MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium ulcerans BR-AD22 chromosome

Total Repeats: 1514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015683	GCAGA	2	10	713	722	40 %	0 %	40 %	20 %	337289621
2	NC_015683	ACCAC	2	10	1707	1716	40 %	0 %	0 %	60 %	337289621
3	NC_015683	TCAAC	2	10	3057	3066	40 %	20 %	0 %	40 %	337289622
4	NC_015683	AAGGA	2	10	3858	3867	60 %	0 %	40 %	0 %	337289623
5	NC_015683	GCTCA	2	10	4633	4642	20 %	20 %	20 %	40 %	337289623
6	NC_015683	TAGGG	2	10	5457	5466	20 %	20 %	60 %	0 %	337289624
7	NC_015683	CACGC	2	10	5767	5776	20 %	0 %	20 %	60 %	337289625
8	NC_015683	TGCCG	2	10	10103	10112	0 %	20 %	40 %	40 %	337289629
9	NC_015683	TGGTT	2	10	10316	10325	0 %	60 %	40 %	0 %	337289629
10	NC_015683	CGGTG	2	10	13105	13114	0 %	20 %	60 %	20 %	337289631
11	NC_015683	CAGTA	2	10	14699	14708	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015683	ATTTG	2	10	16030	16039	20 %	60 %	20 %	0 %	337289634
13	NC_015683	CTTTT	2	10	19351	19360	0 %	80 %	0 %	20 %	337289638
14	NC_015683	GCAAA	2	10	22096	22105	60 %	0 %	20 %	20 %	337289639
15	NC_015683	TTGCT	2	10	25531	25540	0 %	60 %	20 %	20 %	337289645
16	NC_015683	GGTAC	2	10	26564	26573	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015683	TTCGC	2	10	29613	29622	0 %	40 %	20 %	40 %	337289649
18	NC_015683	TGTCT	2	10	30308	30317	0 %	60 %	20 %	20 %	337289649
19	NC_015683	GGATG	2	10	31993	32002	20 %	20 %	60 %	0 %	337289650
20	NC_015683	AAGCG	2	10	32039	32048	40 %	0 %	40 %	20 %	337289650
21	NC_015683	TGCGA	2	10	32436	32445	20 %	20 %	40 %	20 %	337289650
22	NC_015683	CCCAG	2	10	32719	32728	20 %	0 %	20 %	60 %	337289650
23	NC_015683	CTGTT	2	10	33261	33270	0 %	60 %	20 %	20 %	337289651
24	NC_015683	AAAGC	2	10	34996	35005	60 %	0 %	20 %	20 %	337289652
25	NC_015683	CTGGA	2	10	36940	36949	20 %	20 %	40 %	20 %	337289654
26	NC_015683	CAGAC	2	10	42284	42293	40 %	0 %	20 %	40 %	337289659
27	NC_015683	TGCGG	2	10	43429	43438	0 %	20 %	60 %	20 %	337289660
28	NC_015683	CTGAT	2	10	43981	43990	20 %	40 %	20 %	20 %	337289661
29	NC_015683	CTCTT	2	10	44621	44630	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015683	GGAGC	2	10	44978	44987	20 %	0 %	60 %	20 %	337289662
31	NC_015683	CATCA	2	10	47461	47470	40 %	20 %	0 %	40 %	337289664
32	NC_015683	CTTTT	2	10	52052	52061	0 %	80 %	0 %	20 %	337289667
33	NC_015683	GACGG	2	10	52486	52495	20 %	0 %	60 %	20 %	337289667
34	NC_015683	TGAGG	2	10	52899	52908	20 %	20 %	60 %	0 %	337289667
35	NC_015683	ATCTG	2	10	54236	54245	20 %	40 %	20 %	20 %	337289669
36	NC_015683	TCATG	2	10	56890	56899	20 %	40 %	20 %	20 %	337289670
37	NC_015683	AACGG	2	10	57827	57836	40 %	0 %	40 %	20 %	337289672
38	NC_015683	CCTAT	2	10	57957	57966	20 %	40 %	0 %	40 %	337289672
39	NC_015683	GAGAA	2	10	59003	59012	60 %	0 %	40 %	0 %	337289673
40	NC_015683	CCCGG	2	10	59745	59754	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_015683	AAAAG	2	10	60274	60283	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015683	CGTTC	2	10	60508	60517	0 %	40 %	20 %	40 %	337289674
43	NC_015683	TGTGG	2	10	66997	67006	0 %	40 %	60 %	0 %	337289681
44	NC_015683	CTTTC	2	10	67428	67437	0 %	60 %	0 %	40 %	337289681
45	NC_015683	ATGCC	2	10	69979	69988	20 %	20 %	20 %	40 %	337289684
46	NC_015683	GCCTC	2	10	73965	73974	0 %	20 %	20 %	60 %	337289686
47	NC_015683	CAGTG	2	10	81042	81051	20 %	20 %	40 %	20 %	337289693
48	NC_015683	AGTGA	2	10	81434	81443	40 %	20 %	40 %	0 %	337289693
49	NC_015683	GCAGC	2	10	84389	84398	20 %	0 %	40 %	40 %	337289698
50	NC_015683	GACTG	2	10	84405	84414	20 %	20 %	40 %	20 %	337289698
51	NC_015683	CAAGG	2	10	86650	86659	40 %	0 %	40 %	20 %	337289700
