MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 27696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015722	TCT	2	6	238812	238817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319574
5502	NC_015722	GC	3	6	238818	238823	0 %	0 %	50 %	50 %	339319574
5503	NC_015722	TTTA	2	8	238871	238878	25 %	75 %	0 %	0 %	339319574
5504	NC_015722	TTG	2	6	238918	238923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319574
5505	NC_015722	CTTTC	2	10	238929	238938	0 %	60 %	0 %	40 %	339319574
5506	NC_015722	T	6	6	238944	238949	0 %	100 %	0 %	0 %	339319574
5507	NC_015722	GCA	2	6	238968	238973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319574
5508	NC_015722	ATA	2	6	239088	239093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319574
5509	NC_015722	TCT	2	6	239154	239159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319574
5510	NC_015722	TAAGTG	2	12	239216	239227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319574
5511	NC_015722	AAAT	2	8	239252	239259	75 %	25 %	0 %	0 %	339319574
5512	NC_015722	AGA	2	6	239294	239299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319574
5513	NC_015722	ATT	2	6	239327	239332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319574
5514	NC_015722	TAA	2	6	239333	239338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319574
5515	NC_015722	ATT	2	6	239346	239351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319574
5516	NC_015722	CAA	2	6	239458	239463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339319574
5517	NC_015722	CTG	2	6	239484	239489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319574
5518	NC_015722	GAT	2	6	239527	239532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319574
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5520	NC_015722	TCT	2	6	239571	239576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319574
5521	NC_015722	ATA	2	6	239577	239582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319574
5522	NC_015722	TA	3	6	239588	239593	50 %	50 %	0 %	0 %	339319574
5523	NC_015722	TAT	2	6	239644	239649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319574
5524	NC_015722	TAT	2	6	239699	239704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319574
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5529	NC_015722	T	6	6	239871	239876	0 %	100 %	0 %	0 %	339319574
5530	NC_015722	TTGA	2	8	239921	239928	25 %	50 %	25 %	0 %	339319574
5531	NC_015722	TGG	2	6	239976	239981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_015722	GAG	2	6	239988	239993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_015722	ACC	2	6	240033	240038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5534	NC_015722	A	6	6	240057	240062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_015722	TAA	2	6	240079	240084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319575
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5539	NC_015722	T	6	6	240321	240326	0 %	100 %	0 %	0 %	339319575
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5542	NC_015722	ACA	2	6	240446	240451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339319576
5543	NC_015722	CAG	2	6	240483	240488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319576
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5547	NC_015722	GAG	3	9	240807	240815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339319577
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5549	NC_015722	CTAT	2	8	240881	240888	25 %	50 %	0 %	25 %	339319577
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5553	NC_015722	A	6	6	241020	241025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_015722	TA	4	8	241029	241036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_015722	ATA	2	6	241041	241046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_015722	G	6	6	241084	241089	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_015722	TAA	2	6	241122	241127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_015722	GAA	2	6	241151	241156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_015722	GTG	2	6	241158	241163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_015722	ATGT	2	8	241196	241203	25 %	50 %	25 %	0 %	339319578
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5565	NC_015722	A	7	7	241479	241485	100 %	0 %	0 %	0 %	339319578
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5572	NC_015722	TAA	2	6	241734	241739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319578
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5577	NC_015722	AG	3	6	241922	241927	50 %	0 %	50 %	0 %	339319578
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5579	NC_015722	TCT	2	6	241953	241958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319578
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5583	NC_015722	AT	3	6	242138	242143	50 %	50 %	0 %	0 %	339319578
5584	NC_015722	AAGA	2	8	242152	242159	75 %	0 %	25 %	0 %	339319578
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5589	NC_015722	TTA	2	6	242340	242345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319578
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5592	NC_015722	GGC	2	6	242477	242482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339319578
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5597	NC_015722	ATT	2	6	242646	242651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319578
5598	NC_015722	CA	3	6	242673	242678	50 %	0 %	0 %	50 %	339319578
5599	NC_015722	TACCA	2	10	242740	242749	40 %	20 %	0 %	40 %	339319578
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5604	NC_015722	CTTTG	2	10	242860	242869	0 %	60 %	20 %	20 %	339319578
5605	NC_015722	ATT	2	6	242880	242885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319578
5606	NC_015722	A	6	6	242894	242899	100 %	0 %	0 %	0 %	339319578
5607	NC_015722	GAATA	2	10	242903	242912	60 %	20 %	20 %	0 %	339319578
5608	NC_015722	T	8	8	242923	242930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_015722	ATTT	2	8	243066	243073	25 %	75 %	0 %	0 %	339319579
5610	NC_015722	GCTT	2	8	243101	243108	0 %	50 %	25 %	25 %	339319579
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5612	NC_015722	AG	3	6	243271	243276	50 %	0 %	50 %	0 %	339319579
5613	NC_015722	TAT	2	6	243351	243356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319579
5614	NC_015722	GTT	2	6	243358	243363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319579
5615	NC_015722	CTT	2	6	243364	243369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319579
5616	NC_015722	TTA	2	6	243418	243423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319579
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5618	NC_015722	TTTA	2	8	243444	243451	25 %	75 %	0 %	0 %	339319579
5619	NC_015722	TA	4	8	243457	243464	50 %	50 %	0 %	0 %	339319579
5620	NC_015722	AAG	2	6	243470	243475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319579
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5623	NC_015722	ACT	2	6	243505	243510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_015722	TC	3	6	243528	243533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5994	NC_015722	AT	3	6	259989	259994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5995	NC_015722	ATGGAG	2	12	260088	260099	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5998	NC_015722	T	7	7	260249	260255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5999	NC_015722	CCAT	2	8	260286	260293	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6000	NC_015722	TAC	2	6	260320	260325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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