MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 chromosome

Total Repeats: 4106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015687	ATTTT	2	10	224	233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015687	GTTCA	2	10	1106	1115	20 %	40 %	20 %	20 %	337735210
3	NC_015687	TTTAA	2	10	1559	1568	40 %	60 %	0 %	0 %	337735210
4	NC_015687	AAATT	2	10	2556	2565	60 %	40 %	0 %	0 %	337735211
5	NC_015687	ATGAT	2	10	3964	3973	40 %	40 %	20 %	0 %	337735213
6	NC_015687	TGAAA	2	10	6824	6833	60 %	20 %	20 %	0 %	337735216
7	NC_015687	ATATT	2	10	6921	6930	40 %	60 %	0 %	0 %	337735216
8	NC_015687	TCGTG	2	10	10747	10756	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015687	AGATT	2	10	14181	14190	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015687	CATAA	2	10	14194	14203	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015687	CTTAA	2	10	14972	14981	40 %	40 %	0 %	20 %	337735217
12	NC_015687	GACAA	2	10	15380	15389	60 %	0 %	20 %	20 %	337735218
13	NC_015687	GGTAA	2	10	15889	15898	40 %	20 %	40 %	0 %	337735219
14	NC_015687	ATTTA	2	10	16506	16515	40 %	60 %	0 %	0 %	337735219
15	NC_015687	TGAAT	2	10	18531	18540	40 %	40 %	20 %	0 %	337735219
16	NC_015687	AAAAG	2	10	18985	18994	80 %	0 %	20 %	0 %	337735220
17	NC_015687	GTATG	2	10	19300	19309	20 %	40 %	40 %	0 %	337735220
18	NC_015687	TAATT	2	10	20208	20217	40 %	60 %	0 %	0 %	337735221
19	NC_015687	TACAG	2	10	23889	23898	40 %	20 %	20 %	20 %	337735225
20	NC_015687	GAAAA	2	10	25322	25331	80 %	0 %	20 %	0 %	337735226
21	NC_015687	TGATT	2	10	25413	25422	20 %	60 %	20 %	0 %	337735226
22	NC_015687	AGAGG	2	10	26534	26543	40 %	0 %	60 %	0 %	337735227
23	NC_015687	AAAGA	2	10	28933	28942	80 %	0 %	20 %	0 %	337735229
24	NC_015687	AAGAA	2	10	29109	29118	80 %	0 %	20 %	0 %	337735229
25	NC_015687	TATAT	2	10	31983	31992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015687	AGAGG	2	10	32389	32398	40 %	0 %	60 %	0 %	337735231
27	NC_015687	TATAA	2	10	33844	33853	60 %	40 %	0 %	0 %	337735232
28	NC_015687	ATTTT	2	10	34191	34200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015687	TTAAT	2	10	34342	34351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015687	CATTT	2	10	35480	35489	20 %	60 %	0 %	20 %	337735233
31	NC_015687	GATTT	2	10	35934	35943	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015687	GTTTA	2	10	38452	38461	20 %	60 %	20 %	0 %	337735237
33	NC_015687	AATTT	2	10	38669	38678	40 %	60 %	0 %	0 %	337735237
34	NC_015687	ATTGA	2	10	39351	39360	40 %	40 %	20 %	0 %	337735237
35	NC_015687	AATTA	2	10	40063	40072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015687	ATGGA	2	10	40684	40693	40 %	20 %	40 %	0 %	337735238
37	NC_015687	ATATA	2	10	41211	41220	60 %	40 %	0 %	0 %	337735239
38	NC_015687	TACAT	2	10	41866	41875	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015687	CTTTA	2	10	42181	42190	20 %	60 %	0 %	20 %	337735240
40	NC_015687	AGGAG	2	10	42685	42694	40 %	0 %	60 %	0 %	337735240
41	NC_015687	TAATT	2	10	42789	42798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015687	AGGAA	2	10	43141	43150	60 %	0 %	40 %	0 %	337735241
43	NC_015687	ATTTT	2	10	44301	44310	20 %	80 %	0 %	0 %	337735242
44	NC_015687	TATAT	2	10	45728	45737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015687	TTTTG	2	10	46847	46856	0 %	80 %	20 %	0 %	337735244
46	NC_015687	ACAAA	2	10	49445	49454	80 %	0 %	0 %	20 %	337735246
47	NC_015687	TAAAT	2	10	49893	49902	60 %	40 %	0 %	0 %	337735247
48	NC_015687	AATAA	2	10	50107	50116	80 %	20 %	0 %	0 %	337735248
49	NC_015687	TGGTT	2	10	52044	52053	0 %	60 %	40 %	0 %	337735248