52	NC_015683	GCAAA	2	10	91554	91563	60 %	0 %	20 %	20 %	337289706
53	NC_015683	TGGTG	2	10	96558	96567	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015683	CCCAG	2	10	96838	96847	20 %	0 %	20 %	60 %	337289712
55	NC_015683	CCAAA	2	10	96886	96895	60 %	0 %	0 %	40 %	337289712
56	NC_015683	CTTCC	2	10	100407	100416	0 %	40 %	0 %	60 %	337289713
57	NC_015683	GAACG	2	10	102906	102915	40 %	0 %	40 %	20 %	337289715
58	NC_015683	TCCAC	2	10	104223	104232	20 %	20 %	0 %	60 %	337289716
59	NC_015683	TCTCT	2	10	104560	104569	0 %	60 %	0 %	40 %	337289717
60	NC_015683	AGCCG	2	10	110122	110131	20 %	0 %	40 %	40 %	337289723
61	NC_015683	CGCGT	2	10	115069	115078	0 %	20 %	40 %	40 %	337289726
62	NC_015683	CGTAG	2	10	116574	116583	20 %	20 %	40 %	20 %	337289727
63	NC_015683	GCGGT	2	10	117256	117265	0 %	20 %	60 %	20 %	337289727
64	NC_015683	CATGT	2	10	121817	121826	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015683	ACTGA	2	10	122883	122892	40 %	20 %	20 %	20 %	337289733
66	NC_015683	AAGCT	2	10	123569	123578	40 %	20 %	20 %	20 %	337289733
67	NC_015683	TGGCA	2	10	123991	124000	20 %	20 %	40 %	20 %	337289734
68	NC_015683	AAAAT	2	10	124801	124810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015683	TAATT	2	10	126585	126594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015683	TCCGG	2	10	127573	127582	0 %	20 %	40 %	40 %	337289738
71	NC_015683	CAACA	2	10	128482	128491	60 %	0 %	0 %	40 %	337289739
72	NC_015683	AGCTG	2	10	128513	128522	20 %	20 %	40 %	20 %	337289739
73	NC_015683	ACTTC	2	10	131838	131847	20 %	40 %	0 %	40 %	337289742
74	NC_015683	GTTGA	2	10	134077	134086	20 %	40 %	40 %	0 %	337289744
75	NC_015683	AGCGC	2	10	135166	135175	20 %	0 %	40 %	40 %	337289744
76	NC_015683	ATGGG	2	10	136176	136185	20 %	20 %	60 %	0 %	337289745
77	NC_015683	TTGGA	2	10	139007	139016	20 %	40 %	40 %	0 %	337289749
78	NC_015683	GTGAA	2	10	139630	139639	40 %	20 %	40 %	0 %	337289750
79	NC_015683	TGGGA	2	10	140219	140228	20 %	20 %	60 %	0 %	337289752
80	NC_015683	TGGGG	2	10	141227	141236	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015683	TGCTT	2	10	141925	141934	0 %	60 %	20 %	20 %	337289753
82	NC_015683	TGCAA	2	10	147900	147909	40 %	20 %	20 %	20 %	337289759
83	NC_015683	GCTGG	2	10	148563	148572	0 %	20 %	60 %	20 %	337289760
84	NC_015683	TTGCT	2	10	148925	148934	0 %	60 %	20 %	20 %	337289760
85	NC_015683	AACGC	2	10	151488	151497	40 %	0 %	20 %	40 %	337289762
86	NC_015683	ACCAA	2	10	152398	152407	60 %	0 %	0 %	40 %	337289762
87	NC_015683	TTCAT	2	10	153666	153675	20 %	60 %	0 %	20 %	337289763
88	NC_015683	CGGTG	2	10	155912	155921	0 %	20 %	60 %	20 %	337289764
89	NC_015683	AGAAA	2	10	162366	162375	80 %	0 %	20 %	0 %	337289771
90	NC_015683	CTTTT	2	10	163538	163547	0 %	80 %	0 %	20 %	337289773
91	NC_015683	ATCCC	2	10	166772	166781	20 %	20 %	0 %	60 %	337289776
92	NC_015683	TGCGA	2	10	167296	167305	20 %	20 %	40 %	20 %	337289777
93	NC_015683	TGAGC	2	10	167656	167665	20 %	20 %	40 %	20 %	337289777
94	NC_015683	AGGTG	2	10	169426	169435	20 %	20 %	60 %	0 %	337289779
95	NC_015683	ATGCC	2	10	171714	171723	20 %	20 %	20 %	40 %	337289780
96	NC_015683	GGATG	2	10	175983	175992	20 %	20 %	60 %	0 %	337289782
97	NC_015683	TGGCC	2	10	177980	177989	0 %	20 %	40 %	40 %	337289784
98	NC_015683	ACAGA	2	10	181069	181078	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015683	GGGTT	2	10	183116	183125	0 %	40 %	60 %	0 %	337289790
100	NC_015683	TTGGA	2	10	183138	183147	20 %	40 %	40 %	0 %	337289790
