MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBa

Total Repeats: 4809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015686	ATT	2	6	20185	20190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735050
502	NC_015686	T	7	7	20199	20205	0 %	100 %	0 %	0 %	337735050
503	NC_015686	GTTT	2	8	20279	20286	0 %	75 %	25 %	0 %	337735051
504	NC_015686	AT	3	6	20481	20486	50 %	50 %	0 %	0 %	337735051
505	NC_015686	A	7	7	20503	20509	100 %	0 %	0 %	0 %	337735051
506	NC_015686	AAT	2	6	20512	20517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735051
507	NC_015686	AAC	2	6	20553	20558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735051
508	NC_015686	ATA	2	6	20596	20601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735051
509	NC_015686	TACGT	2	10	20673	20682	20 %	40 %	20 %	20 %	337735051
510	NC_015686	ATC	3	9	20722	20730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735051
511	NC_015686	A	6	6	20743	20748	100 %	0 %	0 %	0 %	337735051
512	NC_015686	TGA	2	6	20815	20820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735051
513	NC_015686	ATA	2	6	20904	20909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735051
514	NC_015686	AGT	3	9	20918	20926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735051
515	NC_015686	CTA	2	6	21029	21034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735051
516	NC_015686	TTG	2	6	21059	21064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735051
517	NC_015686	TCT	2	6	21085	21090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735051
518	NC_015686	AT	3	6	21091	21096	50 %	50 %	0 %	0 %	337735051
519	NC_015686	AT	3	6	21103	21108	50 %	50 %	0 %	0 %	337735051
520	NC_015686	CTGT	2	8	21124	21131	0 %	50 %	25 %	25 %	337735051
521	NC_015686	ATCTA	2	10	21141	21150	40 %	40 %	0 %	20 %	337735051
522	NC_015686	TTC	2	6	21159	21164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735051
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524	NC_015686	T	6	6	21187	21192	0 %	100 %	0 %	0 %	337735051
525	NC_015686	TAAAC	2	10	21196	21205	60 %	20 %	0 %	20 %	337735051
526	NC_015686	AT	3	6	21206	21211	50 %	50 %	0 %	0 %	337735051
527	NC_015686	TGTT	2	8	21219	21226	0 %	75 %	25 %	0 %	337735051
528	NC_015686	TAG	2	6	21279	21284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735051
529	NC_015686	TC	3	6	21319	21324	0 %	50 %	0 %	50 %	337735051
530	NC_015686	CTA	2	6	21389	21394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735051
531	NC_015686	ATT	2	6	21459	21464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735051
532	NC_015686	TCA	2	6	21469	21474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735051
533	NC_015686	TAC	2	6	21513	21518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735051
534	NC_015686	ATC	2	6	21564	21569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735051
535	NC_015686	TGGTT	2	10	21590	21599	0 %	60 %	40 %	0 %	337735051
536	NC_015686	TTTTC	2	10	21605	21614	0 %	80 %	0 %	20 %	337735051
537	NC_015686	A	8	8	21627	21634	100 %	0 %	0 %	0 %	337735051
538	NC_015686	CT	3	6	21675	21680	0 %	50 %	0 %	50 %	337735051
539	NC_015686	AAT	2	6	21705	21710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735051
540	NC_015686	TGA	2	6	21744	21749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735051
541	NC_015686	T	6	6	21762	21767	0 %	100 %	0 %	0 %	337735051
542	NC_015686	AATTTT	2	12	21814	21825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735051
543	NC_015686	T	6	6	21822	21827	0 %	100 %	0 %	0 %	337735051
544	NC_015686	CTT	2	6	21862	21867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_015686	T	6	6	21885	21890	0 %	100 %	0 %	0 %	337735052
546	NC_015686	T	9	9	21904	21912	0 %	100 %	0 %	0 %	337735052
547	NC_015686	AT	3	6	21955	21960	50 %	50 %	0 %	0 %	337735052
548	NC_015686	GTT	2	6	22012	22017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735052
549	NC_015686	A	6	6	22094	22099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015686	CCT	2	6	22100	22105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_015686	ATA	2	6	22112	22117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015686	A	6	6	22129	22134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015686	TAT	2	6	22136	22141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015686	GTAG	2	8	22197	22204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015686	TTA	2	6	22205	22210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015686	CTGG	2	8	22261	22268	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
557	NC_015686	TTA	2	6	22280	22285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735053
558	NC_015686	CTTTT	2	10	22296	22305	0 %	80 %	0 %	20 %	337735053