50	NC_015687	TTAGT	2	10	53480	53489	20 %	60 %	20 %	0 %	337735248
51	NC_015687	AGATA	2	10	55011	55020	60 %	20 %	20 %	0 %	337735249
52	NC_015687	CATTT	2	10	57553	57562	20 %	60 %	0 %	20 %	337735253
53	NC_015687	GAAAA	2	10	59205	59214	80 %	0 %	20 %	0 %	337735254
54	NC_015687	AGTGC	2	10	59479	59488	20 %	20 %	40 %	20 %	337735255
55	NC_015687	AGAAT	2	10	60599	60608	60 %	20 %	20 %	0 %	337735258
56	NC_015687	AATCA	2	10	60983	60992	60 %	20 %	0 %	20 %	337735258
57	NC_015687	TAAAT	2	10	61173	61182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015687	TAAAT	2	10	62510	62519	60 %	40 %	0 %	0 %	337735261
59	NC_015687	TAATA	2	10	63336	63345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015687	TTTTA	2	10	64589	64598	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015687	AGAAA	2	10	67393	67402	80 %	0 %	20 %	0 %	337735268
62	NC_015687	GTTGT	2	10	75334	75343	0 %	60 %	40 %	0 %	337735271
63	NC_015687	AAGGC	2	10	77541	77550	40 %	0 %	40 %	20 %	337735275
64	NC_015687	TAAAA	2	10	79356	79365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015687	AAGTT	2	10	80333	80342	40 %	40 %	20 %	0 %	337735278
66	NC_015687	TTAAA	2	10	80393	80402	60 %	40 %	0 %	0 %	337735278
67	NC_015687	AATTA	2	10	80424	80433	60 %	40 %	0 %	0 %	337735278
68	NC_015687	ATAGT	2	10	81877	81886	40 %	40 %	20 %	0 %	337735280
69	NC_015687	TTAAA	2	10	86221	86230	60 %	40 %	0 %	0 %	337735286
70	NC_015687	TAAAA	2	10	86357	86366	80 %	20 %	0 %	0 %	337735286
71	NC_015687	AATTA	2	10	86706	86715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015687	ATTTT	2	10	86872	86881	20 %	80 %	0 %	0 %	337735287
73	NC_015687	ATGTT	2	10	88869	88878	20 %	60 %	20 %	0 %	337735289
74	NC_015687	CATTA	2	10	89685	89694	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015687	AAATA	2	10	89957	89966	80 %	20 %	0 %	0 %	337735291
76	NC_015687	TAAGT	2	10	91910	91919	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015687	AAAAT	2	10	93484	93493	80 %	20 %	0 %	0 %	337735293
78	NC_015687	GTGAT	2	10	97035	97044	20 %	40 %	40 %	0 %	337735298
79	NC_015687	AAAAG	2	10	97518	97527	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015687	TACAT	2	10	98766	98775	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015687	GATGG	2	10	104076	104085	20 %	20 %	60 %	0 %	337735304
82	NC_015687	TCTTA	2	10	104172	104181	20 %	60 %	0 %	20 %	337735304
83	NC_015687	TCCTT	2	10	104516	104525	0 %	60 %	0 %	40 %	337735304
84	NC_015687	AAGAA	2	10	105612	105621	80 %	0 %	20 %	0 %	337735305
85	NC_015687	CAGCT	2	10	106065	106074	20 %	20 %	20 %	40 %	337735306
86	NC_015687	AAATG	2	10	106767	106776	60 %	20 %	20 %	0 %	337735307
87	NC_015687	ATGGA	2	10	107111	107120	40 %	20 %	40 %	0 %	337735307
88	NC_015687	AAAGA	2	10	107592	107601	80 %	0 %	20 %	0 %	337735307
89	NC_015687	AGATA	2	10	108409	108418	60 %	20 %	20 %	0 %	337735308
90	NC_015687	TAAAG	2	10	111040	111049	60 %	20 %	20 %	0 %	337735310
91	NC_015687	AGTAA	2	10	112435	112444	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015687	TAAAA	2	10	113784	113793	80 %	20 %	0 %	0 %	337735312
93	NC_015687	GTAAA	2	10	115977	115986	60 %	20 %	20 %	0 %	337735313
94	NC_015687	GAAGT	2	10	116351	116360	40 %	20 %	40 %	0 %	337735315
95	NC_015687	TAAAA	2	10	116547	116556	80 %	20 %	0 %	0 %	337735315
96	NC_015687	AAGAA	2	10	117045	117054	80 %	0 %	20 %	0 %	337735315
97	NC_015687	AAAAG	2	10	117465	117474	80 %	0 %	20 %	0 %	337735316
98	NC_015687	CCTTC	2	10	118302	118311	0 %	40 %	0 %	60 %	337735317
99	NC_015687	GAAAA	2	10	118958	118967	80 %	0 %	20 %	0 %	337735317
