MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015470	TGC	2	6	118941	118946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287072
2502	NC_015470	GT	3	6	119008	119013	0 %	50 %	50 %	0 %	332287072
2503	NC_015470	GTT	2	6	119074	119079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287072
2504	NC_015470	GAG	2	6	119157	119162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_015470	TTTAC	2	10	119189	119198	20 %	60 %	0 %	20 %	332287073
2506	NC_015470	AGTC	2	8	119218	119225	25 %	25 %	25 %	25 %	332287073
2507	NC_015470	ATG	2	6	119229	119234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287073
2508	NC_015470	AG	4	8	119294	119301	50 %	0 %	50 %	0 %	332287073
2509	NC_015470	ATT	2	6	119367	119372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287073
2510	NC_015470	AGA	2	6	119426	119431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287073
2511	NC_015470	ATC	2	6	119442	119447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287073
2512	NC_015470	TTA	2	6	119466	119471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287073
2513	NC_015470	ATT	2	6	119516	119521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287073
2514	NC_015470	TGG	2	6	119564	119569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287073
2515	NC_015470	AAG	2	6	119602	119607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287073
2516	NC_015470	TAC	2	6	119705	119710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287073
2517	NC_015470	CGT	2	6	119777	119782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287073
2518	NC_015470	AGA	2	6	119801	119806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287073
2519	NC_015470	AAG	2	6	119881	119886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287073
2520	NC_015470	A	6	6	119935	119940	100 %	0 %	0 %	0 %	332287073
2521	NC_015470	GAA	2	6	119948	119953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287073
2522	NC_015470	GAA	2	6	119964	119969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287073
2523	NC_015470	TTC	2	6	120004	120009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287073
2524	NC_015470	AGTT	2	8	120013	120020	25 %	50 %	25 %	0 %	332287073
2525	NC_015470	TTA	2	6	120103	120108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287073
2526	NC_015470	A	6	6	120247	120252	100 %	0 %	0 %	0 %	332287073
2527	NC_015470	AGAA	2	8	120320	120327	75 %	0 %	25 %	0 %	332287074
2528	NC_015470	CCA	2	6	120394	120399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287074
2529	NC_015470	AGAA	2	8	120400	120407	75 %	0 %	25 %	0 %	332287074
2530	NC_015470	ACT	2	6	120413	120418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287074
2531	NC_015470	CGT	2	6	120440	120445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287074
2532	NC_015470	GAT	2	6	120457	120462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287074
2533	NC_015470	AAG	2	6	120546	120551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287074
2534	NC_015470	GGT	2	6	120566	120571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287074
2535	NC_015470	TGG	2	6	120652	120657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287074
2536	NC_015470	TAT	2	6	120712	120717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287074
2537	NC_015470	T	8	8	120741	120748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_015470	ACT	2	6	120758	120763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_015470	TTC	2	6	120843	120848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287075
2540	NC_015470	CAG	2	6	120935	120940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287075
2541	NC_015470	TTG	2	6	120965	120970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287075
2542	NC_015470	A	6	6	121075	121080	100 %	0 %	0 %	0 %	332287075
2543	NC_015470	TAC	2	6	121227	121232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287075
2544	NC_015470	AGA	2	6	121281	121286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287075
2545	NC_015470	ACC	2	6	121297	121302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287075
2546	NC_015470	CGC	2	6	121308	121313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332287075
2547	NC_015470	CA	3	6	121320	121325	50 %	0 %	0 %	50 %	332287075
2548	NC_015470	A	7	7	121347	121353	100 %	0 %	0 %	0 %	332287075
2549	NC_015470	GAA	2	6	121537	121542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287075
2550	NC_015470	GTT	2	6	121552	121557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287075
2551	NC_015470	AAG	2	6	121559	121564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287075
2552	NC_015470	AAG	2	6	121607	121612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287075
2553	NC_015470	TCT	2	6	121618	121623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287075
2554	NC_015470	TTC	2	6	121644	121649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287075
2555	NC_015470	TTA	2	6	121750	121755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287075
2556	NC_015470	TAAA	2	8	121776	121783	75 %	25 %	0 %	0 %	332287075
2557	NC_015470	AGC	2	6	121874	121879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287076
2558	NC_015470	TGT	2	6	121896	121901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287076
2559	NC_015470	T	6	6	121938	121943	0 %	100 %	0 %	0 %	332287076
2560	NC_015470	CTG	2	6	121979	121984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287076
2561	NC_015470	AATTA	2	10	122082	122091	60 %	40 %	0 %	0 %	332287076