559	NC_015686	T	6	6	22302	22307	0 %	100 %	0 %	0 %	337735053
560	NC_015686	AT	3	6	22337	22342	50 %	50 %	0 %	0 %	337735053
561	NC_015686	TGA	2	6	22392	22397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735053
562	NC_015686	AAAT	2	8	22416	22423	75 %	25 %	0 %	0 %	337735053
563	NC_015686	CAT	2	6	22433	22438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735053
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567	NC_015686	CTA	2	6	22621	22626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735053
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570	NC_015686	ATA	2	6	22909	22914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735053
571	NC_015686	A	8	8	22920	22927	100 %	0 %	0 %	0 %	337735053
572	NC_015686	AGT	2	6	22952	22957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735053
573	NC_015686	ATA	2	6	23221	23226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735053
574	NC_015686	TAG	2	6	23240	23245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735053
575	NC_015686	TAC	2	6	23255	23260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735053
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577	NC_015686	TAAAG	2	10	23333	23342	60 %	20 %	20 %	0 %	337735053
578	NC_015686	TGCT	2	8	23349	23356	0 %	50 %	25 %	25 %	337735053
579	NC_015686	TG	3	6	23383	23388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015686	TAT	2	6	23412	23417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015686	ATT	3	9	23435	23443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015686	CTT	2	6	23510	23515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735054
583	NC_015686	T	7	7	23514	23520	0 %	100 %	0 %	0 %	337735054
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589	NC_015686	AT	3	6	23751	23756	50 %	50 %	0 %	0 %	337735054
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591	NC_015686	TAAA	2	8	23870	23877	75 %	25 %	0 %	0 %	337735054
592	NC_015686	A	6	6	23875	23880	100 %	0 %	0 %	0 %	337735054
593	NC_015686	TAG	2	6	23925	23930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735054
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595	NC_015686	TAT	2	6	23995	24000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015686	TA	3	6	24012	24017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015686	ATT	2	6	24052	24057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_015686	ATATT	2	10	24097	24106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015686	TTG	2	6	24109	24114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015686	ATT	2	6	24119	24124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015686	AT	3	6	24142	24147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015686	GTA	2	6	24152	24157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015686	TAAA	2	8	24165	24172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015686	T	7	7	24203	24209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015686	TA	3	6	24221	24226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015686	T	9	9	24311	24319	0 %	100 %	0 %	0 %	337735055
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611	NC_015686	A	7	7	24477	24483	100 %	0 %	0 %	0 %	337735055
612	NC_015686	ATTA	2	8	24536	24543	50 %	50 %	0 %	0 %	337735055
613	NC_015686	GCTT	2	8	24567	24574	0 %	50 %	25 %	25 %	337735055
614	NC_015686	AAC	2	6	24585	24590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735055
615	NC_015686	A	6	6	24632	24637	100 %	0 %	0 %	0 %	337735055
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617	NC_015686	TTC	2	6	24692	24697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735055
618	NC_015686	A	6	6	24721	24726	100 %	0 %	0 %	0 %	337735055
619	NC_015686	TTCTTT	2	12	24752	24763	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	337735055
620	NC_015686	T	6	6	24790	24795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015686	ATA	2	6	24904	24909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015686	TA	3	6	25062	25067	50 %	50 %	0 %	0 %	337735056
623	NC_015686	TGAAT	2	10	25106	25115	40 %	40 %	20 %	0 %	337735056
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627	NC_015686	CA	3	6	25299	25304	50 %	0 %	0 %	50 %	337735056
628	NC_015686	T	6	6	25329	25334	0 %	100 %	0 %	0 %	337735056
629	NC_015686	GAA	2	6	25377	25382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735056
630	NC_015686	GCA	2	6	25386	25391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735056
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632	NC_015686	A	6	6	25580	25585	100 %	0 %	0 %	0 %	337735056
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