165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339321350
666	NC_015723	ATC	2	6	25196	25201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321350
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669	NC_015723	CGG	2	6	25329	25334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321350
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684	NC_015723	CGG	2	6	25729	25734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321350
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692	NC_015723	CGA	2	6	26013	26018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321350
693	NC_015723	CCG	2	6	26022	26027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321350
694	NC_015723	TCA	2	6	26058	26063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321350
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696	NC_015723	CGA	2	6	26195	26200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
697	NC_015723	AC	5	10	26241	26250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
698	NC_015723	CA	4	8	26363	26370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
699	NC_015723	CAC	2	6	26409	26414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
700	NC_015723	CTAC	2	8	26422	26429	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
701	NC_015723	GAT	2	6	26435	26440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321351
702	NC_015723	GGA	2	6	26520	26525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339321351
703	NC_015723	CTGT	2	8	26535	26542	0 %	50 %	25 %	25 %	339321351
704	NC_015723	CCG	2	6	26552	26557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321351
705	NC_015723	CG	3	6	26556	26561	0 %	0 %	50 %	50 %	339321351
706	NC_015723	TCA	2	6	26573	26578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321351
707	NC_015723	TGG	2	6	26615	26620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321351
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709	NC_015723	GGA	2	6	26688	26693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339321351
710	NC_015723	AGCG	2	8	26694	26701	25 %	0 %	50 %	25 %	339321351
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712	NC_015723	TCG	2	6	26753	26758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321351
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722	NC_015723	TGG	2	6	27170	27175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321351
723	NC_015723	ATGG	2	8	27180	27187	25 %	25 %	50 %	0 %	339321351
724	NC_015723	TCG	2	6	27194	27199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321351
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744	NC_015723	CCGC	2	8	28016	28023	0 %	0 %	25 %	75 %	339321351
745	NC_015723	GCA	2	6	28063	28068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321351
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749	NC_015723	CAG	2	6	28208	28213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321352
750	NC_015723	ACC	2	6	28230	28235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321352
751	NC_015723	GGT	2	6	28259	28264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321352
752	NC_015723	GAT	2	6	28265	28270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321352
753	NC_015723	GCG	2	6	28306	28311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321352
754	NC_015723	GCA	2	6	28330	28335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321352
755	NC_015723	GGC	2	6	28378	28383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321352
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757	NC_015723	CCA	2	6	28465	28470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321352
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881	NC_015723	TGCG	2	8	33469	33476	0 %	25 %	50 %	25 %	339321355
882	NC_015723	GCT	3	9	33502	33510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321355
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1000	NC_015723	CCA	2	6	37593	37598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321359

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