MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015470	GAA	2	6	236434	236439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287172
5002	NC_015470	ACA	2	6	236464	236469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287172
5003	NC_015470	CAA	2	6	236471	236476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287172
5004	NC_015470	ACT	2	6	236484	236489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287172
5005	NC_015470	TCT	2	6	236499	236504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287172
5006	NC_015470	TTA	2	6	236515	236520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287172
5007	NC_015470	GTA	2	6	236522	236527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287172
5008	NC_015470	TC	4	8	236534	236541	0 %	50 %	0 %	50 %	332287172
5009	NC_015470	ATC	2	6	236558	236563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287172
5010	NC_015470	TCT	2	6	236680	236685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287172
5011	NC_015470	TG	4	8	236698	236705	0 %	50 %	50 %	0 %	332287172
5012	NC_015470	TC	4	8	236790	236797	0 %	50 %	0 %	50 %	332287172
5013	NC_015470	CTT	2	6	236857	236862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287172
5014	NC_015470	ATG	2	6	236872	236877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287172
5015	NC_015470	TGT	2	6	236907	236912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287172
5016	NC_015470	TGG	2	6	236936	236941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287172
5017	NC_015470	AG	3	6	237003	237008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_015470	AT	3	6	237073	237078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_015470	CTA	2	6	237182	237187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_015470	CGA	2	6	237420	237425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287173
5021	NC_015470	TGC	2	6	237431	237436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287173
5022	NC_015470	T	6	6	237515	237520	0 %	100 %	0 %	0 %	332287173
5023	NC_015470	AAC	3	9	237590	237598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287173
5024	NC_015470	T	6	6	237605	237610	0 %	100 %	0 %	0 %	332287173
5025	NC_015470	GTT	2	6	237611	237616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287173
5026	NC_015470	TAA	2	6	237617	237622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287173
5027	NC_015470	TGC	2	6	237678	237683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287173
5028	NC_015470	CTT	2	6	237697	237702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287173
5029	NC_015470	ACT	2	6	237749	237754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287173
5030	NC_015470	CTTT	2	8	237774	237781	0 %	75 %	0 %	25 %	332287173
5031	NC_015470	TGC	2	6	237866	237871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287173
5032	NC_015470	CATC	2	8	237901	237908	25 %	25 %	0 %	50 %	332287173
5033	NC_015470	GCT	2	6	237918	237923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287173
5034	NC_015470	CTT	2	6	237979	237984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287173
5035	NC_015470	CGA	2	6	238035	238040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287173
5036	NC_015470	CATG	2	8	238159	238166	25 %	25 %	25 %	25 %	332287173
5037	NC_015470	CTTG	2	8	238177	238184	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_015470	GAAT	2	8	238228	238235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_015470	GAA	3	9	238242	238250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_015470	T	6	6	238265	238270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_015470	AAG	2	6	238274	238279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_015470	T	7	7	238289	238295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_015470	AAG	2	6	238328	238333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_015470	ACC	2	6	238347	238352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_015470	AATT	2	8	238367	238374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_015470	GAT	2	6	238408	238413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_015470	TTTC	2	8	238467	238474	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_015470	GTT	2	6	238495	238500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_015470	A	8	8	238535	238542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_015470	AGA	2	6	238577	238582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_015470	GAG	2	6	238663	238668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287174
5052	NC_015470	T	6	6	238723	238728	0 %	100 %	0 %	0 %	332287174
5053	NC_015470	GTT	2	6	238779	238784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287174
5054	NC_015470	CT	3	6	238786	238791	0 %	50 %	0 %	50 %	332287174
5055	NC_015470	AGC	2	6	238839	238844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287174
5056	NC_015470	TTG	2	6	238847	238852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287174
5057	NC_015470	CTC	2	6	238936	238941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287174
5058	NC_015470	CTTT	2	8	238982	238989	0 %	75 %	0 %	25 %	332287174
5059	NC_015470	T	6	6	238987	238992	0 %	100 %	0 %	0 %	332287174
5060	NC_015470	AGA	2	6	239139	239144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287174
5061	NC_015470	GATT	2	8	239150	239157	25 %	50 %	25 %	0 %	332287174
5062	NC_015470	GCA	2	6	239183	239188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287174
5063	NC_015470	ACTA	2	8	239359	239366	50 %	25 %	0 %	25 %	332287174
5064	NC_015470	TTG	2	6	239446	239451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287174
