MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 27696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015722	GA	3	6	19649	19654	50 %	0 %	50 %	0 %	339319345
502	NC_015722	TTAGAA	2	12	19782	19793	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339319346
503	NC_015722	GT	3	6	19795	19800	0 %	50 %	50 %	0 %	339319346
504	NC_015722	AAAATA	2	12	19832	19843	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	339319346
505	NC_015722	A	7	7	19855	19861	100 %	0 %	0 %	0 %	339319346
506	NC_015722	GCA	2	6	19880	19885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319346
507	NC_015722	CAT	2	6	19894	19899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319346
508	NC_015722	GTA	2	6	20003	20008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319346
509	NC_015722	AAG	2	6	20015	20020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319346
510	NC_015722	CAG	2	6	20060	20065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319346
511	NC_015722	AGC	2	6	20092	20097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319346
512	NC_015722	ATGCG	2	10	20115	20124	20 %	20 %	40 %	20 %	339319346
513	NC_015722	AAGATT	2	12	20144	20155	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	339319346
514	NC_015722	TGG	2	6	20167	20172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339319346
515	NC_015722	GAAG	2	8	20204	20211	50 %	0 %	50 %	0 %	339319346
516	NC_015722	ATG	2	6	20234	20239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319346
517	NC_015722	CTG	2	6	20253	20258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319346
518	NC_015722	AAT	2	6	20334	20339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319346
519	NC_015722	A	7	7	20369	20375	100 %	0 %	0 %	0 %	339319347
520	NC_015722	AACTT	2	10	20433	20442	40 %	40 %	0 %	20 %	339319347
521	NC_015722	GGC	2	6	20500	20505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339319347
522	NC_015722	GTG	2	6	20700	20705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339319347
523	NC_015722	GAA	2	6	20765	20770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319347
524	NC_015722	ATTG	2	8	20814	20821	25 %	50 %	25 %	0 %	339319348
525	NC_015722	AATT	2	8	20825	20832	50 %	50 %	0 %	0 %	339319348
526	NC_015722	AGC	2	6	20907	20912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319348
527	NC_015722	AAG	2	6	20913	20918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319348
528	NC_015722	TTG	2	6	20945	20950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319348
529	NC_015722	AGA	2	6	20951	20956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319348
530	NC_015722	TGC	2	6	20961	20966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319348
531	NC_015722	AGAAGT	2	12	20990	21001	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015722	GTT	2	6	21029	21034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319349
533	NC_015722	TAA	2	6	21049	21054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319349
534	NC_015722	GTA	2	6	21117	21122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319349
535	NC_015722	ATG	2	6	21138	21143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319349
536	NC_015722	ATA	2	6	21147	21152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319349
537	NC_015722	A	6	6	21209	21214	100 %	0 %	0 %	0 %	339319349
538	NC_015722	TTG	2	6	21219	21224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319349
539	NC_015722	A	6	6	21231	21236	100 %	0 %	0 %	0 %	339319349
540	NC_015722	GAT	2	6	21343	21348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319350
541	NC_015722	GTT	2	6	21371	21376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319350
542	NC_015722	AAG	2	6	21410	21415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319350
543	NC_015722	TGT	3	9	21433	21441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319350
544	NC_015722	AAG	2	6	21453	21458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319350
545	NC_015722	TAG	2	6	21472	21477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319350
546	NC_015722	GTA	2	6	21479	21484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319350
547	NC_015722	GTTGT	2	10	21503	21512	0 %	60 %	40 %	0 %	339319350
548	NC_015722	TAAA	2	8	21513	21520	75 %	25 %	0 %	0 %	339319350
549	NC_015722	A	6	6	21577	21582	100 %	0 %	0 %	0 %	339319350
550	NC_015722	ATA	2	6	21593	21598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319350
551	NC_015722	AT	3	6	21623	21628	50 %	50 %	0 %	0 %	339319351
552	NC_015722	AAG	2	6	21636	21641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319351
553	NC_015722	TGA	3	9	21650	21658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319351
554	NC_015722	GAAAG	2	10	21692	21701	60 %	0 %	40 %	0 %	339319351
555	NC_015722	AAG	2	6	21780	21785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319351
556	NC_015722	ACCA	2	8	21866	21873	50 %	0 %	0 %	50 %	339319351
557	NC_015722	GAA	2	6	21901	21906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319351
558	NC_015722	A	7	7	21920	21926	100 %	0 %	0 %	0 %	339319351
559	NC_015722	AAG	2	6	21958	21963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015722	ATT	2	6	21997	22002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319352
561	NC_015722	A	6	6	22029	22034	100 %	0 %	0 %	0 %	339319352
562	NC_015722	GAAA	2	8	22252	22259	75 %	0 %	25 %	0 %	339319352
563	NC_015722	ATG	2	6	22260	22265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319352