101	NC_015683	TGTCG	2	10	185157	185166	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015683	AGTTC	2	10	185258	185267	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015683	TTAGA	2	10	186317	186326	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015683	ATTCC	2	10	193883	193892	20 %	40 %	0 %	40 %	337289799
105	NC_015683	GCCGG	2	10	195364	195373	0 %	0 %	60 %	40 %	337289800
106	NC_015683	CAGTG	2	10	201581	201590	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015683	TATTT	2	10	203116	203125	20 %	80 %	0 %	0 %	337289806
108	NC_015683	GAAGT	2	10	206749	206758	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015683	TGAAC	2	10	207620	207629	40 %	20 %	20 %	20 %	337289810
110	NC_015683	GGCGA	2	10	207765	207774	20 %	0 %	60 %	20 %	337289810
111	NC_015683	ACGTG	2	10	208794	208803	20 %	20 %	40 %	20 %	337289811
112	NC_015683	GCCAG	2	10	209350	209359	20 %	0 %	40 %	40 %	337289812
113	NC_015683	CGAGG	2	10	210062	210071	20 %	0 %	60 %	20 %	337289812
114	NC_015683	GTACC	2	10	212512	212521	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_015683	TTTCT	2	10	214467	214476	0 %	80 %	0 %	20 %	337289816
116	NC_015683	TGCGG	2	10	216262	216271	0 %	20 %	60 %	20 %	337289819
117	NC_015683	AAGGT	2	10	219902	219911	40 %	20 %	40 %	0 %	337289822
118	NC_015683	CCTTG	2	10	220951	220960	0 %	40 %	20 %	40 %	337289823
119	NC_015683	GCATA	2	10	222676	222685	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015683	GCGCT	2	10	227511	227520	0 %	20 %	40 %	40 %	337289828
121	NC_015683	CTGGA	2	10	229614	229623	20 %	20 %	40 %	20 %	337289829
122	NC_015683	ACGGT	2	10	230115	230124	20 %	20 %	40 %	20 %	337289829
123	NC_015683	ATTTT	2	10	231009	231018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015683	GCCGC	2	10	234839	234848	0 %	0 %	40 %	60 %	337289831
125	NC_015683	CGCAT	2	10	235511	235520	20 %	20 %	20 %	40 %	337289831
126	NC_015683	GGGCA	2	10	238713	238722	20 %	0 %	60 %	20 %	337289834
127	NC_015683	GTGGA	2	10	243275	243284	20 %	20 %	60 %	0 %	337289836
128	NC_015683	AAGAC	2	10	244078	244087	60 %	0 %	20 %	20 %	337289836
129	NC_015683	CATTG	2	10	245129	245138	20 %	40 %	20 %	20 %	337289837
130	NC_015683	CACGG	2	10	248031	248040	20 %	0 %	40 %	40 %	337289839
131	NC_015683	TAATA	2	10	248476	248485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015683	AAATG	2	10	249558	249567	60 %	20 %	20 %	0 %	337289840
133	NC_015683	TGCGC	2	10	252664	252673	0 %	20 %	40 %	40 %	337289842
134	NC_015683	CGATT	2	10	254192	254201	20 %	40 %	20 %	20 %	337289842
135	NC_015683	GACCC	2	10	256181	256190	20 %	0 %	20 %	60 %	337289844
136	NC_015683	GTAGC	2	10	258776	258785	20 %	20 %	40 %	20 %	337289847
137	NC_015683	TGGTG	2	10	258915	258924	0 %	40 %	60 %	0 %	337289847
138	NC_015683	GCAGT	2	10	260265	260274	20 %	20 %	40 %	20 %	337289848
139	NC_015683	AATGC	2	10	260537	260546	40 %	20 %	20 %	20 %	337289848
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144	NC_015683	GGCGC	2	10	278532	278541	0 %	0 %	60 %	40 %	337289863
145	NC_015683	TGCGC	2	10	278787	278796	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_015683	TGGCA	2	10	279607	279616	20 %	20 %	40 %	20 %	337289866
147	NC_015683	GAGCC	2	10	280497	280506	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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149	NC_015683	CGGGG	2	10	288483	288492	0 %	0 %	80 %	20 %	337289876
150	NC_015683	GAAAA	2	10	288623	288632	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015683	ATAAA	2	10	289100	289109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015683	AGTTC	2	10	289582	289591	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_015683	CGAGA	2	10	289946	289955	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_015683	TGCGC	2	10	291607	291616	0 %	20 %	40 %	40 %	337289878
