MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015470	TCCT	2	8	143316	143323	0 %	50 %	0 %	50 %	332287095
3002	NC_015470	GTT	2	6	143337	143342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287095
3003	NC_015470	AGAAA	2	10	143347	143356	80 %	0 %	20 %	0 %	332287095
3004	NC_015470	ATT	2	6	143359	143364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287095
3005	NC_015470	TAC	2	6	143377	143382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287095
3006	NC_015470	TGA	2	6	143521	143526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287095
3007	NC_015470	TAC	2	6	143556	143561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287095
3008	NC_015470	CAG	2	6	143565	143570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287095
3009	NC_015470	TTG	3	9	143625	143633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287095
3010	NC_015470	TA	3	6	143688	143693	50 %	50 %	0 %	0 %	332287095
3011	NC_015470	ATG	2	6	143796	143801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287095
3012	NC_015470	TAT	2	6	143815	143820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287095
3013	NC_015470	ATT	2	6	143867	143872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287095
3014	NC_015470	TAG	2	6	143904	143909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287095
3015	NC_015470	TTC	2	6	143910	143915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287095
3016	NC_015470	GTG	2	6	143916	143921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287095
3017	NC_015470	AGA	2	6	143922	143927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287095
3018	NC_015470	TTG	2	6	143933	143938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287095
3019	NC_015470	TTA	2	6	144032	144037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287096
3020	NC_015470	AAT	2	6	144069	144074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287096
3021	NC_015470	GAG	2	6	144098	144103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287096
3022	NC_015470	TCTA	2	8	144141	144148	25 %	50 %	0 %	25 %	332287096
3023	NC_015470	T	6	6	144234	144239	0 %	100 %	0 %	0 %	332287096
3024	NC_015470	TTG	2	6	144269	144274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287096
3025	NC_015470	ATA	2	6	144434	144439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287096
3026	NC_015470	CAG	2	6	144442	144447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287096
3027	NC_015470	TAG	2	6	144452	144457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287096
3028	NC_015470	ATCA	2	8	144492	144499	50 %	25 %	0 %	25 %	332287096
3029	NC_015470	CAA	2	6	144632	144637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287096
3030	NC_015470	TGT	2	6	144664	144669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287096
3031	NC_015470	AT	3	6	144768	144773	50 %	50 %	0 %	0 %	332287096
3032	NC_015470	T	6	6	144825	144830	0 %	100 %	0 %	0 %	332287096
3033	NC_015470	AAT	2	6	144844	144849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287096
3034	NC_015470	TGAA	2	8	144856	144863	50 %	25 %	25 %	0 %	332287096
3035	NC_015470	GGAA	3	12	144864	144875	50 %	0 %	50 %	0 %	332287096
3036	NC_015470	TCC	2	6	144876	144881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287096
3037	NC_015470	AGTA	2	8	144897	144904	50 %	25 %	25 %	0 %	332287096
3038	NC_015470	A	7	7	144913	144919	100 %	0 %	0 %	0 %	332287096
3039	NC_015470	TAT	2	6	144990	144995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_015470	TAA	2	6	144997	145002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015470	AAT	2	6	145083	145088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287097
3042	NC_015470	A	7	7	145116	145122	100 %	0 %	0 %	0 %	332287097
3043	NC_015470	TAT	2	6	145180	145185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287097
3044	NC_015470	T	7	7	145217	145223	0 %	100 %	0 %	0 %	332287097
3045	NC_015470	T	7	7	145268	145274	0 %	100 %	0 %	0 %	332287097
3046	NC_015470	TGTC	2	8	145286	145293	0 %	50 %	25 %	25 %	332287097
3047	NC_015470	TTG	2	6	145294	145299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287097
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3049	NC_015470	TTTA	2	8	145376	145383	25 %	75 %	0 %	0 %	332287097
3050	NC_015470	TTG	2	6	145399	145404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287097
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3052	NC_015470	TTC	2	6	145495	145500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287097
3053	NC_015470	TGTTTT	2	12	145530	145541	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	332287097
3054	NC_015470	ACT	2	6	145549	145554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287097
3055	NC_015470	TTA	2	6	145572	145577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287097
3056	NC_015470	CT	4	8	145666	145673	0 %	50 %	0 %	50 %	332287097
3057	NC_015470	TCC	2	6	145727	145732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287097
3058	NC_015470	T	6	6	145764	145769	0 %	100 %	0 %	0 %	332287097
3059	NC_015470	AGA	2	6	145790	145795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287097
3060	NC_015470	GAT	2	6	145904	145909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287097
3061	NC_015470	TA	3	6	145997	146002	50 %	50 %	0 %	0 %	332287097
3062	NC_015470	AAAGA	2	10	146012	146021	80 %	0 %	20 %	0 %	332287097