100	NC_015687	AAAGA	2	10	120038	120047	80 %	0 %	20 %	0 %	337735319
101	NC_015687	CAATC	2	10	122035	122044	40 %	20 %	0 %	40 %	337735320
102	NC_015687	GATAC	2	10	124105	124114	40 %	20 %	20 %	20 %	337735322
103	NC_015687	AATAA	2	10	124284	124293	80 %	20 %	0 %	0 %	337735322
104	NC_015687	ATTTT	2	10	124727	124736	20 %	80 %	0 %	0 %	337735322
105	NC_015687	GTATT	2	10	128916	128925	20 %	60 %	20 %	0 %	337735327
106	NC_015687	CAATA	2	10	129046	129055	60 %	20 %	0 %	20 %	337735327
107	NC_015687	GGAGA	2	10	130478	130487	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015687	AGATG	2	10	131000	131009	40 %	20 %	40 %	0 %	337735328
109	NC_015687	CAAGC	2	10	132497	132506	40 %	0 %	20 %	40 %	337735329
110	NC_015687	ATGGA	2	10	132578	132587	40 %	20 %	40 %	0 %	337735329
111	NC_015687	GAACT	2	10	133961	133970	40 %	20 %	20 %	20 %	337735331
112	NC_015687	AAGCT	2	10	134237	134246	40 %	20 %	20 %	20 %	337735332
113	NC_015687	ATATT	2	10	135609	135618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015687	AATAG	2	10	136517	136526	60 %	20 %	20 %	0 %	337735334
115	NC_015687	GATTT	2	10	136929	136938	20 %	60 %	20 %	0 %	337735334
116	NC_015687	GCGGT	2	10	138278	138287	0 %	20 %	60 %	20 %	337735335
117	NC_015687	CTGTT	2	10	138743	138752	0 %	60 %	20 %	20 %	337735336
118	NC_015687	AAAAG	2	10	140286	140295	80 %	0 %	20 %	0 %	337735339
119	NC_015687	TATTT	2	10	141884	141893	20 %	80 %	0 %	0 %	337735341
120	NC_015687	TAAAA	2	10	142376	142385	80 %	20 %	0 %	0 %	337735342
121	NC_015687	TACCT	2	10	142959	142968	20 %	40 %	0 %	40 %	337735343
122	NC_015687	TTATA	2	10	144440	144449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015687	TTCTT	2	10	145981	145990	0 %	80 %	0 %	20 %	337735347
124	NC_015687	ATAAG	2	10	148898	148907	60 %	20 %	20 %	0 %	337735350
125	NC_015687	TATAA	2	10	149434	149443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015687	ATAGT	2	10	150846	150855	40 %	40 %	20 %	0 %	337735354
127	NC_015687	CTTAA	2	10	151943	151952	40 %	40 %	0 %	20 %	337735354
128	NC_015687	AAAAT	2	10	154465	154474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015687	ATAAA	2	10	154821	154830	80 %	20 %	0 %	0 %	337735358
130	NC_015687	ACTTT	2	10	156087	156096	20 %	60 %	0 %	20 %	337735360
131	NC_015687	ATATT	2	10	157436	157445	40 %	60 %	0 %	0 %	337735361
132	NC_015687	ATAGA	2	10	157747	157756	60 %	20 %	20 %	0 %	337735361
133	NC_015687	TCGTG	2	10	159373	159382	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015687	AGATT	2	10	162807	162816	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015687	CATAA	2	10	162820	162829	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015687	TGATA	2	10	163227	163236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015687	TCGTG	2	10	164511	164520	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015687	AGATT	2	10	167945	167954	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015687	CATAA	2	10	167958	167967	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015687	TGATA	2	10	168365	168374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015687	TCGTG	2	10	169649	169658	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015687	AGATT	2	10	173092	173101	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015687	CATAA	2	10	173105	173114	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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158	NC_015687	GAATT	2	10	183418	183427	40 %	40 %	20 %	0 %	337735369
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