MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 2143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015470	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015470	GT	3	6	309	314	0 %	50 %	50 %	0 %	332286960
3	NC_015470	TG	3	6	498	503	0 %	50 %	50 %	0 %	332286960
4	NC_015470	TC	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	332286960
5	NC_015470	AC	3	6	1295	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	332286961
6	NC_015470	GT	3	6	1461	1466	0 %	50 %	50 %	0 %	332286961
7	NC_015470	TC	3	6	1584	1589	0 %	50 %	0 %	50 %	332286961
8	NC_015470	TG	3	6	1888	1893	0 %	50 %	50 %	0 %	332286961
9	NC_015470	GA	3	6	2786	2791	50 %	0 %	50 %	0 %	332286962
10	NC_015470	GA	3	6	3340	3345	50 %	0 %	50 %	0 %	332286963
11	NC_015470	AT	3	6	4227	4232	50 %	50 %	0 %	0 %	332286963
12	NC_015470	CT	3	6	4729	4734	0 %	50 %	0 %	50 %	332286963
13	NC_015470	CT	3	6	6469	6474	0 %	50 %	0 %	50 %	332286964
14	NC_015470	GA	3	6	6893	6898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015470	GT	3	6	7804	7809	0 %	50 %	50 %	0 %	332286965
16	NC_015470	TC	3	6	7875	7880	0 %	50 %	0 %	50 %	332286965
17	NC_015470	AT	3	6	8464	8469	50 %	50 %	0 %	0 %	332286966
18	NC_015470	GT	3	6	8687	8692	0 %	50 %	50 %	0 %	332286966
19	NC_015470	AG	3	6	9231	9236	50 %	0 %	50 %	0 %	332286966
20	NC_015470	TG	3	6	10493	10498	0 %	50 %	50 %	0 %	332286966
21	NC_015470	TC	3	6	11263	11268	0 %	50 %	0 %	50 %	332286967
22	NC_015470	AC	3	6	11279	11284	50 %	0 %	0 %	50 %	332286967
23	NC_015470	AT	3	6	11523	11528	50 %	50 %	0 %	0 %	332286967
24	NC_015470	GA	3	6	11602	11607	50 %	0 %	50 %	0 %	332286967
25	NC_015470	AG	3	6	11790	11795	50 %	0 %	50 %	0 %	332286967
26	NC_015470	TC	3	6	11843	11848	0 %	50 %	0 %	50 %	332286967
27	NC_015470	GT	3	6	12058	12063	0 %	50 %	50 %	0 %	332286967
28	NC_015470	GA	3	6	12446	12451	50 %	0 %	50 %	0 %	332286967
29	NC_015470	AG	3	6	12515	12520	50 %	0 %	50 %	0 %	332286967
30	NC_015470	GA	3	6	12586	12591	50 %	0 %	50 %	0 %	332286967
31	NC_015470	GT	3	6	12867	12872	0 %	50 %	50 %	0 %	332286967
32	NC_015470	TA	3	6	13807	13812	50 %	50 %	0 %	0 %	332286967
33	NC_015470	TA	3	6	13827	13832	50 %	50 %	0 %	0 %	332286967
34	NC_015470	AT	3	6	14111	14116	50 %	50 %	0 %	0 %	332286968
35	NC_015470	CT	3	6	14791	14796	0 %	50 %	0 %	50 %	332286968
36	NC_015470	TA	3	6	15121	15126	50 %	50 %	0 %	0 %	332286968
37	NC_015470	TG	4	8	15659	15666	0 %	50 %	50 %	0 %	332286968
38	NC_015470	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015470	TC	3	6	18953	18958	0 %	50 %	0 %	50 %	332286972
40	NC_015470	GT	3	6	19394	19399	0 %	50 %	50 %	0 %	332286972
41	NC_015470	TA	3	6	19438	19443	50 %	50 %	0 %	0 %	332286972
42	NC_015470	TC	3	6	19544	19549	0 %	50 %	0 %	50 %	332286972
43	NC_015470	GT	3	6	19673	19678	0 %	50 %	50 %	0 %	332286972
44	NC_015470	AC	3	6	20114	20119	50 %	0 %	0 %	50 %	332286972