3063	NC_015470	AAG	2	6	146028	146033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287097
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3065	NC_015470	TTAT	2	8	146094	146101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_015470	TTAT	2	8	146129	146136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_015470	GTAA	2	8	146150	146157	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3069	NC_015470	TATT	2	8	146334	146341	25 %	75 %	0 %	0 %	332287098
3070	NC_015470	CTTT	2	8	146387	146394	0 %	75 %	0 %	25 %	332287098
3071	NC_015470	CTT	2	6	146414	146419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287098
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3074	NC_015470	A	6	6	146568	146573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_015470	CTT	2	6	146599	146604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_015470	GAA	2	6	146664	146669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_015470	GGT	2	6	146685	146690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_015470	GAA	2	6	146715	146720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_015470	TCT	2	6	146781	146786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_015470	AAG	2	6	146806	146811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_015470	T	6	6	146816	146821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_015470	TCA	2	6	146866	146871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_015470	ATAGGC	2	12	146932	146943	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3084	NC_015470	GAA	2	6	147010	147015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_015470	CTG	2	6	147069	147074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_015470	T	6	6	147092	147097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_015470	TCT	2	6	147115	147120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_015470	CTC	2	6	147158	147163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_015470	GAG	2	6	147193	147198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_015470	T	6	6	147202	147207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_015470	AT	3	6	147213	147218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_015470	A	6	6	147238	147243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_015470	TTG	2	6	147259	147264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_015470	TGA	2	6	147300	147305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_015470	TAC	2	6	147382	147387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_015470	TTTA	2	8	147424	147431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_015470	AATA	2	8	147479	147486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_015470	AGT	2	6	147496	147501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_015470	ATTT	3	12	147537	147548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_015470	T	6	6	147593	147598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_015470	ATT	2	6	147607	147612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_015470	T	6	6	147617	147622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_015470	T	7	7	147701	147707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_015470	ACA	2	6	147717	147722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_015470	A	6	6	147738	147743	100 %	0 %	0 %	0 %	332287099
3106	NC_015470	CTT	2	6	147756	147761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287099
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3108	NC_015470	TGA	2	6	147800	147805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287099
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3110	NC_015470	AAG	2	6	147859	147864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287099
3111	NC_015470	CAT	3	9	147882	147890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287099
3112	NC_015470	TGA	2	6	147909	147914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015470	G	6	6	147919	147924	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_015470	C	6	6	147925	147930	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3115	NC_015470	CAT	2	6	147947	147952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_015470	TTCCGT	2	12	148027	148038	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_015470	T	6	6	148080	148085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_015470	TTTTA	2	10	148191	148200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_015470	T	6	6	148203	148208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015470	ATT	2	6	148264	148269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_015470	TAA	2	6	148274	148279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015470	AGA	2	6	148280	148285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_015470	T	6	6	148352	148357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_015470	GAA	2	6	148414	148419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_015470	CAC	2	6	148473	148478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_015470	CAA	2	6	148564	148569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_015470	TAAG	2	8	148604	148611	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_015470	AAAG	2	8	148634	148641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_015470	T	7	7	148649	148655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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