MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015470	CTAA	2	8	210912	210919	50 %	25 %	0 %	25 %	332287150
4502	NC_015470	GTC	2	6	211076	211081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_015470	T	6	6	211165	211170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_015470	AAT	2	6	211262	211267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287151
4505	NC_015470	AAGC	2	8	211277	211284	50 %	0 %	25 %	25 %	332287151
4506	NC_015470	ATT	2	6	211322	211327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287151
4507	NC_015470	AAG	2	6	211348	211353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287151
4508	NC_015470	GTT	2	6	211370	211375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287151
4509	NC_015470	GTA	2	6	211428	211433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287151
4510	NC_015470	GA	3	6	211462	211467	50 %	0 %	50 %	0 %	332287151
4511	NC_015470	GTAG	2	8	211749	211756	25 %	25 %	50 %	0 %	332287152
4512	NC_015470	TGA	2	6	211763	211768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287152
4513	NC_015470	TTG	2	6	211795	211800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287152
4514	NC_015470	AT	3	6	211823	211828	50 %	50 %	0 %	0 %	332287152
4515	NC_015470	TTC	2	6	211834	211839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287152
4516	NC_015470	GTTT	2	8	211874	211881	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_015470	T	6	6	211893	211898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_015470	GGT	2	6	212075	212080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287153
4519	NC_015470	GAA	2	6	212200	212205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287153
4520	NC_015470	GTT	2	6	212306	212311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287153
4521	NC_015470	AGG	2	6	212326	212331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287153
4522	NC_015470	ATT	2	6	212482	212487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287153
4523	NC_015470	ATT	2	6	212686	212691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287153
4524	NC_015470	GTT	2	6	212692	212697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287153
4525	NC_015470	TCC	2	6	212726	212731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287153
4526	NC_015470	AGA	3	9	212734	212742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287153
4527	NC_015470	TGA	2	6	212824	212829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287153
4528	NC_015470	TTG	2	6	212994	212999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_015470	ATC	2	6	213074	213079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_015470	TGC	2	6	213190	213195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_015470	GAAG	2	8	213207	213214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_015470	CAT	2	6	213244	213249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_015470	AT	3	6	213248	213253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_015470	AAAG	2	8	213269	213276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_015470	TAC	2	6	213295	213300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_015470	GGT	2	6	213349	213354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_015470	ATA	2	6	213425	213430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_015470	TCT	2	6	213473	213478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_015470	CATA	2	8	213546	213553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4540	NC_015470	CCT	2	6	213605	213610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_015470	ATGT	2	8	213662	213669	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_015470	ACA	2	6	213674	213679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_015470	GCC	2	6	213704	213709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_015470	AAG	2	6	213714	213719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_015470	A	7	7	213748	213754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_015470	T	7	7	213772	213778	0 %	100 %	0 %	0 %	332287154
4547	NC_015470	TTG	2	6	213809	213814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287154
4548	NC_015470	GTT	2	6	213829	213834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287154
4549	NC_015470	ATG	2	6	213879	213884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287154
4550	NC_015470	GTT	2	6	213950	213955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287154
4551	NC_015470	AGAT	2	8	214056	214063	50 %	25 %	25 %	0 %	332287154
4552	NC_015470	AGAA	2	8	214179	214186	75 %	0 %	25 %	0 %	332287154
4553	NC_015470	GAAAA	2	10	214208	214217	80 %	0 %	20 %	0 %	332287154
4554	NC_015470	TGC	2	6	214231	214236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287154
4555	NC_015470	T	7	7	214263	214269	0 %	100 %	0 %	0 %	332287154
4556	NC_015470	GTA	2	6	214300	214305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287154
4557	NC_015470	AAC	2	6	214321	214326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287154
4558	NC_015470	GTT	2	6	214339	214344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287154
4559	NC_015470	C	6	6	214347	214352	0 %	0 %	0 %	100 %	332287154
4560	NC_015470	CAA	2	6	214373	214378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287154
4561	NC_015470	GTT	2	6	214491	214496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287155
4562	NC_015470	ATT	2	6	214511	214516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287155
4563	NC_015470	TTC	2	6	214526	214531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287155
4564	NC_015470	TAGCA	2	10	214574	214583	40 %	20 %	20 %	20 %	332287155
4565	NC_015470	AGC	2	6	214649	214654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287155
4566	NC_015470	ACA	2	6	214659	214664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287155
4567	NC_015470	ACG	2	6	214701	214706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287155
4568	NC_015470	GCT	2	6	214771	214776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287155