5065	NC_015470	GGA	2	6	239494	239499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287174
5066	NC_015470	AGGC	2	8	239517	239524	25 %	0 %	50 %	25 %	332287174
5067	NC_015470	AAG	2	6	239595	239600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287174
5068	NC_015470	T	7	7	239623	239629	0 %	100 %	0 %	0 %	332287174
5069	NC_015470	ATTATA	2	12	239709	239720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_015470	A	6	6	239744	239749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_015470	CTT	2	6	239781	239786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_015470	TAT	2	6	239808	239813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_015470	ATAA	2	8	239849	239856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_015470	GA	3	6	239891	239896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_015470	A	6	6	239926	239931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_015470	GCA	2	6	239944	239949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_015470	GCA	2	6	239954	239959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_015470	CAA	2	6	240012	240017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_015470	GCTT	2	8	240027	240034	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_015470	TTC	2	6	240070	240075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_015470	TAAAA	2	10	240126	240135	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_015470	T	6	6	240170	240175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_015470	TCA	2	6	240177	240182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287175
5084	NC_015470	GAA	2	6	240206	240211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287175
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5086	NC_015470	A	6	6	240436	240441	100 %	0 %	0 %	0 %	332287175
5087	NC_015470	TAG	2	6	240542	240547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287175
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5089	NC_015470	AAAT	2	8	240665	240672	75 %	25 %	0 %	0 %	332287175
5090	NC_015470	TCT	2	6	240715	240720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287175
5091	NC_015470	GAG	2	6	240746	240751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287175
5092	NC_015470	CTT	2	6	240754	240759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287175
5093	NC_015470	GTTT	2	8	240898	240905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_015470	TAG	2	6	240966	240971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_015470	A	7	7	241058	241064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_015470	AG	3	6	241100	241105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_015470	TAT	2	6	241116	241121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_015470	TCAT	2	8	241128	241135	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_015470	ATA	2	6	241143	241148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_015470	CGT	2	6	241164	241169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287176
5101	NC_015470	GAA	2	6	241201	241206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287176
5102	NC_015470	ATC	2	6	241248	241253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287176
5103	NC_015470	TAT	2	6	241285	241290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287176
5104	NC_015470	GAG	2	6	241300	241305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287176
5105	NC_015470	GAT	2	6	241324	241329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287176
5106	NC_015470	TTCAG	2	10	241354	241363	20 %	40 %	20 %	20 %	332287176
5107	NC_015470	TTG	2	6	241429	241434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287176
5108	NC_015470	CAT	2	6	241546	241551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287176
5109	NC_015470	ATT	2	6	241556	241561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287176
5110	NC_015470	GTTT	2	8	241667	241674	0 %	75 %	25 %	0 %	332287176
5111	NC_015470	AGG	2	6	241693	241698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287176
5112	NC_015470	TG	3	6	241751	241756	0 %	50 %	50 %	0 %	332287176
5113	NC_015470	ATT	2	6	241791	241796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287176
5114	NC_015470	TTC	2	6	241852	241857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287176
5115	NC_015470	AGA	2	6	241865	241870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287176
5116	NC_015470	TGA	2	6	241900	241905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287176
5117	NC_015470	TTG	2	6	241950	241955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287176
5118	NC_015470	CGG	2	6	241957	241962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332287176
5119	NC_015470	TTG	2	6	241968	241973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287176
5120	NC_015470	ATT	2	6	242003	242008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287176
5121	NC_015470	ATG	2	6	242073	242078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287176
5122	NC_015470	ATG	2	6	242105	242110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287176
5123	NC_015470	GCA	2	6	242135	242140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287176
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5125	NC_015470	A	6	6	242180	242185	100 %	0 %	0 %	0 %	332287176
5126	NC_015470	TCA	2	6	242191	242196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287176
5127	NC_015470	GCTT	2	8	242250	242257	0 %	50 %	25 %	25 %	332287176
5128	NC_015470	AT	3	6	242331	242336	50 %	50 %	0 %	0 %	332287176
5129	NC_015470	TGA	2	6	242455	242460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287176