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156	NC_015683	TGGCT	2	10	296724	296733	0 %	40 %	40 %	20 %	337289884
157	NC_015683	CAGGA	2	10	304137	304146	40 %	0 %	40 %	20 %	337289888
158	NC_015683	TGCGT	2	10	305912	305921	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_015683	TGCGT	2	10	309223	309232	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
160	NC_015683	GCAGC	2	10	312855	312864	20 %	0 %	40 %	40 %	337289898
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172	NC_015683	GAATG	2	10	346960	346969	40 %	20 %	40 %	0 %	337289930
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174	NC_015683	CTGGA	2	10	352716	352725	20 %	20 %	40 %	20 %	337289937
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176	NC_015683	GATCG	2	10	359561	359570	20 %	20 %	40 %	20 %	337289942
177	NC_015683	CATCG	2	10	361915	361924	20 %	20 %	20 %	40 %	337289944
178	NC_015683	GGTGC	2	10	362027	362036	0 %	20 %	60 %	20 %	337289944
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203	NC_015683	CAGAT	2	10	390415	390424	40 %	20 %	20 %	20 %	337289973
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226	NC_015683	ATGCA	2	10	431248	431257	40 %	20 %	20 %	20 %	337290004
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236	NC_015683	GGAAA	2	10	451087	451096	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
237	NC_015683	TTTGG	2	10	451574	451583	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
238	NC_015683	GAAAA	2	10	455882	455891	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
239	NC_015683	TGCTT	2	10	456750	456759	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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242	NC_015683	CGGTG	2	10	458880	458889	0 %	20 %	60 %	20 %	337290035
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245	NC_015683	GCGTT	2	10	471713	471722	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
246	NC_015683	GTGAT	2	10	473791	473800	20 %	40 %	40 %	0 %	337290052
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249	NC_015683	ATGGG	2	10	476999	477008	20 %	20 %	60 %	0 %	337290053
250	NC_015683	GGCAG	2	10	477637	477646	20 %	0 %	60 %	20 %	337290054
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252	NC_015683	CAGCT	2	10	479267	479276	20 %	20 %	20 %	40 %	337290057
253	NC_015683	AGGAA	2	10	479474	479483	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
254	NC_015683	TTAGA	2	10	481921	481930	40 %	40 %	20 %	0 %	337290061
255	NC_015683	GCGCC	2	10	483137	483146	0 %	0 %	40 %	60 %	337290063
256	NC_015683	CGTTG	2	10	483946	483955	0 %	40 %	40 %	20 %	337290063
257	NC_015683	AGGAA	2	10	484383	484392	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
258	NC_015683	CGAGT	2	10	485574	485583	20 %	20 %	40 %	20 %	337290065
259	NC_015683	CAGAA	2	10	489766	489775	60 %	0 %	20 %	20 %	337290067
260	NC_015683	CTGCG	2	10	490390	490399	0 %	20 %	40 %	40 %	337290067
261	NC_015683	TGAGA	2	10	491994	492003	40 %	20 %	40 %	0 %	337290068
262	NC_015683	GACTC	2	10	494839	494848	20 %	20 %	20 %	40 %	337290073
263	NC_015683	GATCA	2	10	495620	495629	40 %	20 %	20 %	20 %	337290073
264	NC_015683	GGGGA	2	10	499851	499860	20 %	0 %	80 %	0 %	337290078
265	NC_015683	TCAAC	2	10	500852	500861	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
266	NC_015683	GAGCA	2	10	503422	503431	40 %	0 %	40 %	20 %	337290081
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395	NC_015683	TAAAC	2	10	759722	759731	60 %	20 %	0 %	20 %	337290308
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