4569	NC_015470	AGC	2	6	214778	214783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287155
4570	NC_015470	AG	3	6	214885	214890	50 %	0 %	50 %	0 %	332287155
4571	NC_015470	T	6	6	215004	215009	0 %	100 %	0 %	0 %	332287155
4572	NC_015470	T	7	7	215037	215043	0 %	100 %	0 %	0 %	332287155
4573	NC_015470	T	6	6	215098	215103	0 %	100 %	0 %	0 %	332287155
4574	NC_015470	TTC	2	6	215237	215242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287155
4575	NC_015470	AAGAA	2	10	215272	215281	80 %	0 %	20 %	0 %	332287155
4576	NC_015470	AAG	2	6	215288	215293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287155
4577	NC_015470	TGA	2	6	215325	215330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_015470	TAA	2	6	215362	215367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_015470	T	6	6	215395	215400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_015470	AT	3	6	215440	215445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_015470	GA	3	6	215500	215505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_015470	GT	3	6	215540	215545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_015470	CT	3	6	215577	215582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4584	NC_015470	T	6	6	215605	215610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_015470	T	6	6	215668	215673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_015470	T	6	6	215714	215719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_015470	A	6	6	215765	215770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_015470	AG	3	6	215804	215809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_015470	TC	3	6	215863	215868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4590	NC_015470	GAA	2	6	215906	215911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287156
4591	NC_015470	TCA	2	6	215931	215936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287156
4592	NC_015470	AG	3	6	216041	216046	50 %	0 %	50 %	0 %	332287156
4593	NC_015470	GT	3	6	216125	216130	0 %	50 %	50 %	0 %	332287156
4594	NC_015470	GACA	2	8	216162	216169	50 %	0 %	25 %	25 %	332287156
4595	NC_015470	AG	3	6	216191	216196	50 %	0 %	50 %	0 %	332287156
4596	NC_015470	CTC	2	6	216248	216253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287156
4597	NC_015470	ATT	2	6	216276	216281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287156
4598	NC_015470	TTG	2	6	216384	216389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287156
4599	NC_015470	GGT	2	6	216395	216400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287156
4600	NC_015470	AGC	2	6	216451	216456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287156
4601	NC_015470	TTG	2	6	216516	216521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287156
4602	NC_015470	AAG	2	6	216551	216556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287157
4603	NC_015470	GAAAG	2	10	216572	216581	60 %	0 %	40 %	0 %	332287157
4604	NC_015470	TAT	2	6	216660	216665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287157
4605	NC_015470	AGA	2	6	216687	216692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287157
4606	NC_015470	ATTT	2	8	216743	216750	25 %	75 %	0 %	0 %	332287157
4607	NC_015470	TCA	2	6	216855	216860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287157
4608	NC_015470	GTG	2	6	216938	216943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287157
4609	NC_015470	ACTC	2	8	216952	216959	25 %	25 %	0 %	50 %	332287157
4610	NC_015470	TTA	2	6	217046	217051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287157
4611	NC_015470	TGT	2	6	217104	217109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287157
4612	NC_015470	TG	3	6	217208	217213	0 %	50 %	50 %	0 %	332287157
4613	NC_015470	TAG	2	6	217293	217298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287157
4614	NC_015470	TAC	2	6	217309	217314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287157
4615	NC_015470	AT	3	6	217544	217549	50 %	50 %	0 %	0 %	332287158
4616	NC_015470	AGAA	2	8	217849	217856	75 %	0 %	25 %	0 %	332287158
4617	NC_015470	TTG	2	6	217861	217866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
4618	NC_015470	CAAC	2	8	217916	217923	50 %	0 %	0 %	50 %	332287158
4619	NC_015470	TTC	2	6	218255	218260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287158
4620	NC_015470	AGC	2	6	218315	218320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287158
4621	NC_015470	ATC	2	6	218321	218326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287158
4622	NC_015470	TGT	2	6	218347	218352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
4623	NC_015470	GA	3	6	218378	218383	50 %	0 %	50 %	0 %	332287158
4624	NC_015470	AGT	2	6	218416	218421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287158
4625	NC_015470	GCG	2	6	218444	218449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332287158
4626	NC_015470	CTC	2	6	218453	218458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287158
4627	NC_015470	AT	3	6	218520	218525	50 %	50 %	0 %	0 %	332287158
4628	NC_015470	GTTAG	2	10	218556	218565	20 %	40 %	40 %	0 %	332287158
4629	NC_015470	CTA	2	6	218580	218585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287158
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4631	NC_015470	TGGAT	2	10	218708	218717	20 %	40 %	40 %	0 %	332287158
4632	NC_015470	CTG	4	12	218770	218781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287158
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4647	NC_015470	ATT	2	6	219380	219385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287158
4648	NC_015470	GTT	2	6	219397	219402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
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4729	NC_015470	AAGA	2	8	222929	222936	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4730	NC_015470	ACC	2	6	223056	223061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287159
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