45	NC_015470	TC	3	6	21145	21150	0 %	50 %	0 %	50 %	332286973
46	NC_015470	GA	3	6	22447	22452	50 %	0 %	50 %	0 %	332286974
47	NC_015470	GA	3	6	23670	23675	50 %	0 %	50 %	0 %	332286974
48	NC_015470	TA	3	6	25504	25509	50 %	50 %	0 %	0 %	332286975
49	NC_015470	AG	3	6	25611	25616	50 %	0 %	50 %	0 %	332286975
50	NC_015470	TA	3	6	26514	26519	50 %	50 %	0 %	0 %	332286975
51	NC_015470	TA	3	6	27373	27378	50 %	50 %	0 %	0 %	332286976
52	NC_015470	TC	3	6	27458	27463	0 %	50 %	0 %	50 %	332286976
53	NC_015470	TA	3	6	28050	28055	50 %	50 %	0 %	0 %	332286976
54	NC_015470	AG	3	6	29925	29930	50 %	0 %	50 %	0 %	332286978
55	NC_015470	AG	3	6	30586	30591	50 %	0 %	50 %	0 %	332286979
56	NC_015470	GA	3	6	31108	31113	50 %	0 %	50 %	0 %	332286980
57	NC_015470	GA	4	8	31238	31245	50 %	0 %	50 %	0 %	332286980
58	NC_015470	TC	3	6	31851	31856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015470	GT	3	6	33082	33087	0 %	50 %	50 %	0 %	332286982
60	NC_015470	AG	3	6	34611	34616	50 %	0 %	50 %	0 %	332286985
61	NC_015470	AG	3	6	34683	34688	50 %	0 %	50 %	0 %	332286985
62	NC_015470	AT	3	6	34729	34734	50 %	50 %	0 %	0 %	332286985
63	NC_015470	TG	3	6	34818	34823	0 %	50 %	50 %	0 %	332286985
64	NC_015470	CG	3	6	35130	35135	0 %	0 %	50 %	50 %	332286985
65	NC_015470	AT	3	6	35449	35454	50 %	50 %	0 %	0 %	332286985
66	NC_015470	GA	3	6	35930	35935	50 %	0 %	50 %	0 %	332286986
67	NC_015470	TA	3	6	37503	37508	50 %	50 %	0 %	0 %	332286986
68	NC_015470	TC	3	6	37741	37746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015470	GA	3	6	38473	38478	50 %	0 %	50 %	0 %	332286987
70	NC_015470	CG	3	6	38502	38507	0 %	0 %	50 %	50 %	332286987
71	NC_015470	TA	3	6	38508	38513	50 %	50 %	0 %	0 %	332286987
72	NC_015470	GC	3	6	39840	39845	0 %	0 %	50 %	50 %	332286989
73	NC_015470	AG	3	6	39851	39856	50 %	0 %	50 %	0 %	332286989
74	NC_015470	AG	3	6	40731	40736	50 %	0 %	50 %	0 %	332286990
75	NC_015470	GC	3	6	41448	41453	0 %	0 %	50 %	50 %	332286990
76	NC_015470	AT	3	6	41780	41785	50 %	50 %	0 %	0 %	332286990
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82	NC_015470	TC	4	8	47823	47830	0 %	50 %	0 %	50 %	332286998
83	NC_015470	TA	3	6	48252	48257	50 %	50 %	0 %	0 %	332286999
84	NC_015470	AT	3	6	48266	48271	50 %	50 %	0 %	0 %	332286999
85	NC_015470	AT	3	6	48518	48523	50 %	50 %	0 %	0 %	332286999
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88	NC_015470	AG	3	6	49406	49411	50 %	0 %	50 %	0 %	332286999
89	NC_015470	GC	3	6	49975	49980	0 %	0 %	50 %	50 %	332287000
90	NC_015470	TC	3	6	50380	50385	0 %	50 %	0 %	50 %	332287000
91	NC_015470	TA	3	6	50553	50558	50 %	50 %	0 %	0 %	332287000
92	NC_015470	TA	3	6	52215	52220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015470	GT	3	6	53105	53110	0 %	50 %	50 %	0 %	332287001
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95	NC_015470	AG	3	6	55435	55440	50 %	0 %	50 %	0 %	332287004
