MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 27696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_015722	TCA	2	6	683609	683614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_015722	AAAAC	2	10	683629	683638	80 %	0 %	0 %	20 %	339320002
16004	NC_015722	CTT	2	6	683664	683669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339320002
16005	NC_015722	GATT	2	8	683680	683687	25 %	50 %	25 %	0 %	339320002
16006	NC_015722	TCGC	2	8	683740	683747	0 %	25 %	25 %	50 %	339320002
16007	NC_015722	AT	3	6	683806	683811	50 %	50 %	0 %	0 %	339320002
16008	NC_015722	AT	3	6	683871	683876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_015722	ATAGG	2	10	683890	683899	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_015722	TTTAG	2	10	683939	683948	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_015722	ATT	2	6	683987	683992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320003
16012	NC_015722	CCT	2	6	684015	684020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339320003
16013	NC_015722	TA	3	6	684047	684052	50 %	50 %	0 %	0 %	339320003
16014	NC_015722	CAT	2	6	684097	684102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339320003
16015	NC_015722	CTA	2	6	684204	684209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339320003
16016	NC_015722	TAT	2	6	684232	684237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320003
16017	NC_015722	TAT	2	6	684249	684254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320003
16018	NC_015722	T	6	6	684354	684359	0 %	100 %	0 %	0 %	339320003
16019	NC_015722	TAA	2	6	684382	684387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320003
16020	NC_015722	ATA	2	6	684421	684426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320003
16021	NC_015722	AGTTT	2	10	684438	684447	20 %	60 %	20 %	0 %	339320003
16022	NC_015722	CTT	3	9	684507	684515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339320003
16023	NC_015722	GCT	2	6	684538	684543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320003
16024	NC_015722	CCAA	2	8	684544	684551	50 %	0 %	0 %	50 %	339320003
16025	NC_015722	TGCT	2	8	684592	684599	0 %	50 %	25 %	25 %	339320003
16026	NC_015722	AT	3	6	684679	684684	50 %	50 %	0 %	0 %	339320003
16027	NC_015722	TGT	3	9	684716	684724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339320003
16028	NC_015722	GTC	2	6	684745	684750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320003
16029	NC_015722	TCATA	2	10	684774	684783	40 %	40 %	0 %	20 %	339320003
16030	NC_015722	TAG	2	6	684832	684837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339320003
16031	NC_015722	TATCA	2	10	684838	684847	40 %	40 %	0 %	20 %	339320003
16032	NC_015722	GTT	2	6	684856	684861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339320003
16033	NC_015722	GTT	2	6	684899	684904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339320003
16034	NC_015722	TTC	2	6	685027	685032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339320003
16035	NC_015722	ATAA	2	8	685038	685045	75 %	25 %	0 %	0 %	339320003
16036	NC_015722	GTT	2	6	685074	685079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339320003
16037	NC_015722	CTT	2	6	685182	685187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339320003
16038	NC_015722	TCT	2	6	685211	685216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339320003
16039	NC_015722	TAAA	2	8	685263	685270	75 %	25 %	0 %	0 %	339320003
16040	NC_015722	AAG	2	6	685295	685300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339320003
16041	NC_015722	TTA	2	6	685326	685331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320003
16042	NC_015722	T	6	6	685338	685343	0 %	100 %	0 %	0 %	339320003
16043	NC_015722	ATT	2	6	685353	685358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320004
16044	NC_015722	TAA	2	6	685364	685369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320004
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16046	NC_015722	CTT	2	6	685411	685416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339320004
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16049	NC_015722	TAA	2	6	685493	685498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320004
16050	NC_015722	CAA	2	6	685508	685513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339320004
16051	NC_015722	CTT	2	6	685552	685557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339320004
16052	NC_015722	GAA	2	6	685581	685586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339320004
16053	NC_015722	ATCC	2	8	685654	685661	25 %	25 %	0 %	50 %	339320004
16054	NC_015722	T	6	6	685662	685667	0 %	100 %	0 %	0 %	339320004
16055	NC_015722	TTCT	2	8	685726	685733	0 %	75 %	0 %	25 %	339320004
16056	NC_015722	AGTT	2	8	685798	685805	25 %	50 %	25 %	0 %	339320004
16057	NC_015722	ATTT	2	8	685841	685848	25 %	75 %	0 %	0 %	339320004
16058	NC_015722	CATA	2	8	685898	685905	50 %	25 %	0 %	25 %	339320004
16059	NC_015722	ATAA	2	8	685924	685931	75 %	25 %	0 %	0 %	339320004
16060	NC_015722	CAA	2	6	685972	685977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339320004
16061	NC_015722	AAT	2	6	686033	686038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320004
16062	NC_015722	AACG	2	8	686078	686085	50 %	0 %	25 %	25 %	339320004
16063	NC_015722	CAG	2	6	686095	686100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339320004
16064	NC_015722	CAT	2	6	686149	686154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339320004
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16067	NC_015722	CAA	2	6	686411	686416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339320004
16068	NC_015722	TTA	2	6	686424	686429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320004
16069	NC_015722	ACC	2	6	686486	686491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339320004
16070	NC_015722	TA	3	6	686501	686506	50 %	50 %	0 %	0 %	339320004
16071	NC_015722	TGC	2	6	686533	686538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320004
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16073	NC_015722	ACT	2	6	686577	686582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339320004
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16076	NC_015722	GTA	2	6	686636	686641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339320004
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16082	NC_015722	AGC	3	9	686846	686854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339320004
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16089	NC_015722	TCA	2	6	687153	687158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339320004
16090	NC_015722	CCTA	2	8	687215	687222	25 %	25 %	0 %	50 %	339320004
16091	NC_015722	TCA	2	6	687229	687234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339320004
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16093	NC_015722	TTG	2	6	687291	687296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339320005
16094	NC_015722	ATTAT	2	10	687308	687317	40 %	60 %	0 %	0 %	339320005
16095	NC_015722	TCG	2	6	687323	687328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320005
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16105	NC_015722	TGG	2	6	687857	687862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_015722	AATA	2	8	687900	687907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_015722	CAA	2	6	687948	687953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_015722	GAA	2	6	688034	688039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339320006
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16112	NC_015722	AG	3	6	688177	688182	50 %	0 %	50 %	0 %	339320006
16113	NC_015722	ACTG	2	8	688183	688190	25 %	25 %	25 %	25 %	339320006
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16117	NC_015722	A	7	7	688332	688338	100 %	0 %	0 %	0 %	339320007
16118	NC_015722	ATT	2	6	688403	688408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_015722	AGGT	2	8	688417	688424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_015722	GAT	2	6	688496	688501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16123	NC_015722	GAA	2	6	688618	688623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16125	NC_015722	TTG	2	6	688689	688694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16251	NC_015722	CAAA	2	8	693801	693808	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16252	NC_015722	AG	3	6	693831	693836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16253	NC_015722	ACT	2	6	693840	693845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16255	NC_015722	AT	3	6	693893	693898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16256	NC_015722	TTA	3	9	693924	693932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320012
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16283	NC_015722	GA	3	6	695041	695046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16381	NC_015722	C	9	9	699029	699037	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16382	NC_015722	AAC	2	6	699038	699043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16383	NC_015722	TGC	2	6	699140	699145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16385	NC_015722	GTC	2	6	699289	699294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16500	NC_015722	TATC	2	8	703856	703863	25 %	50 %	0 %	25 %	339320022

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