2562	NC_015470	AGC	2	6	122097	122102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287076
2563	NC_015470	GAA	2	6	122119	122124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287076
2564	NC_015470	CTC	2	6	122153	122158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287076
2565	NC_015470	CTG	2	6	122168	122173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287076
2566	NC_015470	CTC	2	6	122180	122185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287076
2567	NC_015470	AGA	2	6	122237	122242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287076
2568	NC_015470	A	7	7	122257	122263	100 %	0 %	0 %	0 %	332287076
2569	NC_015470	TAA	2	6	122265	122270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287076
2570	NC_015470	AGT	2	6	122283	122288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287076
2571	NC_015470	ATC	2	6	122292	122297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287076
2572	NC_015470	ATT	2	6	122305	122310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287076
2573	NC_015470	GAA	2	6	122323	122328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287076
2574	NC_015470	GAA	2	6	122335	122340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287076
2575	NC_015470	AAAT	2	8	122349	122356	75 %	25 %	0 %	0 %	332287076
2576	NC_015470	AGA	2	6	122366	122371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287076
2577	NC_015470	ATT	2	6	122379	122384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287076
2578	NC_015470	CCT	2	6	122386	122391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287076
2579	NC_015470	AATT	2	8	122399	122406	50 %	50 %	0 %	0 %	332287076
2580	NC_015470	ATT	2	6	122533	122538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287076
2581	NC_015470	GAA	3	9	122545	122553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287076
2582	NC_015470	CTT	2	6	122591	122596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287076
2583	NC_015470	AGA	2	6	122604	122609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287076
2584	NC_015470	TCT	2	6	122642	122647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_015470	AGT	2	6	122673	122678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_015470	T	6	6	122709	122714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_015470	ATTT	2	8	122758	122765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_015470	AAT	2	6	122770	122775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_015470	ATT	2	6	122790	122795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_015470	TGG	2	6	122803	122808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_015470	CTTTT	2	10	122880	122889	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2592	NC_015470	AAAG	2	8	122933	122940	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_015470	T	6	6	122949	122954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_015470	T	6	6	122967	122972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_015470	T	6	6	123020	123025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_015470	TTTCTT	2	12	123038	123049	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2597	NC_015470	TAAT	2	8	123102	123109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_015470	GCG	2	6	123128	123133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_015470	TTC	3	9	123191	123199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_015470	AT	3	6	123213	123218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_015470	AAC	2	6	123322	123327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287077
2602	NC_015470	AGCA	2	8	123352	123359	50 %	0 %	25 %	25 %	332287077
2603	NC_015470	TCCT	2	8	123361	123368	0 %	50 %	0 %	50 %	332287077
2604	NC_015470	AGAA	2	8	123418	123425	75 %	0 %	25 %	0 %	332287077
2605	NC_015470	GAGAT	2	10	123436	123445	40 %	20 %	40 %	0 %	332287077
2606	NC_015470	ACA	2	6	123491	123496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287077
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2608	NC_015470	TGA	2	6	123545	123550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287077
2609	NC_015470	CAA	2	6	123579	123584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287077
2610	NC_015470	AAG	2	6	123745	123750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287077
2611	NC_015470	TAC	2	6	123780	123785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287077
2612	NC_015470	AGA	3	9	123850	123858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287077
2613	NC_015470	TTG	2	6	123883	123888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287077
2614	NC_015470	TA	4	8	124059	124066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_015470	TTG	2	6	124197	124202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287078
2616	NC_015470	AGC	2	6	124203	124208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287078
2617	NC_015470	AGC	2	6	124281	124286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287078
2618	NC_015470	GAG	2	6	124398	124403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287078
2619	NC_015470	GCT	3	9	124415	124423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287078
2620	NC_015470	AG	3	6	124467	124472	50 %	0 %	50 %	0 %	332287078
2621	NC_015470	TGT	2	6	124474	124479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287078
2622	NC_015470	TGCATT	2	12	124579	124590	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332287078
2623	NC_015470	GTG	2	6	124658	124663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287079
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