MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925

Total Repeats: 2806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015426	TCA	2	6	88038	88043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331270858
2502	NC_015426	ATC	2	6	88062	88067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331270858
2503	NC_015426	T	6	6	88071	88076	0 %	100 %	0 %	0 %	331270858
2504	NC_015426	T	6	6	88083	88088	0 %	100 %	0 %	0 %	331270858
2505	NC_015426	TCTT	2	8	88103	88110	0 %	75 %	0 %	25 %	331270858
2506	NC_015426	T	6	6	88149	88154	0 %	100 %	0 %	0 %	331270858
2507	NC_015426	TA	3	6	88175	88180	50 %	50 %	0 %	0 %	331270858
2508	NC_015426	AT	3	6	88293	88298	50 %	50 %	0 %	0 %	331270858
2509	NC_015426	TAT	2	6	88309	88314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270858
2510	NC_015426	TAT	2	6	88316	88321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270858
2511	NC_015426	TTA	2	6	88326	88331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270858
2512	NC_015426	T	6	6	88375	88380	0 %	100 %	0 %	0 %	331270858
2513	NC_015426	TCTT	2	8	88443	88450	0 %	75 %	0 %	25 %	331270858
2514	NC_015426	ATT	2	6	88493	88498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270858
2515	NC_015426	CCCG	2	8	88538	88545	0 %	0 %	25 %	75 %	331270858
2516	NC_015426	TAT	3	9	88621	88629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270858
2517	NC_015426	T	6	6	88648	88653	0 %	100 %	0 %	0 %	331270858
2518	NC_015426	CA	3	6	88680	88685	50 %	0 %	0 %	50 %	331270858
2519	NC_015426	TAA	2	6	88721	88726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270858
2520	NC_015426	TCT	2	6	88815	88820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331270858
2521	NC_015426	TAA	2	6	88822	88827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270858
2522	NC_015426	TATG	2	8	88840	88847	25 %	50 %	25 %	0 %	331270858
2523	NC_015426	AT	3	6	88863	88868	50 %	50 %	0 %	0 %	331270858
2524	NC_015426	TAT	2	6	88928	88933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270858
2525	NC_015426	ATT	2	6	88934	88939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270858
2526	NC_015426	AGT	2	6	88949	88954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270858
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2528	NC_015426	T	6	6	88987	88992	0 %	100 %	0 %	0 %	331270858
2529	NC_015426	ATT	2	6	88994	88999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270858
2530	NC_015426	T	6	6	89029	89034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_015426	ATT	2	6	89035	89040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_015426	TCG	2	6	89054	89059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_015426	TCG	2	6	89076	89081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_015426	TCG	2	6	89120	89125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_015426	AAG	2	6	89130	89135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_015426	TCG	2	6	89162	89167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_015426	TAC	2	6	89222	89227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_015426	AAC	2	6	89228	89233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_015426	TAT	2	6	89249	89254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_015426	TTATA	2	10	89256	89265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_015426	ATA	2	6	89286	89291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_015426	T	7	7	89307	89313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_015426	TAA	2	6	89325	89330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_015426	TA	3	6	89354	89359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_015426	AT	3	6	89394	89399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_015426	A	6	6	89404	89409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_015426	AGAA	2	8	89418	89425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_015426	GAA	2	6	89443	89448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270859
2549	NC_015426	GTAT	2	8	89468	89475	25 %	50 %	25 %	0 %	331270859
2550	NC_015426	ATG	2	6	89480	89485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270859
2551	NC_015426	CTT	2	6	89493	89498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331270859
2552	NC_015426	GTA	2	6	89499	89504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270859
2553	NC_015426	ATGT	2	8	89550	89557	25 %	50 %	25 %	0 %	331270859
2554	NC_015426	A	6	6	89566	89571	100 %	0 %	0 %	0 %	331270859
2555	NC_015426	ATTA	2	8	89632	89639	50 %	50 %	0 %	0 %	331270859
2556	NC_015426	ATA	2	6	89672	89677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270859
2557	NC_015426	T	6	6	89698	89703	0 %	100 %	0 %	0 %	331270859
2558	NC_015426	TAAA	2	8	89727	89734	75 %	25 %	0 %	0 %	331270859
2559	NC_015426	AT	3	6	89792	89797	50 %	50 %	0 %	0 %	331270859
2560	NC_015426	ACC	2	6	89878	89883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331270859
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2562	NC_015426	ATTTC	2	10	90033	90042	20 %	60 %	0 %	20 %	331270859
2563	NC_015426	A	6	6	90056	90061	100 %	0 %	0 %	0 %	331270859
2564	NC_015426	TTA	2	6	90069	90074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270859
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2569	NC_015426	ATA	2	6	90354	90359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270859
2570	NC_015426	ATG	2	6	90416	90421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270859
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2572	NC_015426	GAG	2	6	90470	90475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	331270859
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2577	NC_015426	TAA	3	9	90718	90726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270859
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2580	NC_015426	ATG	2	6	90774	90779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270859
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2582	NC_015426	A	6	6	90830	90835	100 %	0 %	0 %	0 %	331270859
2583	NC_015426	ATTTTA	2	12	90949	90960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2586	NC_015426	TTTAC	2	10	91057	91066	20 %	60 %	0 %	20 %	331270860
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2593	NC_015426	TAG	2	6	91307	91312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270860
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2598	NC_015426	CAA	2	6	91409	91414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331270860
2599	NC_015426	TGC	2	6	91446	91451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331270860
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2601	NC_015426	ATTT	2	8	91521	91528	25 %	75 %	0 %	0 %	331270860
2602	NC_015426	TCT	2	6	91546	91551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331270860
2603	NC_015426	TTGC	2	8	91553	91560	0 %	50 %	25 %	25 %	331270860
2604	NC_015426	AGC	2	6	91593	91598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331270860
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2606	NC_015426	GCT	2	6	91636	91641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331270860
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2608	NC_015426	AGC	2	6	91659	91664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331270860
2609	NC_015426	TGT	2	6	91717	91722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270860
2610	NC_015426	TTC	2	6	91737	91742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331270860
2611	NC_015426	CTG	2	6	91748	91753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331270860
2612	NC_015426	TTC	2	6	91758	91763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331270860
2613	NC_015426	TTC	2	6	91779	91784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331270860
2614	NC_015426	TGA	2	6	91866	91871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270860
2615	NC_015426	ACTA	2	8	91884	91891	50 %	25 %	0 %	25 %	331270860
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2617	NC_015426	TCT	2	6	91951	91956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331270860
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2619	NC_015426	AGA	2	6	92022	92027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270860
2620	NC_015426	TAT	2	6	92031	92036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270860
2621	NC_015426	TGA	2	6	92057	92062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270860
2622	NC_015426	ATTA	2	8	92064	92071	50 %	50 %	0 %	0 %	331270860
2623	NC_015426	AAAT	2	8	92072	92079	75 %	25 %	0 %	0 %	331270860
2624	NC_015426	ATA	2	6	92141	92146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270860
2625	NC_015426	TAT	2	6	92186	92191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270860
2626	NC_015426	TAC	2	6	92204	92209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331270860
2627	NC_015426	AT	3	6	92212	92217	50 %	50 %	0 %	0 %	331270860
2628	NC_015426	T	6	6	92220	92225	0 %	100 %	0 %	0 %	331270860
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2806	NC_015426	ATT	2	6	98709	98714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.