564	NC_015722	TAC	2	6	22415	22420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319352
565	NC_015722	TTG	2	6	22438	22443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319352
566	NC_015722	GAA	2	6	22467	22472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319352
567	NC_015722	TAGTA	2	10	22548	22557	40 %	40 %	20 %	0 %	339319353
568	NC_015722	A	7	7	22567	22573	100 %	0 %	0 %	0 %	339319353
569	NC_015722	AT	3	6	22627	22632	50 %	50 %	0 %	0 %	339319353
570	NC_015722	AGA	2	6	22650	22655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319353
571	NC_015722	TG	3	6	22724	22729	0 %	50 %	50 %	0 %	339319353
572	NC_015722	AG	3	6	22789	22794	50 %	0 %	50 %	0 %	339319353
573	NC_015722	TTG	2	6	22810	22815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319353
574	NC_015722	TTA	2	6	22872	22877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319354
575	NC_015722	TTC	2	6	22940	22945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319354
576	NC_015722	GAA	2	6	22980	22985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319354
577	NC_015722	GAA	2	6	23004	23009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319354
578	NC_015722	TAT	2	6	23055	23060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319354
579	NC_015722	AGA	2	6	23078	23083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319354
580	NC_015722	A	6	6	23140	23145	100 %	0 %	0 %	0 %	339319354
581	NC_015722	AGA	2	6	23211	23216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319354
582	NC_015722	TCG	2	6	23305	23310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_015722	GC	3	6	23448	23453	0 %	0 %	50 %	50 %	339319355
584	NC_015722	GGTT	2	8	23544	23551	0 %	50 %	50 %	0 %	339319355
585	NC_015722	ATCTAT	2	12	23658	23669	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	339319355
586	NC_015722	TGC	2	6	23703	23708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319355
587	NC_015722	TAAAGG	2	12	23742	23753	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	339319355
588	NC_015722	AAG	2	6	23778	23783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319355
589	NC_015722	AAG	3	9	23794	23802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319355
590	NC_015722	TAG	2	6	23803	23808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319355
591	NC_015722	AG	3	6	23833	23838	50 %	0 %	50 %	0 %	339319356
592	NC_015722	GCT	2	6	23887	23892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319356
593	NC_015722	CA	3	6	23924	23929	50 %	0 %	0 %	50 %	339319356
594	NC_015722	AT	4	8	23930	23937	50 %	50 %	0 %	0 %	339319356
595	NC_015722	TGA	2	6	23949	23954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319356
596	NC_015722	A	6	6	23956	23961	100 %	0 %	0 %	0 %	339319356
597	NC_015722	AGT	2	6	23970	23975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319356
598	NC_015722	GCT	2	6	23977	23982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319356
599	NC_015722	A	6	6	24013	24018	100 %	0 %	0 %	0 %	339319356
600	NC_015722	ATTG	2	8	24057	24064	25 %	50 %	25 %	0 %	339319356
601	NC_015722	TTA	2	6	24073	24078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319356
602	NC_015722	A	6	6	24081	24086	100 %	0 %	0 %	0 %	339319356
603	NC_015722	AAG	2	6	24092	24097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319356
604	NC_015722	TGC	2	6	24153	24158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319356
605	NC_015722	GGT	2	6	24166	24171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339319356
606	NC_015722	CAA	2	6	24204	24209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339319357
607	NC_015722	A	6	6	24208	24213	100 %	0 %	0 %	0 %	339319357
608	NC_015722	G	6	6	24281	24286	0 %	0 %	100 %	0 %	339319357
609	NC_015722	GGTAAA	2	12	24327	24338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	339319357
610	NC_015722	TAG	2	6	24437	24442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319357
611	NC_015722	CAT	2	6	24450	24455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319357
612	NC_015722	GAAAT	2	10	24462	24471	60 %	20 %	20 %	0 %	339319357
613	NC_015722	GCT	2	6	24498	24503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319357
614	NC_015722	AAT	2	6	24518	24523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319357
615	NC_015722	CAA	2	6	24595	24600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339319357
616	NC_015722	ATA	2	6	24607	24612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319357
617	NC_015722	A	6	6	24681	24686	100 %	0 %	0 %	0 %	339319357
618	NC_015722	CTA	2	6	24721	24726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319357
619	NC_015722	A	7	7	24807	24813	100 %	0 %	0 %	0 %	339319358
620	NC_015722	CTA	2	6	24840	24845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319358
621	NC_015722	AGC	2	6	24880	24885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319358
622	NC_015722	A	6	6	24916	24921	100 %	0 %	0 %	0 %	339319358
623	NC_015722	GAT	2	6	25111	25116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319358
624	NC_015722	AGA	2	6	25159	25164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015722	GA	3	6	25183	25188	50 %	0 %	50 %	0 %	339319359
626	NC_015722	A	6	6	25204	25209	100 %	0 %	0 %	0 %	339319359
627	NC_015722	GAG	2	6	25263	25268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339319359
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629	NC_015722	TAA	2	6	25369	25374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319359
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