96	NC_015470	AG	4	8	56049	56056	50 %	0 %	50 %	0 %	332287004
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102	NC_015470	AG	3	6	60307	60312	50 %	0 %	50 %	0 %	332287009
103	NC_015470	AG	3	6	60608	60613	50 %	0 %	50 %	0 %	332287009
104	NC_015470	GA	3	6	61852	61857	50 %	0 %	50 %	0 %	332287009
105	NC_015470	AG	3	6	62140	62145	50 %	0 %	50 %	0 %	332287009
106	NC_015470	TC	3	6	62592	62597	0 %	50 %	0 %	50 %	332287009
107	NC_015470	AG	3	6	63235	63240	50 %	0 %	50 %	0 %	332287009
108	NC_015470	TG	3	6	63308	63313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015470	TC	3	6	64788	64793	0 %	50 %	0 %	50 %	332287011
110	NC_015470	TG	3	6	65553	65558	0 %	50 %	50 %	0 %	332287011
111	NC_015470	CA	4	8	65840	65847	50 %	0 %	0 %	50 %	332287011
112	NC_015470	GA	4	8	66579	66586	50 %	0 %	50 %	0 %	332287012
113	NC_015470	AT	3	6	67358	67363	50 %	50 %	0 %	0 %	332287013
114	NC_015470	GA	4	8	67465	67472	50 %	0 %	50 %	0 %	332287013
115	NC_015470	AG	3	6	67578	67583	50 %	0 %	50 %	0 %	332287013
116	NC_015470	TG	3	6	67927	67932	0 %	50 %	50 %	0 %	332287013
117	NC_015470	GT	3	6	68171	68176	0 %	50 %	50 %	0 %	332287013
118	NC_015470	TA	3	6	68612	68617	50 %	50 %	0 %	0 %	332287014
119	NC_015470	TA	3	6	69315	69320	50 %	50 %	0 %	0 %	332287014
120	NC_015470	AG	3	6	70238	70243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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122	NC_015470	GT	3	6	72037	72042	0 %	50 %	50 %	0 %	332287017
123	NC_015470	GT	3	6	73699	73704	0 %	50 %	50 %	0 %	332287019
124	NC_015470	GA	3	6	74641	74646	50 %	0 %	50 %	0 %	332287020
125	NC_015470	TC	3	6	75229	75234	0 %	50 %	0 %	50 %	332287021
126	NC_015470	TC	3	6	76034	76039	0 %	50 %	0 %	50 %	332287021
127	NC_015470	GC	3	6	76266	76271	0 %	0 %	50 %	50 %	332287022
128	NC_015470	TC	3	6	76333	76338	0 %	50 %	0 %	50 %	332287022
129	NC_015470	TC	3	6	76436	76441	0 %	50 %	0 %	50 %	332287022
130	NC_015470	CA	3	6	76571	76576	50 %	0 %	0 %	50 %	332287022
131	NC_015470	CT	3	6	76759	76764	0 %	50 %	0 %	50 %	332287022
132	NC_015470	CG	3	6	76869	76874	0 %	0 %	50 %	50 %	332287022
133	NC_015470	GA	3	6	78860	78865	50 %	0 %	50 %	0 %	332287023
134	NC_015470	AG	3	6	79194	79199	50 %	0 %	50 %	0 %	332287023
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136	NC_015470	AC	3	6	80329	80334	50 %	0 %	0 %	50 %	332287024
137	NC_015470	AG	3	6	81218	81223	50 %	0 %	50 %	0 %	332287025
138	NC_015470	CT	3	6	81398	81403	0 %	50 %	0 %	50 %	332287025
139	NC_015470	AC	3	6	81745	81750	50 %	0 %	0 %	50 %	332287025
140	NC_015470	AC	3	6	81947	81952	50 %	0 %	0 %	50 %	332287026
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142	NC_015470	AC	3	6	82325	82330	50 %	0 %	0 %	50 %	332287026
143	NC_015470	TG	3	6	82804	82809	0 %	50 %	50 %	0 %	332287026
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