MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p5BKT015925

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015419	TAT	2	6	51	56	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015419	ATA	2	6	64	69	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015419	ACA	2	6	241	246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268175
4	NC_015419	TAA	2	6	296	301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268175
5	NC_015419	ACA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268175
6	NC_015419	TAA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268175
7	NC_015419	CAA	2	6	403	408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268175
8	NC_015419	TTA	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015419	AGG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015419	AAT	2	6	536	541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015419	AAG	2	6	564	569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015419	CTA	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015419	TAA	2	6	719	724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015419	AAG	2	6	725	730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015419	TAT	2	6	745	750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015419	ACA	2	6	762	767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015419	TGT	2	6	809	814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015419	TCT	2	6	824	829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015419	TTG	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015419	CCT	2	6	890	895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015419	AAT	2	6	900	905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015419	TCT	2	6	964	969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015419	TTG	2	6	1287	1292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268176
24	NC_015419	TTG	2	6	1296	1301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268176
25	NC_015419	TTA	2	6	1385	1390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
26	NC_015419	ATT	2	6	1476	1481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
27	NC_015419	ATT	2	6	1537	1542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
28	NC_015419	AAT	2	6	1617	1622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268176
29	NC_015419	TCA	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268176
30	NC_015419	TTG	2	6	1671	1676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268176
31	NC_015419	AAT	2	6	1930	1935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268176
32	NC_015419	ACT	2	6	1986	1991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268176
33	NC_015419	TAT	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
34	NC_015419	TTA	2	6	2254	2259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
35	NC_015419	CTA	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268176
36	NC_015419	ATT	2	6	2283	2288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
37	NC_015419	TAT	2	6	2294	2299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
38	NC_015419	CTT	2	6	2327	2332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268176
39	NC_015419	ACC	2	6	2409	2414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268176
40	NC_015419	TTC	2	6	2466	2471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268176
41	NC_015419	ATT	2	6	2484	2489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
42	NC_015419	CAA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268176
43	NC_015419	ATT	2	6	2602	2607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015419	ATA	2	6	2783	2788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015419	ACA	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015419	ATT	2	6	2838	2843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015419	ATA	3	9	2844	2852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015419	ATG	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268177
49	NC_015419	CTT	2	6	2900	2905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268177
50	NC_015419	AGT	2	6	2985	2990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268177
51	NC_015419	CCA	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268177
52	NC_015419	CCT	2	6	3151	3156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331268177
53	NC_015419	TTC	2	6	3212	3217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268177
54	NC_015419	AAC	2	6	3231	3236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268177
55	NC_015419	TTA	2	6	3257	3262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268177
56	NC_015419	ATA	2	6	3311	3316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015419	TAT	2	6	3333	3338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015419	GTT	2	6	3388	3393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015419	AAC	2	6	3405	3410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015419	TAT	2	6	3589	3594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268178
61	NC_015419	TCA	2	6	3595	3600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268178
62	NC_015419	ATC	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268178
63	NC_015419	CAA	2	6	3739	3744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268178
64	NC_015419	CCA	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268178
65	NC_015419	AGT	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268178
66	NC_015419	CTT	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268178
67	NC_015419	ATT	2	6	4089	4094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268178
68	NC_015419	ATT	2	6	4129	4134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015419	GAT	2	6	4148	4153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015419	ATA	2	6	4200	4205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015419	ATT	2	6	4257	4262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268179
72	NC_015419	ATT	2	6	4276	4281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268179
73	NC_015419	ATA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268179
74	NC_015419	ATT	2	6	4409	4414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268179
75	NC_015419	TAA	2	6	4440	4445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268179
76	NC_015419	AAT	2	6	4481	4486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268179
77	NC_015419	TCT	2	6	4487	4492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268179
78	NC_015419	ATT	2	6	4699	4704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268179
79	NC_015419	ATA	2	6	4796	4801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015419	ATT	2	6	4901	4906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015419	TAG	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015419	CCA	2	6	5158	5163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015419	CTA	2	6	5172	5177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015419	ATT	2	6	5289	5294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015419	GTA	2	6	5351	5356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015419	TAC	2	6	5509	5514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015419	TTA	2	6	5785	5790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015419	AAC	2	6	5791	5796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015419	TTA	2	6	5836	5841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015419	CTT	2	6	5946	5951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015419	ATT	2	6	6295	6300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015419	TAT	2	6	6476	6481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015419	TAT	2	6	6503	6508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015419	CAT	2	6	6512	6517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015419	CTT	2	6	6724	6729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268180
96	NC_015419	CTT	2	6	6798	6803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268180
97	NC_015419	ATC	2	6	6830	6835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268180
98	NC_015419	ATA	2	6	6979	6984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268180
99	NC_015419	ATC	2	6	7046	7051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268180
100	NC_015419	ATA	3	9	7099	7107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015419	AAT	2	6	7113	7118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015419	TCC	2	6	7147	7152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015419	AGT	2	6	7162	7167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015419	TCA	2	6	7219	7224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015419	ATA	2	6	7225	7230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015419	TAT	2	6	7306	7311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268181
107	NC_015419	ATT	2	6	7327	7332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268181
108	NC_015419	CTT	2	6	7365	7370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268181
109	NC_015419	CAA	2	6	7440	7445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268181
110	NC_015419	TAT	3	9	7500	7508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268181
111	NC_015419	ATC	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268181
112	NC_015419	ATT	2	6	7582	7587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268181
113	NC_015419	TTC	2	6	7625	7630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268181
114	NC_015419	ATT	2	6	7818	7823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015419	TAT	2	6	7954	7959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015419	TTA	2	6	8029	8034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268182
117	NC_015419	TAA	2	6	8048	8053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268182
118	NC_015419	TAA	2	6	8065	8070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268182
119	NC_015419	TCT	2	6	8085	8090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268182
120	NC_015419	GTT	2	6	8094	8099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268182
121	NC_015419	CAT	2	6	8198	8203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268182
122	NC_015419	CTT	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268182
123	NC_015419	CAA	2	6	8371	8376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268182
124	NC_015419	TAT	2	6	8506	8511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268182
125	NC_015419	ATT	2	6	8543	8548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015419	GTT	2	6	8617	8622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015419	TTG	2	6	8671	8676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015419	TTG	2	6	8705	8710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015419	CTT	2	6	8809	8814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015419	TCA	2	6	8846	8851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268183
131	NC_015419	TAA	2	6	8859	8864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268183
132	NC_015419	TAG	2	6	8943	8948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268183
133	NC_015419	ACC	2	6	9088	9093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268183
134	NC_015419	CAA	2	6	9116	9121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268183
135	NC_015419	AGT	2	6	9145	9150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268183
136	NC_015419	TTA	2	6	9182	9187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268183
137	NC_015419	TAG	2	6	9402	9407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268183
138	NC_015419	TCT	2	6	9422	9427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268183
139	NC_015419	TAT	2	6	9504	9509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268183
140	NC_015419	TCG	2	6	9519	9524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331268183
141	NC_015419	TCT	2	6	9593	9598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268183
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151	NC_015419	TTA	2	6	10049	10054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268184
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173	NC_015419	TTC	2	6	12352	12357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268187
174	NC_015419	TTG	2	6	12370	12375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.