5130	NC_015470	GAA	2	6	242465	242470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287176
5131	NC_015470	ATT	2	6	242480	242485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287176
5132	NC_015470	TGA	2	6	242524	242529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287176
5133	NC_015470	GAA	2	6	242573	242578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287176
5134	NC_015470	TTA	2	6	242600	242605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287176
5135	NC_015470	TTTAG	2	10	242644	242653	20 %	60 %	20 %	0 %	332287176
5136	NC_015470	TGT	2	6	242664	242669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_015470	AG	3	6	242714	242719	50 %	0 %	50 %	0 %	332287177
5138	NC_015470	T	7	7	242745	242751	0 %	100 %	0 %	0 %	332287177
5139	NC_015470	GCA	2	6	242775	242780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287177
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5141	NC_015470	ATG	2	6	242901	242906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287177
5142	NC_015470	ACT	2	6	242919	242924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287177
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5147	NC_015470	ATCG	2	8	243165	243172	25 %	25 %	25 %	25 %	332287177
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5151	NC_015470	CTG	2	6	243380	243385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287178
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5162	NC_015470	GCG	2	6	243859	243864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332287178
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5164	NC_015470	AAAG	2	8	243985	243992	75 %	0 %	25 %	0 %	332287178
5165	NC_015470	TTGAAT	2	12	244022	244033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_015470	AGGA	2	8	244058	244065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_015470	AG	3	6	244066	244071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5168	NC_015470	T	7	7	244080	244086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5169	NC_015470	TTA	2	6	244170	244175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287179
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5183	NC_015470	TTC	2	6	245037	245042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287179
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5190	NC_015470	TTTAGG	2	12	245443	245454	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332287180
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5200	NC_015470	AGT	2	6	245890	245895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287181
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5203	NC_015470	CTT	2	6	245995	246000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287181
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5214	NC_015470	AGA	2	6	246649	246654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287182
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5217	NC_015470	TGA	2	6	246824	246829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287182
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5221	NC_015470	TAACA	2	10	246980	246989	60 %	20 %	0 %	20 %	332287182
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5225	NC_015470	T	6	6	247139	247144	0 %	100 %	0 %	0 %	332287182
5226	NC_015470	GTTT	2	8	247240	247247	0 %	75 %	25 %	0 %	332287182
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5230	NC_015470	TAG	2	6	247443	247448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287182
5231	NC_015470	ATAA	2	8	247452	247459	75 %	25 %	0 %	0 %	332287182
5232	NC_015470	GGA	2	6	247465	247470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287182
5233	NC_015470	GTA	2	6	247471	247476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287182
5234	NC_015470	ACA	2	6	247478	247483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287182
5235	NC_015470	TCT	2	6	247547	247552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287182
5236	NC_015470	TCT	2	6	247574	247579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287182
5237	NC_015470	ATC	2	6	247606	247611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287182
5238	NC_015470	GTTT	2	8	247701	247708	0 %	75 %	25 %	0 %	332287183
5239	NC_015470	T	6	6	247718	247723	0 %	100 %	0 %	0 %	332287183
5240	NC_015470	AAT	2	6	247812	247817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287183
5241	NC_015470	TCA	2	6	247849	247854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287183
5242	NC_015470	AAG	2	6	247856	247861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_015470	ATA	2	6	247955	247960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287184
5244	NC_015470	TAC	2	6	248044	248049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287184
5245	NC_015470	GAA	2	6	248057	248062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287184
5246	NC_015470	TTGAG	2	10	248103	248112	20 %	40 %	40 %	0 %	332287184
5247	NC_015470	GTT	2	6	248169	248174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287184
5248	NC_015470	GAT	2	6	248219	248224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287184
5249	NC_015470	GA	3	6	248273	248278	50 %	0 %	50 %	0 %	332287184
5250	NC_015470	TATT	2	8	248289	248296	25 %	75 %	0 %	0 %	332287184
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5480	NC_015470	CT	3	6	259118	259123	0 %	50 %	0 %	50 %	332287195
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5499	NC_015470	CAG	2	6	260088	260093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287196
5500	NC_015470	CTT	2	6	260094	260099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287196

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